JAMSTECはIODP以外にも、研究航海や商業掘削による地球深部探査船「ちきゅう」の利用を推進しています。JAMSTECが実施主体となる研究航海では、JAMSTECの規定に基づいて、乗船研究者の募集と選定、サンプル/データの管理が行われます。募集要項やサンプル/データリクエストに関しては、以下のサイトをご参照ください。

商業掘削に関しては、契約した企業にのみサンプル/データを提供するため、乗船研究者の募集や航海情報などが一般に公開されることはありません。