平成18年度地球シミュレータ研究プロジェクト利用報告会

発表要旨

1. プロジェクトの目的

　強力なシミュレーション手法である拡張アンサンブル法を用いて、アミノ酸数５０個余りのタンパク質の水中の折りたたみシミュレーションに世界で初めて成功することを目指す。原子レベルの詳細を取り入れたシミュレーションではこの問題は、未だに大変な難問とされている。具体的には、拡張アンサンブル法として、我々が独自に開発し、世界中で現在広く使われているレプリカ交換分子動力学法（REMD）及びその更なる改良版であるマルチカノニカルレプリカ交換法（MUCAREM）を用いる。