植物プランクトン色素データ
K2、S1点におけるCTD観測時のニスキンボトルから得られた植物プランクトン色素に関連する採水分析データ(クロロフィルa濃度、サイズ分画による植物プランクトン色素濃度(>10µm, 3-10µm, 1-3µm,<1µmの計4分画)、HPLCによる補助色素濃度)について掲載しています。データは各クルーズで1つのexcelファイルにまとめてあります。
利用できる航海IDと観測期間
分析方法に関して
ターナー蛍光光度計(model 10-AU; Turner Designs Inc.)を用いた蛍光法によるchlorophyll a 測定を酸添加法 (Holm-Hansen et al., 1965) と非酸添加法 (Welschmeyer, 1994)によって実施している。また植物プランクトン色素の測定は高速液体クロマトグラフィー(HPLC; Waters Corp. or Agilent Technologies, Inc.)によっても実施している。
蛍光法では、0.15—0.5 Lの海水サンプルを直径25 mmのワットマンGF/Fフィルターを用いてろ過した。ろ過したフィルターは直ちにN,N-dimethylformamide (DMF) に浸漬し、-20 °Cの暗所に24時間以上保管して抽出を行った後 (Suzuki and Ishimaru, 1990)、船上にて航海中に測定した。蛍光法によるサイズ分画測定を非酸添加法で実施し、1Lの海水サンプルを多段ろ過にて孔径10 µm、3 µm、1 µmのポリカーボネートフィルター(直径47 mm)とGF/Fフィルター(直径25 mm)に順に通して行った。HPLC測定では、2—5 Lの海水サンプルを直径25 mmのワットマンGF/Fフィルターでろ過して水分を除去した後 (Furuya et al., 1998)、蛍光法と同様にDMFで抽出して、C8カラムを用いたZapata et al., (2000)の手法に基づいて測定した。蛍光法の装置仕様を表1に示す。
蛍光光度計はスタンダードchlorophyll a (Anacystis nidulans, Sigma Chemical Co.) を用いて校正した。HPLC測定は次のスタンダード色素を用いて校正した (chlorophyll a, chlorophyll b, chlorophyll c2, chlorophyll c3, divinyl chlorophyll a, pheophytin a, chlorophyllide a, pheophorbide a, [3,8-Divinyl]-protochlorophyllide, peridinin, fucoxanthin, 19'-butanoyloxyfucoxanthin, 19'-hexanoyloxyfucoxanthin, neoxanthin, prasinoxanthin, violaxanthin, diadinoxanthin, antheraxanthin, alloxanthin, diatoxanthin, zeaxanthin, lutein, crocoxanthin, ß,ɛ-carotene, ß,ß-carotene; Sigma Chemical Co., DHI Co. and WAKO Ltd.)。zeaxanthin とluteinおよびneoxanthin とviolaxanthinは保持時間が近く、クロマトグラムで両者を明確に分離することができなかった。
Non-acidification method | Acidification method | |
---|---|---|
Excitation filter (nm) | 436 | 340-500 |
Emission filter (nm) | 680 | >665 |
Lamp | Blue Mercury Vapor | Daylight White |
データに関して
Column Heading Mnemonic | Units Mnemonic | Comments |
---|---|---|
CRUISE | Cruise code | |
STNNBR | Station number | |
CASTNO | Cast number | |
SAMPNO | Sample number | |
DATE | UTC | Cast date |
TIME | UTC | Cast time |
LATITUDE | DEG | Latitude |
LONGITUDE | DEG | Longitude |
BTLNBR | Niskin bottle number | |
CTDPRS | dbar | Pressure |
CTDDPT | m | Depth |
CHLORA | µg/L | Chlorophyll a (acidification method) |
1CHLORA | µg/L | Chlorophyll a (acidification method): replicate |
CHLWELSH | µg/L | Chlorophyll a (non-acidification method) |
1CHLWEL | µg/L | Chlorophyll a (non-acidification method): replicate |
>10_SIZE | µg/L | Size-fractionated chlorophyll a (non-acidification method): >10µm |
3-10_SIZE | µg/L | Size-fractionated chlorophyll a (non-acidification method): 3-10µm |
1-3_SIZE | µg/L | Size-fractionated chlorophyll a (non-acidification method): 1-3µm |
<1_SIZE | µg/L | Size-fractionated chlorophyll a (non-acidification method): <1µm |
CHLAHPLC | µg/L | Chlorophyll a (HPLC) |
CHLC3 | µg/L | Chlorophyll c3 (HPLC) |
CHLIDEA | µg/L | Chlorophyllide a (HPLC) |
MGDVP | µg/L | [3,8-Divinyl]-Protochlorophyllide (HPLC) |
CHLC2 | µg/L | Chlorophyll c2 (HPLC) |
PERID | µg/L | Peridinin (HPLC) |
PHIDEA | µg/L | Pheophorbide a (HPLC) |
BUTFUCO | µg/L | 19'-butanoyloxyfucoxanthin (HPLC) |
FUCO | µg/L | Fucoxanthin (HPLC) |
NEO | µg/L | Neoxanthin (HPLC) |
PRAS | µg/L | Prasinoxanthin (HPLC) |
HEXFUCO | µg/L | 19'-hexanoyloxyfucoxanthin (HPLC) |
VIOLA | µg/L | Violaxanthin (HPLC) |
DIADINO | µg/L | Diadinoxanthin (HPLC) |
DINO | µg/L | Dinoxanthin (HPLC) |
ANTH | µg/L | Antheraxanthin (HPLC) |
ALLO | µg/L | Alloxanthin (HPLC) |
DIATO | µg/L | Diatoxanthin (HPLC) |
ZEA | µg/L | Zeaxanthin (HPLC) |
LUT | µg/L | Lutein (HPLC) |
CROCO | µg/L | Crocoxanthin (HPLC) |
CHLB | µg/L | Chlorophyll b (HPLC) |
DCHLA | µg/L | Divinyl chlorophyll a (HPLC) |
PHYTINA | µg/L | Pheophytin a (HPLC) |
ALPHAC | µg/L | ß,ɛ-carotene (HPLC) |
BETAC | µg/L | ß,ß-carotene (HPLC) |
***_FLAG | Quality flags for pigment data |
2 = Acceptable measurement.
3 = Questionable measurement.
4 = Bad measurement.
9 = Sample not drawn for this measurement from this bottle.
参考文献
Holm-Hansen, O., Lorenzen, C.J., Holmes, R.W., strickland, J.D.H., 1965. Fluorometric determination of chlorophyll. J. Cons. Cons. Int. Explor. Mer. 30, 3-15.
Welschmeyer, N.A., 1994. Fluorometric analysis of chlorophyll a in the presence of chlorophyll b and pheopigments. Limnol. Oceanogr. 39, 1985-1992.
Zapata, M., Rodríguez, F., Garrido, J.L., 2000. Separation of chlorophylls and carotenoids from marine phytoplankton: a new HPLC method using a reversed phase C8 column and pyridine-containing mobile phases. Mar. Ecol. Prog. Ser. 195:29-45.
Suzuki, R., Ishimaru, T., 1990. An improved method for the determination of phytoplankton chlorophyll using N, N-dimethylformamide. J. Oceanogr. 46, 190-194.
Furuya, K., Hayashi, M., Yabushita, Y., 1998. HPLC determination of phytoplankton pigments using N,N-dimethylformamide. J. Oceanogr. 54 (2), 199-203.