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論文
- Sabitree Shahi; Sakae Hisano; Wasiatus Sa'diyah; Yoshihiro Takaki; Hideki Kondo; Nobuhiro Suzuki
〔Major achievements〕Thorough characterization of a new curvulavirid from a Japanese strain of Cryphonectria nitschkei
Journal of General Virology, 2025年12月17日
106, 12
[査読有り] - Masanori Kaneko; Yoshinori Takano; Yuta Isaji; Nanako O. Ogawa; Yoshito Chikaraishi; Naoto F. Ishikawa; Hiroyuki Imachi; Yoshihiro Takaki; Miyuki Ogawara; Fumie Kabashima; Martin Krüger; Naohiko Ohkouchi
Nitrogen and carbon flows in a microbial mat involving anaerobic oxidation of methane in northwestern Black Sea: perspectives from nitrogen and carbon isotopic composition of coenzyme F430 and its biosynthetic pathway
Progress in Earth and Planetary Science, 2025年12月06日
12, 1
[査読有り] - Hitoshi Kodamatani; Masahiro Yamamoto; Yoshihiro Takaki; Shintaro Hamasuna; Katsuyuki Ichitani; Ryo Kanzaki; Takashi Tomiyasu
Three-year dynamics of methylmercury production in Hg2+-spiked paddy soils: Mercury speciation, microbial communities, and rice contamination
Chemosphere, 2025年12月
393, 144767, 144767
[査読有り] - Syun-ichi Urayama; Akihito Fukudome; Pascal Mutz; Yosuke Matsushita; Yoshihiro Takaki; Yosuke Nishimura; Sofia Medvedeva; Mart Krupovic; Eugene V. Koonin; Takuro Nunoura
Identification of Obelisk-like covalently closed circular RNA replicon in hot springs by double-stranded RNA sequencing and expansion of the diversity of the Obelisk superfamily
bioRxiv, 2025年09月03日 - Hiromi Kambara; Taito Kawamoto; Shuji Matsushita; Tomonori Kindaichi; Noriatsu Ozaki; Yoshiteru Aoi; Yoshihiro Takaki; Hiroyuki Imachi; Masaru Konishi Nobu; Miyuki Ogawara; Akiyoshi Ohashi
First isolation of a methanotrophic Mycobacterium reveals ammonia- and pH-tolerant methane oxidation
Applied and Environmental Microbiology, 2025年08月20日
91, 8
[査読有り] - Mikako Tachioka; Masayuki Miyazaki; Mikiko Tsudome; Miwako Tsuda; Kohsuke Uchimura; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
Marinicellulosiphila megalodicopiae gen. nov., sp. nov., a deep-sea alkaliphilic cellulolytic bacterium isolated from an endemic ascidian Megalodicopia hians
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2025年04月02日
75, 4
[査読有り] - Hirokazu Shimoshige; Keiichi Yanagisawa; Masayuki Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Hidetaka Nomaki; Mizuki Fukui; Hiroki Shirakawa; Hideki Kobayashi; Azuma Taoka; Toru Maekawa
Isolation and cultivation of a novel freshwater magnetotactic coccus FCR-1 containing unchained magnetosomes
Communications Biology, 2025年03月27日
8, 1
[査読有り] - Jiarui Sun; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Paul N. Evans; Takuro Nunoura; Christian Rinke
Metagenomic insights into taxonomic and functional patterns in shallow coastal and deep subseafloor sediments in the Western Pacific
Microbial Genomics, 2025年03月18日
11, 3
[査読有り] - Mitsuhiro Yoshida; Sofia Medvedeva; Akihito Fukudome; Yuri I Wolf; Syun-ichi Urayama; Yosuke Nishimura; Yoshihiro Takaki; Eugene V Koonin; Mart Krupovic; Takuro Nunoura
“Paraxenoviridae”, a putative family of globally distributed marine bacteriophages with double-stranded RNA genomes
The ISME Journal, 2025年01月02日
19, 1
[査読有り] - Mikako Tachioka; Mikiko Tsudome; Miwako Tsuda; Satoshi Hiraoka; Masayuki Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
Characteristics of deep-sea microbial cellulases: key determinants of the ultimate fate of plant biomass on Earth
Journal of Wood Science, 2024年11月14日
70, 1
[査読有り] - Masahiro Yamamoto; Yoshifumi Kawada; Yoshihiro Takaki; Kosuke Shimoniida; Mariko Shitara; Akiko Tanizaki; Hiroyuki Kashima; Miho Hirai; Yutaro Takaya; Tatsuo Nozaki; Takafumi Kasaya; Ken Takai
Electrochemical survey of electroactive microbial populations in deep‑sea hydrothermal fields
Progress in Earth and Planetary Science, 2024年08月
11, 45
[査読有り] - Hiroyuki Imachi; Masaru K Nobu; Shingo Kato; Yoshihiro Takaki; Masayuki Miyazaki; Makoto Miyata; Miyuki Ogawara; Yumi Saito; Sanae Sakai; Yuhei O Tahara; Yoshinori Takano; Eiji Tasumi; Katsuyuki Uematsu; Toshihiro Yoshimura; Takashi Itoh; Moriya Ohkuma; Ken Takai
Promethearchaeum syntrophicum gen. nov., sp. nov., an anaerobic, obligately syntrophic archaeon, the first isolate of the lineage 'Asgard' archaea, and proposal of the new archaeal phylum Promethearchaeota phyl. nov. and kingdom Promethearchaeati regn. nov.
International journal of systematic and evolutionary microbiology, 2024年07月
74, 7
[査読有り] - Hisako Hirayama, Yoshihiro Takaki, Mariko Abe, Masayuki Miyazaki, Katsuyuki Uematsu, Yohei Matsui, Ken Takai
Methylomarinovum tepidoasis sp. nov., a moderately thermophilic methanotroph of the family Methylothermaceae isolated from a deep-sea hydrothermal field
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2024年03月13日
74
[査読有り] - Syun-ichi Urayama, Akihito Fukudome, Miho Hirai, Tomoyo Okumura, Yosuke Nishimura, Yoshihiro Takaki, Norio Kurosawa, Eugene V. Koonin, Mart Krupovic, Takuro Nunoura
Double-stranded RNA sequencing reveals distinct riboviruses associated with thermoacidophilic bacteria from hot springs in Japan
Nature Microbiology, 2024年01月17日
9, 2, 514, 523
[査読有り] - Yi Zhang, Yoshihiro Takaki, Yukari Yoshida-Takashima, Satoshi Hiraoka, Kanako Kurosawa, Takuro Nunoura, Ken Takai
A sequential one-pot approach for rapid and convenient characterization of putative restriction-modification systems
mSystems, 2023年10月16日
8, 6, e00817-23
[査読有り] - Akihiro Tame,Tadashi Maruyama,Tetsuro Ikuta,Yoshihito Chikaraishi,Nanako O. Ogawa,Masashi Tsuchiya,Kiyotaka Takishita,Miwako Tsuda,Miho Hirai,Yoshihiro Takaki,Naohiko Ohkouchi,Katsunori Fujikura,Takao Yoshida
mTORC1 regulates phagosome digestion of symbiotic bacteria for intracellular nutritional symbiosis in a deep-sea mussel
Science Advances, 2023年08月23日
9, 34, eadg8364
[査読有り] - Syun-ichi Urayama; Akihito Fukudome; Miho Hirai; Tomoyo Okumura; Yosuke Nishimura; Yoshihiro Takaki; Norio Kurosawa; Eugene V. Koonin; Mart Krupovic; Takuro Nunoura
Distinct groups of RNA viruses associated with thermoacidophilic bacteria
2023年07月03日
[査読有り] - Yurika Ujiie, Yoshiyuki Ishitani, Yukiko Nagai, Yoshihiro Takaki, Takashi Toyofuku, Shun’ichi Ishii
Unique evolution of foraminiferal calcification to survive global changes
Science Advances, 2023年06月21日
9, 25
[査読有り] - Shinsuke Kawagucci, Sanae Sakai, Eiji Tasumi, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Masafumi Saitoh, Yuichiro Ueno, Naohiro Yoshida, Takazo Shibuya, James Clifford Sample, Tomoyo Okumura, Ken Takai
Deep Subseafloor Biogeochemical Processes and Microbial Populations Potentially Associated with the 2011 Tohoku-oki Earthquake at the Japan Trench Accretionary Wedge (IODP Expedition 343)
Microbes and Environments, 2023年06月16日
38, 2
[査読有り] - Tatsuya Yamashita, Hiroki Matsuda, Kyohei Koizumi, Logu Thirumalaisamy, Myeongok Kim, Lumi Negishi, Hitoshi Kurumizaka, Yoriko Tominaga, Yoshihiro Takagi, Ken Takai, Taiga Okumura, Hidekazu Katayama, Masaki Horitani, Nazmul Ahsan, Yoshitaka Okada, Koji Nagata, Yohey Suzuki, Michio Suzuki
Heme protein identified from scaly-foot gastropod can synthesize pyrite (FeS2) nanoparticles
Acta Biomaterialia, 2023年04月27日
162, 110, 119
[査読有り] - Mikiko Tsudome, Mikako Tachioka, Masayuki Miyazaki, Miwako Tsuda, Yoshihiro Takaki, Shigeru Deguchi
Marinagarivorans cellulosilyticus sp. nov., a cellulolytic bacterium isolated from the deep-sea off Noma-misaki, Japan
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2023年03月02日
73, 3
[査読有り] - Yuto Chiba, Akinori Yabuki, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Syun-ichi Urayama,Daisuke Hagiwara
The first identification of a narnavirus in Bigyra, a marineprotist
Microbes and Environments, 2023年03月01日
38, 1
[査読有り] - Yukari Yoshida-Takashima, Yoshihiro Takaki, Mitsuhiro Yoshida, Yi Zhang, Takuro Nunoura & Ken Takai
Genomic insights into phage-host interaction in the deep-sea chemolithoautotrophic Campylobacterota, Nitratiruptor
ISME Communications, 2022年11月01日
2
[査読有り] - Masahiro Yamamoto, Yoshihiro Takaki, Hiroyuki Kashima, Miwako Tsuda, Akiko Tanizaki, Ryuhei Nakamura & Ken Takai
In situ electrosynthetic bacterial growth using electricity generated by a deep-sea hydrothermal vent
ISME Journal, 2022年09月23日
17, 12, 20
[査読有り] - Shoichi Sakaguchi, Syun-ichi Urayama, Yoshihiro Takaki, Kensuke Hirosuna, Hong Wu, Youichi Suzuki, Takuro Nunoura, Takashi Nakano, So Nakagawa
NeoRdRp: A comprehensive dataset for identifying RNA-dependent RNA polymerase of various RNA viruses from metatranscriptomic data
Microbes and Environments, 2022年08月24日
37, 3
[査読有り] - Syun-ichi Urayama, Yoshihiro Takaki, Yuto Chiba, Yanjie Zhao, Misa Kuroki, Daisuke Hagiwara, Takuro Nunoura
Eukaryotic microbial RNA viruses—acute or persistent? —Insights into their function in the aquatic ecosystem
Microbes and Environments, 2022年08月03日
37, 5
[査読有り] - Mikiko Tsudome, Mikako Tachioka, Masayuki Miyazaki, Kohsuke Uchimura, Miwako Tsuda, Yoshihiro Takaki, Shigeru Deguchi
An ultrasensitive nanofiber-based assay for enzymatic hydrolysis and deep-sea microbial degradation of cellulose
iScience, 2022年07月25日
25, 104732, 1, 17
[査読有り] - Oshiki M, Takaki Y, Hirai M, Nunoura T, Kamigaito A, Okabe S
Metagenomic Analysis of Five Phylogenetically Distant Anammox Bacterial Enrichment Cultures
Microbes and Environments, 2022年07月09日
37, 3
[査読有り] - Syun-suke Kadoya, Syun-ichi Urayama, Takuro Nunoura, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Masaaki Kitajima, Toyoko Nakagomi, Osamu Nakagomi, Satoshi Okabe, Osamu Nishimura, Daisuke Sano
The Intrapopulation Genetic Diversity of RNA Virus may Influence the Sensitivity of Chlorine Disinfection
Frontiers in Microbiology, 2022年05月20日
13
[査読有り] - Hisako Hirayama, Yoshihiro Takaki, Mariko Abe, Hiroyuki Imachi, Tetsuro Ikuta, Junichi Miyazaki, Eiji Tasumi, Katsuyuki Uematsu, Akihiro Tame, Miwako Tsuda, Keiko Tanaka, Yohei Matsui, Hiromi Kayama Watanabe, Hiroyuki Yamamoto, Ken Takai
Multispecies populations of methanotrophic Methyloprofundus and cultivation of a likely dominant species from the Iheya North deep-sea hydrothermal field
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2022年01月25日
88, 2
[査読有り] - Junya Hirai, Syun-ichi Urayama, Yoshihiro Takaki, Miho Hirai, Keizo Nagasaki, Takuro Nunoura
RNA virosphere in a marine zooplankton community in the subtropical western North Pacific
Microbes and Environments, 2022年01月01日
37, 5
[査読有り] - Yuki Hongo, Kei Kimura, Yoshihiro Takaki, Yukari Yoshida, Shuichiro Baba, Genta Kobayashi, Keizo Nagasaki, Takeshi Hano, Yuji Tomaru
The genome of the diatom Chaetoceros tenuissimus carries an ancient integrated fragment of an extant virus
Scientific Reports, 2021年11月24日
11, 1, 22877
[査読有り] - Mitsunobu S., Ohashi Y., Makita H., Suzuki Y., Nozaki T., Ohigashi T., Ina T., Takaki Y.
One-Year In Situ Incubation of Pyrite at the Deep Seafloor and Its Microbiological and Biogeochemical Characterizations
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2021年09月22日
87
[査読有り] - Tetsuro Ikuta, Yuka Amari, Akihiro Tame, Yoshihiro Takaki, Miwako Tsuda, Ryo Iizuka, Takashi Funatsu, Takao Yoshida
Inside or out? Clonal thiotrophic symbiont populations occupy deep-sea mussel bacteriocytes with pathways connecting to the external environment
ISME Communications, 2021年08月17日
1, 38
[査読有り] - Yukari Ohta,Madoka Katsumata,Kanako Kurosawa,Yoshihiro Takaki,Hiroshi Nishimura,Takashi Watanabe, Ken-ichi Kasuya
Degradation of ester linkages in rice straw components by Sphingobium species recovered from the sea bottom using a non-secretory tannase-family α/β hydrolase
Environmental Microbiology, 2021年06月29日
23, 8, 4151, 4167
[査読有り] - Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Fumie Kondo, Masayuki Horie, Syun-Ichi Urayama, Takuro Nunoura
RNA Viral Metagenome Analysis of Subnanogram dsRNA Using Fragmented and Primer Ligated dsRNA Sequencing (FLDS)
Microbes and Environments, 2021年05月01日
36, 2
[査読有り] - Taro Maeda, Shunichi Takahashi, Takao Yoshida, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Yukiko Nagai, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Asuka Arimoto, Hisaki Ishii, Nori Satoh, Tomoaki Nishiyama, Mitsuyasu Hasebe, Tadashi Maruyama, Jun Minagawa, Junichi Obokata, Shuji Shigenobu
Chloroplast acquisition without the gene transfer in kleptoplastic sea slugs, Plakobranchus ocellatus
eLife, 2021年04月27日
10, e60176
[査読有り] - Melina Kerou , Rafael Ponce-Toledo , Rui Zhao , Sophie Abby , Miho Hirai , Hidetaka Nomaki , Yoshihiro Takaki , Takuro Nunoura , Steffen Jørgensen, Christa Schleper
Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages
ISME Journal, 2021年04月01日
15, 9, 2792, 2808
[査読有り] - Kanae Igawa-Ueda, Tetsuro Ikuta (co-first author), Akihiro Tame, Katsushi Yamaguchi, Shuji Shigenobu, Yuki Hongo, Yoshihiro Takaki, Katsunori Fujikura, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Symbiont transmission onto the cell surface of early oocytes in the deep-sea clam, Phreagena okutanii
Zoological Science, 2021年02月25日
38, 2, 140, 147
[査読有り] - Tamaki Uehara-Ichiki, Syun-ichi Urayama, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Masashi Fujinaga, Kaoru Hanada
Complete genome sequence of Sikte (Sitke) waterborne virus, a member of the genus Tombusvirus.
ARCHIVES OF VIROLOGY, 2021年01月25日
166, 3, 991, 994
[査読有り] - Syun-ichi Urayama, Nobutaka Doi, Fumie Kondo, Yuto Chiba, Yoshihiro Takaki, Miho Hirai, Yasutaka Minegishi, Daisuke Hagiwara and Takuro Nunour
Diverged and active partitiviruses in lichen
Frontiers in Microbiology, 2020年10月21日
11
[査読有り] - Kaori Motoki; Tomoo O. Watsuji; Yoshihiro Takaki; Ken Takai; Wataru Iwasaki
Metatranscriptomics by in Situ RNA Stabilization Directly and Comprehensively Revealed Episymbiotic Microbial Communities of Deep-Sea Squat Lobsters
mSystems, 2020年10月06日
5, 5 - Yuto Chiba, Yuji Tomaru, Hiromori Shimabukuro, Kei Kimura, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Daisuke Hagiwara, Takuro Nunoura, Syun-ichi Urayama
Viral RNA genomes identified from marine macroalgae and a diatom
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2020年06月17日
35, 3
[査読有り] - Syun-suke Kadoya, Syun-ichi Urayama, Takuro Nunoura, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Masaaki Kitajima, Toyoko Nakagomi, Osamu Nakagomi, Satoshi Okabe, Osamu Nishi-mura, Daisuke Sano
Bottleneck Size-Dependent Changes in the Genetic Diversity and Specific Growth Rate of a Rotavirus A Strain
JOURNAL OF VIROLOGY, 2020年05月04日
94, 10
[査読有り] - Jin Sun, Chong Chen, Norio Miyamoto, Runsheng Li, Julia D. Sigwart, Ting Xu, Yanan Sun, Wai Chuen Wong, Jack C.H. Ip, Weipeng Zhang, Yi Lan, Dass Bissessur, Tomo-o Watsuji, Hiromi Kayama Watanabe, Yoshihiro Takaki, Kazuho Ikeo, Nobuyuki Fujii, Kazutoshi Yoshitake, Jian-Wen Qiu, Ken Takai, Pei-Yuan Qian
The Scaly-foot Snail genome and implications for the origins of biomineralised armour
Nature Communications, 2020年04月08日
11
[査読有り] - Syun-ichi Urayamaa, Yoshihiro Takaki, Daisuke Hagiwara, Takuro Nunoura
dsRNA-seq reveals novel RNA virus and virus-like putative complete genome sequences from Hymeniacidon sp. sponge
Microbes and Environments, 2020年02月28日
35, 2
[査読有り] - Junichi Miyazaki , Tetsuro Ikuta , Tomo-o Watsuji , Mariko Abe , Masahiro Yamamoto , Satoshi Nakagawa , Yoshihiro Takaki , Kentaro Nakamura , Ken Takai
Dual energy metabolism of the Campylobacterota endosymbiont in the chemosynthetic snail Alviniconcha marisindica
ISME Journal, 2020年02月12日
14, 1273, 1289
[査読有り] - Hiroyuki Imachi, Masaru Nobu, Nozomi Nakahara, Yuki Morono, Miyuki Ogawara, Yoshihiro Takaki, Yoshinori Takano, Katsuyuki Uematsu, Tetsuro Ikuta, Motoo Ito, Yohei Matsui, Masayuki Miyazaki, Kazuyoshi Murata, Yumi Saito, Sanae Sakai, Chihong Song, Eiji Tasumi, Yuko Yamanaka, Takashi Yamaguchi, Yoichi Kamagata, Hideyuki Tamaki, Ken Takai
Isolation of an archaeon at the prokaryote-eukaryote interface
NATURE, 2020年01月15日
577, 519, 525
[査読有り] - Jimmy Saw, Takuro Nunoura, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Rachel Parsons, Michelle Michelsen, Krista Longnecker, Elizabeth Kujawinski, Ramunas Stepanauskas, Zachary Landry, Craig Carlson, Stephen Giovannoni
Pangenomics Analysis Reveals Diversification of Enzyme Families and Niche Specialization in Globally Abundant SAR202 Bacteria
mBio, 2020年01月07日
11, 1
[査読有り] - Fumika Fukasawa, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Ysuhiro Shimane, Cathleen E. Thomas, Syun-ichi Urayama, Takuro Nunoura, Satoshi Koyama
A new polycipivirus identified in Colobopsis shohki
ARCHIVES OF VIROLOGY, 2019年12月21日
165, 3, 761, 763
[査読有り] - Daniele De Corte, Joaquín Martínez Martínez, Mariana Silvia Cretoiu, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Eva Sintes, Gerhard J Herndl, Taichi Yokokawa
Viral Communities in the Global Deep Ocean Conveyor Belt Assessed by Targeted Viromics
Frontiers in Microbiology, 2019年08月21日
10
[査読有り] - Nozomi Nakahara, Masaru K. Nobu, Yoshihiro Takaki, Masayuki Miyazaki, Eiji Tasumi, Sanae Sakai, Miyuki Ogawara, Naoko Yoshida, Hideyuki Tamaki, Yuko Yamanaka, Arata Katayama, Takashi Yamaguchi, Ken Takai, Hiroyuki Imachi
Aggregatilinea lenta gen. nov., sp. nov., a slow-growing, facultatively anaerobic bacterium isolated from subseafloor sediment, and proposal of the new order Aggregatilineales ord. nov. within the class Anaerolineae of the phylum Chloroflexi
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019年04月01日
69, 4, 1185, 1194
[査読有り] - Sanae Sakai, Yoshihiro Takaki, Masayuki Miyazaki, Miyuki Ogawara, Katsunori Yanagawa, Junichi Miyazaki, Ken Takai
Methanofervidicoccus abyssi gen. nov., sp. nov., a hydrogenotrophic methanogen, isolated from a hydrothermal vent chimney in the Mid-Cayman Spreading Center, the Caribbean Sea
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 2019年03月07日
69, 4, 1225, 1230
[査読有り] - Hiroyuki Imachi, Eiji Tasumi, Yoshihiro Takaki, Tatsuhiko Hoshino, Florence Schubotz, Shuchai Gan, Tzu-Hsuan Tu, Yumi Saito, Yuko Yamanaka, Akira Ijiri, Yohei Matsui, Masayuki Miyazaki, Yuki Morono, Ken Takai, Kai-Uwe Hinrichs, Fumio Inagaki
Cultivable microbial community in 2-km-deep, 20-million-year-old subseafloor coalbeds through ~1000 days anaerobic bioreactor cultivation
Scientific Reports, 2019年02月19日
9
[査読有り] - Yong Wang, Jiao-Mei Huang, Guo-Jie Cui, Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Wen-Li Li, Jun Li, Zhao-Ming Gao, Ken Takai, Ai-Qun Zhang, Ramunas Stepanauskas
Genomics insights into ecotype formation of ammonia-oxidizing archaea in the deep ocean
Environmental Microbiology, 2019年02月19日
21, 2, 716, 729
[査読有り] - Syun-ichi Urayamaa, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Norio Miyamoto
Complete genome sequence of a novel RNA virus identified from a deep-sea animal, Osedax japonicus
Microbes and Environments, 2018年12月28日
33, 4, 446, 449
[査読有り] - Nozomi Nakahara, Yoshihiro Takaki, Miyuki Ogawara, Takashi Yamaguchi, Ken Takai, Hiroyuki Imachi
Complete genome sequence of Pelolinea submarina MO-CFX1T within the phylum Chloroflexi, isolated from subseafloor sediment
Marine Genomics, 2018年11月22日
46, 49, 53
[査読有り] - Syun-ichi Urayama, Yoshihiro Takaki, Shinro Nishi, Yukari Yoshida-Takashima, Shigeru Deguchi, Ken Takai, Takuro Nunoura
Unveiling the RNA virosphere associated with marine microorganisms
Molecular Ecology Resources, 2018年10月30日
18, 6, 1444, 1455
[査読有り] - Watsuji T, Motoki K, Hada E, Nagai Y, Takaki Y, Yamamoto A, Ueda K, Toyofuku T, Yamamoto H, Takai K.
Compositional and Functional Shifts in the Epibiotic Bacterial Community of Shinkaia crosnieri Baba & Williams (a Squat Lobster from Hydrothermal Vents) during Methane-Fed Rearing
Microbes and Environments, 2018年10月17日
33, 4, 348, 356
[査読有り] - Takenori Satomura, Junji Hayashi, Hiroaki Sakamoto, Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Ken Takai, Hideto Takami, Toshihisa Ohshima, Haruhiko Sakuraba, Shin-ichiro Suye
D-Lactate electrochemical biosensor prepared by immobilization of thermostable dye-linked D-lactate dehydrogenase from Candidatus Caldiarchaeum subterraneum
JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 2018年10月01日
126, 4, 425, 430
[査読有り] - Takuro Nunoura, Manabu Nishizawa, Miho Hirai, Shigeru Shimamura, Phurt Harnvoravongchai, Osamu Koide, Yuki Morono, Toshiaki Fukui, Fumio Inagaki, Junichi Miyazaki, Yoshihiro Takaki, Ken Takai
Microbial Diversity in Sediments from the Bottom of the Challenger Deep, the Mariana Trench
Microbes and Environments, 2018年07月04日
33, 2, 186, 194
[査読有り] - Hiroko Makita, Shinro Nishi, Yoshihiro Takaki, Emiko Tanaka, Takuro Nunoura, Satoshi Mitsunobu, Ken Takai
Draft Genome Sequence of Mariprofundus micogutta Strain ET2
Genome Announcements, 2018年05月17日
6, 20 - Satomura, T., Hayashi, J., Sakamoto, H., Nunoura, T., Takaki, Y., Takai, K., Takami, H., Ohshima, T., Sakuraba, H., and Suye, S
D-Lactate electrochemical biosensor prepared by immobilization of thermostable dye-linked D-lactate dehydrogenase from Candidatus Caldiarchaeum subterraneum
JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING, 2018年04月22日
126, 4, 425, 430
[査読有り] - Kato S, Shibuya T, Takaki Y, Hirai M, Nunoura T, Suzuki K
Genome-enabled metabolic reconstruction of dominant chemosynthetic colonizers in deep-sea massive sulfide deposits
Environmental Microbiology, 2018年02月14日
20, 862, 877
[査読有り] - Shingo Kato, Takazo Shibuya, Yoshihiro Takaki, Miho Hirai, Takuro Nunoura and Katsuhiko Suzuki
Genome-enabled metabolic reconstruction of dominant chemosynthetic colonizers in deep-sea massive sulfide deposits
Environmental Microbiology, 2018年02月14日
20, 2, 862, 877
[査読有り] - Yoshida, M., Mochizuki, T., Urayama, S., Yoshida-Takashima, Y., Nishi, S., Hirai, M., Nomaki, H., Takaki, Y., Nunoura, T., and Takai, K.
Quantitative viral community DNA analysis reveals the dominance of single-stranded DNA viruses in offshore upper bathyal sediment from Tohoku, Japan.
Frontiers in Microbiology, 2018年02月06日
9, 75
[査読有り] - Mitsuhiro Yoshida, Tomohiro Mochizuki, Syun-ichi Urayama, Yukari Yoshida-Takashima, Shinro Nishi, Miho Hirai, Hidetaka Nomaki, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Ken Takai
Quantitative viral community DNA analysis reveals the dominance of single-stranded DNA viruses in offshore upper bathyal sediment from Tohoku, Japan
Frontiers in Microbiology, 2018年02月06日
9
[査読有り] - Nunoura, T., Chikaraishi, Y., Izaki, R., Suwa, T., Sato, T., Harada, T., Mori, K., Kato, Y., Miyazaki, M., Shimamura, S., Yanagawa, K., Shuto, A., Ohkouchi, N., Fujita, N., Takaki, Y., Atomi, H., and Takai, K.
A primordial and reversible TCA cycle in a facultatively chemolithoautotrophic thermophile
Science, 2018年02月02日
359, 6375, 559, 563
[査読有り] - Takuro Nunoura, Yoshito Chikaraishi, Rikihisa Izaki, Takashi Suwa, Takaaki Sato, Takeshi Harada, Koji Mori, Yumiko Kato, Masayuki Miyazaki, Shigeru Shimamura, Katsunori Yanagawa, Aya Shuto, Naohiko Ohkouchi, Nobuyuki Fujita, Yoshihiro Takaki, Haruyuki Atomi, Ken Takai
A primordial and reversible TCA cycle in a facultatively chemolithoautotrophic thermophile
Science, 2018年02月02日
359, 6375, 559, 563
[査読有り] - Junichi Miyazaki, Shinsuke Kawagucci, Akiko Makabe, Ayu Takahashi, Kazuya Kitada, Junji Torimoto, Yohei Matsui, Eiji Tasumi, Takazo Shibuya, Kentaro Nakamura, Shunsuke Horai, Shun Sato, Jun-ichiro Ishibashi, Hayato Kanzaki, Satoshi Nakagawa, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Kyoko Okino, Hiromi Kayama Watanabe, Hidenori Kumagai, Chong Chen
Deepest and hottest hydrothermal activity in the Okinawa Trough: the Yokosuka site at Yaeyama Knoll
Royal Society Open Science, 2017年12月20日
4
[査読有り] - Hisashi Muto, Yoshihiro Takaki, Miho Hirai, Sayaka Mino, Shigeki Sawayama, Ken Takai, Satoshi Nakagawa
A Simple and Efficient RNA Extraction Method from Deep-Sea Hydrothermal Vent Chimney Structures
Microbes and Environments, 2017年11月30日
32, 4, 330, 335
[査読有り] - Miho Hirai, Shinro Nishi, Miwako Tsuda, Michinari Sunamura, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura
Library Construction from Subnanogram DNA for Pelagic Sea Water and Deep-Sea Sediments
Microbes and Environments, 2017年11月28日
32, 4, 336, 343
[査読有り] - Maria G. Pachiadaki, Eva Sintes, Kristin Bergauer, Julia M. Brown, Nicholas R. Record, Brandon K. Swan, Mary Elizabeth Mathyer, Steven Hallam, Purificacion Lopez-Garcia, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, Tanja Woyke, Gerhard J. Herndl, Ramunas Stepanauskas
Major role of nitrite-oxidizing bacteria in 1 dark ocean carbon fixation
Science, 2017年11月24日
358, 6366, 1046, 1051
[査読有り] - Daniele De Corte, Abhishek Srivastava, Marja Koski, Juan Antonio L Garcia, Yoshihiro Takaki, Taichi Yokokawa, Takuro Nunoura, Nathalie H Elisabeth, Eva Sintes, Gerhard J Herndl
Metagenomic insights into zooplankton‐associated bacterial communities
Environmental Microbiology, 2017年10月27日
20, 2, 492, 505
[査読有り] - Genki Ozawa, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Kiyotaka Takishita, Tetsuro Ikuta, James P. Barry, Tadashi Maruyama, Katsunori Fujikura, Takao Yoshida
Ancient occasional host switching of maternally transmitted bacterial symbionts of chemosynthetic vesicomyid clams
Genome Biology and Evolution, 2017年08月23日
9, 9, 2226, 2236
[査読有り] - Satoshi Nakagawa, Hikari Saito, Akihiro Tame, Miho Hirai, Hideyuki Yamaguchi, Takashi Sunata, Masanori Aida, Hisashi Muto, Shigeki Sawayama, Yoshihiro Takaki
Microbiota in the coelomic fluid of two common coastal starfish species and characterization of an abundant Helicobacter-related taxon
Scientific Reports, 2017年08月18日
7, 1, 8764
[査読有り] - Ryousuke Nagata, Yoshihiro Takaki, Akihiro Tame, Takuro Nunoura, Hisashi Muto, Sayaka Mino, Shigeki Sawayama, Ken Takai, Satoshi Nakagawa
Lebetimonas natsushimae sp. nov., a novel strictly anaerobic, moderately thermophilic chemoautotroph isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete nest in the Mid-Okinawa Trough
SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY, 2017年06月04日
40, 352, 356
[査読有り] - Takishita K., Takaki Y., Chikaraishi Y., Ikuta T., Ozawa G., Yoshida T., Ohkouchi N., Fujikura
Genomic evidence that methanotrophic endosymbionts provide deep-sea Bathymodiolus mussels with a sterol intermediate in cholesterol biosynthesis
Genome Biology and Evolution, 2017年05月01日
9, 5, 1148, 1160
[査読有り] - Shigeru Shimamura,Takashi Kaneko,Genki Ozawa,Mamiko Nishino Matsumoto,Takeru Koshiishi,Yoshihiro Takaki,Chiaki Kato,Ken Takai,Takao Yoshida,Katsunori Fujikura,James P. Barry,Tadashi Maruyama
Loss of genes related to Nucleotide Excision Repair (NER) and implications for reductive genome evolution in symbionts of deep-sea vesicomyid clams
PLoS One, 2017年02月15日
12, 2
[査読有り] - Genki Ozawaa, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Shin-ichi Yokobori, Yasuhiko Ohara, Kiyotaka Takishita, Tadashi Maruyama, Katsunori Fujikura, Takao Yoshida
Updated mitochondrial phylogeny of Pteriomorph and Heterodont Bivalvia, including deep-sea chemosymbiotic Bathymodiolus mussels, vesicomyid clams and the thyasirid clam Conchocele cf. bisecta
Marine Genomics, 2017年02月01日
31, 43, 52
[査読有り] - Hideto Takami, Atsushi Toyoda, Ikuo Uchiyama, Takehiko Itoh, Yoshihiro Takaki, Wataru Arai, Shinro Nishi, Mikihiko Kawai, Kazuo Shin-ya and Haruo Ikeda
Complete genome sequence and expression profile of the commercial lytic enzyme producer Lysobacter enzymogenes M497-1
DNA RESEARCH, 2017年01月08日
24, 1, 9
[査読有り] - S Kawagucci, J Miyazaki, T Noguchi, K Okamura, T Shibuya, T Watsuji, M Nishizawa, H Watanabe, K Okino, N Takahata, Y Sano, K Nakamura, A Shuto, M Abe, Y Takaki, T Nunoura, M Koonjul, M Singh, G Beedessee, M Khishma, V Bhoyroo, D Bissessur, LS Kumar, D Marie, K Tamaki, K Takai
Fluid chemistry in the Solitaire and Dodo hydrothermal fields of the Central Indian Ridge
Geofluids, 2016年11月01日
[査読有り] - Makita H, Tanaka E, Mitsunobu S, Miyazaki M, Nunoura T, Uematsu K, Takaki Y, Nishi S, Shimamura S, Takai K.
Mariprofundus micogutta sp. nov., a novel iron-oxidizing zetaproteobacterium isolated from a deep-sea hydrothermal field at the Bayonnaise knoll of the Izu-Ogasawara arc, and a description of Mariprofundales ord. nov. and Zetaproteobacteria classis nov.
Archives of Microbiology, 2016年10月20日
199, 2, 335, 346
[査読有り] - Katsunori Yanagawa, Akira Ijiri, Anja Breuker, Sanae Sakai, Youko Miyoshi, Shinsuke Kawagucci, Takuroh Noguchi, Miho Hirai, Axel Schippers, Jun-ichiro Ishibashi, Yoshihiro Takaki, Michinari Sunamura, Tetsuro Urabe, Takuro Nunoura, and Ken Takai
Defining boundaries for the distribution of microbial communities beneath the sediment-buried, hydrothermally active seafloor
ISME Journal, 2016年10月18日
11, 2, 529, 542
[査読有り] - Hiroko Makita, Sakiko Kikuchi, Satoshi Mitsunobu, Yoshihiro Takaki, Toshiro Yamanaka, Tomohiro Toki, Takuroh Noguchi, Kentaro Nakamura, Mariko Abe, Miho Hirai, Masahiro Yamamoto, Katsuyuki Uematsu, Junichi Miyazaki, Takuro Nunoura, Yoshio Takahashi, Ken Takai
Comparative Analysis of Microbial Communities in Iron-Dominated Flocculent Mats in Deep Sea Hydrothermal Environments
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2016年10月01日
82, 19, 5741, 5755
[査読有り] - Takuro Nunoura, Miho Hirai, Yukari Yoshida-Takashima, Manabu Nishizawa, Shinsuke Kawagucci, Taichi Yokokawa, Junichi Miyazaki, Osamu Koide, Hiroko Makita, Yoshihiro Takaki, Michinari SUNAMURA, Ken Takai
Distribution and niche separation of planktonic microbial communities in the water columns from the surface to the hadal waters of the Japan Trench under the eutrophic ocean
Frontiers in Microbiology, 2016年08月10日
7
[査読有り] - Nishizawa Manabu, Sakai Sanae, Konno Uta, Nakahara Nozomi, Takaki Yoshihiro, Saito Yumi, Imachi Hiroyuki, Tasumi Eiji, Makabe Akiko, Koba Keisuke, Takai Ken
Nitrogen and Oxygen Isotope Effects of Ammonia Oxidation by Thermophilic Thaumarchaeota from a Geothermal Water Stream.
Appl Environ Microbiol, 2016年08月01日
82, 15, 4492, 4504
[査読有り] - Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Jungo Kakuta, Hiromi Kazama, Miho Hirai, Noriaki Masui, Hitoshi Tomaru, Yuki Morono, Hiroyuki Imachi, Fumio Inagaki, Ken Takai
Variance and potential niche separation of microbial communities in subseafloor sediments off Shimokita Peninsula, Japan
Environmental Microbiology, 2016年06月23日
18, 6, 1889, 1906
[査読有り] - Yuki Hongo, Tetsuro Ikuta, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Shuji Shigenobu, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Expression of genes involved in the uptake of inorganic carbon in the gill of a deep-sea vesicomyid clam harboring intracellular thioautotrophic bacteria
Gene, 2016年06月10日
585, 2, 228, 240
[査読有り] - Tetsuro Ikuta, Kanae Igawa, Akihiro Tame, Tsuneyoshi Kuroiwa, Haruko Kuroiwa, Yui Aoki, Yoshihiro Takaki, Yukiko Nagai, Genki Ozawa, Masahiro Yamamoto, Ryusaku Deguchi, Katsunori Fujikura, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Surfing the vegetal pole in a small population: extracellular vertical transmission of an 'intracellular' deep-sea clam symbiont
Royal Society Open Science, 2016年05月18日
[査読有り] - Urayama S, Takaki Y, Nunoura T.
FLDS: A Comprehensive dsRNA Sequencing Method for Intracellular RNA Virus Surveillance.
Microbes Environ., 2016年03月26日
31, 1, 33, 40
[査読有り] - Kazuki Nakamura, Ryo Iizuka, Shinro Nishi, Takao Yoshida, Yuji Hatada, Yoshihiro Takaki, Ayaka Iguchi, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji & Takashi Funatsu
Culture-independent method for identification of microbial enzyme-encoding genes by activity-based single-cell sequencing using a water-in-oil microdroplet platform
Scientific Reports, 2016年02月26日
6, 22259
[査読有り] - Nunoura, T., Takaki, Y., Shimamura, S., Kakuta, J., Kazama, H., Hirai, M., Masui, N., Tomaru, H., Morono, Y., Imachi, H., Inagaki, F., and Takai, K.
Variance and potential niche separation of microbial communities in subseafloor sediments off Shimokita Peninsula, Japan
Environmental Microbiology, 2015年12月10日
[査読有り] - Kazuki Nakamura, Ryo Iizuka, Takao Yoshida, Yuji Hatada, Yoshihiro Takaki, Shinro Nishi, Ayaka Iguchi, Dong Hyun Yoon, Tetsushi Sekiguchi, Shuichi Shoji, Takashi Funatsu
CULTURE-INDEPENDENT METHOD FOR SCREENING AND IDENTIFYING MICROBIAL ENZYME-ENCODING GENES USING MICRODROPLET-BASED SINGLE CELL GENOMICS
19th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences (MicroTAS 2015), 2015年10月27日
[査読有り] - Tetsuro Ikuta, Yoshihiro Takaki, Yukiko Nagai, Shigeru Shimamura, Miwako Tsuda, Shinsuke Kawagucci, Yui Aoki, Koji Inoue, Morimi Teruya, Kazuhito Satou, Kuniko Teruya, Makiko Shimoji, Hinako Tamotsu, Takashi Hirano, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Heterogeneous composition of key metabolic gene clusters in a vent mussel symbiont population
The ISME Journal, 2015年09月29日
[査読有り] - Takuro Nunouraa, Yoshihiro Takaki, Miho Hirai, Shigeru Shimamura, Akiko Makabe, Osamu Koide, Tohru Kikuchi, Junichi Miyazaki, Keisuke Koba, Naohiro Yoshida, Michinari Sunamura, Ken Takai
Hadal biosphere: insight into the microbial ecosystem in the deepest ocean on Earth
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2015年03月17日
112, 11, E1230, E1236
[査読有り] - Nunoura, T., Takaki, Y., Hirai, M., Shimamura, S., Makabe, A., Koide, O., Kikuchi, T., Miyazaki, J., Koba, K., Yoshida, N., Sunamura, M., and Takai, K.
Hadal biosphere: insight into the microbial ecosystem in the deepest ocean on Earth
Proceedings of the National Academy of Sciences, USA, 2015年02月23日
[査読有り] - 柳川 勝紀; 井尻 暁; Anja Breuker; 酒井 早苗; 三好 陽子; 川口 慎介; 野口 拓郎; 平井 美穂; Axel Schippers; 石橋 純一郎; 高木 善弘; 布浦 拓郎; 高井 研
熱水噴出孔下に存在する生命圏の限界
日本地球化学会年会要旨集, 2015年
62, 136 - Nagasaki T, Hongo Y, Koito T, Nakamura-Kusakabe I, Shimamura S, Takaki Y, Yoshida T, Maruyama T, Inoue K.
Cysteine dioxygenase and cysteine sulfinate decarboxylase genes of the deep-sea mussel Bathymodiolus septemdierum: possible involvement in hypotaurine synthesis and adaptation to hydrogen sulfide.
Amino Acids., 2014年12月16日
[査読有り] - Watsuji, T., Yamamoto, A., Motoki, K., Ueda, K., Hada, E., Takaki, Y., Kawagucci, S., and Takai, K.
Molecular evidence of digestion and absorption of epibiotic bacterial community by deep-sea crab Shinkaia crosnieri
The ISME Journal, 2014年10月14日
[査読有り] - Nunoura, T., Takaki, Y., Kazama, H., Kakuta, J., Shimamura, S., Makita, H., Hirai, M., Miyazaki, M., and Takai, K
Physiological and Genomic Features of a Novel Sulfur-Oxidizing Gammaproteobacterium Belonging to a Previously Uncultivated Symbiotic Lineage Isolated from a Hydrothermal Vent
PLoS One, 2014年08月18日
9
[査読有り] - Katsunori Yanagawa, Anja Breuker, Axel Schippers, Manabu Nishizawa, Akira Ijiri, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Michinari Sunamura, Tetsuro Urabe, Takuro Nunoura, Ken Takai
Microbial Community Stratification Controlled by the Subseafloor Fluid Flow and Geothermal Gradient at the Iheya North Hydrothermal Field in the Mid-Okinawa Trough (Integrated Ocean Drilling Program Expedition 331)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2014年07月25日
80, 19, 6126, 6135
[査読有り] - Mikihiko Kawai, Taiki Futagami, Atsushi Toyoda, Yoshihiro Takaki, Shinro Nishi, Sayaka Hori, Wataru Arai, Taishi Tsubouchi, Yuki Morono, Ikuo Uchiyama, Takehiko Itoh, Asao Fujiyama, Fumio Inagaki, Hideto Takami
High frequency of phylogenetically diverse reductive dehalogenase-homologous genes in deep subseafloor sedimentary metagenomes
Frontiers in Microbiology, 2014年03月03日
5
[査読有り] - Mikihiko Kawai, Taiki Futagami, Atsushi Toyoda, Yoshihiro Takaki, Shinro Nishi, Sayaka Hori, Wataru Arai, Taishi Tsubouchi, Yuki Morono, Ikuo Uchiyama, Takehiko Itoh, Asao Fujiyama, Fumio Inagaki, Hideto Takami
High frequency of phylogenetically diverse reductive dehalogenase-homologous genes in deep subseafloor sedimentary metagenomes
Frontiers in Microbiology, 2014年02月13日
5, 80
[査読有り] - Watsuji, T., Yamamoto, A., Takaki, Y., Ueda, K., Kawagucci, S., and Takai, K.
Diversity and methane oxidation of active epibiotic methanotrophs on live Shinkaia crosnieri
The ISME Jounal, 2014年01月09日
[査読有り] - Yuki Hongo, Yoshimitsu Nakamura, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Katsuyuki Uematsu, Takashi Toyofuku, Hisako Hirayama, Ken Takai, Masatoshi Nakazawa, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Exclusive localization of carbonic anhydrase in bacteriocytes of the deep-sea clam Calyptogena okutanii with thioautotrophic symbiotic bacteria.
Journal of Experimental Biology, 2013年12月01日
216, 23, 4403, 4414
[査読有り] - Nishi S, Tsubouchi T, Takaki Y, Koyanagi R, Satoh N, Maruyama T, Hatada Y.
Draft Genome Sequence of Loktanella cinnabarina LL-001T, Isolated from Deep-Sea Floor Sediment.
Genome Announcement, 2013年11月14日
14, 1(6)
[査読有り] - Tsubouchi T, Nishi S, Usui K, Shimane Y, Takaki Y, Maruyama T, Hatada Y.
Draft Genome Sequence of the Dimorphic Prosthecate Bacterium Brevundimonas abyssalis TAR-001T.
Genome Announcement, 2013年10月31日
17, 1(5)
[査読有り] - Hongo, Y., Nakamura, Y., Shimamura, S., Takaki, Y., Uematsu, K., Toyofuku, T., Hirayama, H., Takai, K., Nakazawa, M., Maruyama, T., and Yoshida, T.
Exclusive localization of carbonic anhydrase in bacteriocytes of the deep-sea clam Calyptogena okutanii with thioautotrophic symbiotic bacteria
The Journal of experimental biology, 2013年09月12日
[査読有り] - Nakagawa, S., Shimamura, S., Takaki, Y., Suzuki, Y., Murakami, S., Watanabe, T., Fujiyoshi, S., Mino, S., Sawabe, T., Maeda, T., Makita, H., Nemoto, S., Nishimura, S., Watanabe, H., Watsuji, T., and Takai, K.
Allying with armored snails: the complete genome of gammaproteobacterial endosymbiont
The ISME Journal, 2013年08月08日
8, 40, 51
[査読有り] - Yukari Yoshida-Takashima, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Takuro Nunoura, Ken Takai
Genome sequence analysis of a novel deep-sea vent epsilon-proteobacterial phage and possible co-evolution of the related phages with the Epsilonproteobacteria
Extremophiles, 2013年05月01日
17, 3, 405, 419
[査読有り] - Yukari Yoshida-Takashima, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Takuro Nunoura, Ken Takai
Genome sequence of a novel deep-sea vent epsilonproteobacterial phage provides new insight into the co-evolution of Epsilonproteobacteria and their phages
Extremophiles, 2013年03月20日
17, 3, 405, 419
[査読有り] - Mitsuhiro Yoshida*, Yoshihiro Takaki, Masamitsu Eitoku, Takuro Nunoura, and Ken Takai
Metagenomic analysis of viral communities in (hado)pelagic sediments
PLoS One, 2013年02月27日
8, 2
[査読有り] - Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Hiromi Kazama, Miho Hirai, Juichiro Ashi, Hiroyuki Imachi, Ken Takai
Microbial diversity in deep-sea methane seep sediments presented by SSU rRNA gene tag sequencing
Microbes and Environments, 2012年12月03日
27, 4, 382, 390
[査読有り] - Jacqueline Buettiker; Sonoko Ishino; Takeshi Yamagami; Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Hideto Takami; Ken Takai; Yoshizumi Ishino
Characterization of DNA polymerase B1 from Caldiarchaeum subterraneum, an uncultivated archaea
GENES & GENETIC SYSTEMS, 2012年12月
87, 6, 420, 420
[査読有り] - Taro Maeda1,2, Euichi Hirose3, Yoshito Chikaraishi2, Masaru Kawato2, Kiyotaka Takishita2, Takao Yoshida1,2, Heroen Verbruggen4,5, Jiro Tanaka1, Shigeru Shimamura2, Yoshihiro Takaki2, Masashi Tsuchiya2, Kenji Iwai6, Tadashi Maruyama
Algivore or Phototroph? Plakobranchus ocellatus (Gastropoda) Continuously Acquires Kleptoplasts and Nutrition from Multiple Algal Species in Nature
PLoS One, 2012年07月25日
7, 7
[査読有り] - Sugahara Junichi, Fujishima Kosuke, Nunoura Takuro, Takaki Yoshihiro, Takami Hideto, Takai Ken, Tomita Masaru, Kanai Akio
Genomic Heterogeneity in a Natural Archaeal Population Suggests a Model of tRNA Gene Disruption
PLoS One, 2012年03月05日
7, 3
[査読有り] - S Kawagucci, Y T Yoshida, T Noguchi, M C Honda, H Uchida, H Ishibashi, F Nakagawa, U Tsunogai, K Okamura, Y Takaki, T Nunoura, J Miyazaki, M Hirai, W Lin, H Kitazato, K Takai
Disturbance of deep-sea environments induced by the M9.0 Tohoku Earthquake
Scientific Reports, 2012年02月16日
2, 270, 270
[査読有り] - A deeply branching thermophilic bacterium with an ancient acetyl-CoA pathway dominates a subsurface ecosystem
PLoS One, 2012年01月27日
7, 1, e30559
[査読有り] - Hirokazu Kuwahara, Yoshihiro Takaki1, Shigeru Shimamura, Takao Yoshida, Taro Maeda, Takekazu Kunieda, Tadashi Maruyama
Loss of genes for DNA recombination and repair in the reductive genome evolution of thioautotrophic symbionts of Calyptogena clams
BMC Evolutionary Biology, 2011年10月31日
11, 285
[査読有り] - KUWAHARA HIROKAZU, TAKAKI YOSHIHIRO, SHIMAMURA SHIGERU, YOSHIDA TAKAO, Maeda Taro , Kunieda Takekazu , MARUYAMA TADASHI
Loss of genes for DNA recombination and repair in the reductive genome evolution of thioautotrophic symbionts of Calyptogena clams
BMC Evolutionary Biology, 2011年10月03日
11, 285
[査読有り] - Sanae Sakai; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Mitsuo Sekine; Takahisa Tajima; Hiroki Kosugi; Natsuko Ichikawa; Eiji Tasumi; Aiko T. Hiraki; Ai Shimizu; Yumiko Kato; Rika Nishiko; Koji Mori; Nobuyuki Fujita; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Genome Sequence of a Mesophilic Hydrogenotrophic Methanogen Methanocella paludicola, the First Cultivated Representative of the Order Methanocellales
PLOS ONE, 2011年07月
6, 7
[査読有り] - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Jungo Kakuta; Shinro Nishi; Junichi Sugahara; Hiromi Kazama; Gab-Joo Chee; Masahira Hattori; Akio Kanai; Haruyuki Atomi; Ken Takai; Hideto Takami
Insights into the evolution of Archaea and eukaryotic protein modifier systems revealed by the genome of a novel archaeal group
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011年04月
39, 8, 3204, 3223
[査読有り] - Yoshihiro Takaki,Shigeru Shimamura(JAMSTEC) , Satoshi Nakagawa(Hokkaido University) , Yasuo Fukuhara(NITE) , Hiroshi Horikawa(NITE) , Akiho Ankai(NITE) , Takeshi Harada(NITE) , Akira Hosoyama(NITE) , Akio Oguchi(NITE) , Shigehiro Fukui(NITE) , Nobuyuki Fujita(NITE) , Hideto Takami(JAMSTEC) , Ken Takai(JAMSTEC)
Bacterial Lifestyle in a Deep-sea Hydrothermal Vent Chimney Revealed by the Genome Sequence of the Thermophilic Bacterium Deferribacter desulfuricans SSM1.
DNA RESEARCH, 2010年02月26日
17, 3, 123, 137
[査読有り] - Maiko Harada,Takao Yoshida(JAMSTEC) , Hirokazu Kuwahara(JAMSTEC) , Shigeru Shimamura(JAMSTEC) , Yoshihiro Takaki(JAMSTEC) , Chiaki Kato(JAMSTEC) , Tetsuya Miwa(JAMSTEC) , Hiroshi Miyake(Kitasato University) , Tadashi Maruyama(JAMSTEC)
Expression of genes for sulfur oxidation in the intracellular chemoautotrophic symbiont of the deep-sea bivalve Calyptogena okutanii
Extremophiles, 2009年12月01日
[査読有り] - 小林 徹,小出 修 , 森 梢 , 島村 繁 , 松浦 孝恵 , 三浦 健 , 高木 善弘 , 諸野 裕樹 , 布浦 拓郎 , 井町 寛之 , 稲垣 史生 , 高井 研 , 掘越 弘毅
Phylogenetic and enzymatic diversity of deep subseafloor aerobic microorganisms in organics- and methane-rich sediments off Shimokita Peninsula
Extremophiles, 2008年07月01日
12, 519, 527
[査読有り] - Kuwahara Hirokazu,Yoshihiro Takaki , Takao Yoshida , Shigeru Shimamura , Kiyotaka Takishita , James D. Reimer , Chiaki Kato , Tadashi Maruyama
Reductive genome evolution in chemoautotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
Extremophiles, 2008年05月01日
12, 3, 365, 374
[査読有り] - NAKAGAWA SATOSHI , TAKAKI YOSHIHIRO , SHIMAMURA SHIGERU , TAKAI KEN , HORIKOSHI KOKI , Reysenbach Anna-Louise
Deep-sea vent epsilon-proteobacterial genomes provide insights into emergence of pathogens
Proc Natl Acad Sci USA, 2007年07月31日
104, 12146, 12150
[査読有り] - 桑原 宏和
Reduced genome of the thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea clam, Calyptogena okutanii
Current biology, 2007年05月15日
17, 10, 881, 886
[査読有り] - Kageyama Yasushi, TAKAKI YOSHIHIRO , SHIMAMURA SHIGERU , NISHI SHINRO , NOGI YUICHI , UCHIMURA KOSUKE , KOBAYASHI TORU , Hitomi Jun , Ozaki Katsuya , Kawai Shunji , Ito Susumu , HORIKOSHI KOKI
Intragenomic diversity of the V1 regions of 16S rRNA genes in high-alkaline protease-producing Bacillus clausii spp
Extremophiles, 2007年04月12日
11, 597, 603
[査読有り] - TAKAMI HIDETO , TAKAKI YOSHIHIRO , Chee Gab-Joo , NISHI SHINRO , SHIMAMURA SHIGERU , Suzuki Hiroko , Matsui Satomi , Uchiyama Ikuo
Thermoadaptation trait revealed by the genome sequence of thermophilic Geobacillus kaustophilus
Nucleic Acids Research, 2004年12月02日
6292, 6303
[査読有り] - 高見 英人,西 真郎 , 呂 傑 , 島村 繁 , 高木 善弘
Genomic characterization of thermophilic Geobacillus species isolated from the deepest sea mud of the Mariana Trench
Extremophiles, 2004年10月01日
351, 356
[査読有り]
MISC
- 元木香織; 元木香織; 和辻智郎; 和辻智郎; 高木善弘; 徳田真紀; 笠谷貴史; 高井研; 岩崎渉; 岩崎渉; 岩崎渉
長時間を要するサンプリングが微生物叢メタトランスクリプトーム解析に与える影響
日本微生物生態学会大会(Web), 2019年
33rd - 和辻智郎; 元木香織; 羽田枝美; 長井裕季子; 高木善弘; 豊福高志; 山本啓之; 高井研
ゴエモンコシオリエビの外部共生菌相を用いた環境影響評価方法の構築
日本微生物生態学会大会(Web), 2016年
31st - 元木香織; 元木香織; 元木香織; 山本麻未; 山本麻未; 羽田枝美; 長井裕季子; 長井裕季子; 豊福高志; 上田賢志; 高木善弘; 高井研; 和辻智郎
メタン添加水槽におけるゴエモンコシオリエビの外部共生菌の変遷
日本微生物生態学会大会(Web), 2015年
30th - 和辻,智郎; 山本,麻未; 元木,香織; 羽田,枝美; 上田,賢志; 高木,善弘; 川口,慎介; 高井,研
P25-32 ゴエモンコシオリエビのエサは胸毛で飼うバクテリアである(ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2014年10月16日
2014, 254 - 和辻智郎; 山本麻未; 元木香織; 山本麻未; 元木香織; 羽田枝美; 上田賢志; 高木善弘; 川口慎介; 高井研
ゴエモンコシオリエビのエサは胸毛で飼うバクテリアである
日本土壌微生物学会講演要旨集, 2014年
2014 - 牧田 寛子; 中村 謙太郎; 高橋 嘉夫; 高井 研; 布浦 拓郎; 平井 美穂; 高木 善弘; 菊池 早希子; 光延 聖; 土岐 知弘; 山中 寿朗; 宮崎 淳一
深海底熱水活動域に存在する酸化鉄被膜地帯での微生物調査
日本地球化学会年会要旨集, 2014年
61, 0, 40, 40
書籍等出版物
講演・口頭発表等
- 山本 正浩、川田 佳史、高木 善弘、下新井田 康介、設樂 真莉子、谷崎 明子、鹿島 裕之、平井 美穂、高谷 雄太郎、野崎 達夫、笠谷 貴史、高井 研
深海熱水噴出域における電気微生物生態系の探索
第36回 日本微生物生態学会, 2023年11月30日, [招待有り] - 吉田ゆかり、吉田光宏、高木善弘、布浦拓郎、高井研
化学合成独立栄養細菌Nitratiruptorに感染する一本鎖DNAウイルスの性状解析
日本微生物生態学会第36回大会, 2023年11月28日 - Yurika Ujiie, Yoshiyuki Ishitani, Yukiko Nagai, Yoshihiro Takagi, Takashi Toyofuku, Shunichi Ishii
Carbonic anhydrase in Foraminifera: Perspective on one of major role of ‘vital effect’
JpGU 2023, Makuhari, Japan, 2023年05月26日 - 山本正浩、高木善弘、小林瑠那、鹿島裕之、津田美和子、谷崎明子、中村龍平、高井研
潮汐周期と同期した深海熱水噴出孔での放電現象と電気合成微生物生態系
JpGU 2023, 2023年05月21日, [招待有り] - Yurika Ujiie, Yoshiyuki Ishitani, Yukiko Nagai, Yoshihiro Takaki, Takashi Toyofuku and Shunichi Ishii,
Unique Evolution of Foraminiferal Calcification to Survive Global Changes
AGU 2022, Online, 2022年12月15日 - 山本正浩、高木善弘、鹿島裕之、津田美和子、谷崎明子、中村龍平、高井研
深海熱水噴出孔の放電によって集積された独立栄養性細菌とその細胞外電子伝達経路
第35回 日本微生物生態学会, 2022年11月01日 - 平井 美穂,高木 善弘,近藤 史江,堀江 真行,浦山 俊一,布浦 拓郎
RNAウイルス探索技術FLDS法の改良と今後の新たな可能性
日本微生物生態学会 第35回大会, 2022年11月01日 - 吉田 ゆかり, 吉田 光宏, 高木 善弘, 布浦 拓郎, 高井 研
深海底熱水生態系における一本鎖DNAウイルスの探索
日本微生物生態学会第35回大会, 2022年11月01日 - 高木 善弘、平山 仙子、阿部 真理子、井町 寛之、生田 哲朗、宮崎 淳一、津田 美和子、山本 啓之、高井 研
深海熱水活動域における Methyloprofundus 属 細菌の多様性とゲノム特性
日本微生物生態学会年会, 2022年11月01日 - 宮崎淳一・高木善弘・津田美和子・CHEN Chong・渡部裕美・高井研
生物移動実験を通したスイヨウアルビンガイ共生菌の遺伝子発現パターンの変化
日本微生物生態学会第35回大会, 2022年10月31日 - 増川日向子、小林瑠那、高木善弘、高井研、新井博之、山本正浩
深海熱水噴出域由来の電気合成微生物の細胞外電子伝達タンパク質群の構造・局在性予測
第62回 生物物理若手の会 夏の学校, 2022年08月30日 - Junichi Miyazaki, Tetsuro Ikuta, Tomo-o Watsuji, Mariko Abe, Masahiro Yamamoto, Satoshi Nakagawa, Yoshihiro Takaki, Kentaro Nakamura, Miwako Tsuda, Chong Chen, Hiromi Kayama Watanabe, Ken Takai
Dual energy metabolism in endosymbionts of Alviniconcha vent snails
ISME18, 2022年08月15日 - 本郷悠貴, 木村圭, 高木善弘, 吉田ゆかり, 長崎慶三, 羽野健志, 外丸裕司
海産珪藻Chaetoceros tenuissimusのゲノム中に見られた感染性ウイルス遺伝子の挿入履歴
藻類学会, 2022年03月29日 - 高木善弘
「地球最後のフロンティア『深海』に何を見る? 可逆的TCA回路と真核生物の成り立ち」
山口大学微生物研究推進体第13回研究成果発表会, 2021年12月25日, [招待有り] - 小林瑠那, 山本正浩, 谷崎明子, 平井美穂, 鹿島裕之, 高木善弘, 高井研
深海熱水噴出域由来の微生物は電気を食べて育つのか?
海と地球のシンポジウム 2021, 2021年12月21日 - 甘利友花, 高木善弘, 津田美和子, 多米晃裕, 吉田尊雄, 生田哲朗
シンカイヒバリガイ類は共生細菌をどのように見分けているのか?
海と地球のシンポジウム2021, 2021年12月20日 - 小林瑠那, 山本正浩, 谷崎明子, 平井美穂, 鹿島裕之, 高木善弘, 高井研
深海熱水噴出域に由来にする独立栄養性微生物の電気合成増殖の実証
日本微生物生態学会 第34回大会, 2021年11月01日 - 甘利 友花,多米 晃裕,高木 善弘,津田 美和子,飯塚 怜,船津 高志,吉田 尊雄,生田 哲朗
深海性二枚貝シチヨウシンカイヒバリガイにおける化学合成細菌を共生させる鰓上皮細胞のユニークな構造
日本動物学会 2021年度 年会, 2021年09月02日 - Yuki Hongo, Kei kimura, Yoshihiro Takaki, Yukari Yoshida, Shuichiro Baba, Genta Kobayashi, Keizo Nagasaki, Takeshi Hano, Yuji Tomaru
Integration of ssDNA fragment from an infectious virus in the genome of the diatom Chaetoceros tenuissimus
10th Aquatic Virus Workshop, 2021年06月30日 - 小林瑠那, 山本正浩, 谷崎明子, 平井美穂, 鹿島裕之, 高木善弘, 高井研
深海熱水噴出域由来のThiomicrorhabdus属細菌の電気合成微生物としてのゲノム的視点からの特徴づけ
極限環境生物学会 2021年度年会, 2021年06月05日 - 小林瑠那、山本正浩、谷崎明子、平井美穂、鹿島裕之、若井暁、生田哲朗、高木善弘、高井研
深海熱水噴出域に由来する電気をエネルギー源とする独立栄養性微生物の探索
極限環境生物学会 2020年度 年会, 2020年10月31日 - 下新井田康介・山本正浩・川田佳史・笠谷貴史・高谷雄太郎・谷崎明子・鹿島裕之・高木善弘・野崎達生・高井研
深海熱水噴出域における電気生態系の探索と解析
極限環境生物学会 2020年度 年会, 2020年10月31日 - 高木善弘、平井美穂、浦山俊一、布浦拓郎
FLDS法の改変によるトランスクリプトーム解析手法の開発
第14回日本ゲノム微生物学会年会, 2020年03月06日 - 氏家由利香、石谷佳之、石井俊一、長井裕季子、高木義弘、生田哲郎、豊福高志
トランスクリプトーム解析に基づく有孔虫の石灰化分子機構
日本古生物学会第169回例会, 東京大学駒場キャンパス, 2020年02月08日 - 小林 瑠那, 山本 正浩, 谷崎 明子, 平井 美穂, 鹿島 裕之, 生田 哲郎, 高木 善弘, 三輪 哲也, 高井 研
深海熱水噴出域に電気をエネルギー源として利用する微生物は存在するか?
好塩微生物研究会, 2019年12月13日 - 下新井田康介・山本正浩・川田佳史・笠谷貴史・谷崎明子・鹿島裕之・高木善弘・野崎達生・高井研
天然の発電所である深海熱水噴出域によって形成される電場が微生物叢に与える影響についての調査
好塩微生物研究会, 2019年12月13日 - 嶋根 康弘、高木 善弘、早船 瑞麗、工藤 美祈、高井 研、峯岸 宏明
好アルカリ性高度好塩性古細菌のドラフトゲノム解析
第20回極限生物学会年会, 2019年11月17日 - 吉田ゆかり、高木善弘、吉田光宏、布浦拓郎、高井研
熱水噴出孔に優先する化学独立栄養細菌と溶原化ファージの共進化について
ネオウイルス学領域班会議, 2019年11月06日 - Yoshihiro Takaki, Syun-ichi Urayama
RNA virus diversity in sea water and hot springs
Mini-Workshop on Virome and Bioinformatics, 2019年10月28日 - Jin Sun, Chong Chen, Norio Miyamoto, Runsheng Li, Julia D. Sigwart, Ting Xu, Yanan Sun, Wai Chuen Wong, Jack C.H. Ip, Weipeng Zhang, Yi Lan, Dass Bissessur, Tomo-o Watsuji, Hiromi Kayama Watanabe, Yoshihiro Takaki, Kazuho Ikeo, Nobuyuki Fujii, Kazutoshi Yoshitake, Jian-Wen Qiu, Ken Takai, Pei-Yuan Qian
The Scaly-foot Snail genome and the ancient origins of biomineralised armour
The Royal Society Theo Murphy International Scientific Meeting "Pearls of wisdom: synergising leadership and expertise in molluscan genomics", 2019年09月16日, [招待有り] - Yurika Ujiié, Yoshiyuki Ishitani, Shun’ichi Ishii, Yukiko Nagai, Yoshihiro Takaki, Tetsuro Ikura, Takashi Toyofuku
Transcript assembly and quantification identify candidate genes for foraminiferal calcification
日本地球惑星科学連合2019年大会, 2019年05月26日 - 山本 正浩, 川田 佳史, 笠谷 貴史, 鹿島 裕之, 設樂 真莉子, 谷崎 明子, 高木 善弘, 高谷 雄太郎, 山口 晃, 北台 紀夫, 中村 龍平, 野崎 達生, 高井 研
深海熱水域における電気生態系の探査
第44回生命の起源および進化学会学術講演会, 2019年03月20日 - 平山 仙子、高木 善弘、阿部 真理子
深海に生息する好気性メタン酸化細菌Methyloprofundus sp. INp10のゲノムおよびトランスクリプトーム解析
2018年度(第19回)極限環境生物学会年会, 2018年12月09日 - 生田 哲朗, 多米 晃裕,高木 善弘,齋藤 正輝,力石 嘉人,土屋 正史,藤倉 克則,吉田 尊雄
掘足類ヤカドツノガイと経卵伝達される細菌の関係
日本共生生物学会第2回大会, 2018年11月24日 - 氏家由利香, 石谷佳之, 石井俊一, 長井裕季子, 高木義弘, 豊福高志, 生田哲郎
有孔虫の炭酸塩の殻形成に関する分子機構-トランスクリプトーム解析から-
第13回バイオミネラリゼーションワークショップ, 2018年11月09日 - 氏家 由利香, 石谷 佳之, 石井 俊一, 長井 裕季子, 高木 義弘, 豊福高志, 生田哲朗
有孔虫の炭酸塩の殻形成に関する分子機構―トランスクリプトーム解析からー
バイオミネラリゼーション研究会・第13回バイオミネラリゼーションワークショップ, 2018年11月09日 - Takuro Nunoura,Syun-Ichi Urayama,Shinji Fukuda,Yoshihiro Takaki
Human fecal RNA viromes revealed by FLDS
第66回日本ウイルス学会学術集会, 2018年10月28日 - 高木善弘、平山仙子、阿部真理子、津田美和子
メタン酸化バイオフィルムにおける遺伝子発現解析
環境微生物系学会合同大会2017, 2018年08月29日 - 吉田ゆかり、高木善弘、布浦拓郎、高井研
Persephonella sp.から誘発される溶原性ファージの性状解析
日本微生物生態学会第32回大会, 2018年07月13日 - 山本正浩、谷崎明子、津田美和子、高木善弘、高井 研
深海熱水発電を利用した電気合成微生物の培養
微生物生態学会2018年大会, 2018年07月12日 - Yurika Ujiie, Yoshiyuki Ishitani, Shunichi Ishii, Yukiko Nagai, Yoshihiro Takaki, Takashi Toyofuku
Transcript assembly and quantification by RNA-Seq identifies candidate genes for foraminiferal biomineralization of Ammonia beccarii
International Symposium on Foraminifera (FORAMS 2018), Edinburgh, UK, 2018年06月18日 - 丸山正、島村繁、高木善弘、吉田尊雄
深海共生二枚貝シロウリガイ類共生細菌におけるDNA修復遺伝子の欠失とゲノム縮小進化
第50回 日本原生生物学会大会 & 第1回 日本共生生物学会大会 合同大会, 2017年11月19日 - 生田 哲朗,高木 善弘,多米 晃裕,藤倉 克則,吉田 尊雄
ヤカドツノガイ卵表面に見出された真正細菌
第50回日本原生生物学会第1回日本共生生物学会大会, 2017年11月18日 - 中原望・吉田奈央子・田角栄二・高木善弘・酒井早苗・宮崎征行・山口隆司・高井研・井町寛之
海底堆積物から分離した新規Chlorolexi門細菌の生理代謝機能の解明
環境微生物系学会合同大会2017, 2017年08月31日 - 平井 美穂 , 西 真朗 , 津田 美和子 , 高木 善弘 , 布浦 拓郎
ピコグラム環境DNAからのメタゲノムライブラリー構築と実験テクニック
環境微生物系学会合同大会2017, 2017年08月30日 - Hiroko Makita, Sakiko Kikuchi, Mitsunobu Satoshi, Emiko Tanaka, Yoshihiro Takaki, Toshiro Yamanaka, Tomohiro Toki, Takuroh Noguchi, Kentaro Nakamura, Mariko Abe, Miho Hirai, Masahiro Yamamoto, Katsuyuki Uematsu, Junichi Miyazaki, Takuro Nunoura, Yoshio Takahashi and Ken Takai
Microorganisms involved in the formation of distinctive iron oxide in deep-sea environments of Earth and even in extraterrestrial bodies
JpGU-AGU Joint Meeting 2017, 2017年05月23日 - Nakahara N, Yoshida N, Tasumi E, Nobu M, Miyazaki M, Takaki Y, Sakai S, Tamaki H, Yamaguchi T, Takai K and Imachi H
Cultivation of microbial dark matters from marine sediments: novel bacteria affiliated with uncultured groups of the phylum Chloroflexi
JpGU-AGU Joint Meeting 2017, 2017年05月22日, [招待有り] - 矢吹彬憲,浦山俊一,高木善弘,横川太一,杉江恒二,松葉史紗子,西真郎,荒井渉,平井美穂,藤倉克則,布浦拓郎
環境RNAを利用した真核微生物の群集構造解析
日本藻類学会第41回大会, 2017年03月24日 - Hiroko Makita, Sakiko Kikuchi, Mitsunobu Satoshi, Emiko Tanaka, Yoshihiro Takaki, Toshiro Yamanaka, Tomohiro Toki, Takuroh Noguchi, Kentaro Nakamura, Mariko Abe, Miho Hirai, Masahiro Yamamoto, Katsuyuki Uematsu, Junichi Miyazaki, Takuro Nunoura, Yoshio Takahashi and Ken Takai
Microorganisms involved in the formation of Iron-dominated flocculent mats in deep-sea hydrothermal environments
4th International Geoscience Symposium “Precambrian World 2017", 2017年03月05日 - 矢吹彬憲,浦山俊一,高木善弘,横川太一,松葉史紗子,西真郎,荒井渉,平井美穂,藤倉克則,布浦拓郎
RNA-seqデータを活用した真核微生物群集構造の解明に向けた取り組み
ブルーアース2017, 2017年03月02日 - 浦山 俊一 , 西 真郎 , 吉田 ゆかり , 高木 善弘 , 高井 研
網羅的RNAウイルス検出手法
分子生物学会, 2016年12月02日 - Tetsuro Ikuta, Kanae Igawa, Akihiro Tame, Tsuneyoshi Kuroiwa, Haruko Kuroiwa, Yui Aoki, Yoshihiro Takaki, Yukiko Nagai, Genki Ozawa, Masahiro Yamamoto, Ryusaku Deguchi, Katsunori Fujikura, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Extracellular endosymbiont transmission via egg's vegetal pole in a deep-sea Calyptogena clam
The 22nd International Congress of Zoology, The 87th Meeting of The Zoological Society of Japan, 2016年11月17日 - 高木善弘、平山仙子、阿部真理子、津田美和子
深海性メタン酸化細菌のバイオフィルムにおける遺伝子発現
第31回日本微生物生態学会, 2016年10月23日 - 吉田 ゆかり, 吉田 光宏, 西 真郎, 高木 善弘, 高井 研
イプシロンプロテオバクテリアが産生する細胞外膜小胞の形態学的・遺伝学的特徴
第31回日本微生物生態学会大会, 2016年10月23日 - 吉田 光宏, 望月 智弘, 浦山 俊一, 吉田(高島) ゆかり, 西 真郎, 高木 善弘, 布浦 拓郎, 高井 研
一本鎖DNAウイルス群を標的とする定量的メタゲノミクス
第31回日本微生物生態学会大会, 2016年10月23日 - 高木 善弘, 平山 仙子, 阿部 真理子, 津田 美和子
深海性メタン酸化細菌のバイオフィルムにおける遺伝子発現
第31回日本微生物生態学会, 2016年10月23日 - 平井 美穂・西 真朗・津田 美和子・高木 善弘・布浦 拓郎
超微量環境DNAからのメタゲノムライブラリー構築に関する技術的検討
日本微生物生態学会第31回大会, 2016年10月23日 - 矢吹彬憲、浦山俊一、高木善弘、西真郎、横川太一、荒井渉、平井美穂、藤倉克則、布浦拓郎
RNA-seqデータを活用した真核微生物群集構造の解明に向けた取り組み
日本微生物生態学会 第31回大会, 2016年10月23日 - 中原望・小西優・高木善弘・酒井早苗・玉木秀幸・山口隆司・高井研・井町寛之
海底堆積物に生息する微生物ダークマターChloroflexi門細菌の分離・培養
第31回日本微生物生態学会大会, 2016年10月23日 - 吉田 光宏,望月 智弘,浦山 俊一,吉田(高島) ゆかり,西 真郎,高木 善弘,布浦 拓郎,高井 研
一本鎖DNAウイルス群を標的とする定量的メタゲノミクス
ファージ・環境ウイルス研究合同シンポジウム, 2016年10月21日 - 浦山 俊一 , 高木 善弘 , 西 真郎 , 吉田 ゆかり , 布浦 拓郎
海洋における微生物細胞内・外RNAウイルスの多様性解析
ファージ・環境ウイルス研究合同シンポジウム, 2016年10月21日 - Nakahara N, Takai Y, Konishi M, Tamaki H, Yamaguchi T, Takai K and Imachi H
Cultivation of uncultured Chloroflexi bacteria, a microbial dark matter in subseafloor biosphere
The 8th Asian Symposium on Microbial Ecology, 2016年10月01日 - Yukari Yoshida, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, 高井研
Diversity and Evolutionary Relationships of Temperate Phages in Deep-sea Chemolithoautotrophic Epsilonproteobacteria, Nitratiruptor
Extremophiles 2016, 2016年09月15日 - Takuro Nunoura, Yoshihiro Takai, Miho Hirai, Aya Shuto, Hiroaki Minegishi, Shinro Nishi, Wataru Arai, Yasuhiro Shimane, Ramunas Stepanauskas, Ken Takai
Comparison of The Hadal Planktonic Biosphere in The Northwest Pacific Trenches
11th International Congress of Extremophiles: Extremophiles 2016, 2016年09月13日 - Nakahara N, Takai Y, Konishi M, Tamaki H, Yamaguchi T, Takai K and Imachi H
Cultivation of previously uncultured Chloroflexi, a bacterial dark matter in subseafloor biosphere
ISME 16, 2016年08月23日 - Takuro Nunoura, Yoshito Chikaraishi, Takeshi Harada, Koji Mori, Yumiko Kato, Takaaki Sato, Katsunori Yanagawa, Masayuki Miyazaki, Aya Shuto, Naohiko Ohkouchi, Nobuyuki Fujita, Haruyuki Atomi, Yoshihiro Takaki, Ken Takai
A primordial and reversible TCA cycle in a facultatively chemolithoautotrophic thermophile
Gordon Research Conference 'Molecular Basis of Microbial One-Carbon Metabolism', 2016年08月03日 - NUNOURA T, TAKAKI Y, MINEGISHI H, HIRAI M, SHUTO A, STEPANAUSKAS R, TAKAI K
Niche separation of marine thaumarchaeotes from the seasurface to the hadal ocean
Goldschmidt 2016, 2016年06月29日, [招待有り] - 高木善弘、平山仙子、阿部真理子、津田美和子
リアクター培養法による深海性メタン酸化細菌の分離培養の試み
第18回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2016年05月29日 - 高木 善弘, 平山 仙子, 阿部 真理子, 津田 美和子
リアクター培養法による深海性メタン酸化細菌の分離培養の試み
第18回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2016年05月29日 - 生田 哲朗、大森 紹仁、津田 美和子、高木 善弘、近藤 真理子
ニッポンウミシダParaHox遺伝子群のクラスター構造と発現
第68回日本動物学会関東支部大会, 2016年03月12日 - 丸山正、嶋根康弘、岩沢美佐子、秦田勇二、吉田尊雄、高木善弘、大石和恵、田中成典、渡邉博文、 徐逢祺、望月祐志、福澤薫、古明地勇人
フラグメント分子軌道法による生物間相互作用解析〜ウイルスの受容体への結合特異性解析への応用〜
平成27年度地球シミュレータ利用報告会, 2016年03月11日 - 深海熱水噴出孔における自然発電の実証と電気生態系の調査
ブルーアース 2016, 2016年03月08日 - 吉田ゆかり,高木善弘, 布浦拓郎, 高井研
イプシロンプロテオバクテリアの溶原ファージのゲノム多様性と宿主との進化的相互関係
ブルーアース2016, 2016年03月08日 - 高木 善弘, 生田 哲朗, 長井 裕季子, 島村 繁, 津田 美和子, 川口 慎介, 青木 結, 井上 広滋, 照屋 盛実, 佐藤 万仁, 照屋 邦子, 下地 真紀子, 保 日奈子, 平野 隆, 丸山 正, 吉田 尊雄
シチヨウシンカイヒバリガイ共生細菌における、エネルギー獲得機能の多様化したゲノム
第10回日本ゲノム微生物学会年会, 2016年03月04日 - 浦山俊一、吉田ゆかり、高木善弘、高井研、布浦拓郎
宿主病徴に依存しない網羅的RNAウイルスゲノム決定手法の確立
日本ゲノム微生物学会, 2016年03月04日 - 高見英人、豊田敦、内山郁夫、伊藤武彦、高木善弘、荒井渉、西 真郎、河合幹彦、池田治生
溶菌酵素生産者Lysobacter enzymogenesのゲノム解析
日本ゲノム微生物学会, 2016年03月04日 - Yuki Hongo, Tetsuro Ikuta, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Shuji Shigenobu, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Inorganic carbon uptake genes in the gill of the deep-sea clam Calyptogena okutanii
第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会, 2015年12月02日 - 吉田ゆかり, 高木善弘, 布浦拓郎, 高井研
イプシロンプロテオバクテリアとファージの進化的相互作用の解明
日本微生物生態学会第30回大会, 2015年10月18日 - 井川 かなえ、本郷 悠貴、高木 善弘、重信 秀治、丸山 正、吉田 尊雄、生田 哲朗
深海性二枚貝シマイシロウリガイの配偶子形成期における共生菌の局在
日本動物学会第86回年会, 2015年09月19日 - 布浦 拓郎・高木 善弘・首藤 彩・平井 美穂・峯岸 宏明・高井 研
1細胞ゲノム解析から見る海洋性アンモニア酸化アーキアの環境適応機構
日本Archaea研究会第28回講演会, 2015年07月23日 - 吉田ゆかり、高木善弘、吉田光宏、布浦拓郎、高井研
極限環境におけるウイルスのゲノム解析
NGS現場の会 第四回研究会, 2015年07月01日 - Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Aya Shuto, Miho Hirai Ramunas Stepanauskas, Ken Takai
Genomic insights into the niche adaptation of marine Thaumarchaeota along the water column from the sea surface to hadal ocean
Third Microbial Single Cell Genomics Workshop, 2015年06月23日, [招待有り] - 野牧 秀隆・布浦 拓郎・平井 美穂・ジュリアーニ・高木 善弘・井上 健太郎・菅 寿美
インド洋酸素極小層内の底生微生物相と炭素・窒素循環
日本地球惑星科学連合2015年大会, 2015年05月28日 - 布浦 拓郎・高木 善弘・首藤 彩・高井 研
1細胞ゲノム解析から見る海洋性アンモニア酸化アーキアの環境適応機構
日本地球惑星科学連合2015年大会, 2015年05月26日 - 長井裕季子・豊福高志・多米晃裕・植松勝之・和辻智郎・生田哲朗・高木善弘・吉田尊雄・小西正朗
硫化水素添加水槽を用いたシロウリガイ類飼育
ブルーアース2015, 2015年03月19日 - 井川 かなえ,本郷 悠貴, 小澤 元希,高木 善弘,重信 秀治, 丸山 正・吉田 尊雄・,生田 哲朗
シマイシロウリガイ生殖巣の発達過程における共生菌の局在解析
ブルーアース2015, 2015年03月19日 - 井川 かなえ、本郷 悠貴,小澤 元希,高木 善弘,山口 勝司・重信 秀治,丸山 正・吉田 尊雄,生田 哲朗
シマイシロウリガイ生殖巣の発達過程における共生菌の局在解析
日本動物学会第67回関東支部大会, 2015年03月14日 - 布浦 拓郎・高木 善弘・首藤 彩・Ramunas Stepanauskas・高井 研
1細胞ゲノム解析から見る海洋性アンモニア酸化アーキアの環境適応機構
第9回日本ゲノム微生物学会年会, 2015年03月08日 - 高木 善弘、首藤 彩、布浦 拓郎、高井 研
未培養好熱性アーキアCaldiarchaeum群集におけるrRNA遺伝子及びその周辺領域の多様性
第9回 日本ゲノム微生物学会年会, 2015年03月07日 - 浦山俊一、吉田ゆかり、吉田光宏、高木善弘、高井研、布浦拓郎
ウイルス核酸種4種の同時分画及びdsRNAメタゲノム手法の確立
第9回 日本ゲノム微生物学会年会, 2015年03月07日 - 外丸裕司、木村圭、吉田ゆかり、高木善弘
珪藻に感染するウイルスの研究
第一回分子珪藻研究会, 2014年12月15日 - 布浦拓郎・高木善弘・力石嘉人・森浩二・佐藤喬章・原田健史・柳川勝紀・首藤彩・大河内直彦・跡見晴幸・藤田信之・高井研
嫌気性水素酸化好熱細菌Thermosulfidibacterの可逆的TCA回路
2014環境微生物系学会合同大会, 2014年10月22日 - 深海底熱水活動域に存在する酸化鉄被膜地帯での微生物調査
2014年度 日本地球化学会年会, 2014年09月16日 - 井川 かなえ,本郷 悠貴,高木 善弘,山口 勝司, 重信 秀治,丸山 正,吉田 尊雄,生田 哲朗
深海性二枚貝シマイシロウリガイ共生細菌の卵母細胞における局在
日本動物学会第85回大会, 2014年09月13日 - Hideto Takami, Wataru Arai, Yoshihiro Takaki, Atsushi Toyoda, Takeaki Taniguchi, Shinro Nishi, Taishi Tsubouchi, Mikihiko Kawai, Fumio Inagaki
Metagenomic characterization of carbon fixation pathways in deep subseafloor microbial communities
ISME15, 2014年08月25日 - 生田 哲朗、高木 善弘、丸山 正、吉田 尊雄
深海化学合成系における新しい環境適応戦略 〜シチヨウシンカイヒバリガイ共生菌ゲノムから〜
日本進化学会第16回大会, 2014年08月24日, [招待有り] - 吉田 尊雄,高木 善弘,島村 繁,丸山 正
深海性二枚貝に細胞内共生する化学合成細菌のゲノム進化
第17回微生物アカデミー研究集会, 2014年08月21日 - Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Aya Shuto, Ramunas Stepanauskas, Ken Takai
Single-cell genomics revealed niche separation of marine Thaumarchaeota along the water column on the Ogasawara Trench
Molecular Biology of Archaea 4, 2014年05月21日 - Biosignature found in iron oxide mineralogy of iron-oxidizing microbe origin?
JpGU 2014, 2014年04月30日 - Genki Ozawa,Takashi Kaneko, Shigeru Shimamura,Yoshihiro Takaki,Takeshi Koshiishi, Chiaki Kato,Tadashi Maruyama,Takao Yoshida
深海性二枚貝シロウリガイ類における化学合成共生細菌の宿主転換の可能性
日本地球惑星科学連合2014年大会, 2014年04月29日, [招待有り] - 長井 裕季子, 豊福 高志, 野牧 秀隆, 和辻 智郎, 生田 哲朗, 高木 義弘, 吉田 尊雄, 滋野 修一, 井上 広滋, 小西 正朗
シチヨウシンカイヒバリガイ共生系は実験室でも化学合成できるのか?
地球惑星連合大会2014, 2014年04月29日 - 瀧下清貴,矢吹彬憲,力石嘉人,高木善弘,吉田尊雄,大河内直彦
真核生物の細胞膜に存在するステロールおよびその代替物質に関する謎
日本地球惑星科学連合2014年大会, 2014年04月28日 - 布浦 拓郎・高木 善弘・力石 嘉人・森 浩二・佐藤 喬章・原田 健史・柳川 勝紀・首藤 彩・大河内 直彦・跡見 晴幸・藤田 信之・高井 研
嫌気性水素酸化好熱細菌Thermosulfidibacterの可逆的TCA回路
第8回ゲノム微生物学会年会, 2014年03月09日 - Aya Shuto,Yoshihiro Takaki,Takami Hideto,Takuro Nunoura,Ken Takai
未培養好熱性アーキアCaldiarchaeum群集におけるゲノム多様性
第8回日本ゲノム微生物学会年会, 2014年03月07日 - Takuro Nunoura, Miho Hirai, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Ken Takai
The deep cold trench biosphere: microbial ecosystem in the Challenger Deep
2014 Ocean Sciences Meeting, 2014年02月28日 - 長井裕季子・豊福高志・野牧秀隆・和辻智郎・生田哲朗・高木善弘・吉田尊雄・小西正朗
硫化水素添加水槽を用いたシロウリガイの飼育
ブルーアース2014, 2014年02月19日 - 高見 英人、豊田 敦、高木 善弘、荒井 渉、谷口 丈晃、西 真郎、坪内 泰志、河合 幹彦、藤山 秋佐夫、稲垣 史生
海洋堆積物中に優占する Candidate division JS1 は潜在的ホモアセトジェン?
日本微生物生態学会 年会, 2013年11月24日 - 吉田ゆかり、高木善弘、布浦拓郎、高井研
深海熱水噴出域に生息する化学合成独立栄養細菌の溶原性ファージのゲノム解析
第29回日本微生物生態学会大会, 2013年11月23日 - 荒井 渉、谷口 丈晃、高木 善弘、河合 幹彦、稲垣 史生、高見 英人
KEGG機能モジュールを用いた海洋堆積物中の菌叢解析と代謝機能の評価
第29回日本微生物生態学会年会, 2013年11月23日 - KEGG機能モジュールを用いた海洋堆積物中の菌叢解析と代謝機能の評価
第29回日本微生物生態学会大会, 2013年11月22日 - メタゲノミクスによる未培養好熱性アーキア集団のゲノム動態解析
第16回日本水環境学会シンポジウム, 2013年11月09日, [招待有り] - 未培養好熱性アーキアCaldiarchaeum群集におけるrRNA遺伝子及びその周辺領域の多様性
極限環境生物学会年会, 2013年10月27日 - 布浦 拓郎、高木 善弘、風間 宏美、角太 淳吾、平井 美穂、島村 繁、高井 研
巻き貝共生菌に極めて近縁な硫黄酸化細菌の単離とゲノム解析
極限環境生物学会2013年度(第14回)年会, 2013年10月27日 - 西真郎、坪内泰志、首藤彩、高木善弘、秦田勇二
リード長の違いが生み出すde novoアセンブリの完成度比較
NGS現場の会 第三回研究会, 2013年09月04日 - Takuro Nunoura, Akiko Makabe, Miho Hirai, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Junichi Miyazaki, Kazuhiro Inoue, Tohru Kikuchi, Osamu Koide, Keisuke Koba, Yuichiro Ueno, Michinari Sunamura, Ken Takai
Niche separation of the nitrifying archaea and bacteria from sea surface to the trench bottom found in the Challenger Deep
ICoN3 3rd International Conference on Nitrification, 2013年09月03日 - MIKIHIKO KAWAI, TAIKI FUTAGAMI, ATSUSHI TOYODA, YOSHIHIRO TAKAKI, IKUO UCHIYAMA, ASAO FUJIYAMA, TAKEHIKO ITOH, FUMIO INAGAKI, HIDETO TAKAMI
Diverse reductive dehalogenases enriched in subseafloor sediment
Goldschmidt2013, 2013年08月26日 - TAKAKI YOSHIHIRO , MIYAZAKI MASAYUKI , TSUDA MIWAKO, TERUYA MORIMI , YOSHIDA TAKAO , SHIMAMURA SHIGERU , SATOH NORIYUKI , KAWATO MASARU , FUJIWARA YOSHIHIRO , MARUYAMA TADASHI
Genome analysis of the closest free-living bacteria of gutless marine worm endosymbionts
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 2013年08月22日 - Takao Yoshida, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Yukiko Nagai, Miwako Tsuda, Masatoshi Tsukahara, Maiko Nezuo, Makiko Shimoji, Kuniko Teruya, Morimi Teruya, Tadashi Maruyama
The genomes of intracellur symbionts in deep-sea Calyptogena clams are still in an early phase of reductive genome evolution.
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 2013年08月20日 - Tetsuro Ikuta, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Heterogeneous subpopulations of thioautotrophic intracellular symbiont in a deep-sea mussel, Bathymodiolus septemdierum, and their patchy distribution in the host gill.
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 2013年08月19日 - Genki Ozawa, Takashi Kaneko, Shigeru Shimamura,Yoshihiro Takaki, Shin-ichi Yokobori, Takeshi Koshiishi, Chiaki Kato, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
Cospeciation of deep-sea Calyptogena clams and chemoautotrophic bacteria
5th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 2013年08月19日 - 二枚貝共生系による木質分解について―フナクイムシのRNA-seq解析
第2回マトリョーシカ型生物学研究会, 2013年07月25日 - 内村康祐、津留美紀子、小林徹、高木善弘、出口茂
深海微生物が生産するセルロース分解酵素
セルロース学会第20回年次大会, 2013年07月19日 - 首藤彩・高木善弘・高見英人・布浦拓郎・高井研
未培養好熱性アーキアCaldiarchaeum群集におけるrRNA遺伝子及び その周辺領域の多様性
日本Archaea研究会第26回講演会, 2013年07月19日 - 課題3: 沖合海底生態系変動メカニズムの解明 テーマ1: 漁場における瓦礫マッピングと分解プロセスの解明
東北マリンサイエンス拠点形成事業全体会議, 2013年06月07日 - 生田 哲朗、高木 善弘、島村 繁、長井 裕季子、津田 美和子、丸山 正、吉田 尊雄
シチヨウシンカイヒバリガイ共生菌のゲノム解読と、水素酸化遺伝子群をはじめとした遺伝子座の有無で分けられるヘテロな亜集団の宿主内での局在解析
第15回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2013年06月01日 - 本郷 悠貴、生田 哲朗、島村 繁、高木 善弘、丸山 正、吉田 尊雄
深海性共生二枚貝における無機炭素取込み機構の解明
第15回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2013年06月01日 - 河合幹彦, 二神泰基, 豊田敦, 高木善弘, 内山郁夫, 伊藤武彦, 藤山秋佐夫, 稲垣史生, 高見英人
海底堆積物中に存在する多様な新規還元的脱ハロゲン化酵素遺伝子
環境バイオテクノロジー学会2013 年度大会, 2013年05月30日 - 動物が葉緑体を細胞内に一時的に取り込み光合成を行う盗葉緑体現象の野外での適応的意義
日本地球惑星科学連合2013年大会, 2013年05月19日 - 高見英人,野口英樹,高木善弘,内山郁夫,豊田敦,西真郎,池甲珠,荒井渉,伊藤武彦,服部正平,高井研
共通祖先系に最も近いバクテリアの潜在的代謝機能
日本農芸化学会 年会, 2013年03月27日 - 河合幹彦、豊田敦、高木善弘、西真郎、荒井渉、内山郁夫、伊藤武彦、坪内泰志、諸野祐樹、青池寛、高井研、藤山秋佐夫、稲垣史生、高見英人
海底堆積層に見つかる多様な還元的脱ハロゲン化酵素遺伝子:天然ハロゲン化有機化合物は海底で代謝されている?
日本農芸化学会大会2013, 2013年03月26日 - 小澤 元希, 金子 隆司 , 島村 繁 , 高木 善弘 , 輿石 武 , 加藤 千明, 丸山 正, 吉田 尊雄
ミトコンドリアゲノムから見た深海性二枚貝シロウリガイ類の系統関係および共生細菌との共進化について
ブルーアース2013, 2013年03月15日 - 宮崎征行・河戸勝・宮本教生・高木善弘(JAMSTEC),山本智子(鹿児島大学),藤原義弘(JAMSTEC/ 広島大学)
ホネクイハナムシ類共生細菌の多様性
ブルーアース2013シンポジウム, 2013年03月15日 - 河戸勝・高木善弘・藤原義弘
深海産二枚貝ヒラノマクラにおける細胞外共生細菌のゲノム解析
ブルーアース2013シンポジウム, 2013年03月15日 - 宮崎征行・河戸勝・宮本教生・高木善弘,山本智子,藤原義弘
ホネクイハナムシ類共生細菌の多様性
ブルーアース2013, 2013年03月15日 - 高木善弘、宮崎征行、吉田尊雄、島村繁、河戸勝、藤原義弘、丸山正
鯨骨生物群集における共生へのゲノミックス的アプローチ
第7回日本ゲノム微生物学会年会, 2013年03月09日 - 吉田ゆかり、高木善弘、島村繁、布浦拓郎、高井研
深海熱水活動域に生息するイプシロンプロテオバクテリアの溶原性ファージのゲノム解析
第7回日本ゲノム微生物学会年会, 2013年03月09日 - 河合幹彦、豊田敦、高木善弘、西真郎、荒井渉、内山郁夫、伊藤武彦、坪内泰志、諸野祐樹、青池寛、高井研、藤山秋佐夫、稲垣史生、高見英人
定量的メタゲノム解析が明らかにした海底下堆積環境を特徴づける還元的脱ハロゲン化遺伝子
第7回日本ゲノム微生物学会年会, 2013年03月09日 - 島村繁、中川聡、高木善弘、高井研
〜解析時間短縮しませんか?〜 糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS」の紹介
第85回日本生化学会大会, 2012年12月15日 - 小澤元希、島村繁、高木善弘、丸山正、吉田尊雄
ミトコンドリアゲノムから見た深海性二枚貝シロウリガイ類の系統関係および共生細菌との共進化について
第35回日本分子生物学会年会, 2012年12月12日 - NAKAGAWA SATOSHI, SHIMAMURA SHIGERU, TAKAKI YOSHIHIRO, Mino Sayaka, MAKITA HIROKO, SAWABE TOMOO, TAKAI KEN
Genomic and population genetic analysis of deep-sea vent chemoautotrophs.
AGU Fall Meeting 2012, 2012年12月05日 - Mikihiko Kawai, Atsushi Toyoda, Yoshihiro Takaki, Shinro Nishi, Wataru Arai, Ikuo Uchiyama, Takehiko Itoh, Taishi Tsubouchi, Yuki Morono, Kan Aoike, Ken Takai, Asao Fujiyama, Fumio Inagaki, Hideto Takami
Vertical profiling of genetic trait in the subsurface sediments up to 100 m depth revealed diverse reductive dehalogenases as one of presumable key genes for survival in the deep subfurface sediments.
International Symposium on Paleoceanography in the Southern Ocean and NW Pacific: Perspective from Earth Drilling Sciences, 2012年11月19日 - 小澤 元希, 島村 繁, 高木 善弘, 丸山 正,吉田 尊雄
ミトコンドリアゲノムから見た深海性二枚貝シロウリガイ類の系統関係および共生細菌との共進化について
日本細胞共生学会 2012年 若手の会, 2012年11月06日 - Mitsuhiro Yoshida*, Yoshihiro Takaki, Takuro Nunoura, and Ken Takai
Metagenomic analyses of the viral communities in (hado)pelagic sediments ((超)深海における表層堆積物中の未知ウイルス群集構造の解明)
第28回日本微生物生態学会大会, 2012年09月20日 - 吉田ゆかり、高木善弘、島村繁、布浦拓郎、高井研
深海底熱水活動域に生息する化学合成独立栄養細菌に感染するファージのゲノム解析
日本進化学会第14回東京大会, 2012年08月21日, [招待有り] - Mikihiko Kawai, Atsushi Toyoda, Yoshihiro Takaki, Shinro Nishi, Wataru Arai, Ikuo Uchiyama, Takehiko Itoh, Taishi Tsubouchi, Yuki Morono, Kan Aoike, Ken Takai, Asao Fujiyama, Fumio Inagaki, Hideto Takami
Vertical profiling of genetic trait in the ocean drilling sediments up to 100 m depth
14th International Symposium on Microbial Ecology, 2012年08月21日 - Yoshihiro Takaki, Mamiko Nishino, Takeru Koshiishi, Shigeru Shimamura, Takao Yoshida, Miwako Tsuda, Chiaki Kato, Tadashi Maruyama
Reductive genome evolution in chemolithotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
14th International Symposium on Microbial Ecology, 2012年08月20日 - YOSHIDA TAKAO , TAKAKI YOSHIHIRO , SHIMAMURA SHIGERU , Tsukahara Masatoshi , Nezuo Maiko , Shimoji Makiko , Satou Kazuhito , Teruya Morimi , MARUYAMA TADASHI
The genome of an intracellur symbiont of deep sea clam, Calyptogena phaseoliformis, is still in an early phase of reductive genome evolution.
14th International Symposium on Microbial Ecology, 2012年08月20日 - Taro Maeda, Euichi Hirose, Yoshito Chikaraishi, Masaru Kawato, Kiyotaka Takishita, Takao Yoshida, Heroen Verbruggen, Jiro Tanaka, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Masashi Tsuchiya, Kenji Iwai, Shuji Shigenobu, Tadashi Maruyama
Algivore or Phototroph? Plakobranchus ocellatus (Gastropoda) Continuously Acquires Kleptoplasts and Nutrition from Multiple Algal Species in Nature
The 9th Okazaki Biology Conference Marine Biology II, 2012年08月17日 - 内村 康祐, 津留 美紀子, 高木 善弘, 小林 徹, 出口 茂
深海起源のセルロース分解菌のドラフトシーケンスとセルラーゼ機能の分析
日本細菌学会 第6回細菌学若手コロッセウム, 2012年08月09日 - Yuki Hongo, Yoshimitsu Nakamura, Shigeru Shimamura, Yoshihiro Takaki, Katsuyuki Uematsu, Takashi Toyofuku, Hisako Hirayama, Ken Takai, Masatoshi Nakazawa, Tadashi Maruyama, Takao Yoshida
The characterization and localization of carbonic anhydrase in symbiotic deep-sea clam Calyptogena okutanii.
Advances in genomics of (Deep-sea) chemoautotrophic symbioses, 2012年05月25日 - 島村 繁、高木 善弘、 長井 裕季子、 津田 美和子、 丸山 正、吉田 尊雄
NGSを用いた深海性二枚貝の細胞内共生細菌ゲノム解析
第二回NGS現場の会, 2012年05月24日 - 島村 繁、中川 聡、高木 善弘
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS」の紹介
BIO tech 2012 アカデミック フォーラム, 2012年04月27日 - 布浦 拓郎, 風間 宏美, 角太 淳吾, 島村 繁, 高木 善弘, 高井 研
深海底熱水活動域に棲息する新奇硫黄酸化Gammaproteobacteriaのゲノム解析
第6回日本ゲノム微生物学会年会, 2012年03月10日 - 河合 幹彦,豊田 敦,高木 善弘,西 真郎,荒井 渉,内山 郁夫,諸野 祐樹,青池 寛,高井 研,稲垣 史生,高見 英人
海底堆積層の生物代謝能の比較メタゲノム配列解析
第6回日本ゲノム微生物学会年会, 2012年03月10日 - 小澤 元希, 島村 繁, 高木 善弘,横堀 伸一,前田 太郎, 丸山 正,吉田 尊雄
シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析
Blue Earth'12, 2012年02月22日 - 島村繁、中川聡、高木善弘、高井研
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS」の開発
第34回日本分子生物学会, 2011年12月14日 - 小澤 元希, 島村 繁, 高木 善弘,横堀 伸一, 丸山 正, 吉田 尊雄
深海性二枚貝シロウリガイ類のミトコンドリアゲノム解析
第34回分子生物学会, 2011年12月13日 - 阿部 真理子・和辻 智郎・牧田 寛子・島村 繁(独立行政法人海洋研究開発機構 SUGAR), 高木 善弘 (独立行政法人海洋研究開発機構 Biogeos), 宮崎 淳一・山本 正浩・高井 研 (独立行政法人海洋研究開発機構 SUGAR&PEL), 中川聡 (北海道大学),中村謙太郎(独立行政法人海洋研究開発機構 PEL)
インド洋中央海嶺熱水活動域と南マリアナ熱水活動域におけるアルビン貝共生菌の系統・機能遺伝子発現・活性解析
第27回微生物生態学会, 2011年10月09日 - 河合 幹彦,豊田敦,高木 善弘,西 真郎,内山 郁夫,高井 研,稲垣 史生,高見 英人
海底堆積層の生物代謝能の比較メタゲノム配列解析
第27回日本微生物生態学会大会, 2011年10月08日 - 機能ドメイン構造保持パターンからメタゲノム遺伝子機能推定
第27回日本微生物生態学会大会, 2011年10月08日 - 布浦 拓郎,風間 宏美, 角太 淳吾, 島村 繁, 高木 善弘, 高井 研
新奇硫黄酸化細菌の性状とゲノム解析
第27回日本微生物生態学会大会, 2011年10月08日 - 本郷悠貴, 中村欽光, 島村繁, 高木善弘, 植松勝之, 中澤正年, 丸山正, 吉田尊雄
深海の化学合成生態系に優占する二枚貝の炭酸脱水酵素の役割
第7回日本炭酸脱水酵素研究会学術集会, 2011年09月17日 - Yoshihiro Takaki,Takuro Nunoura,Hiromi Kazama,Jungo Kakuta,Shigeru Shimamura,Ken Takai
Isolation, characterization and genomic features of sulfur-oxidizing Gammaproteobateria, a close relative strain of chemoautotrophic endosymbionts
12th Symposium on Aquatic Microbial Ecology, 2011年08月28日 - 島村 繁, 中川 聡, 高木 善弘, 澤辺 智雄, 高井 研
Genome analysis on the horizontally transmitted bacterial endosymbiont of deep-sea vent gastropod in the Central Indian Ridge.
ゲノム微生物学会ワークショップ, 2011年08月20日 - 島村 繁, 中川 聡, 高木 善弘
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS(TM)」の紹介
第10回国際バイオEXPOバイオ アカデミック フォーラム, 2011年07月01日 - 島村 繁 , 中川 聡, 高木 善弘
糖鎖解析支援ソフト「GlyfinTMS (TM)」の紹介
第10回国際バイオEXPOバイオ アカデミック フォーラム, 2011年07月01日 - Yoshihiro Takaki,Takao Yoshida,Shigeru Shimamura,Masatoshi Tsukahara,Maiko Nezuo,Morimi Teruya,Shimoji Makiko,Tadashi Maruyama
Population genomics of the chemoautotrophic endsymbiont in Calyptogena clams
SMBE (Society for Molecular Biology and Evolution) 2011 Kyoto Coference, 2011年06月26日 - 西真郎、高木善弘、坪内泰志、荒井渉、小椋義俊、林哲也、高見英人
メタゲノム解析から見えるマリアナ海溝最深部の優先種ゲノム
第5回 日本ゲノム微生物学会年会, 2011年03月14日 - 島村繁、中川聡、高木善弘、澤辺智雄、高井研
インド洋深海底熱水活動域に棲息する巻貝の細胞内共生微生物のゲノム解析
第5回日本ゲノム微生物学会, 2011年03月14日 - 阿部 真理子・和辻 智郎・牧田 寛子・島村 繁(独立行政法人海洋研究開発機構 SUGAR), 高木 善弘 (独立行政法人海洋研究開発機構 Biogeos), 宮崎 淳一・山本 正浩・高井 研 (独立行政法人海洋研究開発機構 SUGAR&PEL), 中川聡 (北海道大学),中村謙太郎(独立行政法人海洋研究開発機構 PEL),玉木賢策(東京大学)
世界初、水素酸化の化学合成生物の発見 ―インド洋中央海嶺熱水活動域に生息するアルビン貝の機能解析―
ブルーアース2011, 2011年03月08日 - 中川聡,島村繁、高木善弘、高井研、澤辺智雄、YK09-13 Leg2 乗船研究者一同
インド洋の深海底熱水活動域に棲息する細胞内共生微生物のゲノム解析
ブルーアース11, 2011年03月08日 - 牧田 寛子,菊池 早希子,高木 善弘, 阿部 真理子, 宮崎 征行, 山本 正浩, 布浦 拓郎, 川口 慎介, 土田 真二, 中村 謙太郎, 宮崎 淳一, 稲垣 史生, 高井 研, 長塩 皓美, 西尾 竜, 山中 寿朗, 多和田 美紀, 土岐 知弘,野口 拓郎, 岡村 慶, 岡部 宣章, 井尻 暁, 砂村 倫成, 加藤 真悟, 中村 光一, 中川 聡, 中川 太郎, NT10-06Leg2,NT10-13Leg2, YK10-10航海乗船者一同
各地の深海底に存在する褐色変色域での微生物調査
Blue Earth'11, 2011年03月08日 - 小澤 元希,島村 繁,高木 善弘,神保 充,丸山 正,吉田 尊雄
深海性二枚貝のミトコンドリアゲノム解析
Blue Earth'11, 2011年03月07日 - Yoshihiro Takaki(Institute of Biogeosciences), Takao Yoshida(Institute of Biogeosciences) , Shigeru Shimamura(Institute of Biogeosciences) , Masatoshi Tsukahara(Tropical Technology Center LTD) , Maiko Nezuo(Tropical Technology Center LTD) , Morimi Teruya(Okinawa Ind. Tech. Ctr) , Makiko Shimoji(Tropical Technology Center LTD) , Tadashi Maruyama(Institute of Biogeosciences)
Population genomic analysis of the chemoautotrophic endsymbiont in Calyptogena clams
Memorial Symposium for the 26th International Prize for Biology, 2010年12月07日 - 中川聡、島村繁、高木善弘、高井研、澤辺智雄、YK09-13 Leg2 乗船研究者一同
インド洋の深海底熱水活動域に棲息する細胞内共生微生物のゲノム解析
第26回 日本微生物生態学会大会, 2010年11月25日 - 高木 善弘,西 真郎 , 豊田 敦 , 伊藤 武彦 , 荒井 渉 , 坪内 泰志 , 諸野 祐樹 , 稲垣 史生 , 青池 寛 , 高井 研 , 高見 英人
Metabolic potential of deep subsurface biosphere revealed by metagenomic analysis
第26回日本微生物生態学会, 2010年11月25日 - 高木 善弘,吉田 尊雄 , 島村 繁 , 丸山 正 , 桑原 宏和
シロウリガイ類細胞内共生菌のゲノム縮小メカニズムについての考察
第 13 回マリンバイオテクノロジー学会大会, 2010年05月29日 - 高木 善弘,西 真郎 , 豊田 敦 , 伊藤 武彦 , 荒井 渉 , 坪内 泰志 , 諸野 祐樹 , 稲垣 史生 , 青池 寛 , 高井 研 , 高見 英人
メタゲノム解析から見える下北半島沖地下生命圏生態系
第4回日本ゲノム微生物学会年会, 2010年03月08日 - TAKAKI YOSHIHIRO , Nishino Mamiko , Koshi-ishi Takeru , SHIMAMURA SHIGERU , YOSHIDA TAKAO, MARUYAMA TADASHI
Genome evolution in chemolithotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
International symposium of marine genomics, 2009年12月16日 - 布浦 拓郎,風間 宏美 , 角太 淳吾 , 島村 繁 , 高木 善弘 , 高井 研
Isolation, characterization and genomic features of sulfur-oxidizing Gammaproteobateria belongs to a chemoautotrophic endosymbionts lineage
4th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems-Hydrothermal Vents, Seeps and Other Reducing Habitats-, 2009年07月03日 - 高木 善弘,西野 麻美子 , 島村 繁 , 吉田 尊雄 , 桑原 宏和 , 丸山 正
Trend of the genome reduction in chemoautotrophic intracellular symbionts of deep-sea Calyptogena clams
4th International Symposium on Chemosynthesis-Based Ecosystems, 2009年06月30日 - 小林 徹,小出 修 , 森 梢 , 島村 繁 , 三浦 健 , 高木 善弘 , 諸野 裕樹 , 布浦 拓郎 , 井町 寛之 , 稲垣 史生 , 高井 研 , 掘越 弘毅
Phylogenetic diversity of deep subseafloor aerobic microorganisms in organics- and methane-rich sediments off Shimokita Peninsula in Japan
International Congress on Extremophiles 2008, 2008年09月09日 - Masashi Tsuchiya, Akiko Omura, Koichi Iijima, Takuro Nunoura, Yoshihiro Takaki, Shigeru Shimamura, Hideki Masago, Kan Aoike, Hiroyuki Imachi, Fumio Inagaki, Ken Takai, Tatsuhiko Sakamoto, Kaoru Kubokawa, Hiroshi Kitazato
ちきゅうCK05-04 Leg.2およびCK06-06で採取された下北沖堆積物柱状試料の化石DNA解析
地球惑星科学連合大会, 2008年05月27日 - 中川聡、高木善弘、島村繁、高井研
ゲノム解析から見えてきた熱水生態系の一次生産者とヒトに蔓延する病原性微生物の関係
InterRidge Japan研究発表集会, 2007年10月30日 - 中川聡、布浦拓郎、高木善弘、島村繁、大路樹生、高井研
深海底熱水孔環境ミキシングゾーンに優占する化学合成独立栄養細菌
ブルーアース07, 2007年03月08日 - 中川聡、高木善弘、島村繁、高見英人、高井研
深海底熱水孔環境に優占する化学合成独立栄養細菌epsilon-Proteobacteriaのゲノム解析
第1回日本ゲノム微生物学会, 2007年03月02日 - 中川聡、高木善弘、島村繁、高井研
深海底熱水孔環境に優占する化学合成独立栄養細菌epsilon-Proteobacteriaのゲノム解析
第22回日本微生物生態学会, 2006年10月28日 - TAKAMI HIDETO , TAKAKI YOSHIHIRO, Chee Gab-Joo , NISHI SHINRO , SHIMAMURA SHIGERU , Suzuki Hiroko , Matsui Satomi , Uchiyama Ikuo
Thermoadaptation trait revealed by the genome sequence of thermo-philic Geobacillus kaustophilus
ESF Workshop on Environmental Genomics and Environmental Metagenomics, 2004年11月18日 - 高木 善弘,Hideto Takami, Ikuo Uchiyama (Okazaki National Research Institute)?and Koki Horikoshi
Comparative genomic analyses of the transport systems in alkaliphilic Bacillus species.
Extremophiles 2002, 2002年09月22日 - 高木 善弘,高見英人
極限環境に生育するBacillus 属細菌のゲノム比較からの共通性と多様性
日本農芸化学会2002年度大会, 2002年03月25日 - 高木 善弘,佐々木るみゑ、松木明子、高見英人
Bacillus halodurans C-125株に見られたISの種内多様性について
Bacillus halodurans C-125株に見られたISの種内多様性について/日本分子生物学会年会(ポスターセッション), 2001年12月12日 - 高木 善弘,佐々木るみゑ、高見英人、掘越弘毅
Bacillus halodurans C-125株の転移性遺伝因子の種内多様性
日本農芸化学会, 2001年03月24日 - 高木 善弘,高見英人、仲宗根薫、佐々木るみゑ、掘越弘毅
極限(深海)微生物のゲノム解析
テクノ・オーシャン2000国際シンポジウム(ポスターセッション), 2000年11月27日 - 高木 善弘,高見英人、仲宗根薫、佐々木るみゑ、掘越弘毅
Bacillus halodurans ゲノムの全塩基配列からみた好アルカリ性の特徴
第1回極限環境微生物学会年会(ポスターセッション), 2000年09月22日 - 高木 善弘,仲宗根薫 , 平間千恵 , 高見英人 , 井上明 , 辻井薫 , 掘越弘毅
好アルカリ性細菌Bacillus sp.strain C-125のRNAポリメラーゼサブユニット遺伝子の構造解析
第21回日本分子生物学会年会, 1998年12月16日 - 中村 由香,高木善弘 , 仲宗根薫 , 木村由香 , 平間千恵 , 藤富美枝 , 益井宣明 , 井上明 , 高見英人 , 掘越弘毅
枯草菌ゲノム解析結果に基づく好アルカリ性Bacillus sp. C-125株の部分的なゲノム解析
日本農芸化学会'98大会, 1998年03月31日 - 藤 富美枝,高木善弘 , 仲宗根薫 , 木村由香 , 平間千恵 , 益井宣明 , 井上明 , 高見英人 , 掘越弘毅
好アルカリ性細菌Bacillus sp.C-125株のsigA遺伝子のクローニングとその構造解析
日本農芸化学会'98大会, 1998年03月31日 - 高木 善弘,平間千恵 , 藤富美枝 , 仲宗根薫 , 益井宣明 , 木村由香 , 高見英人 , 井上明 , 掘越弘毅
好アルカリ性細菌Bacillus sp.C-125のRNAポリメラーゼβ-サブユニット遺伝子の構造解析
日本農芸化学会'98大会, 1998年03月31日 - 児島 貴史,高木善弘 , 井上明 , 宇佐美論 , 掘越弘毅
深海からのバイオサーファクタント生産菌の分離
国際極限微生物会議'98, 1998年01月18日 - 高木 善弘,井上明 , 小林英城 , 高見英人 , 掘越弘毅
マリアナ海溝より分離したMS300が生産するエキソマルトテトラオハイドレースの性質
第4回 国際海洋会議, 1997年09月26日 - 高木 善弘,益井宣明 , 中村由香 , 平間千恵 , 藤富美枝 , 仲宗根薫 , 高見英人 , 井上明 , 掘越弘毅
好アルカリ性細菌Bacillus sp.C125のRNAポリメラーゼα-サブユニット遺伝子の構造解析
第20回 日本分子生物学会年会, 1997年08月13日 - 高木 善弘
深海からの有機溶媒耐性細菌の分離とその応用
第21回研究発表会, 1996年01月26日 - 高木 善弘,森屋和仁(北海道糖業) , 掘越弘毅
有機溶媒耐性細菌の畜生するバイオサーファクタント
日本農芸化学会 1995年度大会, 1995年08月02日 - 高木 善弘,森屋和仁 , 掘越弘毅
深海現場培養による有機媒体耐性炭化水素分解細菌の分離
マリンバイオテクノロジー研究発表会, 1994年05月28日 - 高木 善弘,森屋和仁 , 掘越弘毅
有機溶媒耐性炭化水素分解細菌の生理的性質
日本農芸化学会 1993年度大会, 1993年03月30日
