研究者情報
researchmap URL
経歴(RM)
- 2025年10月 - 現在
国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門, 副主任研究員 - 2024年04月 - 現在
東北大学・海洋研究開発機構 変動海洋エコシステム高等研究所(兼職), 海洋微生物生態系変動研究ユニット - 2022年04月 - 2025年09月
国立研究開発法人海洋研究開発機構, 超先鋭研究開発部門, 研究員 - 2019年09月 - 2022年03月
沖縄科学技術大学院大学, 海洋生態物理学ユニット, Postdoctoral scholar - 2017年04月 - 2019年08月
カリフォルニア大学サンディエゴ校, スクリプス海洋研究所, Postdoctoral scholar - 2016年04月 - 2017年03月
東京大学, 大気海洋研究所, 特任研究員 - 2015年04月 - 2016年03月
東京大学, 大気海洋研究所, 学振PD
研究活動情報
論文
- Antón Vázquez-Arias; Conxi Rodríguez-Prieto; Yosuke Yamada; Motoo Ito; J. Ángel Fernández; Jesús R. Aboal
Deciphering uptake mechanisms of potentially toxic elements in seaweeds using high resolution imaging analysis
Journal of Hazardous Materials, 2025年08月23日
139646, 139646
[査読有り] - Hongwei Qin; Hisashi Endo; Akiko Ebihara; Amane Fujiwara; Jonaotaro Onodera; Yosuke Yamada; Hideki Fukuda; Toshi Nagata; Takuhei Shiozaki
Microorganisms Contributing to the Biological Pump in the Western Arctic Ocean During Late Summer
Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 2025年07月26日
130, 7
[査読有り] - Yosuke Yamada; Toshiaki Mochizuki; Nirav Patel; Farooq Azam; Hideki Fukuda; Toshi Nagata; Satoshi Mitarai
Organic particle scavenging by marine bacteria: influences of bacterial nanoscale surface properties
Applied and Environmental Microbiology, 2025年07月23日
91, 7
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Akiko Ebihara; Hideki Fukuda; Yosuke Yamada; Taichi Yokokawa; Takeshi Miki; Toshi Nagata
Structuring of particle-associated bacterial communities along the extracellular polymeric substance gradient of sinking and suspended particles in an oligotrophic, subtropical region of the western North Pacific Ocean
Frontiers in Marine Science, 2024年10月30日
11
[査読有り] - Wu Heng; Yamada Yosuke; Chuang Po-Shun; Ishikawa Kota; Mitarai Satoshi
Effects of flows on transparent exopolymer particles released from branching Acropora coral colonies
Frontiers in Marine Science, 2024年06月24日
11
[査読有り] - Yosuke Yamada; Akiko Ebihara; Hideki Fukuda; Shigeyoshi Otosaka; Satoshi Mitarai; Toshi Nagata
Functions of extracellular polymeric substances in partitioning suspended and sinking particles in the upper oceans of two open ocean systems
Limnology and Oceanography, 2024年03月25日
69, 5, 1101, 1114
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Po-Shun Chuang; Yosuke Yamada; Po-Yu Liu; Sen-Lin Tang; Satoshi Mitarai
Bacterial Community Shifts during Polyp Bail-Out Induction in Pocillopora Corals
Microbiology Spectrum, 2023年06月28日
[査読有り] - Yosuke Yamada; Nirav Patel; Hideki Fukuda; Toshi Nagata; Satoshi Mitarai; Farooq Azam
Bacterial surface roughness regulates nanoparticle scavenging in seawater
Limnology and Oceanography, 2023年01月27日
68, 4, 780, 789
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Nirav Patel; Yosuke Yamada; Farooq Azam
Bacterial Nanotubes as Intercellular Linkages in Marine Assemblages
Frontiers in Marine Science, 2021年12月09日
8, 768814
[査読有り] - Yosuke Yamada; Hideki Fukuda; Yu Umezawa; Toshi Nagata
Geographic Variation of Particle Size Distribution in the Kuroshio Region: Possible Causes in the Upper Water Column
Frontiers in Marine Science, 2021年11月16日
8, 768766
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Toshi Nagata; Yosuke Yamada; Hideki Fukuda
Transparent Exopolymer Particles in Deep Oceans: Synthesis and Future Challenges
Gels, 2021年06月22日
7, 3, 75
[査読有り] - Yosuke Yamada; Ryan Guillemette; Anne-Claire Baudoux; Nirav Patel; Farooq Azam
Viral Attachment to Biotic and Abiotic Surfaces in Seawater.
Applied and environmental microbiology, 2020年01月21日
86, 3
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Yosuke Yamada; Yuji Tomaru; Hideki Fukuda; Toshi Nagata
Aggregate Formation During the Viral Lysis of a Marine Diatom
Frontiers in Marine Science, 2018年05月15日
5, 167
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Y Yamada; T Yokokawa; M Uchimiya; S Nishino; H Fukuda; H Ogawa; T Nagata
Transparent exopolymer particles (TEP) in the deep ocean: full-depth distribution patterns and contribution to the organic carbon pool
Marine Ecology Progress Series, 2017年11月16日
583, 81, 93
[査読有り]
筆頭著者, 責任著者 - Y Yamada; H Fukuda; Y Tada; K Kogure; T Nagata
Bacterial enhancement of gel particle coagulation in seawater
Aquatic Microbial Ecology, 2016年04月25日
77, 1, 11, 22
[査読有り]
筆頭著者 - Yosuke Yamada; Hideki Fukuda; Mario Uchimiya; Chiaki Motegi; Shigeto Nishino; Takashi Kikuchi; Toshi Nagata
Localized accumulation and a shelf‐basin gradient of particles in theC hukchiS ea andC anadaB asin, westernA rctic
Journal of Geophysical Research: Oceans, 2015年07月03日
120, 7, 4638, 4653
[査読有り]
筆頭著者 - Y Yamada; H Fukuda; K Inoue; K Kogure; T Nagata
Effects of attached bacteria on organic aggregate settling velocity in seawater
Aquatic Microbial Ecology, 2013年10月16日
70, 3, 261, 272
[査読有り]
筆頭著者
講演・口頭発表等
- Yosuke Yamada; Yuki Morono; Motoo Ito
Bacterial uptake efficiency of carbon and nitrogen from nanoparticles in seawater
Ocean Science Meeting 2026, 2026年02月27日 - Yosuke Yamada
Exploring surface characteristics of individual marine bacteria and their influence on biogeochemical processes
OIST x WPI-AIMEC (Tohoku U & JAMSTEC) Joint Workshop, 2025年11月21日 - Yosuke Yamada
Single-cell analysis of marine bacterial surface properties and their potential impact on biogeochemical cycles
PICES-2025 Annual Meeting, 2025年11月12日 - 山田洋輔; 諸野祐樹; 伊藤元雄
海洋ナノ粒子由来炭素・窒素の細菌利用効率の推定
日本海洋学会2025年度秋季大会, 2025年09月22日 - 星野辰彦; 山田洋輔; 長野由梨子; 菊池早希子; 稲垣史生
海洋一粒子の微生物叢・機能・成分の統合分析
日本海洋学会2025年度秋季大会, 2025年09月22日 - Yosuke Yamada
The ratio of protein to carbohydrate in the extracellular polymeric substances of marine diatoms
FEMS MICRO 2025, 2025年07月15日 - Yosuke Yamada
Nanoscale Characterization of Marine Bacteria and Particles
AIMEC workshop in SIO: Ocean environmental change and its impact on ecosystems, 2025年06月23日 - Yosuke Yamada
The Protein/Carbohydrate Ratio of Extracellular Polymers Released by Diatoms
ASM Microbe 2025, 2025年06月22日 - 山田洋輔
珪藻の細胞外ポリマー物質組成の時間的変化と細胞溶解との潜在的な関連性
日本地球惑星科学連合2025年大会, 2025年05月27日 - 星野 辰彦; 山田 洋輔; 高橋 亮; 稲垣 史生
海洋沈降粒子一粒子分析スキームの構築
日本地球惑星科学連合2025年大会, 2025年05月27日 - 星野辰彦; 山田洋輔; 長野由梨子; 稲垣史生
海洋粒子の微生物群集組成と代謝機能ポテンシャルの一粒子レベル解析
第25回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2025年05月25日 - 山田洋輔
海洋細菌の物質循環との関わり
大隅基礎科学創成財団主催シンポジウム 微生物ラボ・ハブ in 中四国, 2025年05月16日 - Yosuke Yamada, Toshiaki Mochizuki, Nirav Patel, Farooq Azam, Satoshi Mitarai
Variation in Surface Properties of Individual Bacterial Cells that Influences Viral Attachment
ASLO2025 Aquatic Science Meeting, 2025年03月29日 - 山田洋輔
原子間力顕微鏡による海洋微粒子の機械的特性測定
名古屋大学宇宙地球環境研究所・共同利用研究集会 CO2除去に関わる海の生物炭素ポンプ研究の現状と将来展望, 2025年03月14日, [招待有り] - Yosuke Yamada
Applications of atomic force microscopy (AFM) to marine biogeochemistry
Workshop for Collaborative Research of AIMEC, 2025年03月05日 - 山田洋輔
原子間力顕微鏡の海洋生物化学への応用
2024年度日本顕微鏡学会SPM研究会, 2025年01月09日, [招待有り] - Yosuke Yamada; Toshiaki Mochizuki; Hideki Fukuda; Toshi Nagata; Satoshi Mitarai
Mechanical properties of marine particles: Insights from atomic force microscopy
AGU24, 2024年12月13日 - 山田洋輔
海洋物質循環メカニズム解明のための細菌表面の粗さ解析
AFMから見えるバクテリアの世界~その観察手法と展望 ウェビナー, 2024年11月28日, [招待有り] - 山田洋輔
海洋細菌の表面性状と炭素源獲得機構の解明
日本微生物生態学会 第37回大会 JST 創発的研究支援事業「自発的融合の場」:微生物研究を基盤とした創発 的ネットワーキング, 2024年10月28日, [招待有り] - 山田 洋輔; Angela Ares; Margaret Mars Brisbin; 御手洗 哲司
海洋細菌の表面粗さを制御する環境・生物要因の解明
日本海洋学会2024年度秋季大会, 2024年09月19日 - Yosuke Yamada; Angela Ares; Margaret Mars Brisbin; Satoshi Mitarai
Environmental factors and bacterial community composition shaping bacterial surface roughness in coastal waters: Nanoparticle utilization perspective
19th International Symposium on Microbial Ecology (ISME19), 2024年08月22日 - 山田洋輔
過去を知るために現在を知る: 海洋における粒子生成・沈降と微生物との関わり
日本古生物学会 2024 年年会・総会 夜間小集会, 2024年06月22日, [招待有り] - Vázquez-Arias, Antón; Rodríguez-Prieto, Conxi; Yamada, Yosuke; Fernández, J. Ángel; Ito, Motoo; Aboal, Jesús R
EXPLORING THE SUBCELLULAR DISTRIBUTIONS AND UPTAKE MECHANISMS OF CHEMICAL ELEMENTS IN SEAWEED USING NANOSCALE SECONDARY ION MASS SPECTROMETRY (NANOSIMS)
8th Congress of the International Society for Applied Phycology (ISAP2024), 2024年06月18日 - 山田洋輔
原子間力顕微鏡による細菌の表面性状測定と海洋物質循環メカニズムの理解深化
WPI-AIMEC 浅⾍ワークショップ2024, 2024年06月17日 - Heng Wu; Kota Ishikawa; Yosuke Yamada; Akinori Murata; Satoshi Mitarai
Effects of Flows on the Transparent Exopolymer Particle Distribution in a Fringing Coral Reef: Field Observations
Japan Geoscience Union Meeting 2024, 2024年05月29日 - Heng Wu; Kota Ishikawa; Yosuke Yamada; Akinori Murata; Satoshi Mitarai
Effects of Flows on the Transparent Exopolymer Particle Concentration in a Fringing Coral Reef: Field Observations
AGU23, 2023年12月11日 - 山田 洋輔; 望月 俊昭; 星野 辰彦; Nirav Patel; Farooq Azam; 福田 秀樹; 御手洗 哲司
溶存態有機物濃度による海洋細菌の表面性状変化とナノ粒子付着の関係解明
日本海洋学会 2023年度秋季大会, 2023年09月25日 - 海老原諒子; 福田秀樹; 山田洋輔; 横川太一; 永田俊
海洋沈降粒子に発達する細菌群集の異なる生活史戦略
日本海洋学会 2023年度秋季大会, 2023年09月25日 - 福田秀樹; 海老原諒子; 横川太一; 山田洋輔; 佐野雅美; 伊藤幸彦; 永田 俊
春季三陸沖のフロントにおける粒子の分布特性
日本海洋学会 2023年度秋季大会, 2023年09月25日 - 山田洋輔
海洋物質循環における細菌の役割-細菌表面のナノスケール測定による新知見を交えて-
2023 年度日本農芸化学会中四国支部第 38 若手研究者シンポジウム, 2023年07月01日, [招待有り] - Akiko EBIHARA; Hideki FUKUDA; Yosuke YAMADA; Taichi YOKOKAWA; Toshi NAGATA
Network analysis of particle-associated microbiome revealed potential key taxa driving carbon export during a subarctic spring phytoplankton bloom
ASLO Aquatic Sciences Meeting 2023 4–9 June Palma de Mallorca, Spain, 2023年06月08日 - Yosuke Yamada; Toshiaki Mochizuki; Nirav Patel; Farooq Azam; Satoshi Mitarai
Bacterial surface properties and their effects on nanoparticle scavenging in seawater
ASLO Aquatic Sciences Meeting 2023 4–9 June Palma de Mallorca, Spain, 2023年06月07日 - 福田秀樹; 山田洋輔; 斎藤宏明; 永田俊
黒潮周辺海域の表層部における粒径分布の変動特性と有機炭素の沈降フラックス との関係
黒潮生態系とその 変動を駆動する物理・化学・生物過程シンポジウム講演要旨集, 2022年12月06日 - 海老原 諒子; 福田秀樹; 山田 洋輔; 横川 太一; 永田俊
海洋沈降性粒子の微生物群集ネットワーク
日本微生物生態学会要旨集, 2022年11月01日 - 海老原諒子; 福田秀樹; 山田洋輔; 横川太一; 永田俊
沈降性および懸濁性海洋粒子に特徴的な原核生物群集組成の海域間比較
日本海洋学会大会講演要旨集, 2022年09月06日 - 山田洋輔; 望月俊昭; Nirav Patel; Farooq Azam; 御手洗哲司
海洋細菌の表面性状とナノサイズ粒子付着の関係解明
日本海洋学会大会講演要旨集, 2022年09月06日 - W. Heng; Y. Yamada; P. Chuang; K. Ishikawa; S. Mitarai
Effects of flows on release of transparent exopolymer particles from corals
Ocean Science Meeting, Hawaii, USA, 27 Feb-4 Mar, online, 2022年03月04日 - 山田洋輔
現場観測および顕微鏡観察・画像解析による海洋粒子の性状解明(基調講演)
日本海洋学会沿岸海洋研究会 日本海洋学会西南支部 九州沖縄地区合同シンポジウム 講演要旨集、水産海洋研究, 2021年11月22日, [招待有り] - 山田 洋輔; N. Patel; F. Azam; 御手洗 哲司
海洋細菌の表面性状がナノサイズ粒子の付着へ及ぼす影響
日本海洋学会大会講演要旨集, 2020年11月29日 - 山田洋輔
細菌・ウイルスによる海洋炭素循環の制御メカニズム(依頼公演)
日本地球化学会要旨集, 2020年11月21日, [招待有り] - Y. Yamada; N. Patel; F. Azam
Bacterial surface roughness affects viral attachment in seawater
Ocean Sciences Meeting, San Diego, USA, 16-21 Feb, 2020年02月18日 - J. Rivera; N. Patel; Y. Yamada; F. Azam; J. Dinasquet
Bacterioplankton utilization of colloidal organic matter: experimental degradation of the large and abundant protein RuBisCO
5th Annual Scripps Student Symposium, University of California, San Diego, USA, 2018年09月26日 - 濵﨑 恒二; Shu Kuan Wong; 山田 洋輔; 井上 智; 李 謹岑; 植松 光夫; 岩本 洋子; 上野 祐尉子; 植竹 淳; 高見 英人; 鶴丸 央; 岩田 歩; 松木 篤
表面マイクロ層とエアロゾルの微生物動態—九十九湾における観測研究の予察報告−
大気バイオエアロゾルシンポジウム講演要旨集, 2017年02月20日 - Y. Yamada; H. Fukuda; T. Nagata
Bacterial control of gel-like particle coagulation in seawater: implications for the regulation of biological carbon pump
AORI-SIO Symposium for Building Strategic Partnership, Martin Johnson House (T-29), Scripps Institution of Oceanography, UC San Diego, USA 3‒4 Oct, 2016年10月04日 - 山田 洋輔; 福田 秀樹; 永田 俊
黒潮流軸付近において現場型光散乱・透過率粒子測定計で検出された粒子の鉛直分布と粒子サイズ分布
日本海洋学会大会講演要旨集, 2016年09月14日 - 齋藤 類; 眞野 能; 片山 智代; 日原 勉; 山田 洋輔; 宮本 雅俊
ナイトセッション A 海洋若手研究者の会―研究者間ネットワークの構築と強化―
日本海洋学会大会講演要旨集, 2016年09月 - 土屋 健司; 鈴木 健太郎; 青木 一弘; 山田 洋輔; 宮本 雅俊
ナイトセッション A 海洋若手研究者の会―研究者間ネットワークの構築と強化―
日本海洋学会大会講演要旨集, 2016年03月 - Y. Yamada; T. Yokokawa; H. Ogawa; T. Nagata
Gel-like particles dominate particulate organic carbon in the ocean’s interior – Evidence from subtropical and equatorial regions of the central Pacific
Ocean Sciences Meeting, New Orleans, USA, 21‒26 Feb, 2016年02月24日 - 山田 洋輔; 福田 秀樹; 内宮 万里央; 茂手木 千晶; 西野 茂人; 菊池 隆; 永田 俊
西部北極海の陸棚 (チュクチ海) および海盆域 (カナダ海盆) における懸濁態粒子の局所的蓄積と濃度水平勾配
日本海洋学会大会講演要旨集, 2015年03月22日 - Y. Yamada; H. Fukuda; Y. Tada; K. Kogure; T. Nagata
Bacterial enhancement of microgel coagulation in seawater
Aquatic Sciences Meeting, Granada, Spain 22‒27 Feb, 2015年02月23日 - 内宮 万里央; 茂手木 千晶; 山田 洋輔; 楊 燕輝; 福田 秀樹; 永田 俊
西部北極海における微生物群集・有機物の空間変動およびその支配機構
日本海洋学会大会講演要旨集, 2014年03月30日 - 山田 洋輔; 福田 秀樹; 永田 俊
細菌による大型有機凝集物 (マリンスノー) の形成促進要因
日本海洋学会大会講演要旨集, 2013年09月20日 - 山田 洋輔; 福田 秀樹; 永田 俊
細菌による大型有機凝集物 (マリンスノー) の形成促進
日本海洋学会大会講演要旨集, 2013年03月23日 - Y. Yamada; H. Fukuda; K. Inoue; K. Kogure; T. Nagata
Role of attached bacteria in controlling settling velocity of organic aggregates in seawater
2nd International Workshop on Marine Aggregates, Bremen, Germany, 15‒17 Aug, 2012年08月16日 - Y. Yamada; H. Fukuda; K. Inoue; K. Kogure; T. Nagata
Attached bacteria reduce settling velocity of organic aggregates in seawater
Aquatic Sciences Meeting, Shiga, Japan, 8‒13 Jul, 2012年07月12日 - Y. Yamada; H. Fukuda; K. Inoue; K. Kogure; T. Nagata
Attached bacteria reduce settling velocity of organic aggregates in seawater
2nd University of Hawaii and University of Tokyo Joint Symposium on Ocean and Coastal Sciences, Hawaii, USA, 2012年06月13日 - 山田 洋輔; 永田 俊
海洋における凝集物に付着した細菌の網羅的遺伝子発現解析
NGS現場の会研究会講演要旨集, 2012年05月24日 - 山田 洋輔; 福田 秀樹; 井上 雄介; 木暮 一啓; 永田 俊
透明細胞外ポリマー(TEP)の沈降に対する細菌の付着効果
日本海洋学会大会講演要旨集, 2011年09月29日 - P. Juda; Y. Yamada; J. Smigova; I. Raska; T. Higashinakagawa; D. Cmarko
Cellular translocation of mouse PcG M33 protein
22nd Wilhelm Bernhard Workshop, Riga, Latvia, 2011年08月28日
メディア報道
- 海洋機構、「国際掘削」10年
日刊工業新聞社, 日刊工業新聞, 2023年07月17日, 新聞・雑誌 - Viruses Are Not Always the Villain
Saima Sidik, Hakai Magazine, 2022年04月12日, 新聞・雑誌