○伊豆小笠原諸島海域伊豆小笠原諸島海域には、海底火山が数多く分布し水曜海山（水深1400m）、木曜海山（水深1400m）、海形海山（水深400〜800m）、日光海山（水深450m）などに熱水噴出孔生物群集があります。水曜海山では300℃以上の熱水が噴出するチムニーが林立し、シチヨウシンカイヒバリガイBathymodiolus septemdierum が密集しています。海形海山には、眼が退化したユノハナガニ類 Bythograeidae が優占して分布しており、このカニは実験室内でも飼育できるようになりました。
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○鹿児島湾鹿児島湾では、「たぎり」とよばれる火山性噴気現象が昔から知られており、高濃度の二酸化炭素やメタン、硫化水素を含むガスが海底から噴出しています。その付近でみられるサツマハオリムシ Lamellibrachia satsuma は、バイオマスが 9 kg/
以上もある”世界最浅”のハオリムシです。圧力・温度変化の影響が少なく、深海研究部では世界で始めて長期飼育に成功、生理や生態についての研究をすすめています。
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| 鹿児島湾の湾奥でみられる「たぎり」。桜島の火山活動の影響と考えられている。 | 「たぎり」付近でみられるサツマハオリムシのコロニー。岩に高密度で付着するため、まるでハオリムシの山（最大で高さ5m直径10m）のようにみえる。 |
○沖縄トラフ沖縄トラフでは、南奄西海丘（水深650〜750m）、伊平屋海嶺（水深1000〜1400m）、伊是名海穴（水深1300〜1500m）などに熱水噴出孔生物群集が認められます。南奄西海丘には、チムニーが10本ほどあり、最高温度は270℃にも達っします。チムニーを取り囲むように優占的にシンカイヒバリガイ Bathymodiolus japonicus が密集しています。周辺の海底表面には白色の糸状バクテリアマットがあり、このようなバクテリアが基礎生産者になっています。
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| 南奄西海丘の熱水噴出孔生物群集．シンカイヒバリガイが露頭一面に付着している． | 南奄西海丘の粗粒砂堆積域に広がるバクテリアマット． |
○マリアナ背弧海盆マリアナ背弧海盆では、南部域（水深1450m）と、中部域（水深3600m）に熱水噴出孔生物群集があります。両地点ともに殻は毛で覆われ、鰓にバクテリアを共生させる腹足類アルビンガイ Alvinicorcha hessleriが分布しています。また、周辺にはアルビンガイの死殻が堆積しており、世代交代が早いと考えられます。
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○マヌス海盆マヌス海盆（パプアニューギニア）にはDESMOS、PACMANUS、VIENNA WOODSなどの熱水噴出域があり、それぞれに特徴的な化学合成生物群集が存在します。DESMOSサイトの熱水はpHが非常に低いことが特徴で（pH 2程度）、熱水噴出孔周辺にはおびただしい数のハオリムシ類（チューブワーム）が生息しています。白い枯れ枝状の筒がハオリムシ類の棲管（住み家）で、赤い房が鰓です。ハオリムシ類はこの鰓から酸素やエネルギー源となる硫化水素などを取り込みます。
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