査読付き論文
2012
Ishitani, Y., Kamikawa, R., Yabuki, A., Tsuchiya, M., Inagaki, Y., Takishita, K., (2012), Evolution of Elongation Factor-Like (EFL) Protein in Rhizaria Is Revised by Radiolarian EFL Gene Sequences. Journal of Eukaryotic Microbiology, 59, 367-373.
Taro Maeda, Euichi Hirose, Yoshito Chikaraishi, Masaru Kawato, Kiyotaka Takishita, Takao Yoshida, Heroen Verbruggen, Jiro Tanaka, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Tsuchiya, M., Kenji Iwai, Tadashi Maruyama, (2012) Algivore or phototroph? Plakobranchus ocellatus (Gastropoda) continuously acquires kleptoplasts and nutrition from multiple algal species in nature. PLosOne, accepted Jun. 20, 2012.
Tsuchiya, M., Gooday, A. J., Nomaki, H., Oguri, K., Kitazato, H., (accepted), Genetic diversity and environmental preferences of monothalamous foraminifers revealed through clone analysis of environmental small subunit ribosomal DNA sequences. Journal of Foraminiferal Research.
2011
土屋正史，（2011），貧酸素環境の小さな生物：細胞内の小さな生物との相互作用．生物科学．62, 143-150
Ishitani, Y., Ishikawa, S.A., Inagaki, Y., Tsuchiya, M., Takahashi, K., Takishita, K.,（2011）Multigene phylogenetic analyses including diverse radiolarian species support the "Retaria" hypothesis - the sister relationship of Radiolaria and Foraminifera. Mar. Micropal. 81, 32-42
力石嘉人，高野淑識，小川奈々子，佐々木瑶子，土屋正史，大河内直彦（2011）アミノ酸の窒素同位体比を用いた生物の栄養段階の解析：陸上環境を含めた生物生態系の解明に向けて．日本地球化学会，Researches in Organic Geochemistry (Res. Org. Geochem.), 27, 3-11
2010
力石嘉人，小川奈々子，高野淑識，土屋正史，大河内直彦，（2010），アミノ酸の窒素同位体比を用いた水棲生物の栄養段階の解析．地球化学，44，233-241. 特集号「有機物・微生物・生態系の地球化学」
青池 寛、西 弘嗣、坂本竜彦、飯島耕一、土屋正史、平 朝彦、倉本真一、真砂英樹、下北コア微化石研究グループ(2010)地球深部探査船「ちきゅう」の下北半島沖慣塾航海コア試料-物性変動から予測される古環境変動. 化石、87, 65-81.
堂満華子、西 弘嗣、内田淳一、尾田太良、大金 薫、平 朝彦、青池 寛、下北コア微化石研究グループ(2010)地球深部探査船「ちきゅう」の下北半島沖慣塾航海コア試料の年代モデル. 化石、87, 47-64.
2009
Tsuchiya, M., Grimm, G.W., Heinz, P., Stogerer, K., Ertan, K.T., Collen, J., Bruchert, V., Hemleben, C., Hemleben, V., and Kitazato, H. (2009) Ribosomal DNA shows extremely low genetic divergence in a world-wide distributed, but disjunct and highly adapted marine protozoan (Virgulinella fragilis, Foraminiferida). Marine Micropaleontology, 70, 8-19.
土屋 正史 (2009) 浮遊性有孔虫の分子系統解析からみた両極性分布の成立過程． 化石,85, 14-24．
Lecroq, B., Gooday, A.J., Tsuchiya, M., Pawlowski, J. (2009) A new genus of xenophyophores (Foraminifera) from Japan Trench: morphological description, molecular phylogeny and elemental analysis. The Zoological Journal of the Linnean Society, 156, 455-464. DOI: 10.1111/j.1096-3642.2008.00493.x
2008
Tsuchiya, M., Tazume, M., and Kitazato, H. (2008) Molecular characterization of the non-costate morphotypes of buliminid foraminifers based on internal transcribed region of ribosomal DNA (ITS rDNA) sequence data. Marine Micropaleontology, 69, 212-224.
Kuroyanagi, A., Tsuchiya, M., Kawahata, H., and Kitazato, H. (2008) The occurrence of two genotypes of the planktonic foraminifer Globigerinoides ruber (white) and paleo-environmental implications, Marine Micropaleontology, 68, 236-243.
2007
Takishita, K., Tsuchiya, M., Kawato, M., Oguri, K., Kitazato, H. and Maruyama, T. (2007) Genetic Diversity of Microbial Eukaryotes in Anoxic Sediment of the Saline Meromictic Lake Namako-ike (Japan): On the Detection of Anaerobic or Anoxic-tolerant Lineages of Eukaryotes. Protist, 158, 51-64.
2006
Takishita K., Tsuchiya, M., Reimer, J. D. and Maruyama, T. (2006) Molecular evidence demonstrating the basidiomycetous fungus Cryptococcus curvatus is the dominant microbial eukaryote in sediment at the Kuroshima Knoll methane seep. Extremophiles 10, 165-169.
Nozawa, F., Kitazato, H., Tsuchiya, M. and Gooday, A. J. (2006) ‘Live’ benthic foraminifera at an abyssal site in the equatorial Pacific nodule province: Abundance, diversity and taxonomic composition. Deep-Sea Research I, 53, 1406?1422.
2005
Toyofuku-Suzuki, M., Kitazato, H. and Tsuchiya, M. (2005) Phylogenetic relationships among genus Ammonia (Foraminifera) based on ribosomal DNA sequences, which are distributed in the vicinity of the Japanese Islands. Frontier Research on Earth Evolution, 2.
Takishita, K., Inagaki, Y., Tsuchiya, M., Sakaguchi, M. and Maruyama, T. (2005) A close relationship between Cerocozoa and Foraminifera supported by phylogenetic analysis based on combined amino acid sequences of three cytoskeletal proteins (actin, α-tubulin, and β-tubulin). Gene, 362, 153-160.
2003
Tsuchiya, M., Kitazato, H. and Pawlowski, J. (2003) Analysis of internal transcribed spacer of ribosomal DNA reveals cryptic speciation in Planoglabratella opercularis. Journal of Foraminiferal Research, 33, 285-293.
Kitazato, H., Tazume, M. and Tsuchiya, M. (2003) Phylogenetic relationships among the species of genus Bulimina (Foraminifera) inferred from ribosomal DNA sequences. Frontier Research on Earth Evolution, 1, 233-238.
2000
Tsuchiya, M., Kitazato, H. and Pawlowski, J. (2000) Phylogenetic relationships among species of Glabratellidae (Foraminifera) inferred from ribosomal DNA sequences: Comparison with morphological and reproductive data. Micropaleontology, 46, 13-20. In Lee, J.J. and Hallock, P. (eds.), Advances in the Biology of Foraminifera.
土屋 正史, 北里 洋 (2000) 形態と分子から見た有孔虫の種.日本プランクトン学会誌, 47, 66-70
Kitazato, H., Tsuchiya, M. and Takahara, K. (2000) Recognition of breeding populations in foraminifera: an example using the genus Glabratella. Paleontological Research, 4, 1-15.
Toyofuku, T., Kitazato, H., Kawahata, H., Tsuchiya, M. and Nohara, M. (2000) Evaluation of Mg/Ca thermometry in foraminifera: Comparison of experimental results and measurements in nature. Paleoceanography, 15, 456-464.
解説等
2009
豊福 高志，小栗 一将，L.J. de Nooijer，野牧 秀隆，土屋正史，北里 洋，2009，地球化学・地球生物学分野への分子イメージング手法の応用．第四回学際領域における分子イメージングフォーラム、JAXA SP
2008
豊福高志、Lennart Jan de Nooijer, 野牧秀隆、小栗一将、土屋正史、北里洋（2008）
有孔虫細胞内の環境可視化手法の開発と応用―バイオミネラリゼーションの解明を目指して―月刊地球, 30: 346-351
2001
北里 洋・土屋正史・Mary, McGann, 2001，東アジアの内湾生有孔虫Trochammina hadai Uchioはどのようにして太平洋を渡ったのか？月刊海洋，33, 399-405.
2000
土屋正史, 北里 洋，2000，有孔虫における分子系統解析ー底生有孔虫Glabratellidaeを例としてー，月刊海洋，32, 264-269.
1999
北里 洋, 土屋正史, 1999，有孔虫はなぜ環境や古環境の指標として使えるのか？---内湾の指標種，Ammonia beccarii (Linne) を例として---. 鹿児島大学南太平洋海域調査研究報告，no. 32, 3-17.
著書
日本古生物学会編 古生物学事典第二版 (4項を分担執筆). 2010, 朝倉書店.
口頭発表など（国際学会での講演アブストラクト）
2012
Hidetaka Nomaki, Kentaro Inoue, Hisami Suga, Takuro Nunoura, Masashi Tsuchiya, Takashi Toyofuku, Hiroshi Kitazato, In situ experimental measurements of carbon fixation on the deep-sea floor. 13th International Deep-Sea Biology Symposium, Wellington, New Zealand, 3-7 December, 2012.
Toyofuku, T., Nooijer, L.J., Nomaki, H., Tsuchiya, M., Kitazato, H., Foraminiferal cellular environment visualization. Field workshop on living foraminifera in Japan. Sesoko/Yokosuka, 15~19, July. 2012.
Kurasawa, A., Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Nishi, H., Kitazato, H., Genetic diversity of Globigerina bulloides in the Pacific Ocean. Field workshop on living foraminifera in Japan. Sesoko/Yokosuka, 15~19, July. 2012.
Tsuchiya, M., How has foraminiferal biodiversity developed? Field workshop on living foraminifera in Japan. Sesoko/Yokosuka, 15~19, July. 2012.
Nomaki, H., Chikaraishi, Y., Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Ohkouchi, N., Kitazato, H., Nitrate utilization in shallow-water benthic foraminiferal cells under anoxic environments revealed by 15N-labelling experiments. ASLO (Association for the Sciences of Limnology and Oceanography), 8-13 July 2012?Lake Biwa, Otsu, Shiga, Japan.
Chikaraishi, Y., Ogawa, N.O., Takano, Y., Tsuchiya, M., Ohkouchi, N., Estimation of trophic position of organisms based on stable nitrogen isotopic composition of amino acids. ASLO (Association for the Sciences of Limnology and Oceanography), 8-13 July 2012?Lake Biwa, Otsu, Shiga, Japan
Chikaraishi, Y., Ogawa, N.O., Takano, Y., Tsuchiya, M., Ohkouchi, N., Accurate and precise determination of trophic position of organisms based on nitrogen isotopic composition of amino acids. AGU Ocean Science Meeting, 2012.2.23. Salt Lake City
N. Ohkouchi, Chikaraishi, Y., Ogawa, N.O., Tsuchiya, M., Yoshida, T., Lindsay, D.J., Fujiwara, Y., Kitamura, M, Yamamoto, H., Fujikura, K., Is chemosynthetic community 100% supported by nitrogen from subseafloor? Applications of nitrogen isotopic composition of amino acids to the chemosynthetic ecosystem, AGU Ocean Science Meeting, 2012.2.23. Salt Lake City
2011
Toyofuku T, Nomaki H, Tsuchiya M, and Kitazato H, Foraminiferal cellular pH control under high-CO2 condition in the laboratory. EGU2011, 7th April. 2011
2010
Takashi Toyofuku, Lennart de Nooijer, Hidetaka Nomaki, Masashi Tsuchiya, Hiroshi Kitazato, 2-D pH observation on foraminiferal cell under stable environmental condition. FORAMS 2010, Bonn, Germany, September 2012
Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Uematsu, K., Bruchert, V., Collen, J., Yamamoto, H., Kitazato, H., Multiple endobionts of both bacteria and kleptoplast in Virgulinella fragilis (foraminifera): distribution, cytological and genetic characteristics. Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology, December 7~8, 2010
Ohkawara, N., Gooday, A.J., Tsuchiya, M., and Kitazato, H., The Distribution and species diversity of deep-sea foraminifera from the equatorial Pacific. Deep-sea Biology symposium, Iceland, June, 2010
2009
Hori, S., Tsuchiya, M., Nishi, S., Arai, W., Yoshida, T. and Takami, H., Bacteria diversity surrounding a new candidate genes Xenophyophores (Foraminifera) discovered at a depth 7111 m near the Boso Peninsula, International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems (4th CBE), Nago, Okinawa, June29-July 3, 2009 (July 4)
Tsuchiya, M., Gooday, A.J., Nomaki, H., Oguri, K. and Kitazato, H., Cryptic biodiversity and habitat preferences of soft-shelled foraminifera in various oceanographic environments. International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems (4th CBE), Nago, Okinawa, June29-July 3, 2009 (July 4)
2008
Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Heinz, P., Collen, J., Bruchert, V., Hemleben, C., Hemleben, V., Yamamoto, H. and Kitazato, H., Survival strategy of benthic foraminifera in dysoxic environments: distribution, cytological and genetic characteristics of Virgulinella fragilis. The 33rd International Geological Congress, Oslo, Norway, Aug, 7, 2008.
2007
Tsuchiya, M. and Kitazato, H., Ecological and biological perspectives on a molecular phylogenetic lineage of Planoglabratella opercularis (d’Orbigny), The Micropalaeontological Society’s Foraminiferal and Nanofossil groups joint spring meeting 2007, Angers (France), Integrated Studies of Taxonomy, Ecology and Geochemistry”, Angers, France, June 7-8, 2007.
2006
Kuroyanagi, A., Tsuchiya, M., Kawahata, H., and Kitazato, H., Molecular Analysis of the Two Morphotypes of Planktonic Foraminifer Globigerinoides ruber. The 2006 AGU (American Geophysical Union) Fall Meeting, San Francisco, CA, USA, December 11-15, 2006.
Kimoto, K. and Tsuchiya, M., The "unusual" reproduction of planktic foraminifera: An asexual reproductive phase of Neogloboquadrina pachyderma (Ehrenberg). International Symposium on Foraminifera 2006 (FORAMS 2006), Natal, Brasil, September 10-15, 2006.
Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Takishita, K., Yamamoto, H., Collen, J. and Kitazato, H., Molecular characterization of bacteria and kleptoplast within Virgulinella fragilis. International Symposium on Foraminifera 2006 (FORAMS 2006), Natal, Brasil, September 10-15, 2006.
2005
Kitazato, H., Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Oguri, K. and Nomaki, H., Adaptive ecology of benthic foraminifera under dysoxic to anoxic environments: towards understanding evolution of foraminifera on OAE．Recent Advances in Research on Terrestrial and Marine Sequences from the mid-Cretaceous Oceanic Anoxic Events (OAEs)．Hokkaido, Japan, September 2005.
Tsuchiya, M., Gooday, A. J. and Kitazato, H., Molecular phylogenetic analysis of soft-shelled and monothalamous foraminifers in the abyssal plain: Report on Nodinaut Cruise/Kaplan Project at East equatorial Pacific Abyssal Plain. Nodinaut meeting, Ifremer, France, July 20-21, 2005.
Kitazato, H., Nomaki, H., Toyofuku, T. and Tsuchiya, M., Foraminifera as paleoceanographic proxies; biological constraints both from in situ and laboratory culture experiments. The Micropalaeontological Society's Foraminifera and Nannofossil Groups Joint Spring Meeting, Royal Micropaleontological Society of United Kingdom, Southampton Oceanograpgy Centre, UK, June, 2005.
2004
Tsuchiya, M. and Kitazato, H., Morphological stabilities of Planoglabratella opercularis: developmental, ecological and molecular phylogenetic approaches for evaluating test morphology of benthic foraminifera. Living benthic foraminifera and their applications on the fossil record, Tuebingen, Germany, June 10-12, 2004, p.30
2001
Tsuchiya, M., Suzuki, M. and Kitazato, H., Mosaic distribution of genetically variant populations within a species of foraminifera: Paleoceanographic interpretations. 7th International Conference on Paleoceanography (ICP 7) Sapporo, Japan, September 16-22, 2001, p.195
Tazume, M., Tsuchiya, M., and Kitazato, H., Phylogenetic relationships among the species of genus Bulimina (Foraminifera) inferred from rDNA sequences: Comparison between molecular and morphological data. International Congress of Protozoology (ICOP XI) Salzburg, Austria, July 18-19, 2001, p.85
Tsuchiya, M., Kitazato, H. and Pawlowski, J., Phylogenetic analysis of Planoglabratella species (Foraminifera) based on the internal transcribed spacers of ribosomal DNA sequences. International Congress of Protozoology (ICOP XI) Salzburg, Austria, July 19, 2001, p.40
1998
Tsuchiya, M., Kitazato, H. and Pawlowski, J., Phylogenetic relationships among three genera within the subfamily Glabratellidae from Japan based on ribosomal DNA sequences. International Symposium on Foraminifera (FORAMS '98) Instituto Tecnologico y de Estudios Superiores de Monterrey, Mexico, July 9, 1998. p.107
1997
Kitazato, H., Tsuchiya, M. and McGann, M., Molecular relationships between Japanese and Californian Trochammina hadai Uchio (agglutinated foraminifer) inferred from nuclear LSU ribosomal DNA. 5th International Workshop on Agglutinated Foraminifera, Plymouth, September 6-11, 1997, p.31
Tsuchiya, M., Kitazato, H. and Pawlowski, J. Phylogenetic relationships among Glabratella spp. (Foraminifera) based on nuclear LSU ribosomal DNA. 10th International Congress of Protozoology (ICOP-X), University of Sydney, Australia, July 24, 1997, p. 202
1994
Pawlowski, J., Bolivar, I., Farhni, J., Zaninetti, L., Kitazato, H. and Tsuchiya, M., Taxonomic revision of Glabratella spp. based on the sequence of LSU rDNA divergent domain D1. International Symposium on Foraminifera (FORAMS '94), University of California, Berkeley, July 6, 1994, p.52
Tsuchiya, M., Aizawa, M., Suzuki-Kanesaki H. and Kitazato, H., Life history of Glabratella opercularis (d'Orbigny): Observations and experiments. International Symposium on Foraminifera (FORAMS '94), University of California, Berkeley, July 6, 1994, p.62
口頭発表など（国内学会等での講演アブストラクト）
2012
力石 嘉人，土屋 正史，アミノ酸の窒素同位体比を用いた生物の栄養段階解析：共生系へのアプローチ．2012年度日本地球化学会年会
高橋幸愛，藤倉克則，三宅裕志，力石嘉人，土屋 正史，渡部 裕美，丸山 正，日本周辺の深海化学合成生態系に生息するシンカイヒバリガイ属とエラウロコムシ亜科の共生について．2012年度日本地球化学会年会
野牧秀隆，力石嘉人，土屋 正史，豊福高志，大河内直彦，北里 洋，浅海生底生有孔虫細胞内での硝酸態窒素利用の酸化/還元環境下での違い（Differing utilization of nitrate nitrogen in shallow-water benthic foraminiferal cells under oxic/anoxic conditions）日本地球惑星科学連合2012年大会，2012年5月 幕張メッセ
土屋 正史, 吉田尊雄, 力石嘉人, 藤原義弘, 梅津裕一, 永堀淳志, 藤倉克則, 大河内直彦，ミノ酸窒素同位体比分析による海洋生態系の栄養段階推定（2）：宿主・共生系の仕組みの解明．日本地球惑星科学連合2012年大会，2012年5月 幕張メッセ
力石嘉人，藤倉克則，土屋 正史，吉田尊雄，藤原義弘，喜多村稔，Dhugal J. Lindsay, 梅津裕一，永堀淳志，篠崎鮎太，小川奈々子，大河内直彦，アミノ酸窒素同位体比分析による海洋生態系の栄養段階推定（１）：光合成生態系と化学合成生態系の構造．日本地球惑星科学連合2012年大会，2012年5月 幕張メッセ
土屋 正史，宮脇省次，力石嘉人，多米晃裕，植松勝之，大河内直彦，岩礁地性底生有孔虫Planoglabratella opercularisの盗葉緑体の獲得機構とその機能．日本地球惑星科学連合2012年大会，2012年5月 幕張メッセ
石谷佳之，石川奏太，神川龍馬，矢吹彬憲，土屋 正史，稲垣祐司，瀧下清貴，放散虫と有孔虫を姉妹群とする「レタリア仮説」に基づいたアクチン，チューブリンおよびペプチド伸長因子の複雑な進化シナリオ.日本地球惑星科学連合2012年大会，2012年5月 幕張メッセ
宮脇省次，土屋 正史，多米晃裕，植松勝之，三宅裕志，丸山 正，岩礁地性底生有孔虫Planoglabratella opercularisの盗葉緑体の維持に光が与える影響．2012 MRC/有孔虫研究集会．2012年3月4日，東北大学
土屋 正史，宮脇省次，野牧秀隆，深海帯におけるゼノフィオフォアの資源利用：有孔虫類の餌の嗜好性は，同所的・生態的種分化を引き起こすのか？2012 MRC/有孔虫研究集会．2012年3月4日，東北大学
梅津裕一，土屋 正史，力石嘉人，高野淑識，佐々木瑶子，宮崎征行，川戸 勝，Florence Pradillon，山本智子，山中寿朗，藤原義弘，ホネクイハナムシ類の栄養摂取方法の検討．ブルーアース2012，2012年2月22日，東京海洋大学品川キャンパス
野牧秀隆，井上健太郎，菅 寿美，豊福高志，土屋 正史，北里 洋，深海底での炭素固定量の現場測定実験．ブルーアース2012，2012年2月22日，東京海洋大学品川キャンパス
2011
石谷佳之，石川奏太，稲垣祐司，土屋 正史，滝下清貴，複数遺伝子解析により得られた放散虫と有孔虫の姉妹関係．第11回放散虫研究集会，2011年10月29日
石谷佳之，石川奏太，稲垣祐司，土屋 正史，滝下清貴，複数遺伝子解析により得られた放散虫と有孔虫の姉妹関係．第5回日本進化原生生物学研究会，2011年6月11日，富山大学
倉沢篤史，土屋 正史，豊福高志，北里 洋，西 弘嗣，浮遊性有孔虫の遺伝的多様性と縁海における遺伝集団の分岐．日本古生物学会2011年年会（金沢大学）、2011年7月2日
更科 功，豊福高志，藤田和彦，土屋 正史，遠藤一佳，北里 洋，石灰質有孔虫の殻内タンパク質の解析（Characterization of the shell matrix proteins of calcareous foraminifera），日本地球惑星科学連合2011年大会、2011年5月26日幕張メッセ
豊福 高志，ド・ノーイエ レナート，野牧 秀隆，土屋 正史，北里 洋，実験室内における低pH環境下での有孔虫細胞内のpH（Foraminiferal cellular pH control under low pH environment in the laboratory），日本地球惑星科学連合2011年大会、2011年5月26日幕張メッセ
倉沢 篤史，土屋 正史，北里 洋，西 弘嗣，太平洋における浮遊性有孔虫の遺伝的多様性と遺伝型の両極分布について（Genetic diversity of planktic foraminifera and the bipolarity of genotypes in the Pacific），日本地球惑星科学連合2011年大会、2011年5月26日幕張メッセ
宮脇省次，土屋 正史，多米晃裕， 植松 勝之，三宅裕志，岩礁地性底生有孔虫Planoglabratella opercularisにみられる盗葉緑体の共生機構の解明（Kleptoplastidy in the benthic foraminifera Planoglabratella opercularis (d'Orbigny)），日本地球惑星科学連合2011年大会、2011年5月26日幕張メッセ
土屋 正史，豊福 高志，植松 勝之，北里 洋，貧酸素環境に生息する底生有孔虫Virgulinella fragilisの細胞内内生生物の共生機構：特に盗葉緑体の獲得機構について（Chloroplast acquisition in Virgulinella fragilis (foraminifera)），日本地球惑星科学連合2011年大会、2011年5月26日幕張メッセ
Lecroq, B., Lejzerowicz, F., Baerlocher, L., Farinelli, L., Osteras, M., Esling, P., Pawlowski, J., Tsuchiya, M., Kitazato, H., Assesment of foraminiferal richness from deep-sea benthos by Illumina massive sequencing technology. MRC2011，2011年3月4日，東北大学
倉沢篤史，土屋 正史，北里 洋，西 弘嗣，南太平洋における浮遊性有孔虫の遺伝的多様性と太平洋における遺伝的交流様式について．MRC2011，2011年3月4日，東北大学
宮脇省次，土屋 正史，多米晃裕，植松勝之，三宅裕志，岩礁地性底生有孔虫Planoglabratella opercularisにみられる盗葉緑体の獲得機構の解明．MRC2011，2011年3月4日，東北大学
土屋 正史，宮脇省次，多米晃裕，植松勝之，三宅裕志，単細胞真核生物の多細胞性：有孔虫細胞の細分化と特殊化．MRC2011，2011年3月4日，東北大学
2010
倉沢篤史・土屋 正史・豊福高志・北里洋・西弘嗣，南太平洋における浮遊性有孔虫の遺伝的多様性．2010年度日本地球化学会年会，2010年9月7日〜9日，立正大学熊谷校舎（9月8日）
（invited）土屋 正史・力石嘉人・大河内直彦・高野淑識・小川奈々子・藤倉克則・吉田尊雄・喜多村稔・Dhugal J. Lindsay・藤原義弘・野牧秀 隆・豊福高志・山本啓之・丸山正・和田英太郎，アミノ酸窒素同位体比に基づく海洋生態系の食物網構造の解析．2010年度日本地球化学会年会，2010年9月7日〜9日，立正大学熊谷校舎（9月7日）．
土屋 正史，古海洋学的な変動に伴う底生有孔虫類の遺伝的分化．第19回生命地球科学セミナー．2010年7月16日，産総研第七事業所 地圏情報棟3階326号室
倉沢篤史，土屋 正史，豊福高志，北里 洋，西 弘嗣，香月興太，池原 実，北西大西洋および南極海における浮遊性有孔虫Globigerina bulloidesの遺伝的多様性と遺伝型の両極分布．日本古生物学会2010年会，筑波大学，6月13日
大河内 直彦, 力石嘉人, 高野淑識, 小川奈々子, 山口康彦, 柏山祐一郎, 内藤裕一, 米田穣, 横山祐典, 土屋 正史，アミノ酸の窒素同位体比を用いた食性解析法について．Naohiko Ohkouchi, Yoshito Chikaraishi, Yoshinori Takano, Nanako O. Ogawa, Yasuhiko Yamaguchi, Yuichiro Kashiyama, Yuichi Naito, Minoru Yoneda, Yusuke Yokoyama, and Masashi Tsuchiya，2010，On the trophic level estimates based on nitrogen isotopic compositions of amino acids．日本地球惑星科学連合2010年大会 2010年5月23日〜28日，幕張メッセ国際会議場
豊福 高志, レナート=ヤン=ド・ノーイエ, 野牧 秀隆, 小栗 一将, 土屋 正史, 北里 洋，石灰質有孔虫細胞内環境と石灰化過程Takashi Toyofuku1, Lennart Jan deNooijer, Hidetaka Nomaki, Kazumasa Oguri, Masashi Tsuchiya, Hiroshi Kitazato, Intracellular environment of carcaleous foraminifera and biomineralization．日本地球惑星科学連合2010年大会，5月25日，幕張メッセ
野牧 秀隆，土屋 正史，上栗 伸一，望月 直，小柳 満佐子，西 弘嗣，長谷川 四郎，北里 洋，MRC研究グループ，房総沖の高精度年代モデル構築と古海洋復元に向けたCK09-03航海報告．第8回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2010年3月17日?3月9日），島根大学，2010年3月18日
土屋 正史，有孔虫の遺伝型の分布と環境への応答様式．第8回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2010年3月17日?3月9日），島根大学，2010年3月18日
柴田 晴佳・三宅 裕志，古島 靖夫・土屋 正史・丸山 正・吉田 尊雄・中村 欽光・本郷 悠貴，Frederic Sinniger・Catalina Aguilar Hurtado・藤井 琢磨，神保 充，多米 晃裕，Beatrice Lecroq，塚原 正俊，前川 拓也，2010，三陸沖深海におけるゴミの分布と生物によるゴミの利用．’10 Blue Earthシンポジウム（2010年3月2日?3月3日），東京海洋大学，3月3日
丸山 正, 土屋 正史, 吉田尊雄, 中村欽光, 本郷悠貴, 多米晃裕, 三宅裕志, 神保 充, 柴田晴香, Beatrice Lecroq, Cathalina Aguilar Hurtado, Frederic Sinniger, 藤井琢磨，2010，シロウリガイ類共生細菌のゲノム縮小進化研究のためのナギナタシロウリガイおよび深海性大型軟質殻有孔虫Xenophyophore sp.の日本海溝における採集―YK09-12航海概要報告―．’10 Blue Earthシンポジウム（2010年3月2日?3月3日），東京海洋大学，3月3日
土屋 正史，Beatrice Lecroq・Jan Pawlowski，Andrew J. Gooday，北里 洋，2010，北西太平洋深海底における有孔虫ゼノフィオフォアの分布と遺伝的多様性．’10 Blue Earthシンポジウム（2010年3月2日?3月3日），東京海洋大学，3月3日
2009
堀 沙耶香，土屋 正史，西 真郎，荒井 渉，吉田 尊雄，高見 英人，2009，伊豆小笠原海溝深海底（深度7111m）に棲む巨大有孔虫「ゼノフィオフォア」による、アルファプロテオバクテリアの不活化およびガンマプロテオバクテリアの活性化．第32回日本分子生物学会年会（2009年12月9日〜12日，パシフィコ横浜11日）
Masashi Tsuchiya，2009，Molecular characterization of benthic foraminifers．日仏二国間交流事業「Radiolarian Biology based on Paleoceanography Workshop」@九州大学（2009年11月12日〜11月14日，13日発表）
倉沢 篤史，土屋 正史，豊福 高志，北里 洋，西 弘嗣，2009，北西太平洋における浮遊性有孔虫Globigerina bulloidesの遺伝的多様性と太平洋?大西洋間の遺伝的交流について．日本古生物学会2009年年会（2009年6月26日?6月28日），千葉大学（2009年6月27日）
豊福 高志，de Nooijer Lennart，野牧 秀隆，土屋 正史，北里 洋，Internal environmental control within Foraminifera through calcification，地球惑星科学連合大会，幕張メッセ（2009年5月）．
山本 啓之，北里 洋，豊福 高志，野牧 秀隆，小川 奈々子，植松 勝之，小栗 一将，土屋 正史，2009，原始的な単細胞真核生物Gromiaの生態・共生・進化，地球惑星科学連合大会，幕張メッセ（2009年5月19日）．
堀 沙耶香，土屋 正史，荒井 渉，中嶋 潤，高見 英人，2009，RNA および DNA から見た房総沖深海底（深度7111m）に棲む底生有孔虫 Xenophyophore をとりまく微生物群集の多様性解析．第３回日本ゲノム微生物学会年会，中央大学後楽園キャンパス，2009年3月5日?7日
豊福 高志，野牧 秀隆，小栗 一将，土屋 正史，倉沢 篤史，Lennart Jan de Nooijer，Ralf Sciebel，北里 洋，2009，環境自律制御システムを用いた有孔虫飼育実験．第7回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2009年3月2日?3月4日），国立科学博物館新宿分館，2009年3月3日
大河原 にい菜，A.J. Gooday，土屋 正史，北里 洋，2009，赤道太平洋に生息する底生有孔虫の群集構造と分布．第7回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2009年3月2日?3月4日），国立科学博物館新宿分館，2009年3月3日
土屋 正史，2009，深海底生生物群集における有孔虫ゼノフィオフォアの生態的な役割と有孔虫初期進化の解明．第7回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2009年3月2日?3月4日），国立科学博物館新宿分館，2009年3月3日
土屋 正史，Guido W. Grimm，Petra Heinz，Karin Stogerer，Kemal Topac Ertan，John Collen，Volker Bruchert，Christoph Hemleben，Vera Hemleben，北里 洋，2009，貧酸素海域に不連続に分布する底生有孔虫Virgulinella fragilisの遺伝的特徴．日本古生物学会第158回例会，琉球大学／沖縄県立博物館美術館，2009年1月29日
2008
土屋 正史，貧酸素海域に不連続に分布する底生有孔虫の遺伝的特徴，つくば藻類・プロティストフォーラム，筑波大学，2008年10月27日
大河原 にい菜・Gooday, A. J.・土屋 正史・北里 洋，中部赤道太平洋深海底に生息する底生有孔虫群集の種多様性と分布様式，日本プランクトン・ベントス学会合同大会，熊本県立大学，2008年9月4日?7日
小栗 一将・豊福 高志・de Nooijer, Lennart・野牧秀隆・土屋 正史・北里 洋，分子イメージング日独共同セミナー，東北大学工学部，08年9月
Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Kitazato, H., Survival strategy of foraminifers in dysoxic environment: distributional characteristics of virgulinella in the past and present ocean, and cytological and genetical characterization of V. fragilis. International Geological Congress ’08
倉沢篤史・土屋 正史・豊福高志・西 弘嗣・北里 洋，水塊の境界における遺伝集団の分布：北西太平洋における浮遊性有孔虫Globigerina bulloidesの遺伝的多様性（Distiribution of genetic populations at water mass boundary: genetic diversity of Planktonic foraminifera Globigerina bulloides in the Northwest Pacific）．2008年日本古生物学会年会（東北大学）．2008年7月4日?7月6日
豊福高志・Lennart de Nooijer・野牧秀隆・小栗一将・土屋 正史・北里 洋，環境制御下における有孔虫細胞内のpH，Ca計測と石灰化プロセスの推定．東京大学海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化―遺伝子から地球環境まで―」，（2008年6月19日）東京大学海洋研究所
黒柳あずみ・土屋 正史・川幡穂高・北里 洋，浮遊性有孔虫の熱帯種Globigerinoides ruberの２形態型における分子系統解析と古環境復元への応用．東京大学海洋研究所共同利用研究集会「バイオミネラリゼーションと石灰化―遺伝子から地球環境まで―」，（2008年6月19日）東京大学海洋研究所
大河原にい菜・土屋 正史・北里 洋，赤道太平洋深海底に生息する底生有孔虫群集の解析．地球惑星科学連合大会（2008年5月27日），幕張メッセ．Okawara, N., Tsuchiya, M., Kitazato, H., Majima, R., Benthic foraminifera fauna at an abyssal site in the equatorial Pacific. 地球惑星科学連合大会
倉沢篤史・土屋 正史・豊福高志・北里 洋・西 弘嗣，浮遊性有孔虫Globigerina bulloidesの北西太平洋における遺伝的多様性．地球惑星科学連合大会（2008年5月27日），幕張メッセ．Kurasawa, A., Tsuchiya, M., Toyofuku, T., Kitazato, H., Nishi, H., Genetic diversity of planktonic foraminifer Globigerina bulloides in the Northwest Pacific．地球惑星科学連合大会
土屋 正史・大村亜希子・飯島耕一・布浦拓郎・高木善弘・島村 繁・眞砂英樹・青池 寛・井町寛之・稲垣史生・高井 研・坂本竜彦・窪川かおる・北里 洋、ちきゅうCK05-04 Leg.2およびCK06-06で採取された下北沖堆積物柱状試料の化石DNA解析．地球惑星科学連合大会（2008年5月27日），幕張メッセ．Tsuchiya, M., Omura, A., Iijima, K., Nunoura, T., Takaki, Y., Shimamura, S., Masago, H., Aoike, K., Imachi, H., Inagaki, F., Takai, K., Sakamoto, T., Kubokawa, K., Kitazato, H., Search for ancient DNA in sediments collected off Shimokita during the CK05-04 Leg.2 and CK06-06 cruises
Dhugal J. Lindsay・James D. Reimer・森 美由貴・阿部なつ江・土屋 正史・三宅裕志・Jan Pawlowski・Frederic Sinniger・高橋亜夕・北田 貢・藤井琢磨・伊礼由佳・城間枝里子・岡田 聡，「しんかい6500」を用いた日本海溝ゼラチン質生物調査：YK07-15航海の概要と成果．’08 Blue Earthシンポジウム（2008年3月13日?3月14日），横浜市立大学，3月13日
小栗一将・北里 洋・野牧秀隆・土屋 正史・菅 寿美・大村亜希子・Ralf Schiebel、下北沖表層堆積物の酸素濃度分布と底生生物群集について．’08 Blue Earthシンポジウム（2008年3月13日?3月14日），横浜市立大学，3月14日
倉沢篤史・土屋 正史・豊福高志・西 弘嗣・北里 洋・Kate Darling、北太平洋高緯度海域における浮遊性有孔虫Globigerina bulloidesの遺伝的多様性について：MR06-03，MR06-04及びYK07-12で採取された試料の解析結果．’08 Blue Earthシンポジウム（2008年3月13日?3月14日），横浜市立大学，3月14日
土屋 正史・野牧秀隆・小栗一将・北里 洋、相模湾における“soft-shelled”底生有孔虫群集を中心とした原生生物群集に関する研究．’08 Blue Earthシンポジウム（2008年3月13日?3月14日），横浜市立大学，3月13日
倉沢篤史・土屋 正史・豊福高志・北里 洋・西 弘嗣：北太平洋亜寒帯循環における浮遊性有孔虫Globigerina bulloidesの遺伝的集団について．第6回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2008年3月1日?3月4日），北海道大学理学部，2008年3月3日
大河原にい菜・A.J. Gooday・土屋 正史・北里 洋：中部赤道太平洋に生息する深海生底生有孔虫の群集解析．第6回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2008年3月1日?3月4日），北海道大学理学部，2008年3月3日
土屋 正史・豊福高志・John Collen・山本啓之・北里 洋、底生有孔虫Virgulinella fragilisとその細胞内内生生物との関係に注目した貧酸素環境における底生有孔虫類の生存戦略：過去の貧酸素環境が生物進化に与える影響．第6回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2008年3月1日?3月4日），北海道大学理学部，2008年3月3日
土屋 正史・大村亜希子・窪川かおる・北里 洋、深海掘削船「ちきゅう」で採取された下北沖堆積物柱状試料の化石DNA解析．第6回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2008年3月1日?3月4日），北海道大学理学部，2008年3月3日
土屋 正史、浮遊性有孔虫の分子系統解析からみた両極性分布の成立過程．日本古生物学会第157回例会シンポジウム（栃木県宇都宮市，宇都宮大学・栃木県立博物館），2008年2月1日
小栗一将・野牧秀隆・豊福高志・土屋 正史・菅 寿美・Ronnie Glud・Frank Wenzhoefer・Henrik Staahl・北里 洋、堆積物?水境界における酸素濃度分布イメージからみた海底環境：古海洋学と現行堆積学の接点をさぐる．古海洋シンポジウム（東京大学海洋研究所），2008年1月
2007
坂口美亜子，稲垣祐司，瀧下清貴，土屋 正史，橋本哲男，真核生物におけるEF1α-like（EFL）遺伝子の分布と関係性について．日本藻類学会第31回大会（神戸大学）2007年3月23日?3月25日
眞砂英樹，飯島耕一，青池 寛，土屋 正史，CK05?04?2及びCK06?06航海で採取された下北沖テフラの岩石学的記載，2007年地質学会
倉沢篤史・土屋 正史・豊福高志・北里 洋・西 弘嗣，北太平洋西部における浮遊性有孔虫Globigerina bulloides d’Orbignyの遺伝的多様性及び形態・環境との関連について．日本古生物学会2007年年会（大阪府大阪市，大阪市立大学杉本キャンパス），2007年6月30日?7月1日，p. 23
坂口美亜子・稲垣祐司・瀧下清貴・土屋 正史・牧内貴志・橋本哲男，真核生物におけるEF-like（EFL）遺伝子の分布と進化．第3回日本進化原生生物学研究会（独立行政法人海洋研究開発機構 横浜研究所），２００７年7月7日（土）?8日（日）
黒柳あずみ・土屋 正史・川幡穂高・北里 洋，浮遊性有孔虫Globigerinoides ruberに見られる２形態型の分子系統解析と古海洋復元への応用（Molecular phylogenetic analysis of the two morphotypes of planktonic foraminifer Globigerinoides ruber and implications for reconstruction of paleo-environment．ブルーアース’06（パシフィコ横浜 会議センター5Ｆ），2007年3月8日（木）?9日（金）
大河原にい菜・Gooday, A. J. ・土屋 正史・北里 洋，中部赤道太平洋の深海底に生息する底生有孔虫群集．第５回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2007年3月1日?3月3日），北海道大学理学部，2007年3月2日
倉沢 篤・土屋 正史・豊福高志・北里 洋・西 弘嗣，北太平洋西部に置ける浮遊性有孔虫Globigerina bulloides d’Orbignyの遺伝的多様性及び形態・環境との関連について．第５回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2007年3月1日?3月3日），北海道大学理学部，2007年3月1日
土屋 正史・北里 洋，有孔虫類の分子系統解析において遺伝的なクラスターが持つ生態学的な意味．第５回有孔虫研究会/MRC研究発表会（2007年3月1日?3月3日），北海道大学理学部，2007年3月1日
黒柳あずみ・土屋 正史・川幡穂高・北里 洋，太平洋亜熱帯・熱帯域の浮遊性有孔虫Globigerinoides ruberの２形態における分子系統解析と古環境推定への応用（Molecular phylogenetic analysis of the two morphotypes of planktonic foraminifer Globigerinoides ruber in the subtropical-tropical Pacific and paleo-environmental implications）．第156回日本古生物学会例会（徳島県立博物館）2007年2月3日
2006
青池 寛・眞砂英樹・土屋 正史・飯島耕一・杉原孝充・藤根和穂・CK05-04 Leg2 乗船者一同，地球深部探査船「ちきゅう」よる初掘削コア：CK05-04 Leg 2 下北半島東方沖HPCS掘削結果速報（The first cores by D/V Chikyu -Preliminary results of CK05-04 Leg 2, HPCS coring in off-Shimokita）．日本地球惑星科学連合2006年大会（幕張メッセ国際会議場），2006年5月14日，J161-P008
2005
土屋 正史・瀧下清貴・豊福高志・小栗一将・山本啓之・北里 洋，細胞内生生物との関係に注目した貧酸素環境における底生有孔虫Virgulinella fragilisの生存戦略： 過去の嫌気環境が有孔虫進化に与える影響．日本古生物学会2005年年会（東京都文京区，東京大学本郷キャンパス），2005年7月2日，p. 38
2003
土屋 正史 (2003) DNA解析から見た有孔虫．第2回地球システム・地球進化ニューイヤースクール．産業技術総合研究所 (2003.1.7)
2002
土屋 正史・黒柳あずみ・北里 洋・川幡穂高・豊福高志，核内小サブユニットリボソームDNA塩基配列に基づく浮遊性有孔虫類の分子系統学的解析．日本古生物学会2002年年会（福井県勝山市，福井県立恐竜博物館），2002年6月22日，p. 41
2001
土屋 正史・北里 洋，底生有孔虫の分子生物地理：岩礁地性底生有孔虫Planoglabratella opercularisを例として．日本古生物学会2001年年会年会ミレニアムシンポジウム（代々木オリンピックセンター），2001年6月30日，p. 71
2000
北里 洋・土屋 正史，太平洋の東西に分布する内湾生有孔虫Trochammina hadai Uchioはどのようにして拡がったのか？日本地質学会第107年学術大会講演要旨, 2000年，p.23-23
土屋 正史・北里 洋，分子マーカーに基づく系統関係と形態・生態との比較：岩礁地性底生有孔虫Glabratellidaeを例として．日本古生物学会2000年年会（早稲田大学），2000年1月30日，p.129
1999
北里 洋・土屋 正史，形態と分子からみた有孔虫の種．日本プランクトン学会，1999年度春季シンポジウム「プランクトンの分類-形態と分子系統から」東京水産大学，1999年3月31日，p. 301
土屋 正史・北里 洋，伊豆半島の衝突にともなう底生有孔虫類の分布の不連続性と遺伝的多様性．東京大学海洋研究所共同利用シンポジウム「分子海洋学-分子生態学と海洋学の接点」東京大学海洋研究所，1999年3月3日，p. 28
鈴木真琴・土屋 正史・北里 洋，LSU rDNA sequenceに基づく底生有孔虫Ammonia beccariiの変異と系統．日本古生物学会1999年年会（東北大学），1999年1月31日，p. 119
田爪正敏・土屋 正史・北里 洋，SSU rDNAに基づく底生有孔虫Bulimina属及び近縁種の分子系統学的解析．日本古生物学会1999年年会（東北大学），1999年1月31日，p. 117
土屋 正史・北里 洋，DNA塩基配列を用いた岩礁地生底生有孔虫Planoglabratella属の系統関係．日本古生物学会1999年年会（東北大学），1999年1月31日，p. 118
1998
Kitazato, H., M. Tsuchiya, and M. McGann、Molecular relationships between Japanese and Californian Trochammina hadai Uchio (agglutinated foraminifer) inferred from nuclear LSU ribosomal DNA.日本古生物学会1998年年会（神奈川県立生命の星・地球博物館），1998年2月1日，p. 109
1997
土屋 正史・北里 洋，LSU ribosomal DNA sequenceに基づくGlabratella opercularisの種内変異．日本古生物学会1997年年会（京都大学），1997年2月1日，p. 141
1996
北里 洋・松下 訓・小汐真由美・土屋 正史・那須健一・豊福高志，有孔虫の殻形態が持つ意味ー飼育実験が示唆することー．日本古生物学会1996年年会（大阪市立大学），1996年1月28日，p. 111
土屋 正史・千葉 聡・吉永光一・北里 洋・ J. Pawlowski，Ribosomal DNAによる有孔虫Glabratella属の系統関係．日本古生物学会1996年年会（大阪市立大学），1996年1月28日，p. 112
1995
土屋 正史・相澤 睦・金崎仁美・北里 洋，Glabratella opercularis (d'Orbigny) の生活史：観測と実験．日本古生物学会第144回例会（横須賀市自然博物館），1995年6月25日，p. 70