Researcher Information
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Research History
- Apr. 2023 - Present
Japan agency for Marine-Earth Science and Technology (JAMSTEC), Research Center for Bioscience and Nanoscience (CeBN), Researcher - Apr. 2022 - Mar. 2023
Japan agency for Marine-Earth Science and Technology (JAMSTEC), Research Center for Bioscience and Nanoscience (CeBN), Project researcher - Apr. 2018 - Mar. 2022
Japan agency for Marine-Earth Science and Technology (JAMSTEC), R&D Center for Marine Biosciences, JSPS Research Fellow (PD) - Apr. 2015 - Mar. 2018
The University of Tokyo, Graduate school of Agricultural and Life sciences, JSPS Research Fellow (DC1)
Education
- Apr. 2015 - Mar. 2018, The University of Tokyo, Graduate school of Agricultural and Life sciences, Department of Biomaterial Sciences
- Apr. 2013 - Mar. 2015, The University of Tokyo, Graduate school of Agricultural and Life sciences, Department of Biomaterial Sciences
- Apr. 2009 - Mar. 2013, The University of Tokyo, Faculty of Agriculture, Applied Life Science Cours
Research activity information
Papers
- Mikako TACHIOKA; Ikuo TANIGUCHI; Tsuyoshi KOGA; Shigeru DEGUCHI
(8) Deep-Sea-Inspired Chemistry: Materials Innovation from Deep-Sea Extreme Environment
Journal of The Adhesion Society of Japan, Mar. 2026
62, 2, 42, 50
[Reviewed], [Invited]
Lead - Mikako TACHIOKA; Shigeru DEGUCHI
Deep-Sea-Inspired Chemistry: Harnessing Extreme Environments for Sustainable Innovation
The Review of High Pressure Science and Technology, 01 Mar. 2026
36, 1, 44, 52
[Reviewed], [Invited]
Lead - Mikako Tachioka; Masayuki Miyazaki; Mikiko Tsudome; Miwako Tsuda; Kohsuke Uchimura; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
Marinicellulosiphila megalodicopiae gen. nov., sp. nov., a deep-sea alkaliphilic cellulolytic bacterium isolated from an endemic ascidian Megalodicopia hians
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 02 Apr. 2025
75, 4
[Reviewed]
Lead - Mikako Tachioka; Mikiko Tsudome; Miwako Tsuda; Satoshi Hiraoka; Masayuki Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
Characteristics of deep-sea microbial cellulases: key determinants of the ultimate fate of plant biomass on Earth
Journal of Wood Science, 14 Nov. 2024
70, 1
[Reviewed]
Lead - 立岡 美夏子; 山口 空; 出口 茂; 鮫島 正浩; 五十嵐 圭日子
Catalytic Mechanism of GH6 Cellulases Revealed by Visualization of Hydrogen Atoms Through Neutron Crystallography
日本応用糖質科学会誌, 20 May 2024
14, 2, 103, 109
[Reviewed]
Lead - Mikiko Tsudome; Mikako Tachioka; Masayuki Miyazaki; Miwako Tsuda; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
Marinagarivorans cellulosilyticus sp. nov., a cellulolytic bacterium isolated from the deep-sea off Noma-misaki, Japan
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 02 Mar. 2023
73, 3
[Reviewed] - Mikako Tachioka; Mikiko Tsudome; Shigeru Deguchi
Protocol for analyzing enzymatic hydrolysis of cellulose using surface pitting observation technology
STAR Protocols, Mar. 2023
4, 1, 102066, 102066
[Reviewed], [Invited]
Lead - Mikiko Tsudome; Mikako Tachioka; Masayuki Miyazaki; Kohsuke Uchimura; Miwako Tsuda; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
An ultrasensitive nanofiber-based assay for enzymatic hydrolysis and deep-sea microbial degradation of cellulose
iScience, Jul. 2022
25, 8, 104732, 104732
[Reviewed] - Sora Yamaguchi; Naoki Sunagawa; Kaori Matsuyama; Mikako Tachioka; Erika Hirota; Sachiko Takahashi; Kiyohiko Igarashi
Preparation of Large-Volume Crystal of Cellulase Under Microgravity to Investigate the Mechanism of Thermal Stabilization
International Journal of Microgravity Science and Application, 2021
38, 1, 380103-1, 380103-12
[Reviewed] - Sora Yamaguchi; Naoki Sunagawa; Mikako Tachioka; Kiyohiko Igarashi; Masahiro Samejima
Thermostable Mutants of Glycoside Hydrolase Family 6 Cellobiohydrolase from the Basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
Journal of Applied Glycoscience, 03 Sep. 2020
67, 3, 79, 86
[Reviewed] - Kiyohiko Igarashi; Mikako Tachioka
Importance of tautomerization in proteins clarified by neutron crystallography of cellulases
Journal of Japanese Society for Synchrotron Radiation Research, Mar. 2019
32, 2, 59
[Reviewed], [Invited] - Mikako Tachioka; Akihiko Nakamura; Takuya Ishida; Kiyohiko Igarashi; Masahiro Samejima
Crystal structure of a family 6 cellobiohydrolase from the basidiomycete Phanerochaete chrysosporium
ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, Jul. 2017
73, Pt 7, 398, 403
[Reviewed]
Lead - Mikako Tachioka; Akihiko Nakamura; Takuya Ishida; Sachioko Takahashi; YAN Bin; Hiroaki Tanaka; Naoki Furubayashi; Kouji Inaka; Kiyohiko Igarashi; Masahiro Samejima
Production of Large-volume Cellulase Crystals for Visualization of Hydrogen Atoms
International Journal of Microgravity Science and Application, 2017
34, 1, 340108
[Reviewed], [Invited]
Lead - Mikako Tachioka; Naohisa Sugimoto; Akihiko Nakamura; Naoki Sunagawa; Takuya Ishida; Taku Uchiyama; Kiyohiko Igarashi; Masahiro Samejima
Development of simple random mutagenesis protocol for the protein expression system in Pichia pastoris
BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, Sep. 2016
9, 199
[Reviewed]
Lead
Misc.
- 磯部 紀之; 立岡 美夏子; 佐川 直也; 津留 美紀子; 出口 茂
研究所紹介 国立研究開発法人 海洋研究開発機構 研究部門紹介—Introduction of Institutes : Japan Agency for Marine-Earth Science and Technology, JAMSTEC
Cellulose communications, 2019
26, 3, 130, 132
Books and Other Publications
- 伊藤, 政博; 鳴海, 一成; 道久, 則之, Contributor, 深海由来微生物のセルロース分解酵素の機能解析
極限環境微生物の先端科学と社会実装最前線
エヌ・ティー・エス, Dec. 2023
9784860438487
Presentations
- 立岡美夏子; 津留美紀子; 出口茂
深海におけるセルロース分解:有機物の終着点で働く新奇セルラーゼの発見
日本農芸化学会2026年度大会, Mar. 2026, [Invited] - 立岡美夏子; 津留美紀子; 出口茂
貧栄養下の深海細菌の巧妙なセルロース利用戦略
第38回日本微生物生態学会, Sep. 2025, [Invited] - 山口空; 砂川直輝; 立岡美夏子; 五十嵐圭日子
GH6セロビオヒドロラーゼ変異体の活性-構造相関による触媒機構の解明
応用糖質科学, 2023 - 立岡 美夏子; 津留美紀子; 出口茂
分離培養とゲノム解析から明らかになる深海セルロース分解菌の新奇性
「細胞を創る」研究会 15.0, Oct. 2022, [Invited] - 山口空; 砂川直輝; 松山佳織; 古久保美樹; 五十嵐圭日子; 立岡美夏子; 田仲広明; 高橋幸子; 広田恵理華
Preparation of large-volume crystal of Cel6 CBH from the basidiomycete Phanerochaete chryososporium in space to investigate the mechanism of thermal stabilization
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2021 - 山口空; 砂川直輝; 松山佳織; 鮫島正浩; 五十嵐圭日子; 立岡美夏子; 石田卓也
担子菌Phanerochaete chrysosporium由来のセロビオヒドロラーゼCel6Aのフリーシステイン置換による熱安定化
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2020 - 山口空; 砂川直輝; 松山佳織; 立岡美夏子; 田仲広明; 高橋幸子; 広田恵理華; 五十嵐圭日子
糸状菌Phanerochaete chrysosporium由来Cel6Aの熱安定化機構解明に向けた宇宙空間での大型結晶化
応用糖質科学, 2020 - 高感度セルロースゲルスクリーニングによる深海由来セルラーゼの探索
第68回日本応用糖質科学会, Sep. 2019 - 立岡美夏子; 津留美紀子; 磯部紀之; 高木善弘; 出口茂
深海からのセルロース分解菌の分離
第26回セルロース学会, Jul. 2019 - 立岡美夏子; 津留美紀子; 磯部紀之; 高木善弘; 出口茂
ナノファイバーセルロースを用いた深海由来セルロース分解菌の探索
第69回日本木材学会大会, Mar. 2019 - 山口空; 砂川直輝; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩; 立岡美夏子
Phanerochaete chrysosporium由来セロビオヒドロラーゼCel6Aの熱安定性の向上を目的としたアミノ酸置換変異体の作製
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2019 - 山口空; 砂川直輝; 立岡美夏子; 立岡美夏子; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
糸状菌Phanerochaete chrysosporium由来Cel6Aの耐熱化機構
応用糖質科学, 2019 - 立岡 美夏子
深海からのセルロース分解菌の単離とドラフトゲノムの解析
第67回日本応用糖質科学会, Sep. 2018 - 立岡 美夏子
高分解能 X 線結晶構造解析による担子菌由来セロビオヒドロラーゼの加水分解機構の検討
第68回日本木材学会大会, Mar. 2018 - 立岡美夏子; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
高分解能X線結晶構造解析による担子菌由来セロビオヒドロラーゼの加水分解機構の検討
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2018 - 立岡 美夏子
Phanerochaete chrysosporium由来セロビオヒドロラーゼIIの中性子結晶構造解析
第66回日本応用糖質科学会, Sep. 2017 - 立岡 美夏子
Sub-Atomic Resolution X-Ray and Neutron Structure Analysis of the GH Family 6 Cellobiohydrolase
Gordon Research Conference, Jul. 2017 - 立岡美夏子; 石田卓也; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
担子菌由来セルラーゼの微小重力下での結晶化と高分解能X線構造解析
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2017 - 立岡美夏子; 五十嵐圭日子; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
糸状菌由来セロビオヒドロラーゼII(Cel6A)の高分解能X線結晶構造解析と中性子結晶構造解析
KEK Progress Report (Web), 2017 - 立岡美夏子; 石田卓也; 内山拓; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
担子菌Phanerochaete chrysosporium由来セロビオヒドロラーゼPcCel6Aの構造と機能の解析
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2016 - 立岡美夏子; 杉本直久; 中村彰彦; 内山拓; 石田卓也; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
P-27 Development of Random Mutagenesis and Screening Methods for Functional Modification of Cellulases
バイオマス科学会議発表論文集(Web), 2016 - 立岡 美夏子
Crystallization of GH6 cellobiohydrolase in microgravity and structure determination at 0.80 Å resolution
Gordon Research Seminar, Aug. 2015 - 立岡 美夏子
Effects of manganese ions and plasmid concentration in Phi29 polymerase-based random mutagenesis
International Symposium on Wood Science and Technology, Mar. 2015 - 立岡 美夏子
ランダム変異導入法を用いた担子菌Phanerochaete chrysosporium由来セロビオヒドロラーゼの改変
第65回日本木材学会大会, Mar. 2015 - 立岡 美夏子
Random mutagenesis of Phanerochaete chrysosporium cellobiohydrolase II (Cel6A) in Pichia pastoris expression system
Mie Bioforum 2014, Dec. 2014 - 立岡美夏子; 杉本直久; 五十嵐圭日子; 鮫島正浩
Pichia pastoris異宿主発現系とφ29DNAポリメラーゼを用いた糸状菌由来セルラーゼの進化工学的改変
日本木材学会大会研究発表要旨集(完全版)(CD-ROM), 2014 - 立岡 美夏子
糸状菌由来セルラーゼの進化工学的改変を目指したPichia pastoris異宿主発現系へのランダム変異導入
第63回日本木材学会大会, Mar. 2013