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Papers
- Yi Zhang; Chieko Ishiwata; Noriko Kudo; Shigeru Shimamura; Kanako Kurosawa; Daisuke Nishiura; Taichi Yokokawa
Ultrasensitive quantification and comprehensive evaluation of nicking endonuclease efficiency.
Analytical biochemistry, 14 Mar. 2026
116114, 116114 - Satoshi Nakagawa; Hirokazu Yagi; Tomoki Suyama; Shigeru Shimamura; Saeko Yanaka; Maho Yagi-Utsumi; Shingo Kato; Moriya Ohkuma; Koichi Kato; Ken Takai
Exploring protein N-glycosylation in ammonia-oxidizing Nitrososphaerota archaea through glycoproteomic analysis.
mBio, 19 May 2025
e0385924 - Hirokazu Yagi; Taiki Saito; Shih-Yun Guu; Nao Yamakawa; Shigeru Shimamura; Sachiko Kondo; Maho Yagi-Utsumi; Ken Takai; Jun-Ichi Furukawa; Yann Guerardel; Kay-Hooi Khoo; Kazuharu Arakawa; Koichi Kato
Uncommon N-Glycan Structures in Anhydrobiotic Tardigrades.
Molecular & cellular proteomics : MCP, 28 Apr. 2025
100979, 100979 - Hirokazu Shimoshige; Keiichi Yanagisawa; Masayuki Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Hidetaka Nomaki; Mizuki Fukui; Hiroki Shirakawa; Hideki Kobayashi; Azuma Taoka; Toru Maekawa
Isolation and cultivation of a novel freshwater magnetotactic coccus FCR-1 containing unchained magnetosomes
Communications Biology, 27 Mar. 2025 - Yu Su; Yuta Michimori; Yuto Fukuyama; Shigeru Shimamura; Takuro Nunoura; Haruyuki Atomi
TK2268 encodes the major aminotransferase involved in the conversion from oxaloacetic acid to aspartic acid in Thermococcus kodakarensis.
Applied and environmental microbiology, 24 Feb. 2025
e0201724 - Yoko Chiba; Tomomi Sumida; Masafumi Kameya; Yuto Fukuyama; Tomoyuki Wakashima; Shigeru Shimamura; Ryoma Kamikawa; Yoshito Chikaraishi; Takuro Nunoura
Impact of acetate on CO2 fixation pathways in thermophilic and hydrogenotrophic bacteria.
ISME communications, Jan. 2025
5, 1, ycaf227 - Satoshi Nakagawa; Hiroyuki D Sakai; Shigeru Shimamura; Yoshiki Takamatsu; Shingo Kato; Hirokazu Yagi; Saeko Yanaka; Maho Yagi-Utsumi; Norio Kurosawa; Moriya Ohkuma; Koichi Kato; Ken Takai
N-linked protein glycosylation in Nanobdellati (formerly DPANN) archaea and their hosts.
Journal of bacteriology, 28 Aug. 2024
e0020524 - Yi Zhang; Takuro Nunoura; Daisuke Nishiura; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Kanako Kurosawa; Chieko Ishiwata; Shigeru Deguchi
Correction: A single-molecule counting approach for convenient and ultrasensitive measurement of restriction digest efficiencies
PLOS ONE, 05 Aug. 2024
19, 8, e0308550, e0308550 - Yusuke Tsukatani; Chihiro Azai; Tomoyasu Noji; Shigeru Kawai; Saori Sugimoto; Shigeru Shimamura; Yasuhiro Shimane; Jiro Harada; Tadashi Mizoguchi; Hitoshi Tamiaki; Shinji Masuda
Genes for the type-I reaction center and galactolipid synthesis are required for chlorophyll a accumulation in a purple photosynthetic bacterium.
Plant & cell physiology, 20 Jul. 2024 - Yuta Michimori; Rikihisa Izaki; Yu Su; Yuto Fukuyama; Shigeru Shimamura; Karin Nishimura; Yuya Miwa; Sotaro Hamakita; Takahiro Shimosaka; Yuki Makino; Ryo Takeno; Takaaki Sato; Haruki Beppu; Isaac Cann; Tamotsu Kanai; Takuro Nunoura; Haruyuki Atomi
Removal of phosphoglycolate in hyperthermophilic archaea
Proceedings of the National Academy of Sciences, 09 Apr. 2024
121, 16 - Yoko Uchida-Fukuhara; Shigeru Shimamura; Rikai Sawafuji; Takumi Nishiuchi; Minoru Yoneda; Hajime Ishida; Hirofumi Matsumura; Takumi Tsutaya
Palaeoproteomic investigation of an ancient human skeleton with abnormal deposition of dental calculus.
Scientific reports, 11 Mar. 2024
14, 1, 5938, 5938 - Satoshi Nakagawa; Hiroyuki Imachi; Shigeru Shimamura; Saeko Yanaka; Hirokazu Yagi; Maho Yagi-Utsumi; Hiroyuki Sakai; Shingo Kato; Moriya Ohkuma; Koichi Kato; Ken Takai
Characterization of protein glycosylation in an Asgard archaeon.
BBA advances, 2024
6, 100118, 100118 - Yuto Fukuyama; Shigeru Shimamura; Sanae Sakai; Yuta Michimori; Tomomi Sumida; Yoshito Chikaraishi; Haruyuki Atomi; Takuro Nunoura
Development of a rapid and highly accurate method for 13C tracer-based metabolomics and its application on a hydrogenotrophic methanogen.
ISME communications, Jan. 2024
4, 1, ycad006 - Norio Kitadai; Shigeru Shimamura; Wataru Takahagi; Masayuki Miyazaki; Eiji Tasumi; Satoshi Okada
Elemental sulfur, hydrogen sulfide, and carbon monoxide-driven dimerization of glycine at sub-millimolar concentrations: Implications for the origin of life
Geochimica et Cosmochimica Acta, 15 May 2023
349, 55, 63 - Ángela Ares; Sanae Sakai; Toshio Sasaki; Shigeru Shimamura; Satoshi Mitarai; Takuro Nunoura
Sequestration and efflux largely account for cadmium and copper resistance in the deep-sea Nitratiruptor sp. SB155-2 (phylum Campylobacterota).
Environmental microbiology, Dec. 2022
24, 12, 6144, 6163 - Hirokazu Shimoshige; Hideki Kobayashi; Shigeru Shimamura; Masayuki Miyazaki; Toru Maekawa
Fundidesulfovibrio magnetotacticus sp. nov., a sulphate-reducing magnetotactic bacterium, isolated from sediments and freshwater of a pond.
International journal of systematic and evolutionary microbiology, Sep. 2022
72, 9 - Shigeru Kawai; Shigeru Shimamura; Yasuhiro Shimane; Yusuke Tsukatani
Proteomic Time-Course Analysis of the Filamentous Anoxygenic Phototrophic Bacterium, Chloroflexus aurantiacus, during the Transition from Respiration to Phototrophy.
Microorganisms, 25 Jun. 2022
10, 7 - Yurina Hashimoto; Shigeru Shimamura; Akihiro Tame; Shigeki Sawayama; Junichi Miyazaki; Ken Takai; Satoshi Nakagawa
Physiological and comparative proteomic characterization of Desulfolithobacter dissulfuricans gen. nov., sp. nov., a novel mesophilic, sulfur-disproportionating chemolithoautotroph from a deep-sea hydrothermal vent.
Frontiers in microbiology, 2022
13, 1042116, 1042116 - Taro Maeda; Shunichi Takahashi; Takao Yoshida; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Yukiko Nagai; Atsushi Toyoda; Yutaka Suzuki; Asuka Arimoto; Hisaki Ishii; Nori Satoh; Tomoaki Nishiyama; Mitsuyasu Hasebe; Tadashi Maruyama; Jun Minagawa; Junichi Obokata; Shuji Shigenobu
Chloroplast acquisition without the gene transfer in kleptoplastic sea slugs, Plakobranchus ocellatus.
eLife, 27 Apr. 2021
10 - Hirokazu Shimoshige; Hideki Kobayashi; Shigeru Shimamura; Toru Mizuki; Akira Inoue; Toru Maekawa
Isolation and cultivation of a novel sulfate-reducing magnetotactic bacterium belonging to the genus Desulfovibrio.
PloS one, 2021
16, 3, e0248313 - Yi Zhang; Takuro Nunoura; Daisuke Nishiura; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Kanako Kurosawa; Chieko Ishiwata; Shigeru Deguchi
A single-molecule counting approach for convenient and ultrasensitive measurement of restriction digest efficiencies.
PloS one, 2020
15, 12, e0244464 - Wataru Takahagi; Kaito Seo; Takazo Shibuya; Yoshinori Takano; Kosuke Fujishima; Masafumi Saitoh; Shigeru Shimamura; Yohei Matsui; Masaru Tomita; Ken Takai
Peptide Synthesis under the Alkaline Hydrothermal Conditions on Enceladus
ACS Earth and Space Chemistry, 21 Nov. 2019
3, 11, 2559, 2568 - Yoko Chiba; Ayako Yoshida; Shigeru Shimamura; Masafumi Kameya; Takeo Tomita; Makoto Nishiyama; Ken Takai
Discovery and analysis of a novel type of the serine biosynthetic enzyme phosphoserine phosphatase in Thermus thermophilus.
The FEBS journal, Feb. 2019
286, 4, 726, 736 - Takuro Nunoura; Manabu Nishizawa; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Phurt Harnvoravongchai; Osamu Koide; Yuki Morono; Toshiaki Fukui; Fumio Inagaki; Junichi Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Ken Takai
Microbial Diversity in Sediments from the Bottom of the Challenger Deep, the Mariana Trench.
Microbes and environments, 04 Jul. 2018
33, 2, 186, 194 - Takuro Nunoura; Yoshito Chikaraishi; Rikihisa Izaki; Takashi Suwa; Takaaki Sato; Takeshi Harada; Koji Mori; Yumiko Kato; Masayuki Miyazaki; Shigeru Shimamura; Katsunori Yanagawa; Aya Shuto; Naohiko Ohkouchi; Nobuyuki Fujita; Yoshihiro Takaki; Haruyuki Atomi; Ken Takai
A primordial and reversible TCA cycle in a facultatively chemolithoautotrophic thermophile.
Science (New York, N.Y.), 02 Feb. 2018
359, 6375, 559, 563 - Genki Ozawa; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Kiyotaka Takishita; Tetsuro Ikuta; James P Barry; Tadashi Maruyama; Katsunori Fujikura; Takao Yoshida
Ancient Occasional Host Switching of Maternally Transmitted Bacterial Symbionts of Chemosynthetic Vesicomyid Clams.
Genome biology and evolution, 01 Sep. 2017
9, 9, 2226, 2236 - Hiroko Makita; Emiko Tanaka; Satoshi Mitsunobu; Masayuki Miyazaki; Takuro Nunoura; Katsuyuki Uematsu; Yoshihiro Takaki; Shinro Nishi; Shigeru Shimamura; Ken Takai
Mariprofundus micogutta sp. nov., a novel iron-oxidizing zetaproteobacterium isolated from a deep-sea hydrothermal field at the Bayonnaise knoll of the Izu-Ogasawara arc, and a description of Mariprofundales ord. nov. and Zetaproteobacteria classis nov.
Archives of microbiology, Mar. 2017
199, 2, 335, 346 - Genki Ozawa; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Shin-Ichi Yokobori; Yasuhiko Ohara; Kiyotaka Takishita; Tadashi Maruyama; Katsunori Fujikura; Takao Yoshida
Updated mitochondrial phylogeny of Pteriomorph and Heterodont Bivalvia, including deep-sea chemosymbiotic Bathymodiolus mussels, vesicomyid clams and the thyasirid clam Conchocele cf. bisecta.
Marine genomics, Feb. 2017
31, 43, 52 - Sakiko Orui Sakaguchi; Shigeru Shimamura; Yuichi Shimizu; Gen Ogawa; Yuichiro Yamada; Keiko Shimizu; Hiroaki Kasai; Hiroshi Kitazato; Yoshihiro Fujiwara; Katsunori Fujikura; Kiyotaka Takishita
Comparison of morphological and DNA-based techniques for stomach content analyses in juvenile chum salmon Oncorhynchus keta: a case study on diet richness of juvenile fishes
Fisheries Science, 01 Jan. 2017
83, 1, 47, 56 - Hirokazu Shimoshige; Yoshikata Nakajima; Hideki Kobayashi; Keiichi Yanagisawa; Yutaka Nagaoka; Shigeru Shimamura; Toru Mizuki; Akira Inoue; Toru Maekawa
Formation of Core-Shell Nanoparticles Composed of Magnetite and Samarium Oxide in Magnetospirillum magneticum Strain RSS-1.
PloS one, 2017
12, 1, e0170932 - Shigeru Shimamura; Takashi Kaneko; Genki Ozawa; Mamiko Nishino Matsumoto; Takeru Koshiishi; Yoshihiro Takaki; Chiaki Kato; Ken Takai; Takao Yoshida; Katsunori Fujikura; James P Barry; Tadashi Maruyama
Loss of genes related to Nucleotide Excision Repair (NER) and implications for reductive genome evolution in symbionts of deep-sea vesicomyid clams.
PloS one, 2017
12, 2, e0171274 - Yuki Hongo; Tetsuro Ikuta; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Shuji Shigenobu; Tadashi Maruyama; Takao Yoshida
Expression of genes involved in the uptake of inorganic carbon in the gill of a deep-sea vesicomyid clam harboring intracellular thioautotrophic bacteria.
Gene, 10 Jul. 2016
585, 2, 228, 40 - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Jungo Kakuta; Hiromi Kazama; Miho Hirai; Noriaki Masui; Hitoshi Tomaru; Yuki Morono; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Ken Takai
Variance and potential niche separation of microbial communities in subseafloor sediments off Shimokita Peninsula, Japan.
Environmental microbiology, Jun. 2016
18, 6, 1889, 906 - Tetsuro Ikuta; Yoshihiro Takaki; Yukiko Nagai; Shigeru Shimamura; Miwako Tsuda; Shinsuke Kawagucci; Yui Aoki; Koji Inoue; Morimi Teruya; Kazuhito Satou; Kuniko Teruya; Makiko Shimoji; Hinako Tamotsu; Takashi Hirano; Tadashi Maruyama; Takao Yoshida
Heterogeneous composition of key metabolic gene clusters in a vent mussel symbiont population.
The ISME journal, Apr. 2016
10, 4, 990, 1001 - Takaaki Kubota; Shigeru Shimamura; Tohru Kobayashi; Takuro Nunoura; Shigeru Deguchi
Distribution of eukaryotic serine racemases in the bacterial domain and characterization of a representative protein in Roseobacter litoralis Och 149.
Microbiology (Reading, England), Jan. 2016
162, 1, 53, 61 - Fumiya Noguchi; Shigeru Shimamura; Takuro Nakayama; Euki Yazaki; Akinori Yabuki; Tetsuo Hashimoto; Yuji Inagaki; Katsunori Fujikura; Kiyotaka Takishita
Metabolic Capacity of Mitochondrion-related Organelles in the Free-living Anaerobic Stramenopile Cantina marsupialis.
Protist, Nov. 2015
166, 5, 534, 50 - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Akiko Makabe; Osamu Koide; Tohru Kikuchi; Junichi Miyazaki; Keisuke Koba; Naohiro Yoshida; Michinari Sunamura; Ken Takai
Hadal biosphere: insight into the microbial ecosystem in the deepest ocean on Earth.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 17 Mar. 2015
112, 11, E1230-6 - Toshihiro Nagasaki; Yuki Hongo; Tomoko Koito; Ikumi Nakamura-Kusakabe; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Takao Yoshida; Tadashi Maruyama; Koji Inoue
Cysteine dioxygenase and cysteine sulfinate decarboxylase genes of the deep-sea mussel Bathymodiolus septemdierum: possible involvement in hypotaurine synthesis and adaptation to hydrogen sulfide.
Amino acids, Mar. 2015
47, 3, 571, 8 - Satoshi Nakagawa; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Yohey Suzuki; Shun-ichi Murakami; Tamaki Watanabe; So Fujiyoshi; Sayaka Mino; Tomoo Sawabe; Takahiro Maeda; Hiroko Makita; Suguru Nemoto; Shin-Ichiro Nishimura; Hiromi Watanabe; Tomo-o Watsuji; Ken Takai
Allying with armored snails: the complete genome of gammaproteobacterial endosymbiont.
The ISME journal, Jan. 2014
8, 1, 40, 51 - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Hiromi Kazama; Jungo Kakuta; Shigeru Shimamura; Hiroko Makita; Miho Hirai; Masayuki Miyazaki; Ken Takai
Physiological and genomic features of a novel sulfur-oxidizing gammaproteobacterium belonging to a previously uncultivated symbiotic lineage isolated from a hydrothermal vent.
PloS one, 2014
9, 8, e104959 - Yuki Hongo; Yoshimitsu Nakamura; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Katsuyuki Uematsu; Takashi Toyofuku; Hisako Hirayama; Ken Takai; Masatoshi Nakazawa; Tadashi Maruyama; Takao Yoshida
Exclusive localization of carbonic anhydrase in bacteriocytes of the deep-sea clam Calyptogena okutanii with thioautotrophic symbiotic bacteria.
The Journal of experimental biology, 01 Dec. 2013
216, Pt 23, 4403, 14 - Taishi Tsubouchi; Yasuhiro Shimane; Keiko Usui; Shigeru Shimamura; Kozue Mori; Toshiki Hiraki; Akihiro Tame; Katsuyuki Uematsu; Tadashi Maruyama; Yuji Hatada
Brevundimonas abyssalis sp. nov., a dimorphic prosthecate bacterium isolated from deep-subsea floor sediment.
International journal of systematic and evolutionary microbiology, Jun. 2013
63, Pt 6, 1987, 1994 - Yukari Yoshida-Takashima; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Takuro Nunoura; Ken Takai
Genome sequence of a novel deep-sea vent epsilonproteobacterial phage provides new insight into the co-evolution of Epsilonproteobacteria and their phages.
Extremophiles : life under extreme conditions, May 2013
17, 3, 405, 19 - Masayuki Miyazaki; Osamu Koide; Tohru Kobayashi; Kozue Mori; Shigeru Shimamura; Takuro Nunoura; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Takahiko Nagahama; Yuichi Nogi; Shigeru Deguchi; Ken Takai
Geofilum rubicundum gen. nov., sp. nov., isolated from deep subseafloor sediment.
International journal of systematic and evolutionary microbiology, May 2012
62, Pt 5, 1075, 1080 - Taro Maeda; Euichi Hirose; Yoshito Chikaraishi; Masaru Kawato; Kiyotaka Takishita; Takao Yoshida; Heroen Verbruggen; Jiro Tanaka; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Masashi Tsuchiya; Kenji Iwai; Tadashi Maruyama
Algivore or phototroph? Plakobranchus ocellatus (Gastropoda) continuously acquires kleptoplasts and nutrition from multiple algal species in nature.
PloS one, 2012
7, 7, e42024 - Hirokazu Kuwahara; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Takao Yoshida; Taro Maeda; Takekazu Kunieda; Tadashi Maruyama
Loss of genes for DNA recombination and repair in the reductive genome evolution of thioautotrophic symbionts of Calyptogena clams.
BMC evolutionary biology, 03 Oct. 2011
11, 285, 285 - Sanae Sakai; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Mitsuo Sekine; Takahisa Tajima; Hiroki Kosugi; Natsuko Ichikawa; Eiji Tasumi; Aiko T Hiraki; Ai Shimizu; Yumiko Kato; Rika Nishiko; Koji Mori; Nobuyuki Fujita; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Genome sequence of a mesophilic hydrogenotrophic methanogen Methanocella paludicola, the first cultivated representative of the order Methanocellales.
PloS one, 2011
6, 7, e22898 - Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Satoshi Nakagawa; Yasuo Fukuhara; Hiroshi Horikawa; Akiho Ankai; Takeshi Harada; Akira Hosoyama; Akio Oguchi; Shigehiro Fukui; Nobuyuki Fujita; Hideto Takami; Ken Takai
Bacterial lifestyle in a deep-sea hydrothermal vent chimney revealed by the genome sequence of the thermophilic bacterium Deferribacter desulfuricans SSM1.
DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes, Jun. 2010
17, 3, 123, 37 - Masahiro Yamamoto; Satoshi Nakagawa; Shigeru Shimamura; Ken Takai; Koki Horikoshi
Molecular characterization of inorganic sulfur-compound metabolism in the deep-sea epsilonproteobacterium Sulfurovum sp. NBC37-1.
Environmental microbiology, May 2010
12, 5, 1144, 53 - Hirokazu Shimoshige; Hideki Kobayashi; Shigeru Shimamura; Ron Usami
Gravity sensing by Escherichia coli.
Bioscience, biotechnology, and biochemistry, 2010
74, 12, 2511, 4 - Maiko Harada; Takao Yoshida; Hirokazu Kuwahara; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki; Chiaki Kato; Tetsuya Miwa; Hiroshi Miyake; Tadashi Maruyama
Expression of genes for sulfur oxidation in the intracellular chemoautotrophic symbiont of the deep-sea bivalve Calyptogena okutanii.
Extremophiles : life under extreme conditions, Nov. 2009
13, 6, 895, 903 - Tohru Kobayashi; Osamu Koide; Kozue Mori; Shigeru Shimamura; Takae Matsuura; Takeshi Miura; Yoshihiro Takaki; Yuki Morono; Takuro Nunoura; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Ken Takai; Koki Horikoshi
Phylogenetic and enzymatic diversity of deep subseafloor aerobic microorganisms in organics- and methane-rich sediments off Shimokita Peninsula.
Extremophiles : life under extreme conditions, Jul. 2008
12, 4, 519, 27 - Hirokazu Kuwahara; Yoshihiro Takaki; Takao Yoshida; Shigeru Shimamura; Kiyotaka Takishita; James D Reimer; Chiaki Kato; Tadashi Maruyama
Reductive genome evolution in chemoautotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams.
Extremophiles : life under extreme conditions, May 2008
12, 3, 365, 74 - Atsushi Kurata; Kohsuke Uchimura; Shigeru Shimamura; Tohru Kobayashi; Koki Horikoshi
Nucleotide and deduced amino acid sequences of a subtilisin-like serine protease from a deep-sea bacterium, Alkalimonas collagenimarina AC40T
Applied Microbiology and Biotechnology, 05 Sep. 2007
77, 2 - Satoshi Nakagawa; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Anna-Louise Reysenbach; Ken Takai; Koki Horikoshi
Deep-sea vent ε-proteobacterial genomes provide insights into emergence of pathogens
Proceedings of the National Academy of Sciences, 17 Jul. 2007
104, 29 - Yasushi Kageyama; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Shinro Nishi; Yuichi Nogi; Kohsuke Uchimura; Tohru Kobayashi; Jun Hitomi; Katsuya Ozaki; Shuji Kawai; Susumu Ito; Koki Horikoshi
Intragenomic diversity of the V1 regions of 16S rRNA genes in high-alkaline protease-producing Bacillus clausii spp.
Extremophiles : life under extreme conditions, Jul. 2007
11, 4, 597, 603 - Hirokazu Kuwahara; Takao Yoshida; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Shinro Nishi; Maiko Harada; Kazuyo Matsuyama; Kiyotaka Takishita; Masaru Kawato; Katsuyuki Uematsu; Yoshihiro Fujiwara; Takako Sato; Chiaki Kato; Masanari Kitagawa; Ikunoshin Kato; Tadashi Maruyama
Reduced genome of the thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea clam, Calyptogena okutanii.
Current biology : CB, 15 May 2007
17, 10, 881, 6 - Takahiko Nagahama; Makiko Hamamoto; Takashi Nakase; Shigeru Shimamura; Koki Horikoshi
Phylogenetic relationship within the Erythrobasidium clade: molecular phylogenies, secondary structure, and intron positions inferred from partial sequences of ribosomal RNA and elongation factor-1alpha genes.
The Journal of general and applied microbiology, Feb. 2006
52, 1, 37, 45 - Takuro Nunoura; Hisako Hirayama; Hideto Takami; Hanako Oida; Shinro Nishi; Shigeru Shimamura; Yohey Suzuki; Fumio Inagaki; Ken Takai; Kenneth H Nealson; Koki Horikoshi
Genetic and functional properties of uncultivated thermophilic crenarchaeotes from a subsurface gold mine as revealed by analysis of genome fragments.
Environmental microbiology, Dec. 2005
7, 12, 1967, 84 - Hideto Takami; Shinro Nishi; Jei Lu; Shigeru Shimamura; Yoshihiro Takaki
Genomic characterization of thermophilic Geobacillus species isolated from the deepest sea mud of the Mariana Trench.
Extremophiles : life under extreme conditions, Oct. 2004
8, 5, 351, 6 - Hideto Takami; Yoshihiro Takaki; Gab-Joo Chee; Shinro Nishi; Shigeru Shimamura; Hiroko Suzuki; Satomi Matsui; Ikuo Uchiyama
Thermoadaptation trait revealed by the genome sequence of thermophilic Geobacillus kaustophilus.
Nucleic acids research, 2004
32, 21, 6292, 303
Misc.
- Shimamura Shigeru; Sumida Tomomi; Nunoura Takuro
Analysis of amino acids by Orbitrap mass spectrometry.
低温科学, 20 Mar. 2021
79, 37, 42
[Reviewed] - Sumida Tomomi; Shimamura Shigeru; Takuro Nunoura
Detection of tracing of stable isotope labelled amino acids using Orbitrap-Fusion CE-MS and Quadrupole GC-MS
低温科学, 20 Mar. 2021
79, 43, 49
[Reviewed] - 布浦拓郎; 高見英人; 笈田花子; 平山仙子; 西真郎; 島村繁; 鈴木庸平; 稲垣史生; 高井研; 山下敦士; 服部正平; 掘越弘毅
地殼内生物圏におけるメタゲノム解析(遺伝子解析,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2005
21 - 布浦拓郎; 笈田花子; 平山仙子; 鈴木庸平; 稲垣史生; 西真郎; 島村繁; 高見英人; 高井研; KENNETH H. Nealson; 掘越弘毅
菱刈金山地下熱水環境に優占する未知なる好熱性Archaeaゲノムの探索
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004
20 - 笈田花子; 布浦拓郎; 平山仙子; 鈴木庸平; 稲垣史生; 西真郎; 島村繁; 高見英人; 高井研; KENNETH H. Nealson; 堀越弘毅
菱刈金山地下熱水環境に存在する未培養好熱性Archaeaのrrn遺伝子オペロンを含むFosmidクローンの解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004
20
Books and Other Publications
Presentations
- Hirokazu SHIMOSHIGE; Keiichi YANAGISAWA; Masayuki MIYAZAKI; Yoshihiro TAKAKI; Shigeru SHIMAMURA; Hidetaka NOMAKI; Mizuki FUKUI; Hiroki SHIRAKAWA; Hideki KOBAYASHI; Azuma TAOKA; Toru MAEKAWA
Isolation of novel freshwater magnetotactic coccus FCR-1 with unchained magnetosome from Chichijima
日本農芸化学会大会 2025年度, 07 Mar. 2025 - 酒井博之; 酒井博之; 中川聡; 中川聡; 中川聡; 島村繁; 高井研; 布浦拓郎; 黒沢則夫; 大熊盛也
Nanobdellati・宿主・ウイルス共培養系における三者の相互作用の解析
日本微生物生態学会大会(Web), 2025 - Satoshi Nakagawa, Hiroyuki Sakai, Shigeru Shimamura, Hisashi Muto, Ken Takai
Glycobiological interactions between DPANN and host Archaea
6th ExCELLSシンポジウム, 22 Jan. 2024 - 森田祥空; 酒井博之; 島村繁; 武藤久; 澤山茂樹; 高井研; 高井研; 中川聡; 中川聡; 中川聡
酸性温泉に由来する新規Nanobdellati(DPANNアーキア)及び宿主アーキアのグライコプロテオミクス
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2024 - 若島朋幸; 若島朋幸; 福山宥斗; 島村繁; 常松奈緒; 布浦拓郎; 千葉洋子; 千葉洋子
Search for the unknown serine biosynthesis pathway in the autotrophic bacterium Thermodesulfatator indicus
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024 - 千葉洋子; 千葉洋子; 常松奈緒; 亀谷将史; 亀谷将史; 若島朋幸; 若島朋幸; 島村繁; 福山宥斗; 布浦拓郎
Studies on CO tolerance and utilization of an autotrophic bacterium Hydrogenobacter thermophilus
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024 - 外丸裕司; 山田和正; 本郷悠貴; 島村繁; 高尾祥丈; 一見和彦
珪藻の葉緑体に蓄積する新奇環状一本鎖DNAウイルス
日本微生物生態学会大会(Web), 2024 - Hirokazu Shimoshige, Shigeru Shimamura, Toru Maekawa
Proteomic analysis of the sulfate-reducing magnetotactic bacterium, Fundidesulfovibrio magnetotacticus, grown in the presence of tryptophan.
The 20th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology, 08 Dec. 2023 - Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Tomomi Sumida, Yoko Chiba, Yoshito Chikaraishi, Haruyuki Atomi, Takuro Nunoura
Assimilation of CO2 in hyperthermophilic and heterotrophic bacteria revealed by 13C tracer-based metabolomics using CE-MS
The 36th JSME & The 13th ASME, 28 Nov. 2023 - Tomoyuki Wakashima, Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Nao Tsunematsu, Takuro Nunoura, Yoko Chiba
Exploring a novel glycine biosynthesis pathway in Thermodesulfatator indicus , a thermophilic sulfate-reducing bacterium using isotopomer analysis.
第36回日本微生物生態学会, 28 Nov. 2023 - 福山 宥斗; 島村 繁; 酒井 早苗; 道盛 裕太; 澄田 智美; 力石 嘉人; 跡見 晴幸; 布浦 拓郎
Orbitrap Fusion MSを活用した高感度且つ高精度なトレーサー解析
第17回メタボロームシンポジウム, 19 Oct. 2023 - Yuto Fukuyama, Shigeru Shimamura, Sanae Sakai, Yuta Michimori, Tomomi Sumida, Yoshito Chikaraishi, Haruyuki Atomi, Takuro Nunoura
A novel CE-MS-based tracer metabolomics: a promising tool to verify real amino acid biosynthetic pathways and central carbon metabolic pathways in any kinds of archaeal isolates
The 2023 Gordon Research Conference "Archaea: Ecology, Metabolism and Molecular Biology", 26 Jul. 2023 - Fukuyama F, Shimamura S, Sakai S, Michimori Y, Sumida Y, Chikaraishi Y, Atomi H, Nunoura T
A novel CE-MS based tracer metabolomics: a promising tool to verify real amino acid biosynthetic pathways and central carbon metabolic pathway in any kinds of microbial isolates.
The 2023 Gordon Research Conference: Archaea: Ecology, Metabolism and Molecular Biology, 25 Jul. 2023 - 河合 繁; 島村 繁; 嶋根 康弘; 塚谷 祐介
糸状性光合成細菌Chloroflexus aurantiacusの呼吸から光合成モードへの移行過程における経時的プロテオーム解析
第64回日本植物生理学会, 17 Mar. 2023 - FUKUYAMA Yuto; SHIMAMURA Shigeru; SUMIDA Tomomi; CHIBA Yoko; CHIKARAISHI Yoshito; ATOMI Haruyuki; NUNOURA Takuro
Assimilation of CO2 in hyperthermophilic and heterotrophic bacteria revealed by 13C tracer-based metabolomics using CE-MS
日本微生物生態学会大会(Web), 2023 - 高松芳基; 島村繁; 加藤真悟; 矢木宏和; 矢木宏和; 矢木真穂; 矢木真穂; 谷中冴子; 加藤晃一; 加藤晃一; 澤山茂樹; 大熊盛也; 井町寛之; 高井研; 高井研; 中川聡; 中川聡; 中川聡
ナノアーキアおよび宿主アーキアのグライコプロテオーム
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2023 - 福山宥斗; 島村繁; 澄田智美; 酒井早苗; 跡見晴幸; 布浦拓郎
微量メタボローム解析法を用いたMethanothermobacter thermautotrophicusにおけるアミノ酸生合成系の代謝ギャップの探索
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2023 - 中川聡; 中川聡; 中川聡; 島村繁; 高松芳基; 酒井博之; 加藤真悟; 澤山茂樹; 矢木宏和; 矢木宏和; 矢木真穂; 矢木真穂; 谷中冴子; 谷中冴子; 加藤晃一; 加藤晃一; 高井研; 高井研
Protein glycosylation in DPANN archaea and their host archaea.
日本微生物生態学会大会(Web), 2023 - 若島朋幸; 若島朋幸; 福山宥斗; 島村繁; 常松奈緒; 布浦拓郎; 千葉洋子; 千葉洋子
Exploring a novel glycine biosynthesis pathway in Thermodesulfatator indicus, a thermophilic sulfate-reducing bacterium using isotopomer analysis.
日本微生物生態学会大会(Web), 2023 - 河合 繁; 島村 繁; 嶋根 康弘; 塚谷 祐介
糸状性光合成細菌Chloroflexus aurantiacusの光合成タンパク質の発現機序
第13回藍藻の分子生物学, 10 Dec. 2022 - 中川 聡, 島村 繁, 酒井 博之, 加藤 真悟, 高松 芳基, 澤山 茂樹, 矢木 宏和, 矢木 真穂, 谷中 冴子, 加藤 晃一, 高井 研
DPANNアーキアおよびその宿主・非宿主のグライコプロテオミクス
日本微生物生態学会 第35回大会, 02 Nov. 2022 - 福山 宥斗, 島村 繁, 澄田 智美, 力石 嘉人,千葉 洋子, 跡見 晴幸, 布浦 拓郎
微量メタボローム解析による従属栄養性超好熱バクテリアThermotogaのCO2再利用能の評価
The 35th annual JSME conference, 01 Nov. 2022 - 福山 宥斗; 澄田 智美; 島村 繁; 千葉 洋子; 力石 嘉人; 跡見 晴幸; 布浦 拓郎
従属栄養性超好熱バクテリアThermotoga maritimaにおける微量メタボローム解析を用いたCO2再利用能の評価
新学術領域研究「超地球生命体を解き明かすポストコッホ機能生態学」若手交流ポスター発表会, 02 Sep. 2022 - Yurina Hashimoto, Shigeru Shimamura, Akihiro Tame, Shigeki Sawayama, Junichi Miyazaki, Ken Takai, Satoshi Nakagawa
Physiological and proteomic characteristics of a novel sulfur-disproportionating bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal vent
18th International Symposium on Microbial Ecology, 16 Aug. 2022 - Yuto Fukuyama, Tomomi Sumida, Shigeru Shimamura, Yoko Chiba, Hisato Chikaraishi, Haruyuki Atomi, Takuro Nunoura
Reassimilation of CO2 and acetate in Thermotoga maritima revealed by 13C isotope tracing experiments using microfluidic capillary electrophoresis-mass spectrometry
The 2022 Gordon Research Conference on Molecular Basis of Microbial One-Carbon Metabolism, 08 Aug. 2022 - Yurina Hashimoto, Shigeru Shimamura, Akihiro Tame, Shigeki Sawayama, Junichi Miyazaki, Ken Takai, Satoshi Nakagawa
Physiological and metabolic characteristics of a novel sulfur-disproportionating bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal vent chimney at the Suiyo Seamount, Japan
12th Asian Symposium on Microbial Ecology, 19 Apr. 2022 - 福山宥斗; 澄田智美; 島村繁; 酒井早苗; 跡見晴幸; 布浦拓郎
微量メタボローム解析を用いたMethanothermobacter thermautotrophicusにおけるアミノ酸生合成系の再構築
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2022 - 須山友貴; 島村繁; 加藤真悟; 矢木宏和; 矢木宏和; 矢木真穂; 矢木真穂; 谷中冴子; 加藤晃一; 加藤晃一; 澤山茂樹; 大熊盛也; 井町寛之; 高井研; 高井研; 中川聡; 中川聡; 中川聡
常温性アンモニア酸化アーキアを対象とするグライコプロテオーム解析
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2022 - 福原瑶子; 蔦谷匠; 澤藤りかい; 島村繁; 松村博文; 石田肇; 池亀美華; 岡村裕彦
オホーツク文化人の歯石を対象とした古代プロテオミクス解析の検討
日本解剖学会総会・全国学術集会講演プログラム・抄録集, 2022 - 福原瑶子; 澤藤りかい; 島村繁; 松村博文; 石田肇; 池亀美華; 岡村裕彦; 蔦谷匠
歯石の古代プロテオミクス解析によるオホーツク人の口腔内環境の復元
霊長類研究, 2022 - 河合 繁; 島村 繁; 塚谷 祐介
好熱性光合成細菌Chloroflexus aurantiacusの光照射時における増殖様式と光合成タンパク質の発現機序
第34回日本微生物生態学会年会, 01 Nov. 2021 - 河合 繁; 島村 繁; 塚谷 祐介
好熱性光合成細菌Chloroexus aurantiacusの光照射時における増殖様式と光合成タンパク質の発現機序
日本微生物生態学会 第34回大会, 01 Nov. 2021 - 橋本 侑里南; 島村 繁; 多米 晃裕; 澤山 茂樹; 宮崎 淳一; 高井 研; 中川 聡
深海熱水活動域に由来する新規硫黄不均化細菌の分離と性状解析
日本微生物生態学会 第34回大会, 31 Oct. 2021 - 蔦谷 匠; 島村 繁; 板垣 徹; 鈴木 美和; 谷川 章雄; 澤藤 りかい
近世の合わせ口かわらけ内容物の古代プロテオミクス分析
日本人類学会第75回大会, 10 Oct. 2021 - 福山 宥斗; 澄田 智美; 島村 繁; 千葉 洋子; 力石 嘉人; 跡見 晴幸; 布浦 拓郎
超高分解能質量分析装置を用いた微量メタボローム解析
令和3年度第3回「ポストコッホ生体」領域会議, 28 May 2021 - Nagahisa S, Tachibana S, Shimamura S & Takano Y
Hydrothermal Synthesis of Soluble Organic Molecules Starting from the Solar O/C/N Ratio
Goldschmidt Conference 2020, 25 Jun. 2020 - 大類穗子; 島村繁; 生田哲朗; 清水勇一; 小川元; 小川元; 山田雄一郎; 志賀直信; 清水恵子; 笠井宏朗; 山根広大; 北里洋; 藤原義弘; 藤倉克則; 瀧下清貴; 瀧下清貴
沖合底層生態系の変動メカニズムの解明 サケ漁獲量の向上に向けた生態と感染症の解析 サケ稚魚の食性解析-効果的な種苗放流を目指して-
東北マリンサイエンス拠点形成事業(海洋生態系の調査研究)成果報告書 令和2年(CD-ROM), 2020 - Yi Zhang, Takuro Nunoura, Daisuke Nishiura, Miho Hirai, Shigeru Shimamura, Shigeru Deguchi
A SINGLE-MOLECULE VIEW OF RESTRICTION DIGESTS
第6回新学術領域「ネオウイルス学」領域班会議, 10 Jun. 2019 - Takahagi Wataru, Seo Kaito., Shibuya T., Takano Yoshinori., Fujishima Kousuke., Saitoh Masafumi., Shimamura Shigeru., Matsui Yohei, Tomita Masaru., Takai Ken.
Mineral surface-assisted abiotic peptide synthesis under Enceladus alkaline hydrothermal condition
Ocean World 2019, 22 May 2019 - 下重裕一; 小林英城; 島村繁; 水木徹; 井上明; 前川透
淡水域底泥中からの新規硫酸還元磁性細菌の分離・培養
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2019 - 土井昂大; 島村繁; 矢木宏和; 矢木真穂; 谷中冴子; 澤山茂樹; 井町寛之; 高井研; 高井研; 加藤晃一; 加藤晃一; 中川聡; 中川聡
深海の化学合成生態系に優占する共生微生物の糖鎖生物学的性状
日本微生物生態学会大会(Web), 2019 - 高萩航; 高萩航; 瀬尾海渡; 瀬尾海渡; 高野淑識; 渋谷岳造; 斎藤誠史; 島村繁; 松井洋平; 藤島皓介; 冨田勝; 冨田勝; 高井研
エンセラダス熱水環境下での水-岩石-有機物相互作用によるペプチド合成
日本地球惑星科学連合大会予稿集(Web), 2018 - 千葉洋子; 島村繁; 吉田彩子; 西山真; 高井研
Thermus thermophilusの有する新規セリン生合成酵素の同定と性状解析
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2018 - 峯岸宏明; 越後輝敦; 嶋根康弘; 奥村知世; 布浦拓郎; 酒井早苗; 平井美穂; 島村繁; 高井研
高濃度塩泉・鹿塩温泉における微生物叢の解析
好塩微生物研究会講演要旨集, 2018 - 丸山正; 島村繁; 高木善弘; 吉田尊雄
深海共生二枚貝シロウリガイ類共生細菌におけるDNA修復遺伝子の欠失とゲノム縮小進化
日本原生生物学会大会講演要旨集, 2017 - 大類 穗子; 瀧下 清貴; 島村 繁; 清水 勇一; 小川 元; 山田 雄一郎; 清水 恵子; 笠井 宏朗; 北里 洋; 藤原 義弘; 藤倉 克則
形態観察と DNA 解析を用いた稚魚の食性解析 −シロサケを例として−
平成 28 年度日本水産学会春季大会, 27 Mar. 2016 - 高木 善弘; 生田 哲朗; 長井 裕季子; 島村 繁; 津田 美和子; 川口 慎介; 青木 結; 井上 広滋; 照屋 盛実; 佐藤 万仁; 照屋 邦子; 下地 真紀子; 保 日奈子; 平野 隆; 丸山 正; 吉田 尊雄
シチヨウシンカイヒバリガイ共生細菌における、エネルギー獲得機能の多様化したゲノム
第10回日本ゲノム微生物学会年会, 04 Mar. 2016 - 下重裕一; 中島義賢; 柳澤圭一; 小林英城; 水木徹; 島村繁; 井上明; 前川透
Magnetospirillum magneticum RSS-1株におけるFe3O4-Sm2O3コアシェルナノ粒子の形成
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2016 - 高木善弘; 生田哲朗; 長井裕季子; 島村繁; 津田美和子; 川口慎介; 青木結; 井上広滋; 照屋盛実; 佐藤万仁; 照屋邦子; 下地真紀子; 保日奈子; 平野隆; 丸山正; 吉田尊雄
シチヨウシンカイヒバリガイ共生細菌における,エネルギー獲得機能の多様化したゲノム
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2016 - 大類穂子; 瀧下清貴; 島村繁; 清水勇一; 小川元; 山田雄一郎; 清水恵子; 笠井宏朗; 北里洋; 藤原義弘; 藤倉克則
形態観察とDNA解析を用いた稚魚の食性解析-シロサケを例として-
日本水産学会大会講演要旨集, 2016 - Yuki Hongo, Tetsuro Ikuta, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Shuji Shigenobu, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Inorganic carbon uptake genes in the gill of the deep-sea clam Calyptogena okutanii
第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会, 02 Dec. 2015 - 大類 穗子; 瀧下 清貴; 島村 繁; 清水 勇一; 小川 元; 山田 雄一郎; 清水 恵子; 笠井 宏朗; 北里 洋; 藤原 義弘; 藤倉 克則
形態観察とDNA解析によるシロサケ稚魚の胃内容物解析
平成27度東北マリンサイエンス拠点形成事業における全体会議, 06 Jun. 2015 - Fumiya Noguchi, Shigeru Shimamura, Takuro Nakayama, Euki Yazaki, Tetsuo Hashimoto, Yuji Inagaki, Katsunori Fujikura, Kiyotaka Takishita
Metabolic capacity of mitochondrion-derived organelles in the free-living anaerobic stramenopile Cantina marsupialis
The Society for General Microbiology Annual Conference 2015, 31 Mar. 2015 - 野口文哉; 野口文哉; 島村繁; 中山卓郎; 矢崎裕規; 橋本哲男; 稲垣祐司; 藤倉克則; 藤倉克則; 瀧下清貴
嫌気性ストラメノパイル生物Cantina marsupialisが有するミトコンドリア関連オルガネラの代謝能推定
藻類, 2015 - 西尾早生; 阿賀由侑子; 藤井利江; 安井沙英; 六田早織; 島村繁; 西真郎; 小林英城; 長濱統彦
クリプト菌門の共通性と特異性-西日本の淡水湖沼における菌類多様性-
日本菌学会大会講演要旨集, 2015 - 窪田高秋; 島村繁; 小林徹; 出口茂
微生物における真核生物型セリンラセマーゼの分布と生化学的解析
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015 - 峯岸宏明; 峯岸宏明; 峯岸宏明; 嶋根康弘; 越後輝敦; 亀倉正博; 伊藤隆; 大熊盛也; 奥村知世; 酒井早苗; 島村繁; 布浦拓郎; 高井研
日本国内から分離された高度好塩性古細菌
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2015 - 下重裕一; 水木徹; 中島義賢; 小林英城; 島村繁; 井上明; 前川透
希土類元素含有磁性粒子を形成する磁性細菌の探索
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2015 - 野口文哉; 島村繁; 中山卓郎; 矢崎裕規; 橋本哲男; 稲垣祐司; 藤倉克則; 瀧下清貴
嫌気性ストラメノパイル生物Cantina marsupialisが有するミトコンドリア関連オルガネラの代謝能推定
ブルーアース要旨集, 2015 - Hirokazu Shimoshige, Hideki Kobayashi, Toru Mizuki, Shigeru Shimamura, Akira Inoue, Toru Maekawa
Isolation of rare earth metals resistant magnetotactic bacteria from aquatic environments
10th International Congress on Extremophiles 2014, 10 Sep. 2014 - 吉田 尊雄; 高木 善弘; 島村 繁; 丸山 正
深海性二枚貝に細胞内共生する化学合成細菌のゲノム進化
第17回微生物アカデミー研究集会, 21 Aug. 2014 - Genki Ozawa,Takashi Kaneko, Shigeru Shimamura,Yoshihiro Takaki,Takeshi Koshiishi, Chiaki Kato,Tadashi Maruyama,Takao Yoshida
深海性二枚貝シロウリガイ類における化学合成共生細菌の宿主転換の可能性
日本地球惑星科学連合2014年大会, 29 Apr. 2014, [Invited] - Takuro Nunoura, Miho Hirai, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Ken Takai
The deep cold trench biosphere: microbial ecosystem in the Challenger Deep
2014 Ocean Sciences Meeting, 28 Feb. 2014 - 西尾早生; 藤井利江; 安井沙英; 長野由梨子; 西真郎; 島村繁; 長濱統彦; 長濱統彦
湖沼堆積物における真菌様遺伝子の鉛直分布
日本菌学会大会講演要旨集, 2014 - 窪田高秋; 島村繁; 小林徹; 出口茂
海洋性細菌に広がる推定セリンラセマーゼ配列の発見と解析
日本生物工学会大会講演要旨集, 2014 - 布浦 拓郎; 高木 善弘; 風間 宏美; 角太 淳吾; 平井 美穂; 島村 繁; 高井 研
巻き貝共生菌に極めて近縁な硫黄酸化細菌の単離とゲノム解析
極限環境生物学会2013年度(第14回)年会, 27 Oct. 2013 - Takuro Nunoura, Akiko Makabe, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Junichi Miyazaki, Kazuhiro Inoue, Tohru Kikuchi, Osamu Koide, Keisuke Koba, Yuichiro Ueno, Michinari Sunamura, Ken Takai
Niche separation of the nitrifying archaea and bacteria from sea surface to the trench bottom found in the Challenger Deep
ICoN3 3rd International Conference on Nitrification, 03 Sep. 2013 - TAKAKI YOSHIHIRO , MIYAZAKI MASAYUKI , TSUDA MIWAKO, TERUYA MORIMI , YOSHIDA TAKAO , SHIMAMURA SHIGERU , SATOH NORIYUKI , KAWATO MASARU , FUJIWARA YOSHIHIRO , MARUYAMA TADASHI
Genome analysis of the closest free-living bacteria of gutless marine worm endosymbionts
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 22 Aug. 2013 - Takao Yoshida, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Yukiko Nagai, Miwako Tsuda, Masatoshi Tsukahara, Maiko Nezuo, Makiko Shimoji, Kuniko Teruya, Morimi Teruya, Tadashi Maruyama
The genomes of intracellur symbionts in deep-sea Calyptogena clams are still in an early phase of reductive genome evolution.
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 20 Aug. 2013 - Tetsuro Ikuta, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Heterogeneous subpopulations of thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea mussel, Bathymodiolus septemdierum, and their patchy distribution in the host gill.
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 19 Aug. 2013 - Genki Ozawa, Takashi Kaneko, Shigeru Shimamura,Yoshihiro Takaki, Shin-ichi Yokobori, Takeshi Koshiishi, Chiaki Kato, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Cospeciation of deep-sea Calyptogena clams and chemoautotrophic bacteria
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 19 Aug. 2013 - 生田 哲朗; 高木 善弘; 島村 繁; 長井 裕季子; 津田 美和子; 丸山 正; 吉田 尊雄
シチヨウシンカイヒバリガイ共生菌のゲノム解読と、水素酸化遺伝子群をはじめとした遺伝子座の有無で分けられるヘテロな亜集団の宿主内での局在解析
第15回マリンバイオテクノロジー学会大会, 01 Jun. 2013 - 島村 繁; 金子 隆司; 小澤 元希; 丸山 正; 吉田 尊雄
シロウリガイ類共生細菌種間のゲノム縮小進化とNER関連遺伝子の欠失
第15回マリンバイオテクノロジー学会大会, 01 Jun. 2013 - 前田 太郎; 広瀬 裕一; 力石 嘉人; 河戸 勝; 瀧下 清貴; 吉田 尊雄; Heroen Verbruggen; 田中 次郎; 島村 繁; 高木 善弘; 土屋 正史; 岩井 憲司; 重信 秀治; 丸山 正
動物が葉緑体を細胞内に一時的に取り込み光合成を行う盗葉緑体現象の野外での適応的意義
日本地球惑星科学連合2013年大会, 19 May 2013 - 生田哲朗; 高木善弘; 島村繁; 長井裕季子; 津田美和子; 丸山正; 吉田尊雄
シチョウシンカイヒバリガイ共生菌のゲノム解読と,水素酸化遺伝子群をはじめとした遺伝子座の有無で分けられるヘテロな亜集団の宿主内での局在解析
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2013 - 吉田(高島)ゆかり; 高木善弘; 島村繁; 布浦拓郎; 高井研
深海熱水活動域に生息するイプシロンプロテオバクテリアの溶原性ファージのゲノム解析
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2013 - 高木善弘; 宮崎征行; 吉田尊雄; 島村繁; 河戸勝; 藤原義弘; 丸山正
鯨骨生物群集における共生へのゲノミックス的アプローチ
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2013 - 小澤元希; 小澤元希; 金子隆司; 金子隆司; 島村繁; 高木善弘; 輿石武; 加藤千明; 丸山正; 吉田尊雄
ミトコンドリアゲノムから見た深海性二枚貝シロウリガイ類の系統関係および共生細菌との共進化について
ブルーアース要旨集, 2013 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 生田哲朗; 島村繁; 高木善弘; 丸山正; 丸山正; 吉田尊雄; 吉田尊雄
深海性共生二枚貝における無機炭素取込み機構の解明
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2013 - 吉田光宏; 島村繁; 布浦拓郎; 高井研
海洋シアノファージによる溶菌に由来する溶存態有機物のプロテオーム解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013 - 丸山正; 吉田尊雄; 高木善弘; 島村繁; 宮本教生; 藤原義弘; 宮崎征行; 津田美和子; 首藤彩; 佐藤矩行; 照屋盛実
深海共生系における共生工学の可能性:ホネクイハナムシの場合
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2013 - 島村繁; 金子隆司; 金子隆司; 丸山正; 吉田尊雄
シロウリガイ類共生細胞種間のゲノム縮小進化とNER関連遺伝子の欠失
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2013 - 島村繁、中川聡、高木善弘、高井研
〜解析時間短縮しませんか?〜 糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS」の紹介
第85回日本生化学会大会, 15 Dec. 2012 - NAKAGAWA SATOSHI, SHIMAMURA SHIGERU, TAKAKI YOSHIHIRO, Mino Sayaka, MAKITA HIROKO, SAWABE TOMOO, TAKAI KEN
Genomic and population genetic analysis of deep-sea vent chemoautotrophs.
AGU Fall Meeting 2012, 05 Dec. 2012 - 島村 繁
JAMSTECでの深海生物-共生微生物に関する研究
東京バイオテクノロジー専門学校 平成24年度学生研修講演会, 20 Sep. 2012 - Yoshihiro Takaki, Mamiko Nishino, Takeru Koshiishi, Shigeru Shimamura, Takao Yoshida, Miwako Tsuda, Chiaki Kato, Tadashi Maruyama
Reductive genome evolution in chemolithotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
14th International Symposium on Microbial Ecology, 20 Aug. 2012 - YOSHIDA TAKAO , TAKAKI YOSHIHIRO , SHIMAMURA SHIGERU , Tsukahara Masatoshi , Nezuo Maiko , Shimoji Makiko , Satou Kazuhito , Teruya Morimi , MARUYAMA TADASHI
The genome of an intracellur symbiont of deep sea clam, Calyptogena phaseoliformis, is still in an early phase of reductive genome evolution.
14th International Symposium on Microbial Ecology, 20 Aug. 2012 - Yuki Hongo, Yoshimitsu Nakamura, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Katsuyuki Uematsu, Takashi Toyofuku, Hisako Hirayama, Ken Takai, Masatoshi Nakazawa, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
The characterization and localization of carbonic anhydrase in symbiotic deep-sea clam Calyptogena okutanii.
Advances in genomics of (Deep-sea) chemoautotrophic symbioses, 25 May 2012 - 島村 繁、高木 善弘、 長井 裕季子、 津田 美和子、 丸山 正、吉田 尊雄
NGSを用いた深海性二枚貝の細胞内共生細菌ゲノム解析
第二回NGS現場の会, 24 May 2012 - 島村 繁、中川 聡、高木 善弘
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS」の紹介
BIO tech 2012 アカデミック フォーラム, 27 Apr. 2012 - 金子 隆司, 島村 繁, 丸山 正, 吉田 尊雄
シロウリガイ類共生細菌種間でのヌクレオチド除去修復遺伝子の欠失過程 -共生細菌ゲノム縮小進化との関連-
ブルーアース2012, 22 Feb. 2012 - 布浦拓郎; 風間宏美; 角太淳吾; 島村繁; 高木善弘; 高井研
深海底熱水活動域に棲息する新奇硫黄酸化Gammaproteobacteriaのゲノム解析
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2012 - 島村繁; 金子隆司; 金子隆司; 丸山正; 吉田尊雄
シロウリガイ類共生細菌種間でのNER関連遺伝子の欠失過程と共生細菌ゲノム縮小進化
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2012 - 金子隆司; 金子隆司; 島村繁; 丸山正; 吉田尊雄
シロウリガイ類共生細菌種間でのヌクレオチド除去修復遺伝子の欠失過程-共生細菌ゲノム縮小進化との関連-
ブルーアース要旨集, 2012 - 小澤元希; 小澤元希; 島村繁; 高木善弘; 横堀伸一; 前田太郎; 丸山正; 吉田尊雄
シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析
ブルーアース要旨集, 2012 - 小澤元希; 島村繁; 高木善弘; 丸山正; 丸山正; 吉田尊雄; 吉田尊雄
ミトコンドリアゲノムから見た深海性二枚貝シロウリガイ類の系統関係および共生細菌との共進化について
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2012 - 吉田(高島)ゆかり; 高木善弘; 島村繁; 布浦拓郎; 高井研
深海底熱水活動域に生息する化学合成独立栄養細菌に感染するファージのゲノム解析
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 2012 - 島村繁、中川聡、高木善弘、高井研
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS」の開発
第34回日本分子生物学会, 14 Dec. 2011 - Yoshihiro Takaki,Takuro Nunoura,Hiromi Kazama,Jungo Kakuta,Shigeru Shimamura,Ken Takai
Isolation, characterization and genomic features of sulfur-oxidizing Gammaproteobateria, a close relative strain of chemoautotrophic endosymbionts
12th Symposium on Aquatic Microbial Ecology, 28 Aug. 2011 - 島村 繁; 中川 聡; 高木 善弘; 澤辺 智雄; 高井 研
Genome analysis on the horizontally transmitted bacterial endosymbiont of deep-sea vent gastropod in the Central Indian Ridge.
ゲノム微生物学会ワークショップ, 20 Aug. 2011 - 島村 繁; 中川 聡; 高木 善弘
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS(TM)」の紹介
第10回国際バイオEXPOバイオ アカデミック フォーラム, 01 Jul. 2011 - 島村 繁; 中川 聡; 高木 善弘
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS (TM)」の紹介
第10回国際バイオEXPOバイオ アカデミック フォーラム, 01 Jul. 2011 - Yoshihiro Takaki,Takao Yoshida,Shigeru Shimamura,Masatoshi Tsukahara,Maiko Nezuo,Morimi Teruya,Shimoji Makiko,Tadashi Maruyama
Population genomics of the chemoautotrophic endsymbiont in Calyptogena clams
SMBE (Society for Molecular Biology and Evolution) 2011 Kyoto Coference, 26 Jun. 2011 - 島村 繁; 中川 聡; 高木 善弘; 澤辺 智雄; 高井 研
インド洋深海底熱水活動域に棲息する巻貝の細胞内共生微生物のゲノム解析
第5回日本ゲノム微生物学会年会, 15 Mar. 2011 - 島村 繁; 中川 聡; 高木 善弘; 澤辺 智雄; 高井 研
インド洋深海底熱水活動域に棲息する巻貝の細胞内共生微生物のゲノム解析
第5回日本ゲノム微生物学会, 14 Mar. 2011 - 阿部 真理子; 和辻 智郎; 牧田 寛子; 島村 繁; 高木 善弘; 宮崎 淳一; 山本 正浩; 高井 研; 中川 聡; 中村 謙太郎; 玉木 賢策
世界初、水素酸化の化学合成生物の発見 ―インド洋中央海嶺熱水活動域に生息するアルビン貝の機能解析―
ブルーアース2011, 08 Mar. 2011 - 布浦拓郎; 風間宏美; 角太淳吾; 島村繁; 高木善弘; 高井研
新奇硫黄酸化細菌の性状とゲノム解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011 - 吉田尊雄; 高木善弘; 島村繁; 丸山正
化学合成共生二枚貝の共生菌ゲノムの進化
日本比較免疫学会学術集会講演要旨, 2011 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 中村欽光; 島村繁; 高木善弘; 植松勝之; 中澤正年; 丸山正; 丸山正; 吉田尊雄; 吉田尊雄
深海の化学合成生態系に優占する二枚貝の炭酸脱水酵素の役割
日本炭酸脱水酵素研究雑誌, 2011 - 吉田尊雄; 高木善弘; 島村繁; 塚原正俊; 塚原正俊; 鼠尾まい子; 下地真紀子; 丸山正
ナギナタシロウリガイ細胞内共生菌のゲノム解析とそのゲノム縮小進化
生化学, 2011 - 吉田(高島)ゆかり; 布浦拓郎; 島村繁; 高井研
深海底熱水噴出域から単離した化学合成独立栄養細菌の溶原性ファージの性状解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011 - 阿部真理子; 和辻智郎; 牧田寛子; 島村繁; 高木善弘; 宮崎淳一; 山本正浩; 高井研; 中川聡; 中村謙太郎
インド洋中央海嶺熱水活動域と南マリアナ熱水活動域におけるアルビン貝共生菌の系統・機能遺伝子発現・活性解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011 - 中川聡; 島村繁; 高木善弘; 高井研; 澤辺智雄
インド洋の深海底熱水活動域に棲息する細胞内共生微生物のゲノム解析
ブルーアース要旨集, 2011 - 高木善弘; 島村繁; 丸山正; 吉田尊雄
ナギナタシロウリガイ共生菌のゲノム解析
ブルーアース要旨集, 2011 - 小澤元希; 小澤元希; 島村繁; 高木善弘; 神保充; 丸山正; 吉田尊雄
深海性二枚貝のミトコンドリアゲノム解析
ブルーアース要旨集, 2011 - 阿部真理子; 和辻智郎; 牧田寛子; 島村繁; 高木善弘; 宮崎淳一; 山本正浩; 高井研; 中川聡; 中村謙太郎; 玉木賢策
世界初,水素酸化の化学合成生物の発見-インド洋中央海嶺熱水活動域に生息するアルビン貝の機能解析-
ブルーアース要旨集, 2011 - 小澤元希; 島村繁; 高木善弘; 横堀伸一; 丸山正; 丸山正; 吉田尊雄; 吉田尊雄
深海性二枚貝シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web), 2011 - 瀧原速仁; 荻原淳; 吉田尊夫; 島村繁; 岩淵範之; 砂入道夫
Rhodococcus erythropolis PR4株の培地/アルカン二相培養系における細胞の局在性に対するGroEL2の影響
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011 - 下重裕一; 下重裕一; 小林英城; 島村繁; 宇佐美論
大腸菌の高重力応答
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2011 - 本郷 悠貴; 豊福 高志; 中村 欽光; 島村 繁; 平山 仙子; 高井 研; 藤倉 克則; 植松 勝之; 中澤 正年; 丸山 正; 吉田 尊雄
深海性二枚貝類における炭酸脱水酵素の機能と役割
日本生化学会, 神戸, 07 Dec. 2010 - 島村 繁; 中川 聡; 高木 善弘; 澤辺 智雄; 高井 研
Genome analysis on the horizontally transmitted bacterial endosymbiont of deep-sea vent gastropod in the Central Indian Ridge.
Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology, 07 Dec. 2010 - Yoshihiro Takaki; Takao Yoshida; Shigeru Shimamura; Masatoshi Tsukahara; Maiko Nezuo; Morimi Teruya; Makiko Shimoji; Tadashi Maruyama
Population genomic analysis of the chemoautotrophic endsymbiont in Calyptogena clams
Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology, 07 Dec. 2010 - 瀧原 速仁; 岩淵 範之; 吉田 尊雄; 島村 繁; 砂入 道夫
Rhodococcus erythropolis PR4株の培地/アルカン二相培養系での細胞の局在性,溶媒耐性に対するGroEL2の影響
第26回日本微生物生態学会, 25 Nov. 2010 - 瀧原 速仁; 岩淵 範之; 吉田 尊雄; 島村 繁; 砂入 道夫; 荻原 淳
Rhodococcus erythropolis PR4 株の培地/ アルカン二相培養系におけるプロテオーム解析
第62回日本生物工学会, 28 Oct. 2010 - 布浦拓郎; 風間宏美; 角太淳吾; 島村繁; 高木善弘; 高井研
深海底熱水活動域からの新奇硫黄酸化細菌の単離と全ゲノム解析
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2010 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 豊福高志; 中村欽光; 島村繁; 内村康祐; 平山仙子; 高井研; 藤倉克則; 丸山正; 吉田尊雄
シロウリガイ類における炭酸脱水酵素の活性測定と局在解析
Blue Earth要旨集, 2010 - 布浦拓郎; 風間宏美; 角太淳吾; 島村繁; 高木善弘; 高井研
巻き貝共生菌に近縁な硫黄酸化細菌の単離とそのゲノム解析
Blue Earth要旨集, 2010 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 豊福高志; 中村欽光; 島村繁; 内村康祐; 平山仙子; 高井研; 藤倉克則; 丸山正; 吉田尊雄
シロウリガイ類における炭酸脱水酵素の活性測定と局在解析
Blue Earth要旨集, 2010 - 高木善弘; 吉田尊雄; 桑原宏和; 島村繁; 丸山正
シロウリガイ類細胞内共生菌のゲノム縮小メカニズムについての考察
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2010 - 吉田尊雄; 高木善弘; 西野麻美子; 島村繁; 輿石武; 桑原宏和; 前田太郎; 丸山正
深海性二枚貝シロウリガイ類細胞内共生菌の比較ゲノムによるゲノム縮小進化解析
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2010 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 中村欽光; 豊福高志; 島村繁; 平山仙子; 高井研; 藤倉克則; 中澤正年; 丸山正; 吉田尊雄; 吉田尊雄
シロウリガイ類における炭酸脱水酵素の活性測定と局在解析
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2010 - 中川聡; 島村繁; 高木善弘; 高井研; 澤辺智雄
インド洋の深海底熱水活動域に棲息する細胞内共生微生物のゲノム解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010 - 瀧原速仁; 岩淵範之; 吉田尊夫; 島村繁; 砂入道夫; 荻原淳
Rhodococcus erythropolis PR4株の培地/アルカン二相培養系におけるプロテオーム解析
日本生物工学会大会講演要旨集, 2010 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 豊福高志; 中村欽光; 島村繁; 平山仙子; 高井研; 藤倉克則; 植松勝之; 中澤正年; 丸山正; 吉田尊雄
深海性の共生二枚貝類における炭酸脱水酵素の機能と役割
生化学, 2010 - 宮崎征行; 阿部真理子; 小出修; 森梢; 島村繁; 布浦拓郎; 小林徹; 井町寛之; 能木裕一; 高井研
海底下堆積物から分離した好気性細菌の分類学的研究
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010 - 瀧原速仁; 岩淵範之; 荻原淳; 吉田尊夫; 島村繁; 砂入道夫; 中嶋睦安; 中嶋睦安
Rhodococcus erythropolis PR4株の培地/アルカン二相培養系における各種プロテオーム解析
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2010 - TAKAKI YOSHIHIRO , Nishino Mamiko , Koshi-ishi Takeru , SHIMAMURA SHIGERU , YOSHIDA TAKAO, MARUYAMA TADASHI
Genome evolution in chemolithotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
International symposium of marine genomics, 16 Dec. 2009 - Yuki Hongo, Takao Yoshida, Shigeru Shimamura, Kohsuke Uchimura, Mitio Sunairi, Mutuyasu Nakajima, Tadashi Maruyama
Analysis of the gill specific protein in Calyptogena okutanii
4th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems (4th CBE), 30 Jul. 2009 - 布浦 拓郎; 風間 宏美; 角太 淳吾; 島村 繁; 高木 善弘; 高井 研
Isolation, characterization and genomic features of sulfur-oxidizing Gammaproteobateria belongs to a chemoautotrophic endosymbionts lineage
4th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems-Hydrothermal Vents, Seeps and Other Reducing Habitats-, 03 Jul. 2009 - 高木 善弘; 西野 麻美子; 島村 繁; 吉田 尊雄; 桑原 宏和; 丸山 正
Trend of the genome reduction in chemoautotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
4th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 30 Jun. 2009 - 島村 繁; 西野 麻美子; 高木 善弘; 吉田 尊雄; 河戸 勝; 桑原 宏和; 丸山 正
Possibility of the horizontal gene transfer (HGT) in chemoautotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
4th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 30 Jun. 2009 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 吉田尊雄; 吉田尊雄; 島村繁; 内村康祐; 砂入道夫; 中島睦安; 丸山正
シマイシロウリガイの共生機構における宿主発現タンパク質解析
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2009 - 吉田尊雄; 原田麻衣子; 桑原宏和; 島村繁; 高木善弘; 加藤千明; 三輪哲也; 三宅裕志; 丸山正
シマイシロウリガイ共生菌の硫黄酸化遺伝子の発現解析
マリンバイオテクノロジー学会大会講演要旨集, 2009 - 本郷悠貴; 本郷悠貴; 吉田尊雄; 島村繁; 内村康祐; 砂入道夫; 中嶋睦安; 丸山正
シマイシロウリガイの共生機構における宿主発現タンパク質解析
Blue Earth要旨集, 2009 - 酒井早苗; 高木善弘; 島村繁; 市川夏子; 田島誉久; 関根光雄; 小杉大樹; 田角栄二; 平木愛子; 清水愛; 加藤裕美子; 森浩二; 藤田信之; 井町寛之; 高井研
水素資化性メタン生成古細菌Methanocella paludicolaのゲノム解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2009 - Masashi Tsuchiya, Akiko Omura, Koichi Iijima, Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Hideki Masago, Kan Aoike, Hiroyuki Imachi, Fumio Inagaki, Ken Takai, Tatsuhiko Sakamoto, Kaoru Kubokawa, Hiroshi Kitazato
ちきゅうCK05-04 Leg.2およびCK06-06で採取された下北沖堆積物柱状試料の化石DNA解析
地球惑星科学連合大会, 27 May 2008 - 倉田淳志; 内村康祐; 宮崎征行; 島村繁; 能木裕一; 小林徹; 掘越弘毅
深海底泥由来Alkalimonas collagenimarina AC40Tのコラーゲン分解酵素の特性
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008 - 小出修; 森梢; 島村繁; 三浦健; 高木善弘; 諸野祐樹; 小林徹; 布浦拓郎; 井町寛之; 稲垣史生; 高井研; 掘越弘毅
下北半島沖海底下より掘削されたコア堆積層中に生存する好気性細菌の多様性
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008 - 中川 聡; 高木 善弘; 島村 繁; 高井 研
ゲノム解析から見えてきた熱水生態系の一次生産者とヒトに蔓延する病原性微生物の関係
InterRidge Japan研究発表集会, 30 Oct. 2007 - Masahiro Yamamoto, Satoshi Nakagawa, Shigeru Shimamura, Ken Takai, Koki Horikoshi
Enzymatic Characterization of Thiosulfate Oxidation in Epsilon-Proteobacteria Isolated from Deep-Sea Hydrothermal Field
InterRidge Theoretical Institute ‘Biogeochemical interaction at deep-sea vents’, 11 Sep. 2007 - H. Kuwahara,T. Yoshida , Y. Takaki , S. Shimamura , S. Nishi , M. Harada , K. Matsuyama , K. Takishita , M. Kawato , K. Uematsu , Y. Fujiwara , T. Sato , C. Kato , M. Kitagawa , I. Kato , T. Maruyama
The chemoautotrophic intracellular symbiont in the deep-sea clam, Calyptogena okutanii, has a small genome.
21st Pacific Science Congress, 01 Jun. 2007 - 中川 聡; 高木 善弘; 島村 繁; 高見 英人; 高井 研
深海底熱水孔環境に優占する化学合成独立栄養細菌epsilon-Proteobacteriaのゲノム解析
第1回日本ゲノム微生物学会, 02 Mar. 2007 - 中川聡; 布浦拓郎; 高木善弘; 島村繁; 大路樹生; 高井研
深海底熱水孔環境ミキシングゾーンに優占する化学合成独立栄養細菌
しんかいシンポジウム予稿集, 2007 - 桑原宏和; 吉田尊雄; 高木善弘; 島村繁; 西真郎; 原田麻衣子; 松山和世; 瀧下清貴; 河戸勝; 植松勝之; 藤原義弘; 佐藤孝子; 加藤千明; 北川正成; 加藤郁之進; 丸山正
シマイシロウリガイの共生微生物のゲノム解析から見えた代謝系の特徴
極限環境微生物学会誌, 2007 - 小出修; 森梢; 島村繁; 三浦健; 高木善弘; 小林徹; 布浦拓郎; 井町寛之; 稲垣史生; 高井研; 掘越弘毅
“ちきゅう”による下北半島沖掘削試験から得られたコア堆積層中の好気性菌の多様性
極限環境微生物学会誌, 2007 - 桑原宏和; 高木善弘; 吉田尊雄; 島村繁; 瀧下清貴; REIMER James D; REIMER James D; 加藤千明; 丸山正
シロウリガイ共生細菌ゲノムの比較からみえるゲノム縮小進化
極限環境微生物学会誌, 2007 - 倉田淳志; 内村康祐; 宮崎征行; 島村繁; 能木裕一; 小林徹; 掘越弘毅
深海底泥から得られた新菌種Alkalimonas collagenimarina AC40T由来のコラーゲン分解酵素
極限環境微生物学会誌, 2007 - 中川 聡; 高木 善弘; 島村 繁; 高井 研
深海底熱水孔環境に優占する化学合成独立栄養細菌epsilon-Proteobacteriaのゲノム解析
第22回日本微生物生態学会, 28 Oct. 2006 - 布浦 拓郎; 笈田 花子; 西 真郎; 島村 繁; 高見 英人; 山上 健; 石野 良純; 高井 研
Metagenomic analysis of uncultivated thermophilic crenarchaeotes from subsurface hot water stream in Hishikari gold mine
Frontiers in microbial genomics, 03 Mar. 2006 - 布浦 拓郎; 高見 英人; 笈田 花子; 平山 仙子; 西 真郎; 島村 繁; 鈴木 庸平; 稲垣 史生; 高井 研; 山下 敦士; 服部 正平; 掘越 弘毅
Metagenomics in subsurface biosphere
21st symposium of Japanese Society of Microbial Ecology, 01 Nov. 2005 - 布浦拓郎; 高見英人; 笈田花子; 平山仙子; 西真郎; 島村繁; 鈴木庸平; 稲垣史生; 高井研; 山下敦士; 服部正平; 掘越弘毅
地殼内生物圏におけるメタゲノム解析(遺伝子解析,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2005 - LI Zhijun; ZHANG Hui-Min; 島村繁; 高木善弘; 小林徹; 掘越弘毅
好アルカリ性細菌Bacillus halodurans C-125界面活性剤不溶性膜タンパク質の網羅的解析
日本分子生物学会年会講演要旨集, 2005 - 布浦拓郎; 笈田花子; 平山仙子; 鈴木庸平; 稲垣史生; 西真郎; 島村繁; 高見英人; 高井研; KENNETH H. Nealson; 掘越弘毅
菱刈金山地下熱水環境に優占する未知なる好熱性Archaeaゲノムの探索
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004 - 笈田花子; 布浦拓郎; 平山仙子; 鈴木庸平; 稲垣史生; 西真郎; 島村繁; 高見英人; 高井研; KENNETH H. Nealson; 堀越弘毅
菱刈金山地下熱水環境に存在する未培養好熱性Archaeaのrrn遺伝子オペロンを含むFosmidクローンの解析
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004 - 高見英人; 高木善弘; CHEE G-J; 西真郎; 島村繁; 鈴木洋子; 松井里美; 内山郁夫
好熱性G.kaustophilusの全ゲノム配列から見える好熱菌の特徴
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 2004 - 布浦拓郎; 笈田花子; 平山仙子; 鈴木庸平; 稲垣史生; 西真郎; 島村繁; 高見英人; 高井研
菱刈金山地下熱水環境からの未知なる好熱性Archaeaゲノムの探索
日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集, 2004
