研究者情報
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研究分野
経歴（RM）
- 2026年04月 - 現在
海洋研究開発機構(JAMSTEC), 生命地球科学研究部門 海洋バイオリソース展開・応用研究プログラム, 副主任研究員 - 2025年10月 - 2026年03月
海洋研究開発機構(JAMSTEC) 生命理工学センター, 深海バイオリソース研究グループ, 副主任研究員 - 2021年04月 - 2025年09月
海洋研究開発機構(JAMSTEC) 生命理工学センター, 深海バイオリソース研究グループ, 研究員 - 2019年04月 - 2021年03月
海洋研究開発機構(JAMSTEC), 生命理工学センター 深海バイオリソース研究グループ, 特任研究員 - 2018年04月 - 2019年03月
海洋研究開発機構(JAMSTEC), 海洋生命理工学研究開発センター 深海バイオ・オープンイノベーションプラットフォーム, 特任研究員
研究活動情報
論文
- Michiko Takahashi; Satoshi Hiraoka; Yuki Matsumoto; Rikako Shibagaki; Takako Ujihara; Maeda Hiromichi; Satoru Seo; Keizo Nagasaki; Hiroaki Takeuchi; Shigenobu Matsuzaki
Host-encoded DNA methyltransferases modify the epigenome and host tropism of invading phages
iScience, 2025年04月
28, 4, 112264, 112264
［査読有り］
筆頭著者 - Satoshi Hiraoka; Minoru Ijichi; Hirohiko Takeshima; Yohei Kumagai; Ching-Chia Yang; Yoko Makabe-Kobayashi; Hideki Fukuda; Susumu Yoshizawa; Wataru Iwasaki; Kazuhiro Kogure; Takuhei Shiozaki
Probe Capture Enrichment Sequencing of amoA Genes Improves the Detection of Diverse Ammonia-Oxidising Archaeal and Bacterial Populations.
Molecular ecology resources, 2024年11月18日
e14042
［査読有り］
筆頭著者, 責任著者 - Mikako Tachioka; Mikiko Tsudome; Miwako Tsuda; Satoshi Hiraoka; Masayuki Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Shigeru Deguchi
Characteristics of deep-sea microbial cellulases: key determinants of the ultimate fate of plant biomass on Earth
Journal of Wood Science, 2024年11月14日
70, 1
［査読有り］ - Tomomi Sumida; Satoshi Hiraoka; Keiko Usui; Akihiro Ishiwata; Toru Sengoku; Keith A Stubbs; Katsunori Tanaka; Shigeru Deguchi; Shinya Fushinobu; Takuro Nunoura
Genetic and functional diversity of β-N-acetylgalactosamine-targeting glycosidases expanded by deep-sea metagenome analysis.
Nature communications, 2024年05月10日
15, 1, 3543
［査読有り］ - Yi Zhang; Yoshihiro Takaki; Yukari Yoshida-Takashima; Satoshi Hiraoka; Kanako Kurosawa; Takuro Nunoura; Ken Takai
A sequential one-pot approach for rapid and convenient characterization of putative restriction-modification systems.
mSystems, 2023年10月16日
e0081723
［査読有り］ - Satoshi Hiraoka; Tomomi Sumida; Miho Hirai; Atsushi Toyoda; Shinsuke Kawagucci; Taichi Yokokawa; Takuro Nunoura
〔Major achievements〕Diverse DNA modification in marine prokaryotic and viral communities.
Nucleic acids research, 2022年02月22日
50, 3, 1531, 1550
［査読有り］
筆頭著者, 責任著者 - Satoshi Hiraoka; Miho Hirai; Yohei Matsui; Akiko Makabe; Hiroaki Minegishi; Miwako Tsuda; Juliarni; Eugenio Rastelli; Roberto Danovaro; Cinzia Corinaldesi; Tomo Kitahashi; Eiji Tasumi; Manabu Nishizawa; Ken Takai; Hidetaka Nomaki; Takuro Nunoura
〔Major achievements〕Microbial community and geochemical analyses of trans-trench sediments for understanding the roles of hadal environments.
The ISME journal, 2020年03月
14, 3, 740, 756
［査読有り］
筆頭著者, 責任著者 - Mio Takeuchi; Haruka Ozaki; Satoshi Hiraoka; Yoichi Kamagata; Susumu Sakata; Hideyoshi Yoshioka; Wataru Iwasaki
Possible cross-feeding pathway of facultative methylotroph Methyloceanibacter caenitepidi Gela4 on methanotroph Methylocaldum marinum S8
PLOS ONE, 2019年03月14日
14, 3, e0213535
［査読有り］ - Satoshi Hiraoka; Yusuke Okazaki; Mizue Anda; Atsushi Toyoda; Shin-ichi Nakano; Wataru Iwasaki
〔Major achievements〕Metaepigenomic analysis reveals the unexplored diversity of DNA methylation in an environmental prokaryotic community
Nature Communications, 2019年01月11日
10, 159
［査読有り］
筆頭著者, 責任著者 - Tazro Ohta; Takeshi Kawashima; Natsuko O. Shinozaki; Akito Dobashi; Satoshi Hiraoka; Tatsuhiko Hoshino; Keiichi Kanno; Takafumi Kataoka; Shuichi Kawashima; Motomu Matsui; Wataru Nemoto; Suguru Nishijima; Natsuki Suganuma; Haruo Suzuki; Y-h. Taguchi; Yoichi Takenaka; Yosuke Tanigawa; Momoka Tsuneyoshi; Kazutoshi Yoshitake; Yukuto Sato; Riu Yamashita; Kazuharu Arakawa; Wataru Iwasaki
Collaborative environmental DNA sampling from petal surfaces of flowering cherry Cerasus × yedoensis ‘Somei-yoshino’ across the Japanese archipelago
Journal of Plant Research, 2018年02月19日
131, 4, 709, 717
［査読有り］ - Satoshi Hiraoka; Masaya Miyahara; Kazushi Fujii; Asako Machiyama; Wataru Iwasaki
Seasonal Analysis of Microbial Communities in Precipitation in the Greater Tokyo Area, Japan
Frontiers in Microbiology, 2017年08月11日
8, 1506
［査読有り］
筆頭著者, 責任著者 - Satoshi Hiraoka; Asako Machiyama; Minoru Ijichi; Kentaro Inoue; Kenshiro Oshima; Masahira Hattori; Susumu Yoshizawa; Kazuhiro Kogure; Wataru Iwasaki
Genomic and metagenomic analysis of microbes in a soil environment affected by the 2011 Great East Japan Earthquake tsunami.
BMC genomics, 2016年01月14日
17, 1, 53, 53
［査読有り］
筆頭著者, 責任著者 - Satoshi Hiraoka; Ching-chia Yang; Wataru Iwasaki
Metagenomics and Bioinformatics in Microbial Ecology: Current Status and Beyond
Microbes and environments, 2016年
31, 3, 204, 212
筆頭著者, 責任著者
MISC
- 澄田智美; 平岡聡史; 臼井けい子; 石渡明弘; 伏信進矢; 布浦拓郎
深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索~新規酵素群の分子進化と機能の多様性を紐解く~
日本生化学会大会(Web), 2023年
96th
書籍等出版物
- 分担執筆, 講座
原核生物・ウイルスのエピゲノム研究の展開
日本防菌防黴学会誌 Vol.54，No.3, 2026年03月 - 平岡聡史, 分担執筆, 第Ⅰ部第3章メタゲノム/16S rRNA アンプリコンシークエンスデータ
大規模データで困ったときに、まず図を描くことからはじめる生命科学データ解析 : 解析のゴールドスタンダードを学び、生成AIとの対話でPython・Rを使いこなす
羊土社, 2025年07月
9784758122825 - 澄田智美; 平岡聡史, 分担執筆, みにれびゅう
深海微生物のメタゲノム解析が切り拓く未知の酵素の世界～β-GalNAcに作用する新規酵素群の分子進化の歴史をひもとく～
公益社団法人日本生化学会 生化学 Vol.97 No.1, 2025年02月
講演・口頭発表等
- 平岡聡史
微生物のDNA化学修飾の役割理解を目指したエピゲノム解析
第13回生命医薬情報学連合大会(IIBMP2025), 2025年09月03日, ［招待有り］ - 平岡聡史
ゲノムから見る環境微生物
第2回最先端クロストーク, 2025年07月12日 - 平岡聡史; 張翼; 島村繁; 河合繁; 塚本雄也; 西原亜理沙
高温環境微生物叢を対象としたメタエピゲノム解析
第19回日本ゲノム微生物学会, 2025年03月17日 - 澄田智美; 平岡聡史; 臼井けい子; 出口茂; 伏信進矢; 布浦拓郎
深海微生物叢情報から発見した新規糖質分解酵素群の機能的多様性の解明
日本微生物生態学会第37回広島大会, 2024年10月29日 - 酒井早苗; 福山宥斗; 平岡聡史; 田角栄二; 島村繁; 小河原美幸; 宮崎征行; 宮崎淳一; 高井研
硫酸還元アーキア ”Archaeoglobus lithotrophicus ” MCR株の菌学的特徴とCO利用性
日本微生物生態学会第37回広島大会, 2024年10月29日 - 平岡聡史; 河合繁; 島村繁; 張翼; 塚本雄也; 西原亜理沙
高温環境微生物叢の網羅的エピゲノム解析
日本微生物生態学会第37回広島大会, 2024年10月29日 - 平岡聡史
地球微生物学とバイオインフォマティクス
日本地球化学会 第71回年会, 2024年09月18日, ［招待有り］ - 平岡聡史
環境微生物生態の理解を目指したメタゲノム解析研究の展開
公益財団法人大隅基礎科学創成財団務 微生物コンソーシアム, 2024年06月04日, ［招待有り］ - Satoshi Hiraoka
Culture-independent sequencing analysis of microbial community in deep-sea sediment
JpGU2024, 2024年05月28日, ［招待有り］ - 西原 亜理沙; 飯野 隆夫; 河合 繁; 塚本 雄也; 平岡 聡史; 延 優; 大熊 盛也
陸生温泉の微生物ストリーマーにおける希少微生物叢の発見
日本地球惑星科学連合2024年大会, 2024年05月28日, ［招待有り］ - 平岡聡史
未培養系統が優占する環境微生物叢の代謝を理解するためのシーケンス解析
第一回微生物代謝研究会, 2024年05月11日, ［招待有り］ - Satoshi Hiraoka
Culture-independent sequencing analysis of deep-sea microbial community
日本生態学会第71回全国大会, 2024年03月19日, ［招待有り］ - 平岡聡史
環境微生物の理解に向けたバイオインフォマティクス研究
日本微生物生態学会第36回浜松大会, 2023年11月30日, ［招待有り］ - 高橋迪子; 平岡聡史; 柴垣里佳子; 前田広道; 瀬尾智; 松崎茂展
ピロリ菌保有DNAメチルトランスフェラーゼがバクテリオファージKHP30の感染能に及ぼす影響
日本微生物生態学会第36回浜松大会, 2023年11月29日 - 澄田智美; 平岡聡史; 臼井けい子; 伏信進矢; 布浦拓郎
深海微生物叢情報を利用したβ-GalNAc含有糖鎖に作用する新規糖質分解酵素群の発見
日本微生物生態学会第36回浜松大会 - 澄田 智美、平岡 聡史、臼井 けい子、伏信 進矢、布浦 拓郎
深海微生物叢情報を利用したβ-GalNAc含有糖鎖に作用する新規糖質分解酵素群の発見
日本微生物生態学会第36回浜松大会, 2023年11月28日 - Kanae Kobayashi; Akiko Makabe; Masahito Shigemitsu; Satoshi Hiraoka; Miwako Tsuda; Masayuki Miyazaki; Tomomi Sumida; Hidetaka Nomaki; Takuro Nunoura; Shinsuke Kawagucci
Combined molecular and stable isotopic analyses reveal the microbial nitrogen cycle in the deep-sea sediments
JSME36, 2023年11月28日 - 澄田 智美、平岡 聡史、臼井 けい子、石渡 明弘、伏信 進矢、布浦 拓郎
深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索〜新規酵素群の分子進化と機能の多様性を紐解く〜
第96回日本生化学会大会, 2023年11月01日 - 澄田 智美、平岡 聡史、臼井 けい子、石渡 明弘、伏信 進矢、布浦 拓郎
深海微生物叢情報を利用した新規糖質分解酵素の探索〜新規酵素群の分子進化と機能の多様性を紐解く〜
第96回日本生化学会大会, 2023年10月31日 - 澄田 智美、平岡 聡史、臼井 けい子、石渡 明弘、伏信 進矢、布浦 拓郎
深海メタゲノム情報を利用した新規糖質分解酵素群の発見及び構造機能相関の解明
日本応用糖質科学会2023年度(第72回)大会, 2023年09月13日 - 澄田 智美、平岡 聡史、臼井 けい子、石渡 明弘、伏信 進矢、布浦 拓郎
深海メタゲノム情報を利用した新規糖質分解酵素群の発見及び構造機能相関の解明
日本応用糖質科学会2023年度(第72回)大会, 2023年09月13日 - 平岡聡史
高温環境微生物叢が持つエピゲノム機構の探究
ACT-X「環境とバイオテクノロジー」 第5回領域会議, 2023年08月07日 - 平岡聡史
海洋微生物叢を理解するためのゲノムシーケンス解析研究
第17回日本ゲノム微生物学会年会, 2023年03月08日, ［招待有り］ - 平岡聡史
高温環境微生物叢が持つエピゲノム機構の探究
ACT-X「環境とバイオテクノロジー」 第4回領域会議, 2023年01月21日 - Satoshi Hiraoka, Miho Hirai, Masayuki Miyazaki, Hidetaka Nomaki and Takuro Nunoura
深海堆積物微生物叢の大規模メタゲノム解析と遺伝子・ゲノムデータベース構築
第11回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP2022), 2022年09月13日 - 平岡聡史
Metaepigenomics reveals diverse DNA modifications in lake and marine prokaryotic and viral communities
18th International Symposium on Microbial Ecology (ISME18), 2022年08月14日 - 平岡 聡史
原核微生物が持つエピジェネティクスの理解に向けた海洋細菌群集のDNAメチル化修飾の系統網羅的解析
公益財団法人発酵研究所 第16回助成研究報告会, 2022年06月03日 - 平岡聡史、澄田智美、平井美穂、豊田敦、川口慎介、横川太一、布浦拓郎
海洋細菌叢・ウイルス叢が持つエピゲノムの多様性
日本微生物生態学会第34回大会, 2021年10月31日 - 平岡聡史
Diverse DNA modification in marine prokaryotic and viral communities
2021 PacBio Japan Virtual User Group Meeting, 2021年05月12日, ［招待有り］ - satoshi hiraoka
'Metaepigenomic' analysis for identification of unexplored prokaryotic DNA methylation in nature.
第94回日本細菌学会総会, 2021年03月23日, ［招待有り］ - 平岡聡史
バイオインフォマティクスによる環境微生物生態へのアプローチ
第15回日本ゲノム微生物学会年会, 2021年03月05日, ［招待有り］ - 平岡聡史 平井 美穂、西澤 学、松井 洋平、高井 研、野牧 秀隆、布浦 拓郎
北西太平洋海域から採取した深海・超深海堆積物の大規模菌叢構造解析
第13回日本ゲノム微生物学会年会, 2019年03月06日 - 平岡聡史
メタエピゲノム解析から明らかにする環境細菌叢のエピジェネティクスの多様性と新規DNAメチル化酵素
日本生物工学会バイオインフォマティクス相談部会第二回講演会, 2018年12月05日, ［招待有り］ - satoshi hiraoka
Exploring microbial ecology using a metagenomics approach
Rinkai Hackathon 2018 Symposium, 2018年06月10日, ［招待有り］
メディア報道
- 深海の微生物をDNAから調べる
毎日新聞, 毎日小学生新聞, 指令!海を探究せよ, 2024年11月12日, 新聞・雑誌 - 海洋微生物叢を対象としたメタエピゲノム解析に関する記事掲載
科学新聞社, 科学新聞, 4面, 2022年02月18日, 新聞・雑誌 - 発展する環境DNA(eDNA)領域
日経BP, 日経バイオテク, 2019年05月13日, 新聞・雑誌
