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研究活動情報
論文
- Yoko Chiba; Tomomi Sumida; Masafumi Kameya; Yuto Fukuyama; Tomoyuki Wakashima; Shigeru Shimamura; Ryoma Kamikawa; Yoshito Chikaraishi; Takuro Nunoura
Impact of acetate on CO2fixation pathways in thermophilic and hydrogenotrophic bacteria
2025年04月01日 - Mitsuhiro Yoshida; Sofia Medvedeva; Akihito Fukudome; Yuri I. Wolf; Syun-ichi Urayama; Yosuke Nishimura; Yoshihiro Takaki; Eugene V. Koonin; Mart Krupovic; Takuro Nunoura
“Paraxenoviridae”, a putative family of ubiquitous marine bacteriophages with double-stranded RNA genomes
2025年02月27日 - Yu Su; Yuta Michimori; Yuto Fukuyama; Shigeru Shimamura; Takuro Nunoura; Haruyuki Atomi
〔Major achievements〕TK2268 encodes the major aminotransferase involved in the conversion from oxaloacetic acid to aspartic acid in Thermococcus kodakarensis.
Applied and environmental microbiology, 2025年02月24日
e0201724 - Lei Gao; Lan Liu; Ai-Ping Lv; Lin Fu; Zheng-Han Lian; Takuro Nunoura; Brian P. Hedlund; Qing-Yu Xu; Dildar Wu; Jian Yang; Mukhtiar Ali; Meng-Meng Li; Yong-Hong Liu; Andre Antunes; Hong-Chen Jiang; Lei Cheng; Jian-Yu Jiao; Wen-Jun Li; Bao-Zhu Fang
Reversed oxidative TCA (roTCA) for carbon fixation by an Acidimicrobiia strain from a saline lake
ISME JOURNAL, 2024年10月16日
18, 1 - Matthew D. Johnson; Hiroyuki D. Sakai; Bindusmita Paul; Takuro Nunoura; Somavally Dalvi; Manasi Mudaliyar; Doulin C. Shepherd; Michiru Shimizu; Shubha Udupa; Moriya Ohkuma; Norio Kurosawa; Debnath Ghosal
Large attachment organelle mediates interaction between Nanobdellota archaeon YN1 and its host
ISME JOURNAL, 2024年09月06日
18, 1 - Yi Zhang; Takuro Nunoura; Daisuke Nishiura; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Kanako Kurosawa; Chieko Ishiwata; Shigeru Deguchi
Correction: A single-molecule counting approach for convenient and ultrasensitive measurement of restriction digest efficiencies
PLOS ONE, 2024年08月05日
19, 8, e0308550, e0308550 - Yuta Michimori; Rikihisa Izaki; Yu Su; Yuto Fukuyama; Shigeru Shimamura; Karin Nishimura; Yuya Miwa; Sotaro Hamakita; Takahiro Shimosaka; Yuki Makino; Ryo Takeno; Takaaki Sato; Haruki Beppu; Isaac Cann; Tamotsu Kanai; Takuro Nunoura; Haruyuki Atomi
〔Major achievements〕Removal of phosphoglycolate in hyperthermophilic archaea
Proceedings of the National Academy of Sciences, 2024年04月09日
121, 16 - Syun Ichi Urayama; Akihito Fukudome; Miho Hirai; Tomoyo Okumura; Yosuke Nishimura; Yoshihiro Takaki; Norio Kurosawa; Eugene V. Koonin; Mart Krupovic; Takuro Nunoura
〔Major achievements〕Double-stranded RNA sequencing reveals distinct riboviruses associated with thermoacidophilic bacteria from hot springs in Japan
Nature Microbiology, 2024年02月
9, 2, 514, 523 - Stefano Varrella; Giulio Barone; Cinzia Corinaldesi; Alessio Giorgetti; Hidetaka Nomaki; Takuro Nunoura; Eugenio Rastelli; Michael Tangherlini; Roberto Danovaro; Antonio Dell’Anno
Fungal Abundance and Diversity in the Mariana Trench, the Deepest Ecosystem on Earth
Journal of Fungi, 2024年01月16日
10, 1, 73, 73 - Yuto Fukuyama; Shigeru Shimamura; Sanae Sakai; Yuta Michimori; Tomomi Sumida; Yoshito Chikaraishi; Haruyuki Atomi; Takuro Nunoura
〔Major achievements〕Development of a rapid and highly accurate method for 13C tracer-based metabolomics and its application on a hydrogenotrophic methanogen.
ISME communications, 2024年01月
4, 1, ycad006 - Takuhei Shiozaki; Miho Hirai; Fumie Kondo; Takuya Sato; Miyako Sato; José L. Iriarte; Taichi Yokokawa; Takuro Nunoura; Naomi Harada
Heterogeneous Diazotroph Communities in the Subtropical‐Subantarctic Transition and Aphotic Zones Off the Coast of Patagonia, Eastern South Pacific Ocean
Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 2023年12月22日
128, 12 - Yi Zhang; Yoshihiro Takaki; Yukari Yoshida-Takashima; Satoshi Hiraoka; Kanako Kurosawa; Takuro Nunoura; Ken Takai
A sequential one-pot approach for rapid and convenient characterization of putative restriction-modification systems.
mSystems, 2023年10月16日
e0081723 - Tomomi Sumida; Satoshi Hiraoka; Keiko Usui; Akihiro Ishiwata; Toru Sengoku; Keith A Stubbs; Katsunori Tanaka; Shigeru Deguchi; Shinya Fushinobu; Takuro Nunoura
〔Major achievements〕Genetic and functional diversity of β-N-acetylgalactosamine residue-targeting glycosidases expanded by deep-sea metagenome
Nature Communications, 2023年07月28日 - Syun-ichi Urayama; Akihito Fukudome; Miho Hirai; Tomoyo Okumura; Yosuke Nishimura; Yoshihiro Takaki; Norio Kurosawa; Eugene V. Koonin; Mart Krupovic; Takuro Nunoura
Distinct groups of RNA viruses associated with thermoacidophilic bacteria
bioRxiv, 2023年07月03日 - Kazuki Tachibana; Motohiro Shimanaga; Dewi Langlet; Koji Seike; Masayuki Miyazaki; Mitsuhiro Yoshida; Takuro Nunoura; Hidetaka Nomaki
Meiofauna in the southeastern Bering Sea: community composition and structuring environmental factors
Frontiers in Marine Science, 2023年04月27日
10 - Shinsuke Kawagucci; Sanae Sakai; Eiji Tasumi; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Masafumi Saitoh; Yuichiro Ueno; Naohiro Yoshida; Takazo Shibuya; James Clifford Sample; Tomoyo Okumura; Ken Takai
Deep Subseafloor Biogeochemical Processes and Microbial Populations Potentially Associated with the 2011 Tohoku-oki Earthquake at the Japan Trench Accretionary Wedge (IODP Expedition 343)
Microbes and Environments, 2023年
38, 2, n/a, n/a - Yuto Chiba; Akinori Yabuki; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Syun-Ichi Urayama; Daisuke Hagiwara
The First Identification of a Narnavirus in Bigyra, a Marine Protist.
Microbes and environments, 2023年
38, 1 - Yukari Yoshida-Takashima; Yoshihiro Takaki; Mitsuhiro Yoshida; Yi Zhang; Takuro Nunoura; Ken Takai
〔Major achievements〕Genomic insights into phage-host interaction in the deep-sea chemolithoautotrophic Campylobacterota, Nitratiruptor
ISME Communications, 2022年11月01日
2, 1 - Ángela Ares; Sanae Sakai; Toshio Sasaki; Shigeru Shimamura; Satoshi Mitarai; Takuro Nunoura
Sequestration and efflux largely account for cadmium and copper resistance in the deep-sea Nitratiruptor sp. SB155-2 (phylum Campylobacterota).
Environmental microbiology, 2022年10月25日 - Chisato Yoshikawa; Nanako O. Ogawa; Yoshito Chikaraishi; Akiko Makabe; Yohei Matsui; Yoshikazu Sasai; Masahide Wakita; Makio C. Honda; Yoshihisa Mino; Maki N. Aita; Tetsuichi Fujiki; Takuro Nunoura; Naomi Harada; Naohiko Ohkouchi
〔Major achievements〕Nitrogen Isotopes of Sinking Particles Reveal the Seasonal Transition of the Nitrogen Source for Phytoplankton
Geophysical Research Letters, 2022年09月16日
49, 17 - Sofia Medvedeva; Jiarui Sun; Natalya Yutin; Eugene V. Koonin; Takuro Nunoura; Christian Rinke; Mart Krupovic
Three families of Asgard archaeal viruses identified in metagenome-assembled genomes
Nature Microbiology, 2022年07月
7, 7, 962, 973 - Satoshi Hiraoka; Tomomi Sumida; Miho Hirai; Atsushi Toyoda; Shinsuke Kawagucci; Taichi Yokokawa; Takuro Nunoura
〔Major achievements〕Diverse DNA modification in marine prokaryotic and viral communities.
Nucleic acids research, 2022年02月22日
50, 3, 1531, 1550 - Syun-Suke Kadoya; Syun-Ichi Urayama; Takuro Nunoura; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Masaaki Kitajima; Toyoko Nakagomi; Osamu Nakagomi; Satoshi Okabe; Osamu Nishimura; Daisuke Sano
The Intrapopulation Genetic Diversity of RNA Virus May Influence the Sensitivity of Chlorine Disinfection.
Frontiers in microbiology, 2022年
13, 839513, 839513 - Mamoru Oshiki; Yoshihiro Takaki; Miho Hirai; Takuro Nunoura; Atsushi Kamigaito; Satoshi Okabe
Metagenomic Analysis of Five Phylogenetically Distant Anammox Bacterial Enrichment Cultures.
Microbes and environments, 2022年
37, 3 - Syun-Ichi Urayama; Yoshihiro Takaki; Yuto Chiba; Yanjie Zhao; Misa Kuroki; Daisuke Hagiwara; Takuro Nunoura
Eukaryotic Microbial RNA Viruses-Acute or Persistent? Insights into Their Function in the Aquatic Ecosystem.
Microbes and environments, 2022年
37, 5 - Shoichi Sakaguchi; Syun-Ichi Urayama; Yoshihiro Takaki; Kensuke Hirosuna; Hong Wu; Youichi Suzuki; Takuro Nunoura; Takashi Nakano; So Nakagawa
NeoRdRp: A Comprehensive Dataset for Identifying RNA-dependent RNA Polymerases of Various RNA Viruses from Metatranscriptomic Data.
Microbes and environments, 2022年
37, 3 - Junya Hirai; Syun-ichi Urayama; Yoshiro Takaki; Miho Hirai; Keizo Nagasaki; Takuro Nunoura
RNA Virosphere in a Marine Zooplankton Community in the Subtropical Western North Pacific
Microbes and Environments, 2022年
37, 5, n/a, n/a - Hidetaka Nomaki; Eugenio Rastelli; Nanako O. Ogawa; Yohei Matsui; Masashi Tsuchiya; Elisabetta Manea; Cinzia Corinaldesi; Miho Hirai; Naohiko Ohkouchi; Roberto Danovaro; Takuro Nunoura; Teresa Amaro
In situ experimental evidences for responses of abyssal benthic biota to shifts in phytodetritus compositions linked to global climate change
Global Change Biology, 2021年12月
27, 23, 6139, 6155 - Masanori Kaneko; Yoshinori Takano; Masashi Kamo; Kazuya Morimoto; Takuro Nunoura; Naohiko Ohkouchi
Insights into the Methanogenic Population and Potential in Subsurface Marine Sediments Based on Coenzyme F430 as a Function-Specific Biomarker
JACS Au, 2021年09月13日 - Hidetaka Nomaki; Eugenio Rastelli; Andreia Alves; Hisami Suga; Sandra Ramos; Tomo Kitahashi; Masashi Tsuchiya; Nanako O. Ogawa; Yohei Matsui; Koji Seike; Norio Miyamoto; Cinzia Corinaldesi; Elisabetta Manea; Naohiko Ohkouchi; Roberto Danovaro; Takuro Nunoura; Teresa Amaro
Abyssal fauna, benthic microbes, and organic matter quality across a range of trophic conditions in the western Pacific ocean
Progress in Oceanography, 2021年07月
195, 102591, 102591 - Shinsuke Kawagucci; Yohei Matsui; Akiko Makabe; Tatsuhiro Fukuba; Yuji Onishi; Takuro Nunoura; Taichi Yokokawa
Hydrogen and carbon isotope fractionation factors of aerobic methane oxidation in deep-sea water
2021年06月23日 - Melina Kerou; Rafael I Ponce-Toledo; Rui Zhao; Sophie S Abby; Miho Hirai; Hidetaka Nomaki; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Steffen L Jørgensen; Christa Schleper
Genomes of Thaumarchaeota from deep sea sediments reveal specific adaptations of three independently evolved lineages.
The ISME journal, 2021年04月01日
15, 9, 2792, 2808 - Tamaki Uehara-Ichiki; Syun-Ichi Urayama; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Masashi Fujinaga; Kaoru Hanada
Complete genome sequence of Sikte (Sitke) waterborne virus, a member of the genus Tombusvirus.
Archives of virology, 2021年03月
166, 3, 991, 994 - Alison E Murray; John Freudenstein; Simonetta Gribaldo; Roland Hatzenpichler; Philip Hugenholtz; Peter Kämpfer; Konstantinos T Konstantinidis; Christopher E Lane; R Thane Papke; Donovan H Parks; Ramon Rossello-Mora; Matthew B Stott; Iain C Sutcliffe; J Cameron Thrash; Stephanus N Venter; William B Whitman; Silvia G Acinas; Rudolf I Amann; Karthik Anantharaman; Jean Armengaud; Brett J Baker; Roman A Barco; Helge B Bode; Eric S Boyd; Carrie L Brady; Paul Carini; Patrick S G Chain; Daniel R Colman; Kristen M DeAngelis; Maria Asuncion de Los Rios; Paulina Estrada-de Los Santos; Christopher A Dunlap; Jonathan A Eisen; David Emerson; Thijs J G Ettema; Damien Eveillard; Peter R Girguis; Ute Hentschel; James T Hollibaugh; Laura A Hug; William P Inskeep; Elena P Ivanova; Hans-Peter Klenk; Wen-Jun Li; Karen G Lloyd; Frank E Löffler; Thulani P Makhalanyane; Duane P Moser; Takuro Nunoura; Marike Palmer; Victor Parro; Carlos Pedrós-Alió; Alexander J Probst; Theo H M Smits; Andrew D Steen; Emma T Steenkamp; Anja Spang; Frank J Stewart; James M Tiedje; Peter Vandamme; Michael Wagner; Feng-Ping Wang; Pablo Yarza; Brian P Hedlund; Anna-Louise Reysenbach
Author Correction: Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria.
Nature microbiology, 2021年01月
6, 1, 136, 136 - Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Fumie Kondo; Masayuki Horie; Syun-Ichi Urayama; Takuro Nunoura
RNA Viral Metagenome Analysis of Subnanogram dsRNA Using Fragmented and Primer Ligated dsRNA Sequencing (FLDS).
Microbes and environments, 2021年
36, 2 - Alison E Murray; John Freudenstein; Simonetta Gribaldo; Roland Hatzenpichler; Philip Hugenholtz; Peter Kämpfer; Konstantinos T Konstantinidis; Christopher E Lane; R Thane Papke; Donovan H Parks; Ramon Rossello-Mora; Matthew B Stott; Iain C Sutcliffe; J Cameron Thrash; Stephanus N Venter; William B Whitman; Silvia G Acinas; Rudolf I Amann; Karthik Anantharaman; Jean Armengaud; Brett J Baker; Roman A Barco; Helge B Bode; Eric S Boyd; Carrie L Brady; Paul Carini; Patrick S G Chain; Daniel R Colman; Kristen M DeAngelis; Maria Asuncion de Los Rios; Paulina Estrada-de Los Santos; Christopher A Dunlap; Jonathan A Eisen; David Emerson; Thijs J G Ettema; Damien Eveillard; Peter R Girguis; Ute Hentschel; James T Hollibaugh; Laura A Hug; William P Inskeep; Elena P Ivanova; Hans-Peter Klenk; Wen-Jun Li; Karen G Lloyd; Frank E Löffler; Thulani P Makhalanyane; Duane P Moser; Takuro Nunoura; Marike Palmer; Victor Parro; Carlos Pedrós-Alió; Alexander J Probst; Theo H M Smits; Andrew D Steen; Emma T Steenkamp; Anja Spang; Frank J Stewart; James M Tiedje; Peter Vandamme; Michael Wagner; Feng-Ping Wang; Pablo Yarza; Brian P Hedlund; Anna-Louise Reysenbach
Roadmap for naming uncultivated Archaea and Bacteria.
Nature microbiology, 2020年08月
5, 8, 987, 994 - Syun-Suke Kadoya; Syun-Ichi Urayama; Takuro Nunoura; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Masaaki Kitajima; Toyoko Nakagomi; Osamu Nakagomi; Satoshi Okabe; Osamu Nishimura; Daisuke Sano
Bottleneck Size-Dependent Changes in the Genetic Diversity and Specific Growth Rate of a Rotavirus A Strain.
Journal of virology, 2020年05月04日
94, 10
［査読有り］ - Yong Wang; Jiao Mei Huang; Guo Jie Cui; Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Wen Li Li; Jun Li; Zhao Ming Gao; Ken Takai; Ai Qun Zhang; Ramunas Stepanauskas
Genomics insights into ecotype formation of ammonia-oxidizing archaea in the deep ocean
Environmental Microbiology, 2020年03月
21, 2, 716, 729
［査読有り］ - Satoshi Hiraoka; Miho Hirai; Yohei Matsui; Akiko Makabe; Hiroaki Minegishi; Miwako Tsuda; Juliarni; Eugenio Rastelli; Roberto Danovaro; Cinzia Corinaldesi; Tomo Kitahashi; Eiji Tasumi; Manabu Nishizawa; Ken Takai; Hidetaka Nomaki; Takuro Nunoura
Microbial community and geochemical analyses of trans-trench sediments for understanding the roles of hadal environments.
The ISME journal, 2020年03月
14, 3, 740, 756
［査読有り］ - Fukasawa, F.; Hirai, M.; Takaki, Y.; Shimane, Y.; Thomas, C.E.; Urayama, S.-I.; Nunoura, T.; Koyama, S.
A new polycipivirus identified in Colobopsis shohki
Archives of Virology, 2020年
165, 3, 761, 763 - Saw, J.H.W.; Nunoura, T.; Hirai, M.; Takaki, Y.; Parsons, R.; Michelsen, M.; Longnecker, K.; Kujawinski, E.B.; Stepanauskas, R.; Landry, Z.; Carlson, C.A.; Giovannoni, S.J.
Pangenomics analysis reveals diversification of enzyme families and niche specialization in globally abundant SAR202 bacteria
mBio, 2020年
11, 1 - Syun-Ichi Urayama; Yoshihiro Takaki; Daisuke Hagiwara; Takuro Nunoura
dsRNA-seq Reveals Novel RNA Virus and Virus-Like Putative Complete Genome Sequences from Hymeniacidon sp. Sponge.
Microbes and environments, 2020年
35, 2 - Michael L Chen; Eric D Becraft; Maria Pachiadaki; Julia M Brown; Jessica K Jarett; Josep M Gasol; Nikolai V Ravin; Duane P Moser; Takuro Nunoura; Gerhard J Herndl; Tanja Woyke; Ramunas Stepanauskas
Hiding in Plain Sight: The Globally Distributed Bacterial Candidate Phylum PAUC34f.
Frontiers in microbiology, 2020年
11, 376, 376 - Yuto Chiba; Yuji Tomaru; Hiromori Shimabukuro; Kei Kimura; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Daisuke Hagiwara; Takuro Nunoura; Syun-Ichi Urayama
Viral RNA Genomes Identified from Marine Macroalgae and a Diatom.
Microbes and environments, 2020年
35, 3 - Syun-Ichi Urayama; Nobutaka Doi; Fumie Kondo; Yuto Chiba; Yoshihiro Takaki; Miho Hirai; Yasutaka Minegishi; Daisuke Hagiwara; Takuro Nunoura
Diverged and Active Partitiviruses in Lichen.
Frontiers in microbiology, 2020年
11, 561344, 561344 - Yi Zhang; Takuro Nunoura; Daisuke Nishiura; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Kanako Kurosawa; Chieko Ishiwata; Shigeru Deguchi
A single-molecule counting approach for convenient and ultrasensitive measurement of restriction digest efficiencies.
PloS one, 2020年
15, 12, e0244464 - Eugenio Rastelli; Cinzia Corinaldesi; Antonio Dell’Anno; Michael Tangherlini; Marco Lo Martire; Manabu Nishizawa; Hidetaka Nomaki; Takuro Nunoura; Roberto Danovaro
Drivers of Bacterial α- and β-Diversity Patterns and Functioning in Subsurface Hadal Sediments
Frontiers in Microbiology, 2019年11月14日
10
［査読有り］ - Manea, E.; Dell?anno, A.; Rastelli, E.; Tangherlini, M.; Nunoura, T.; Nomaki, H.; Danovaro, R.; Corinaldesi, C.
Viral infections boost prokaryotic biomass production and organic C cycling in hadal trench sediments
Frontiers in Microbiology, 2019年08月23日
10, AUG, 1952
［査読有り］ - De Corte, D.; Mart{\'i}nez, J.M.; Cretoiu, M.S.; Takaki, Y.; Nunoura, T.; Sintes, E.; Herndl, G.J.; Yokokawa, T.
Viral communities in the global deep ocean conveyor belt assessed by targeted viromics
Frontiers in Microbiology, 2019年08月21日
10, AUG
［査読有り］ - Rastelli E; Corinaldesi C; Dell’Anno A; Tangherlini M; Lo Martire M; Nishizawa M; Nomaki H; Nunoura T; Danovaro R
Drivers of bacterial α- and β-diversity and functioning in subsurface hadal sediments
Frontiers in Microbiology, 2019年
14, 2609
［査読有り］ - Takuro NUNOURA; Yoshito CHIKARAISHI; Haruyuki ATOMI
好熱性水素酸化細菌における始原的で可逆的なTCA回路
KAGAKU TO SEIBUTSU, 2018年12月20日
57, 1, 7, 9 - Syun-Ichi Urayama; Yoshihiro Takaki; Shinro Nishi; Yukari Yoshida-Takashima; Shigeru Deguchi; Ken Takai; Takuro Nunoura
Unveiling the RNA virosphere associated with marine microorganisms.
Molecular ecology resources, 2018年11月
18, 6, 1444, 1455
［査読有り］ - Satomura T; Hayashi J; Sakamoto H; Nunoura T; Takaki Y; Takai K; Takami H; Ohshima T; Sakuraba H; Suye SI
d-Lactate electrochemical biosensor prepared by immobilization of thermostable dye-linked d-lactate dehydrogenase from Candidatus Caldiarchaeum subterraneum.
Journal of bioscience and bioengineering, 2018年10月
126, 4, 425, 430
［査読有り］ - Kawagucci Shinsuke; Makabe Akiko; Kodama Taketoshi; Matsui Yohei; Yoshikawa Chisato; Ono Etsuro; Wakita Masahide; Nunoura Takuro; Uchida Hiroshi; Yokokawa Taichi
Hadal water biogeochemistry over the Izu-Ogasawara Trench observed with a full-depth CTD-CMS
OCEAN SCIENCE, 2018年07月13日
14, 4, 575, 588
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Manabu Nishizawa; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Phurt Harnvoravongchai; Osamu Koide; Yuki Morono; Toshiaki Fukui; Fumio Inagaki; Junichi Miyazaki; Yoshihiro Takaki; Ken Takai
Microbial Diversity in Sediments from the Bottom of the Challenger Deep, the Mariana Trench.
Microbes and environments, 2018年07月04日
33, 2, 186, 194
［査読有り］ - Yoshikawa Chisato; Makabe Akiko; Matsui Yohei; Nunoura Takuro; Ohkouchi Naohiko
Nitrate Isotope Distribution in the Subarctic and Subtropical North Pacific
GEOCHEMISTRY GEOPHYSICS GEOSYSTEMS, 2018年07月
19, 7, 2212, 2224
［査読有り］ - Hiroko Makita; Shinro Nishi; Yoshihiro Takaki; Emiko Tanaka; Takuro Nunoura; Satoshi Mitsunobu; Ken Takai
Draft Genome Sequence of Mariprofundus micogutta Strain ET2.
Genome announcements, 2018年05月17日
6, 20
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Yoshito Chikaraishi; Rikihisa Izaki; Takashi Suwa; Takaaki Sato; Takeshi Harada; Koji Mori; Yumiko Kato; Masayuki Miyazaki; Shigeru Shimamura; Katsunori Yanagawa; Aya Shuto; Naohiko Ohkouchi; Nobuyuki Fujita; Yoshihiro Takaki; Haruyuki Atomi; Ken Takai
A primordial and reversible TCA cycle in a facultatively chemolithoautotrophic thermophile.
Science (New York, N.Y.), 2018年02月02日
359, 6375, 559, 563
［査読有り］ - Daniele De Corte; Abhishek Srivastava; Marja Koski; Juan Antonio L. Garcia; Yoshihiro Takaki; Taichi Yokokawa; Takuro Nunoura; Nathalie H. Elisabeth; Eva Sintes; Gerhard J. Herndl
Metagenomic insights into zooplankton-associated bacterial communities
Environmental Microbiology, 2018年02月01日
20, 2, 492, 505
［査読有り］ - Shingo Kato; Takazo Shibuya; Yoshihiro Takaki; Miho Hirai; Takuro Nunoura; Katsuhiko Suzuki
Genome-enabled metabolic reconstruction of dominant chemosynthetic colonizers in deep-sea massive sulfide deposits
Environmental Microbiology, 2018年02月01日
20, 2, 862, 877
［査読有り］ - Mitsuhiro Yoshida; Tomohiro Mochizuki; Syun-Ichi Urayama; Yukari Yoshida-Takashima; Shinro Nishi; Miho Hirai; Hidetaka Nomaki; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Ken Takai
Quantitative Viral Community DNA Analysis Reveals the Dominance of Single-Stranded DNA Viruses in Offshore Upper Bathyal Sediment from Tohoku, Japan.
Frontiers in microbiology, 2018年
9, 75, 75
［査読有り］ - Urayama, S.-I.; Takaki, Y.; Nunoura, T.; Miyamoto, N.
Complete genome sequence of a novel RNA virus identified from a deep-sea animal, Osedax japonicus
Microbes and Environments, 2018年
33, 4 - Miho Hirai; Shinro Nishi; Miwako Tsuda; Michinari Sunamura; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura
Library Construction from Subnanogram DNA for Pelagic Sea Water and Deep-Sea Sediments
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2017年12月
32, 4, 336, 343
［査読有り］ - Maria G. Pachiadaki; Eva Sintes; Kristin Bergauer; Julia M. Brown; Nicholas R. Record; Brandon K. Swan; Mary Elizabeth Mathyer; Steven J. Hallam; Purificacion Lopez-Garcia; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Tanja Woyke; Gerhard J. Herndl; Ramunas Stepanauskas
Major role of nitrite-oxidizing bacteria in dark ocean carbon fixation
SCIENCE, 2017年11月
358, 6366, 1046, 1050
［査読有り］ - Ryousuke Nagata; Yoshihiro Takaki; Akihiro Tame; Takuro Nunoura; Hisashi Muto; Sayaka Mino; Shigeki Sawayama; Ken Takai; Satoshi Nakagawa
Lebetimonas natsushimae sp nov., a novel strictly anaerobic, moderately thermophilic chemoautotroph isolated from a deep-sea hydrothermal vent polychaete nest in the Mid-Okinawa Trough
SYSTEMATIC AND APPLIED MICROBIOLOGY, 2017年09月
40, 6, 352, 356
［査読有り］ - Sayaka Mino; Satoshi Nakagawa; Hiroko Makita; Tomohiro Toki; Junichi Miyazaki; Stefan M. Sievert; Martin F. Polz; Fumio Inagaki; Anne Godfroy; Shingo Kato; Hiromi Watanabe; Takuro Nunoura; Koichi Nakamura; Hiroyuki Imachi; Tomo-o Watsuji; Shigeaki Kojima; Ken Takai; Tomoo Sawabe
Endemicity of the cosmopolitan mesophilic chemolithoautotroph Sulfurimonas at deep-sea hydrothermal vents
ISME JOURNAL, 2017年04月
11, 4, 909, 919
［査読有り］ - Hiroko Makita; Emiko Tanaka; Satoshi Mitsunobu; Masayuki Miyazaki; Takuro Nunoura; Katsuyuki Uematsu; Yoshihiro Takaki; Shinro Nishi; Shigeru Shimamura; Ken Takai
Mariprofundus micogutta sp nov., a novel iron-oxidizing zetaproteobacterium isolated from a deep-sea hydrothermal field at the Bayonnaise knoll of the Izu-Ogasawara arc, and a description of Mariprofundales ord. nov and Zetaproteobacteria classis nov.
ARCHIVES OF MICROBIOLOGY, 2017年03月
199, 2, 335, 346
［査読有り］ - Bin Zhu; Longfei Wang; Hitoshi Mitsunobu; Xueling Lu; Alfredo J. Hernandez; Yukari Yoshida-Takashima; Takuro Nunoura; Stanley Tabor; Charles C. Richardson
Deep-sea vent phage DNA polymerase specifically initiates DNA synthesis in the absence of primers
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2017年03月
114, 12, E2310, E2318
［査読有り］ - Katsunori Yanagawa; Akira Ijiri; Anja Breuker; Sanae Sakai; Youko Miyoshi; Shinsuke Kawagucci; Takuroh Noguchi; Miho Hirai; Axel Schippers; Jun-ichiro Ishibashi; Yoshihiro Takaki; Michinari Sunamura; Tetsuro Urabe; Takuro Nunoura; Ken Takai
Defining boundaries for the distribution of microbial communities beneath the sediment-buried, hydrothermally active seafloor
ISME JOURNAL, 2017年02月
11, 2, 529, 542
［査読有り］ - Katarzyna Zaremba-Niedzwiedzka; Eva F. Caceres; Jimmy H. Saw; Disa Backstrom; Lina Juzokaite; Emmelien Vancaester; Kiley W. Seitz; Karthik Anantharaman; Piotr Starnawski; Kasper U. Kjeldsen; Matthew B. Stott; Takuro Nunoura; Jillian F. Banfield; Andreas Schramm; Brett J. Baker; Anja Spang; Thijs J. G. Ettema
Asgard archaea illuminate the origin of eukaryotic cellular complexity
NATURE, 2017年01月
541, 7637, 353, +
［査読有り］ - Hiroaki Minegishi; Ryuta Shimogaki; Shigeaki Enomoto; Akinobu Echigo; Yusuke Kondo; Shuhei Nagaoka; Yasuhiro Shimane; Masahiro Kamekura; Takashi Itoh; Moriya Ohkuma; Takuro Nunoura; Ken Takai; Ron Usami
Halopiger thermotolerans sp nov., a thermo-tolerant haloarchaeon isolated from commercial salt
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2016年12月
66, 12, 4975, 4980
［査読有り］ - S. Kawagucci; J. Miyazaki; T. Noguchi; K. Okamura; T. Shibuya; T. Watsuji; M. Nishizawa; H. Watanabe; K. Okino; N. Takahata; Y. Sano; K. Nakamura; A. Shuto; M. Abe; Y. Takaki; T. Nunoura; M. Koonjul; M. Singh; G. Beedessee; M. Khishma; V. Bhoyroo; D. Bissessur; L. S. Kumar; D. Marie; K. Tamaki; K. Takai
Fluid chemistry in the Solitaire and Dodo hydrothermal fields of the Central Indian Ridge
GEOFLUIDS, 2016年12月
16, 5, 988, 1005
［査読有り］ - Hiroko Makita; Sakiko Kikuchi; Satoshi Mitsunobu; Yoshihiro Takaki; Toshiro Yamanaka; Tomohiro Toki; Takuroh Noguchi; Kentaro Nakamura; Mariko Abe; Miho Hirai; Masahiro Yamamoto; Katsuyuki Uematsu; Junichi Miyazaki; Takuro Nunoura; Yoshio Takahashi; Ken Takai
Comparative Analysis of Microbial Communities in Iron-Dominated Flocculent Mats in Deep-Sea Hydrothermal Environments
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2016年10月
82, 19, 5741, 5755
［査読有り］ - Roberto Danovaro; Antonio Dell'Anno; Cinzia Corinaldesi; Eugenio Rastelli; Ricardo Cavicchioli; Mart Krupovic; Rachel T. Noble; Takuro Nunoura; David Prangishvili
Virus-mediated archaeal hecatomb in the deep seafloor
SCIENCE ADVANCES, 2016年10月
2, 10, e1600492
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Miho Hirai; Yukari Yoshida-Takashima; Manabu Nishizawa; Shinsuke Kawagucci; Taichi Yokokawa; Junichi Miyazaki; Osamu Koide; Hiroko Makita; Yoshihiro Takaki; Michinari Sunamura; Ken Takai
Distribution and Niche Separation of Planktonic Microbial Communities in the Water Columns from the Surface to the Hadal Waters of the Japan Trench under the Eutrophic Ocean
Frontiers in Microbiology, 2016年08月
7, 1261
［査読有り］ - Satoshi Koyama; Chihiro Sakai; Cathleen E. Thomas; Takuro Nunoura; Syun-ichi Urayama
A new member of the family Totiviridae associated with arboreal ants (Camponotus nipponicus)
ARCHIVES OF VIROLOGY, 2016年07月
161, 7, 2043, 2045
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Jungo Kakuta; Hiromi Kazama; Miho Hirai; Noriaki Masui; Hitoshi Tomaru; Yuki Morono; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Ken Takai
Variance and potential niche separation of microbial communities in subseafloor sediments off Shimokita Peninsula, Japan
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2016年06月
18, 6, 1889, 1906
［査読有り］ - Takaaki Kubota; Tohru Kobayashi; Takuro Nunoura; Fumito Maruyama; Shigeru Deguchi
Enantioselective Utilization of D-Amino Acids by Deep-Sea Microorganisms
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2016年04月
7, 511
［査読有り］ - Syun-Ichi Urayama; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura
FLDS: A Comprehensive dsRNA Sequencing Method for Intracellular RNA Virus Surveillance
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2016年03月
31, 1, 33, 40
［査読有り］ - Hidetaka Nomaki; Kazuno Arai; Hisami Suga; Takashi Toyofuku; Masahide Wakita; Takuro Nunoura; Kazumasa Oguri; Takafumi Kasaya; Shuichi Watanabe
Sedimentary organic matter contents and porewater chemistry at upper bathyal depths influenced by the 2011 off the Pacific coast of Tohoku Earthquake and tsunami
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY, 2016年02月
72, 1, 99, 111
［査読有り］ - Hidetaka Nomaki; Tomohiro Mochizuki; Tomo Kitahashi; Takuro Nunoura; Kazuno Arai; Takashi Toyofuku; Gengo Tanaka; Shuichi Shigeno; Eiji Tasumi; Katsunori Fujikura; Shuichi Watanabe
Effects of mass sedimentation events after the 2011 off the Pacific coast of Tohoku Earthquake on benthic prokaryotes and meiofauna inhabiting the upper bathyal sediments
JOURNAL OF OCEANOGRAPHY, 2016年02月
72, 1, 113, 128
［査読有り］ - Kobayashi T; Uchimura K; Kubota T; Nunoura T; Deguchi S
Biochemical and genetic characterization of β-1,3 glucanase from a deep subseafloor Laceyella putida.
Applied microbiology and biotechnology, 2016年01月
100, 1, 203, 214
［査読有り］ - Takaaki Kubota; Shigeru Shimamura; Tohru Kobayashi; Takuro Nunoura; Shigeru Deguchi
Distribution of eukaryotic serine racemases in the bacterial domain and characterization of a representative protein in Roseobacter litoralis Och 149
MICROBIOLOGY-SGM, 2016年01月
162, 1, 53, 61
［査読有り］ - Mitsuhiro Yoshida; Yukari Yoshida-Takashima; Takuro Nunoura; Ken Takai
Identification and genomic analysis of temperate Pseudomonas bacteriophage PstS-1 from the Japan trench at a depth of 7000 m
RESEARCH IN MICROBIOLOGY, 2015年11月
166, 9, 668, 676
［査読有り］ - Syun-ichi Urayama; Yukari Yoshida-Takashima; Mitsuhiro Yoshida; Yuji Tomaru; Hiromitsu Moriyama; Ken Takai; Takuro Nunoura
A New Fractionation and Recovery Method of Viral Genomes Based on Nucleic Acid Composition and Structure Using Tandem Column Chromatography
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2015年06月
30, 2, 199, 203
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Miho Hirai; Shigeru Shimamura; Akiko Makabe; Osamu Koide; Tohru Kikuchi; Junichi Miyazaki; Keisuke Koba; Naohiro Yoshida; Michinari Sunamura; Ken Takai
Hadal biosphere: Insight into the microbial ecosystem in the deepest ocean on Earth
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2015年03月
112, 11, E1230, E1236
［査読有り］ - Mitsuhiro Yoshida; Yukari Yoshida-Takashima; Takuro Nunoura; Ken Takai
Genomic characterization of a temperate phage of the psychrotolerant deep-sea bacterium Aurantimonas sp.
EXTREMOPHILES, 2015年01月
19, 1, 49, 58
［査読有り］ - Toshiro Yamanaka; Hiromi Nagashiov; Ryu Nishio; Kazuna Kondo; Takuroh Noguchi; Kei Okamura; Takuro Nunoura; Hiroko Makita; Kentaro Nakamura; Hiromi Watanabe; Kazuhiro Inoue; Tomohiro Toki; Kouichiro Iguchi; Urumu Tsunogai; Ryoichi Nakada; Shogo Ohshima; Shin Toyoda; Jun Kawai; Naohiro Yoshida; Akira Ijiri; Michinari Sunamura
The Tarama Knoll: Geochemical and Biological Profiles of Hydrothermal Activity
Subseafloor Biosphere Linked to Hydrothermal Systems: TAIGA Concept, 2015年01月01日
497, 504
［査読有り］ - Katsunori Yanagawa; Anja Breuker; Axel Schippers; Manabu Nishizawa; Akira Ijiri; Miho Hirai; Yoshihiro Takaki; Michinari Sunamura; Tetsuro Urabe; Takuro Nunoura; Ken Takai
Microbial Community Stratification Controlled by the Subseafloor Fluid Flow and Geothermal Gradient at the Iheya North Hydrothermal Field in the Mid-Okinawa Trough (Integrated Ocean Drilling Program Expedition 331)
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2014年10月
80, 19, 6126, 6135
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Hiromi Kazama; Jungo Kakuta; Shigeru Shimamura; Hiroko Makita; Miho Hirai; Masayuki Miyazaki; Ken Takai
Physiological and Genomic Features of a Novel Sulfur-Oxidizing Gammaproteobacterium Belonging to a Previously Uncultivated Symbiotic Lineage Isolated from a Hydrothermal Vent
PLOS ONE, 2014年08月
9, 8, e104959
［査読有り］ - Masataka Aoki; Masayuki Ehara; Yumi Saito; Hideyoshi Yoshioka; Masayuki Miyazaki; Yayoi Saito; Ai Miyashita; Shuji Kawakami; Takashi Yamaguchi; Akiyoshi Ohashi; Takuro Nunoura; Ken Takai; Hiroyuki Imachi
A Long-Term Cultivation of an Anaerobic Methane-Oxidizing Microbial Community from Deep-Sea Methane-Seep Sediment Using a Continuous-Flow Bioreactor
PLOS ONE, 2014年08月
9, 8, e105356
［査読有り］ - Takuro Nunoura
The family desulfurobacteriaceae
The Prokaryotes: Other Major Lineages of Bacteria and The Archaea, 2014年07月01日
9783642389542, 617, 625
［査読有り］ - Katsunori Yanagawa; Yuki Morono; Yukari Yoshida-Takashima; Masamitsu Eitoku; Michinari Sunamura; Fumio Inagaki; Hiroyuki Imachi; Ken Takai; Takuro Nunoura
Variability of subseafloor viral abundance at the geographically and geologically distinct continental margins
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2014年04月
88, 1, 60, 68
［査読有り］ - Hisako Hirayama; Mariko Abe; Masayuki Miyazaki; Takuro Nunoura; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Ken Takai
Methylomarinovum caldicuralii gen. nov., sp nov., a moderately thermophilic methanotroph isolated from a shallow submarine hydrothermal system, and proposal of the family Methylothermaceae fam. nov.
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2014年03月
64, Pt 3, 989, 999
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Manabu Nishizawa; Tohru Kikuchi; Taishi Tsubouchi; Miho Hirai; Osamu Koide; Junichi Miyazaki; Hisako Hirayama; Keisuke Koba; Ken Takai
Molecular biological and isotopic biogeochemical prognoses of the nitrification-driven dynamic microbial nitrogen cycle in hadopelagic sediments
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2013年11月
15, 11, 3087, 3107
［査読有り］ - Manabu Nishizawa; Keisuke Koba; Akiko Makabe; Naohiro Yoshida; Masanori Kaneko; Shingo Hirao; Jun-ichiro Ishibashi; Toshiro Yamanaka; Takazo Shibuya; Tohru Kikuchi; Miho Hirai; Junichi Miyazaki; Takuro Nunoura; Ken Takai
Nitrification-driven forms of nitrogen metabolism in microbial mat communities thriving along an ammonium-enriched subsurface geothermal stream
GEOCHIMICA ET COSMOCHIMICA ACTA, 2013年07月
113, 152, 173
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Miho Hirai; Masayuki Miyazaki; Hiromi Kazama; Hiroko Makita; Hisako Hirayama; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Isolation and Characterization of a Thermophilic, Obligately Anaerobic and Heterotrophic Marine Chloroflexi Bacterium from a Chloroflexi-dominated Microbial Community Associated with a Japanese Shallow Hydrothermal System, and Proposal for Thermomarinilinea lacunofontalis gen. nov., sp nov.
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2013年06月
28, 2, 228, 235
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Miho Hirai; Masayuki Miyazaki; Hiromi Kazama; Hiroko Makita; Hisako Hirayama; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Isolation and Characterization of a Thermophilic, Obligately Anaerobic and Heterotrophic Marine Chloroflexi Bacterium from a Chloroflexi-dominated Microbial Community Associated with a Japanese Shallow Hydrothermal System, and Proposal for Thermomarinilinea lacunofontalis gen. nov., sp nov.
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2013年06月
28, 2, 228, 235
［査読有り］ - Ken Takai; Mariko Abe; Masayuki Miyazaki; Osamu Koide; Takuro Nunoura; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Tohru Kobayashi
Sunxiuqinia faeciviva sp nov., a facultatively anaerobic organoheterotroph of the Bacteroidetes isolated from deep subseafloor sediment
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2013年05月
63, Pt 5, 1602, 1609
［査読有り］ - Yukari Yoshida-Takashima; Yoshihiro Takaki; Shigeru Shimamura; Takuro Nunoura; Ken Takai
Genome sequence of a novel deep-sea vent epsilonproteobacterial phage provides new insight into the co-evolution of Epsilonproteobacteria and their phages
EXTREMOPHILES, 2013年05月
17, 3, 405, 419
［査読有り］ - Sayaka Mino; Hiroko Makita; Tomohiro Toki; Junichi Miyazaki; Shingo Kato; Hiromi Watanabe; Hiroyuki Imachi; Tomo-o Watsuji; Takuro Nunoura; Shigeaki Kojima; Tomoo Sawabe; Ken Takai; Satoshi Nakagawa
Biogeography of Persephonella in deep-sea hydrothermal vents of the Western Pacific
FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, 2013年04月
4, 107
［査読有り］ - Hisako Hirayama; Hiroyuki Fuse; Mariko Abe; Masayuki Miyazaki; Takamichi Nakamura; Takuro Nunoura; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Ken Takai
Methylomarinum vadi gen. nov., sp nov., a methanotroph isolated from two distinct marine environments
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2013年03月
63, Pt 3, 1073, 1082
［査読有り］ - Shinsuke Kawagucci; Yuichiro Ueno; Ken Takai; Tomohiro Toki; Michihiro Ito; Kazuhiro Inoue; Akiko Makabe; Naohiro Yoshida; Yasuyuki Muramatsu; Naoto Takahata; Yuji Sano; Taku Narita; Genta Teranishi; Hajime Obata; Satoshi Nakagawa; Takuro Nunoura; Toshitaka Gamo
Geochemical origin of hydrothermal fluid methane in sediment-associated fields and its relevance to the geographical distribution of whole hydrothermal circulation
CHEMICAL GEOLOGY, 2013年02月
339, 213, 225
［査読有り］ - Mitsuhiro Yoshida; Yoshihiro Takaki; Masamitsu Eitoku; Takuro Nunoura; Ken Takai
Metagenomic Analysis of Viral Communities in (Hado)Pelagic Sediments
PLOS ONE, 2013年02月
8, 2, e57271
［査読有り］ - Katsunori Yanagawa; Takuro Nunoura; Sean M. McAllister; Miho Hirai; Anja Breuker; Leah Brandt; Christopher H. House; Craig L. Moyer; Jean Louis Birrien; Kan Aoike; Michinari Sunamura; Tetsuro Urabe; Michael J. Mottl; Ken Takai
The first microbiological contamination assessment by deep-sea drilling and coring by the D/V chikyu at the iheya north hydrothermal field in the mid-okinawa trough (IODP Expedition 331)
Frontiers in Microbiology, 2013年
4, NOV, 327
［査読有り］ - Jacqueline Buettiker; Sonoko Ishino; Takeshi Yamagami; Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Hideto Takami; Ken Takai; Yoshizumi Ishino
Characterization of DNA polymerase B1 from Caldiarchaeum subterraneum, an uncultivated archaea
GENES & GENETIC SYSTEMS, 2012年12月
87, 6, 420, 420
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Hiromi Kazama; Miho Hirai; Juichiro Ashi; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Microbial Diversity in Deep-sea Methane Seep Sediments Presented by SSU rRNA Gene Tag Sequencing
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2012年12月
27, 4, 382, 390
［査読有り］ - Masayuki Miyazaki; Osamu Koide; Tohru Kobayashi; Kozue Mori; Shigeru Shimamura; Takuro Nunoura; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Takahiko Nagahama; Yuichi Nogi; Shigeru Deguchi; Ken Takai
Geofilum rubicundum gen. nov., sp nov., isolated from deep subseafloor sediment
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2012年05月
62, Pt 5, 1075, 1080
［査読有り］ - Yukari Yoshida-Takashima; Takuro Nunoura; Hiromi Kazama; Takuroh Noguchi; Kazuhiro Inoue; Hironori Akashi; Toshiro Yamanaka; Tomohiro Toki; Masahiro Yamamoto; Yasuo Furushima; Yuichiro Ueno; Hiroyuki Yamamoto; Ken Takai
Spatial Distribution of Viruses Associated with Planktonic and Attached Microbial Communities in Hydrothermal Environments
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2012年03月
78, 5, 1311, 1320
［査読有り］ - Hiroshi Izumi; Takuro Nunoura; Masayuki Miyazaki; Sayaka Mino; Tomohiro Toki; Ken Takai; Yoshihiko Sako; Tomoo Sawabe; Satoshi Nakagawa
Thermotomaculum hydrothermale gen. nov., sp nov., a novel heterotrophic thermophile within the phylum Acidobacteria from a deep-sea hydrothermal vent chimney in the Southern Okinawa Trough
EXTREMOPHILES, 2012年03月
16, 2, 245, 253
［査読有り］ - Junichi Sugahara; Kosuke Fujishima; Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Hideto Takami; Ken Takai; Masaru Tomita; Akio Kanai
Genomic Heterogeneity in a Natural Archaeal Population Suggests a Model of tRNA Gene Disruption
PLOS ONE, 2012年03月
7, 3, e32504
［査読有り］ - Motoko Igisu; Ken Takai; Yuichiro Ueno; Manabu Nishizawa; Takuro Nunoura; Miho Hirai; Masanori Kaneko; Hiroshi Naraoka; Mie Shimojima; Koichi Hori; Satoru Nakashima; Hiroyuki Ohta; Shigenori Maruyama; Yukio Isozaki
Domain-level identification and quantification of relative prokaryotic cell abundance in microbial communities by Micro-FTIR spectroscopy
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY REPORTS, 2012年02月
4, 1, 42, 49
［査読有り］ - Shinsuke Kawagucci; Yukari T. Yoshida; Takuroh Noguchi; Makio C. Honda; Hiroshi Uchida; Hidenori Ishibashi; Fumiko Nakagawa; Urumu Tsunogai; Kei Okamura; Yoshihiro Takaki; Takuro Nunoura; Junichi Miyazaki; Miho Hirai; Weiren Lin; Hiroshi Kitazato; Ken Takai
Disturbance of deep-sea environments induced by the M9.0 Tohoku Earthquake
SCIENTIFIC REPORTS, 2012年02月
2, 270
［査読有り］ - Hideto Takami; Hideki Noguchi; Yoshihiro Takaki; Ikuo Uchiyama; Atsushi Toyoda; Shinro Nishi; Gab-Joo Chee; Wataru Arai; Takuro Nunoura; Takehiko Itoh; Masahira Hattori; Ken Takai
A Deeply Branching Thermophilic Bacterium with an Ancient Acetyl-CoA Pathway Dominates a Subsurface Ecosystem
PLOS ONE, 2012年01月
7, 1, e30559
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Yoshihiro Takaki; Jungo Kakuta; Shinro Nishi; Junichi Sugahara; Hiromi Kazama; Gab-Joo Chee; Masahira Hattori; Akio Kanai; Haruyuki Atomi; Ken Takai; Hideto Takami
Insights into the evolution of Archaea and eukaryotic protein modifier systems revealed by the genome of a novel archaeal group
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2011年04月
39, 8, 3204, 3223
［査読有り］ - Shinsuke Kawagucci; Hitoshi Chiba; Jun-ichiro Shibash; Toshiro Yamanaka; Tomohiro Toki; Yasuyuki Muramatsu; Yuichiro Ueno; Akiko Makabe; Kazuhiro Inoue; Naohiro Yoshida; Satoshi Nakagawa; Takuro Nunoura; Ken Takai; Naoto Takahata; Yuji Sano; Taku Narita; Genta Teranishi; Hajime Obata; Toshitaka Gamo
Hydrothermal fluid geochemistry at the Iheya North field in the mid-Okinawa Trough: Implication for origin of methane in subseafloor fluid circulation systems
GEOCHEMICAL JOURNAL, 2011年
45, 2, 109, 124
［査読有り］ - Yuriko Nagano; Takahiko Nagahama; Yuji Hatada; Takuro Nunoura; Hideto Takami; Junichi Miyazaki; Ken Takai; Koki Horikoshi
Fungal diversity in deep-sea sediments - the presence of novel fungal groups
FUNGAL ECOLOGY, 2010年11月
3, 4, 316, 325
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Miho Hirai; Hiroyuki Imachi; Masayuki Miyazaki; Hiroko Makita; Hisako Hirayama; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Ken Takai
Kosmotoga arenicorallina sp. nov a thermophilic and obligately anaerobic heterotroph isolated from a shallow hydrothermal system occurring within a coral reef, southern part of the Yaeyama Archipelago, Japan, reclassification of Thermococcoides shengliensis as Kosmotoga shengliensis comb. nov., and emended description of the genus Kosmotoga
ARCHIVES OF MICROBIOLOGY, 2010年10月
192, 10, 811, 819
［査読有り］ - Hiroaki Hasegawa; Masahiro Yamamoto; Takuro Nunoura; Shinsuke Kawagucci; Yuichiro Ueno; Ken Takai
Novel sulfur disproportionation of a deep-sea vent thermophile
GEOCHIMICA ET COSMOCHIMICA ACTA, 2010年06月
74, 12, A386, A386
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Miwako Nakaseama; Ayako Kosaka; Satoru B. Ohkubo; Toru Kikuchi; Hiromi Kazama; Shoko Hosoi-Tanabe; Ko-ichi Nakamura; Masataka Kinoshita; Hisako Hirayama; Fumio Inagaki; Urumu Tsunogai; Jun-ichiro Ishibashi; Ken Takai
Archaeal Diversity and Distribution along Thermal and Geochemical Gradients in Hydrothermal Sediments at the Yonaguni Knoll IV Hydrothermal Field in the Southern Okinawa Trough
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2010年02月
76, 4, 1198, 1211
［査読有り］ - Junichi Miyazaki; Ryosaku Higa; Tomohiro Toki; Juichiro Ashi; Urumu Tsunogai; Takuro Nunoura; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Molecular Characterization of Potential Nitrogen Fixation by Anaerobic Methane-Oxidizing Archaea in the Methane Seep Sediments at the Number 8 Kumano Knoll in the Kumano Basin, Offshore of Japan
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2009年11月
75, 22, 7153, 7162
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Bruno Soffientino; Anna Blazejak; Jungo Kakuta; Hanako Oida; Axel Schippers; Ken Takai
Subseafloor microbial communities associated with rapid turbidite deposition in the Gulf of Mexico continental slope (IODP Expedition 308)
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2009年09月
69, 3, 410, 424
［査読有り］ - Ai Miyashita; Hanako Mochimaru; Hiromi Kazama; Akiyoshi Ohashi; Takashi Yamaguchi; Takuro Nunoura; Koki Horikoshi; Ken Takai; Hiroyuki Imachi
Development of 16S rRNA gene-targeted primers for detection of archaeal anaerobic methanotrophs (ANMEs)
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 2009年08月
297, 1, 31, 37
［査読有り］ - Ai Miyashita; Hanako Mochimaru; Hiromi Kazama; Akiyoshi Ohashi; Takashi Yamaguchi; Takuro Nunoura; Koki Horikoshi; Ken Takai; Hiroyuki Imachi
Molecular Survey of Anaerobic Methane-Oxidizing Archaea by 16S rRNA gene in Terrestrial Habitats
FEMS Microbiology Letters, 2009年03月31日
297, 1, 31, 37
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Ken Takai
Comparison of microbial communities associated with phase-separation-induced hydrothermal fluids at the Yonaguni Knoll IV hydrothermal field, the Southern Okinawa Trough
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2009年03月
67, 3, 351, 370
［査読有り］ - Ken Takai; Takuro Nunoura; Koki Horikoshi; Takazo Shibuya; Kentaro Nakamura; Yohey Suzuki; Matthew Stott; Gary J. Massoth; B. W. Christenson; Cornel E. J. deRonde; David A. Butterfield; Jun-ichiro Ishibashi; John E. Lupton; L. J. Evans
Variability in Microbial Communities in Black Smoker Chimneys at the NW Caldera Vent Field, Brothers Volcano, Kermadec Arc
GEOMICROBIOLOGY JOURNAL, 2009年
26, 8, 552, 569
［査読有り］ - Hiroyuki Imachi; Sanae Saka; Hisako Hirayama; Satoshi Nakagawa; Takuro Nunoura; Ken Takai; Koki Horikoshi
Exilispira thermophila gen. nov., sp nov., an anaerobic, thermophilic spirochaete isolated from a deep-sea hydrothermal vent chimney
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2008年10月
58, Pt 10, 2258, 2265
［査読有り］ - Ken Takai; Kentaro Nakamura; Tomohiro Toki; Urumu Tsunogai; Masayuki Miyazaki; Junichi Miyazaki; Hisako Hirayama; Satoshi Nakagawa; Takuro Nunoura; Koki Horikoshi
Cell proliferation at 122 degrees C and isotopically heavy CH4 production by a hyperthermophilic methanogen under high-pressure cultivation
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2008年08月
105, 31, 10949, 10954
［査読有り］ - Tohru Kobayashi; Osamu Koide; Kozue Mori; Shigeru Shimamura; Takae Matsuura; Takeshi Miura; Yoshihiro Takaki; Yuki Morono; Takuro Nunoura; Hiroyuki Imachi; Fumio Inagaki; Ken Takai; Koki Horikoshi
Phylogenetic and enzymatic diversity of deep subseafloor aerobic microorganisms in organics- and methane-rich sediments off Shimokita Peninsula
EXTREMOPHILES, 2008年07月
12, 4, 519, 527
［査読有り］ - J. Ishibashi; R. Suzuki; H. Hamasaki; T. Yamanaka; H. Chiba; A. Ijiri; U. Tsunogai; S. Nakagawa; T. Nunoura; K. Takai
Subseafloor phase separation and fluid migration supports Calyptogena colony in the marginal region of a hydrothermal field
GEOCHIMICA ET COSMOCHIMICA ACTA, 2008年07月
72, 12, A412, A412
［査読有り］ - Ken Takai; Takuro Nunoura; Jun Ichiro Ishibashi; John Lupton; Ryohei Suzuki; Hiroshi Hamasaki; Yuichiro Ueno; Shinsuke Kawagucci; Toshitaka Gamo; Yohey Suzuki; Hisako Hirayama; Koki Horikoshi
Variability in the microbial communities and hydrothermal fluid chemistry at the newly discovered Mariner hydrothermal field, southern Lau Basin
Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 2008年06月28日
113, 2, G02031 - Ken Takai; Takuro Nunoura; Jun-Ichiro Ishibashi; John Lupton; Ryohei Suzuki; Hiroshi Hamasaki; Yuichiro Ueno; Shinsuke Kawagucci; Toshitaka Gamo; Yohey Suzuki; Hisako Hirayama; Koki Horikoshi
Variability in the microbial communities and hydrothermal fluid chemistry at the newly discovered Mariner hydrothermal field, southern Lau Basin
JOURNAL OF GEOPHYSICAL RESEARCH-BIOGEOSCIENCES, 2008年06月
113, G2
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Junichi Miyazaki; Ai Miyashita; Hiroyuki Imachi; Ken Takai
Quantification of mcrA by fluorescent PCR in methanogenic and methanotrophic microbial communities
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2008年05月
64, 2, 240, 247
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Masayuki Miyazaki; Yohey Suzuki
Thermosulfidibacter takaii gen. nov., sp nov., a thermophilic, hydrogen-oxidizing, sulfur-reducing chemolithoautotroph isolated from a deep-sea hydrothermal field in the Southern Okinawa Trough
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2008年03月
58, Pt 3, 659, 665
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Masayuki Miyazaki; Yohey Suzuki; Ken Takai; Koki Horikoshi
Hydrogenivirga okinawensis sp nov., a thermophilic sulfur-oxidizing chemolithoautotroph isolated from a deep-sea hydrothermal field, Southern Okinawa Trough
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2008年03月
58, Pt 3, 676, 681
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Fumio Inagaki; Mark E. Delwiche; Frederick S. Colwell; Ken Takai
Subseafloor Microbial Communities in Methane Hydrate-Bearing Sediment at Two Distinct Locations (ODP Leg204) in the Cascadia Margin
MICROBES AND ENVIRONMENTS, 2008年
23, 4, 317, 325
［査読有り］ - Hisako Hirayama; Michinari Sunamura; Ken Takai; Takuro Nunoura; Takuro Noguchi; Hanako Oida; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Tamotsu Oomori; Koki Horikoshi
Culture-dependent and -independent characterization of microbial communities associated with a shallow submarine hydrothermal system occurring within a coral reef off Taketomi Island, Japan
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2007年12月
73, 23, 7642, 7656
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Masayuki Miyazaki; Yohey Suzuki; Ken Takai; Koki Horikoshi
Desulfothermus okinawensis sp nov., a thermophilic and heterotrophic sulfate-reducing bacterium isolated from a deep-sea hydrothermal field
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2007年10月
57, Pt 10, 2360, 2364
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Masayuki Miyazaki; Yohey Suzuki; Ken Takai; Koki Horikoshi
Marinitoga okinawensis sp nov., a novel thermophilic and anaerobic heterotroph isolated from a deep-sea hydrothermal field, Southern Okinawa Trough
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2007年03月
57, Pt 3, 467, 471
［査読有り］ - Shojiro Ishibashi; Hiroshi Yoshida; Yoshitaka Watanabe; Hiroyuki Osawa; Junichro Tahara; Tsuyoshi Miyazaki; Kazuaki Ito; Ken Takai; Takuro Nunoura
Development of a sediment sampling system for the deepest ocean and its sea trial result
PROCEEDINGS OF THE SEVENTEENTH (2007) INTERNATIONAL OFFSHORE AND POLAR ENGINEERING CONFERENCE, VOL 1- 4, PROCEEDINGS, 2007年
1095, +
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Noriaki Masui; Fumio Inagaki; Ken Takai; Satoshi Hirano; Kenneth H. Nealson; Koki Horikoshi
Culture-dependent and independent analyses of subsurface microbial communities in oil-bearing strata of the Sagara oil reservoir
ISLAND ARC, 2006年09月
15, 3, 328, 337
［査読有り］ - Fumio Inagaki; Marcel M. M. Kuypers; Urumu Tsunogai; Jun-ichiro Ishibashi; Ko-ichi Nakamura; Tina Treude; Satoru Ohkubo; Miwako Nakaseama; Kaul Gena; Hitoshi Chiba; Hisako Hirayama; Takuro Nunoura; Ken Takai; Bo B. Jorgensen; Koki Horikoshi; Antje Boetius
Microbial community in a sediment-hosted CO2 lake of the southern Okinawa Trough hydrothermal system
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2006年09月
103, 38, 14164, 14169
［査読有り］ - Uta Konno; Urumu Tsunogai; Fumiko Nakagawa; Miwako Nakaseama; Jun-ichiro Ishibashi; Takuro Nunoura; Ko-ichi Nakamura
Liquid CO2 venting on the seafloor: Yonaguni knoll IV hydrothermal system, Okinawa Trough
GEOPHYSICAL RESEARCH LETTERS, 2006年08月
33, 16
［査読有り］ - Ken Takai; Masayuki Miyazaki; Takuro Nunoura; Hisako Hirayama; Hanako Oida; Yasuo Furushima; Hiroyuki Yamamoto; Koki Horikoshi
Sulfurivirga caldicuralii gen. nov., sp nov., a novel microaerobic, thermophilic, thiosulfate-oxidizing chemolithoautotroph, isolated from a shallow marine hydrothermal system occurring in a coral reef, Japan
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2006年08月
56, Pt 8, 1921, 1929
［査読有り］ - Takuro Nunoura; Hanako Oida; Tomohiro Toki; Juichiro Ashi; Ken Takai; Koki Horikoshi
Quantification of mcrA by quantitative fluorescent PCR in sediments from methane seep of the Nankai Trough
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2006年07月
57, 1, 149, 157
［査読有り］ - Y Suzuki; S Kojima; T Sasaki; M Suzuki; T Utsumi; H Watanabe; H Urakawa; S Tsuchida; T Nunoura; H Hirayama; K Takai; KH Nealson; K Horikoshi
Host-symbiont relationships in hydrothermal vent gastropods of the genus Alviniconcha from the Southwest Pacific
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2006年02月
72, 2, 1388, 1393
［査読有り］ - F Inagaki; T Nunoura; S Nakagawa; A Teske; M Lever; A Lauer; M Suzuki; K Takai; M Delwiche; FS Colwell; KH Nealson; K Horikoshi; S D'Hondt; BB Jorgensen
Biogeographical distribution and diversity of microbes in methane hydrate-bearing deep marine sediments, on the Pacific Ocean Margin
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 2006年02月
103, 8, 2815, 2820
［査読有り］ - Yohey Suzuki; Shigeaki Kojima; Hiromi Watanabe; Masae Suzuki; Shinji Tsuchida; Takuro Nunoura; H'isako Hirayama; Ken Takai; Kenneth H. Nealson; Koki Horikoshi
Single host and symbiont lineages of hydrothermalvent gastropods Ifremeria nautilei (Provannidae): biogeography and evolution
MARINE ECOLOGY PROGRESS SERIES, 2006年
315, 167, 175
［査読有り］ - T Nunoura; H Hirayama; H Takami; H Oida; S Nishi; S Shimamura; Y Suzuki; F Inagaki; K Takai; KH Nealson; K Horikoshi
Genetic and functional properties of uncultivated thermophilic crenarchaeotes from a subsurface gold mine as revealed by analysis of genome fragments
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2005年12月
7, 12, 1967, 1984
［査読有り］ - K Takai; BJ Campbell; SC Cary; M Suzuki; H Oida; T Nunoura; H Hirayama; S Nakagawa; Y Suzuki; F Inagaki; K Horikoshi
Enzymatic and genetic characterization of carbon and energy metabolisms by deep-sea hydrothermal chemolithoautotrophic isolates of Epsilonproteobacteria
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2005年11月
71, 11, 7310, 7320
［査読有り］ - S Nakagawa; K Takai; F Inagaki; H Hirayama; T Nunoura; K Horikoshi; Y Sako
Distribution, phylogenetic diversity and physiological characteristics of epsilon-Proteobacteria in a deep-sea hydrothermal field
ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2005年10月
7, 10, 1619, 1632
［査読有り］ - S Nakagawa; K Takai; F Inagaki; H Chiba; J Ishibashi; S Kataoka; H Hirayama; T Nunoura; K Horikoshi; Y Sako
Variability in microbial community and venting chemistry in a sediment-hosted backarc hydrothermal system: Impacts of subseafloor phase-separation
FEMS MICROBIOLOGY ECOLOGY, 2005年09月
54, 1, 141, 155
［査読有り］ - T Nunoura; Y Sako; T Wakagi; A Uchida
Cytochrome aa(3) in facultatively aerobic and hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum oguniense
CANADIAN JOURNAL OF MICROBIOLOGY, 2005年08月
51, 8, 621, 627
［査読有り］ - F Inagaki; U Tsunogai; M Suzuki; A Kosaka; H Machiyama; K Takai; T Nunoura; KH Nealson; K Horikoshi
Characterization of C-1-metabolizing prokaryotic communities in methane seep habitats at the Kuroshima Knoll, southern Ryukyu arc, by analyzing pmoA, mmoX, mxaF, mcrA, and 16S rRNA genes
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2004年12月
70, 12, 7445, 7455
［査読有り］ - K Takai; H Oida; Y Suzuki; H Hirayama; S Nakagawa; T Nunoura; F Inagaki; KH Nealson; K Horikoshi
Spatial distribution of marine crenarchaeota group I in the vicinity of deep-sea hydrothermal systems
APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBIOLOGY, 2004年04月
70, 4, 2404, 2413
［査読有り］ - H Nakayama; Y Morinaga; N Nomura; T Nunoura; Y Sako; A Uchida
An archaeal homing endonuclease I-PogI cleaves at the insertion site of the neighboring intron, which has no nested open reading frame
FEBS LETTERS, 2003年06月
544, 1-3, 165, 170
［査読有り］ - T Nunoura; Y Sako; T Wakagi; A Uchida
Regulation of the aerobic respiratory chain in the facultatively aerobic and hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum oguniense
MICROBIOLOGY-SGM, 2003年03月
149, Pt 3, 673, 688
［査読有り］ - K Takai; F Inagaki; S Nakagawa; H Hirayama; T Nunoura; Y Sako; KH Nealson; K Horikoshi
Isolation and phylogenetic diversity of members of previously uncultivated epsilon-proteobacteria in deep-sea hydrothermal fields
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS, 2003年01月
218, 1, 167, 174
［査読有り］ - T Nunoura; S Akihara; K Takai; Y Sako
Thermaerobacter nagasakiensis sp nov., a novel aerobic and extremely thermophilic marine bacterium
ARCHIVES OF MICROBIOLOGY, 2002年04月
177, 4, 339, 344
［査読有り］ - Y Sako; T Nunoura; A Uchida
Pyrobaculum oguniense sp nov., a novel facultatively aerobic and hyperthermophilic archaeon growing at up to 97 degrees C
INTERNATIONAL JOURNAL OF SYSTEMATIC AND EVOLUTIONARY MICROBIOLOGY, 2001年03月
51, 303, 309
［査読有り］
MISC
- 若島朋幸; 若島朋幸; 福山宥斗; 島村繁; 常松奈緒; 布浦拓郎; 千葉洋子; 千葉洋子
独立栄養性細菌Thermodesulfatator indicusが有する未知のセリン生合成経路の探索
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024年
2024 - 千葉洋子; 千葉洋子; 常松奈緒; 亀谷将史; 亀谷将史; 若島朋幸; 若島朋幸; 島村繁; 福山宥斗; 布浦拓郎
新規CO資化性微生物の探索-好熱性水素細菌Hydrogenobacter thermophilusのCO耐性および資化性の検証
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2024年
2024 - FUKUYAMA Yuto; SHIMAMURA Shigeru; SUMIDA Tomomi; CHIBA Yoko; CHIKARAISHI Yoshito; ATOMI Haruyuki; NUNOURA Takuro
CE-MSを用いた13Cトレーサーに基づくメタボロミクスにより明らかになった超好熱性細菌と従属栄養細菌におけるCO2の同化
日本微生物生態学会大会(Web), 2023年
36th - 福山宥斗; 島村繁; 澄田智美; 酒井早苗; 跡見晴幸; 布浦拓郎
微量メタボローム解析法を用いたMethanothermobacter thermautotrophicusにおけるアミノ酸生合成系の代謝ギャップの探索
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2023年
35th - 若島朋幸; 若島朋幸; 福山宥斗; 島村繁; 常松奈緒; 布浦拓郎; 千葉洋子; 千葉洋子
アイソトポマー分析を用いた好熱性硫酸還元菌Thermodesulfatator indicusの新規グリシン生合成経路の探索
日本微生物生態学会大会(Web), 2023年
36th - KOBAYASHI Kanae; MAKABE Akiko; SHIGEMITSU Masahito; HIRAOKA Satoshi; TSUDA Miwako; MIYAZAKI Masayuki; SUMIDA Tomomi; NOMAKI Hidetaka; NUNOURA Takuro; KAWAGUCHI Shinsuke
結合分子および安定同位体分析は深海堆積物中の微生物窒素サイクルを明らかにする【JST・京大機械翻訳】|||
日本微生物生態学会大会(Web), 2023年
36th - 福山宥斗; 澄田智美; 島村繁; 酒井早苗; 跡見晴幸; 布浦拓郎
微量メタボローム解析を用いたMethanothermobacter thermautotrophicusにおけるアミノ酸生合成系の再構築
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2022年
34th - 平岡聡史; 澄田智美; 平井美穂; 豊田敦; 川口慎介; 横川太一; 布浦拓郎
海洋微生物叢が持つエピゲノムの多様性と進化・生態との関わり
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2022年
16th (Web) - NAGASAKI Keizo; OGATA Hiroyuki; YOSHIDA Takashi; TOMARU Yuji; KIMURA Kei; NUNOURA Takuro; TAKAKI Yoshihiro; URAYAMA Shun-ichi
水生新ウイルス学【JST・京大機械翻訳】|||
日本ウイルス学会学術集会プログラム・予稿集(Web), 2021年
68th - 澄田 智美; 島村 繁; 布浦 拓郎
Orbitrap Fusionを用いたCE-MSと四重極GC-MSでのアミノ酸分析の比較 (安定同位体を用いた有機物・生物・生態系解析)
低温科学, 2021年
79, 43, 49 - 浦山俊一; 浦山俊一; 浦山俊一; 千葉悠斗; 高木善弘; 萩原大祐; 萩原大祐; 布浦拓郎
再構築された“ウイルス生態像”
Journal of Environmental Biotechnology (Web), 2019年
19, 1 - 内田裕; 小野越郎; 小野越郎; 横川太一; 川口慎介; 布浦拓郎; 脇田昌英; 梅田振一郎; 熊本雄一郎; 前野克尚; 前田洋作; 平井美穂; 眞壁明子; 松井洋平; 宮崎征行; 多田雄哉; 田角栄二; 佐々木瑶子; 望月芳和; 砂村倫成; 砂村倫成; 浦山俊一; 浦山俊一; 須田好; 須田好
「かいめい」慣熟航海における伊豆・小笠原海溝のCTD採水観測
ブルーアースサイエンス・テク要旨集, 2018年
2018 - 千葉悠斗; 千葉悠斗; 外丸裕司; 木村圭; 島袋寛盛; 高木善弘; 平井美穂; 浦山俊一; 浦山俊一; 布浦拓郎; 布浦拓郎
大型藻類を対象としたRNAウイルスの網羅的探索
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2018年
12th - 千葉悠斗; 千葉悠斗; 外丸裕司; 木村圭; 島袋寛盛; 高木善弘; 平井美穂; 浦山俊一; 浦山俊一; 布浦拓郎; 布浦拓郎
大型藻類を対象としたRNAウイルスの網羅的探索
藻類, 2018年
66, 1 - 布浦 拓郎
環境ゲノム解析の歴史と海洋・地下環境から探るアーキアと真核生物の関係 (特集 細菌叢解析の光と影) -- (ゲノム進化・メタゲノム)
生体の科学, 2017年03月
68, 2, 146, 149 - 川口 慎介; 横川 太一; 布浦 拓郎; 松井 洋平; 眞壁 明子; 内田 裕
海底広域研究船「かいめい」CTD多連採水システムを用いた伊豆小笠原海溝域での採水と物理・化学・生物解析
日本地球化学会年会要旨集, 2017年
64, 0, 52, 52 - 矢吹彬憲; 浦山俊一; 高木善弘; 横川太一; 松葉史紗子; 西真郎; 荒井渉; 平井美穂; 藤倉克則; 布浦拓郎
RNA-seqデータを活用した真核微生物群集構造の解明に向けた取り組み
ブルーアース要旨集, 2017年
2017 - 土岐 知弘; 田角 栄二; 平井 美穂; 石橋 純一郎; 乗船者一同; 新城 竜一; 布浦 拓郎; 眞壁 明子; 松井 洋平; 川口 慎介; 齋藤 誠史; 加藤 真悟; 中川 聡
CK16-01航海において伊平屋北海丘及び伊平屋小海嶺から採取した間隙水の化学組成
日本地球化学会年会要旨集, 2016年
63, 0 - 吉田光宏; 望月智弘; 浦山俊一; 吉田(高島)ゆかり; 西真郎; 高木善弘; 布浦拓郎; 高井研
一本鎖DNAウイルス群を標的とする定量的メタゲノミクス
日本微生物生態学会大会(Web), 2016年
31st - 小原泰彦; 小原泰彦; STERN Robert J.; MARTINEZ Fernando; 石井輝秋; 奥村知世; 布浦拓郎; 渡部裕美; 川口慎介; 矢吹彬憲; 平井美穂; 高井研; 大西雄二; 宮嶋佑典; 大家翔馬; 道林克禎; 道林克禎; 南澤智美
南部マリアナ前弧しんかい湧水域の地質学的背景
ブルーアース要旨集, 2016年
2016 - 矢吹彬憲; 浦山俊一; 高木善弘; 西真郎; 横川太一; 荒井渉; 平井美穂; 藤倉克則; 布浦拓郎
RNA-seqデータを活用した真核微生物群集構造の解明に向けた取り組み
日本微生物生態学会大会(Web), 2016年
31st - 山本啓之; 北橋倫; 布浦拓郎; 土屋正史; 川口慎介; 渡部裕美; CHEN Chong; 平井美穂; 平山仙子; 三輪哲也; 福場辰洋; 伊藤博和; 福原達雄; 河地正伸; 越川海; 東博紀; 古市尚基; 坪井隼; 淵田茂司; 下島公紀; 山田悠香子; 蝦名直也; 岩本久則; 豊田進介
KR15‐17,KR16‐03航海概要:海洋生態系観測と変動予測手法の開発
ブルーアース要旨集, 2016年
2016, 132 - 美野さやか; 中川聡; 牧田寛子; 工藤桃李; 宮崎淳一; 稲垣史生; 加藤真悟; 布浦拓郎; 井町寛之; 和辻智郎; 高井研; 澤辺智雄
深海底熱水活動域に普遍的に生息する化学合成独立栄養細菌の生物地理学的特徴の解明
日本微生物生態学会大会(Web), 2016年
31st, 183 (WEB ONLY) - 牧田 寛子; 高橋 嘉夫; 高井 研; 田中 英美子; 布浦 拓郎; 平井 美穂; 阿部 真理子; 鈴木 優美; 関野 優也; 菊池 早希子; 光延 聖
海洋環境での酸化鉄被膜形成に関わる微生物
日本地球化学会年会要旨集, 2015年
62, 0 - 柳川 勝紀; 石橋 純一郎; 高木 善弘; 布浦 拓郎; 高井 研; 井尻 暁; Anja Breuker; 酒井 早苗; 三好 陽子; 川口 慎介; 野口 拓郎; 平井 美穂; Axel Schippers
熱水噴出孔下に存在する生命圏の限界
日本地球化学会年会要旨集, 2015年
62, 0, 136 - 金井 保; 橘高 瑞奈; 藤本 理夏子; 徳原 将弘; 石野 良純; 高木 善弘; 高見 英人; 高井 研; 森 泰生; 布浦 拓郎; 跡見 晴幸
1P-047 好熱性アーキア'Ca. Caldiarchaeum subterraneum'のユビキチン様遺伝子群の生化学的機能解析(酵素学,酵素工学,一般講演)
日本生物工学会大会講演要旨集, 2015年
67, 101, 101 - 峯岸宏明; 峯岸宏明; 峯岸宏明; 嶋根康弘; 越後輝敦; 亀倉正博; 伊藤隆; 大熊盛也; 奥村知世; 酒井早苗; 島村繁; 布浦拓郎; 高井研
日本国内から分離された高度好塩性古細菌
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2015年
28th - 道林克禎; 嶋田優香; 大家翔馬; 照峰直伸; 上原茂樹; 小原泰彦; 小原泰彦; 石井輝秋; 針金由美子; 布浦拓郎; 宮崎惇一; 高井研
世界最大の前弧マントル断面:しんかい6500とABISMOによる南部マリアナ海溝調査
ブルーアース要旨集, 2015年
2015 - Ken Takai; Satoshi Nakagawa; Takuro Nunoura
Comparative investigation of microbial communities associated with hydrothermal activities in the okinawa trough
Subseafloor Biosphere Linked to Hydrothermal Systems: TAIGA Concept, 2015年01月01日
421, 435 - 美野さやか; 中川聡; 中川聡; 牧田寛子; 宮崎淳一; 加藤真悟; 和辻智郎; 井町寛之; 布浦拓郎; STEFAN Sievert; ANNE Godfroy; 高井研; 澤辺智雄
深海底熱水活動域に生息する化学合成独立栄養細菌の集団遺伝学:遺伝的多様性と分布パターンの解明
日本微生物生態学会大会(Web), 2015年
30th, OA‐38 (WEB ONLY) - 布浦 拓郎; 木庭 啓介
海洋中の一酸化二窒素生産とアンモニア酸化 (特集 地球温暖化と海洋微生物) -- (温暖化ガスCH₄,N₂Oと海洋微生物)
遺伝 : 生物の科学, 2014年11月
68, 6, 504, 508 - 金井保; 藤本理夏子; 徳原将弘; 布浦拓郎; 橘高瑞奈; 高木善弘; 高見英人; 高井研; 跡見晴幸
未培養好熱性アーキアCaldiarchaeum subterraneumがもつユビキチン様遺伝子の機能解析
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2014年07月25日
27th, 29 - 金井保; 藤本理夏子; 徳原将弘; 布浦拓郎; 橘高瑞奈; 高木善弘; 高見英人; 高井研; 跡見晴幸
好熱性アーキアCaldiarchaeum subterraneumがもつユビキチン様遺伝子の機能解析
日本農芸化学会大会講演要旨集(Web), 2014年03月05日
2014, 2A11P15 (WEB ONLY) - 牧田 寛子; 中村 謙太郎; 高橋 嘉夫; 高井 研; 布浦 拓郎; 平井 美穂; 高木 善弘; 菊池 早希子; 光延 聖; 土岐 知弘; 山中 寿朗; 宮崎 淳一
深海底熱水活動域に存在する酸化鉄被膜地帯での微生物調査
日本地球化学会年会要旨集, 2014年
61, 0, 40, 40 - 平井 美穂; 布浦 拓郎; Juliarni; 野牧 秀隆; 西澤 学; 菅 寿美; 田角 栄二; 宮崎 淳一; 眞壁 明子; 木庭 啓介; 高井 研
P23-2 6つの異なる海域の海底堆積物表層での窒素循環に関わる微生物の分布と化学環境の比較(ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2014年
2014, 228, 228 - 布浦 拓郎; 高木 善弘; 力石 嘉人; 森 浩二; 佐藤 喬章; 原田 健史; 柳川 勝紀; 首藤 彩; 大河内 直彦; 跡見 晴幸; 藤田 信之; 高井 研
O12-12 嫌気性水素酸化好熱細菌Thermosulfidibacterの可逆的TCA回路(口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2014年
2014, 88, 88 - 平井美穂; 布浦拓郎; JULIANI; 野牧秀隆; 西澤学; 菅寿美; 田角栄二; 宮崎淳一; 眞壁明子; 木庭啓介; 高井研
堆積物表層における硝化菌・嫌気的アンモニア酸化菌の分布と化学環境
ブルーアース要旨集, 2014年
2014, 105 - 美野さやか; 中川聡; 牧田寛子; 宮崎淳一; 和辻智郎; 渡部裕美; 西澤学; 中村謙太郎; 布浦拓郎; 井町寛之; 山本正浩; 高井研; 加藤真悟; 小島茂明; 島伸和; 石橋純一郎; 澤辺智雄
深海底熱水活動域に生息する化学合成微生物の分布様式と集団構造の解明
ブルーアース要旨集, 2014年
2014, 106 - 吉田 光宏; 高木 善弘; 布浦 拓郎; 高井 研
PD-03 (超)深海における表層堆積物中の未知ウイルス群集構造の解明(PD 極限環境微生物,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013年02月
8, 2 - 野牧秀隆; 井上健太郎; 菅寿美; 布浦拓郎; 土屋正史; 豊福高志; 北里洋
さまざまな深海環境における化学合成一次生産量の現場測定と生態系での役割
日本古生物学会例会講演予稿集, 2013年01月25日
162nd, 30 - 野牧 秀隆; 新井 和乃; 布浦 拓郎; 豊福 高志; 渡邉 修一; 高井 研; 藤倉 克則
2011年東北地方太平洋沖地震が深海生態系に及ぼした影響
日本地質学会学術大会講演要旨, 2013年
2013, 0, 45, 45 - 辻 健; 今野 祐多; 布浦 拓郎; 高井 研; 土岐 知弘; 笠谷 貴史; 木下 正高
海底調査と地震探査から明らかになってきた東北地方太平洋沖地震で生じた地殻応力の変動
日本地質学会学術大会講演要旨, 2013年
2013, 0 - 平井 美穂; 布浦 拓郎; 吉田 ゆかり; 西澤 学; 牧田 寛子; 小出 修; 川口 慎介; 宮崎 淳一; 高井 研
PA-005 日本海溝横断 : 水塊中の硝化菌群集構造(水圏生態系,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013年
29, 102, 102 - 田角 栄二; 野牧 秀隆; 柳川 勝紀; 今野 祐多; 酒井 早苗; 平井 美穂; 藤倉 克則; 布浦 拓郎; 高井 研
OF-010 巨大地震後の深海底におけるメタン生成ホットスポットの出現(物質循環・地球微生物学,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013年
29, 88, 88 - 吉田 光宏; 島村 繁; 布浦 拓郎; 高井 研
PA-011 海洋シアノファージによる溶菌に由来する溶存態有機物のプロテオーム解析(水圏生態系,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013年
29, 103, 103 - 吉田(高島) ゆかり; 高木 善弘; 布浦 拓郎; 高井 研
PD-005 深海熱水噴出域に生息する化学合成独立栄養細菌の溶原性ファージのゲノム解析(極限環境微生物,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013年
29, 115, 115 - 首藤 彩; 高木 善弘; 高見 英人; 布浦 拓郎; 高井 研
PJ-008 未培養好熱性アーキアCaldiarchaeum群集におけるrRNA遺伝子及びその周辺領域の多様性(ゲノミクス・メタゲノミクス,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2013年
29, 135, 135 - 野牧秀隆; 布浦拓郎; 豊福高志; 新井和乃; 菅寿美; 望月智弘; 脇田昌英; 滋野修一; 田角栄二; 藤森裕史; 今井利矩; 藤原克則; 渡邉修一; 北里洋
東北沖上部漸深海帯における地質・化学・生物調査―MR12‐E02航海による2011年東北地方太平洋沖地震の影響評価―
ブルーアース要旨集, 2013年
2013, 69 - 平井美穂; 西澤学; 野牧秀隆; 柳川勝紀; 北橋倫; 小出修; 田角栄二; 菊池徹; 平山仙子; 宮崎淳一; 木庭啓介; 布浦拓郎; 高井研
小笠原海溝底及び海溝に近接した深海平原堆積物中の窒素循環~深海堆積物中の窒素循環モデルを問い直す~
ブルーアース要旨集, 2013年
2013, 200 - 金井昭夫; 藤島皓介; 菅原潤一; 佐藤朝子; 曽我朋義; 浜島聖文; 村上慎之介; 増田豪; 布浦拓郎; 高木善弘; 高井研; 高見英人; MILLER C. S; BAKER B. J; BANFIELD J. F; DI GIULIO M; 伊藤隆
分断されたtRNAから解析するアーキアの系統分類と遺伝暗号の進化
Inst Ferment Osaka Res Commun, 2012年12月25日
26, 137, 147 - 布浦 拓郎
極限環境微生物学会研究奨励賞受賞研究 未培養系統群アーキア"Aigarchaeota"の生理生態及びゲノム特性
極限環境生物学会誌 = Journal of Japanese Society for Extremophiles, 2012年08月
11, 1, 6, 11 - 布浦拓郎; 平井美穂; 小出修; 宮崎淳一; 高井研; 菊池徹; 井上一大; 眞壁明子; 上野雄一郎; 砂村倫成
海溝‐超深海‐生命圏を探る
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2012年07月20日
25th, 1 - Ken Takai; Michael J. Mottl; Simon H.H. Nielsen; J. L. Birrien; S. Bowden; L. Brandt; A. Breuker; J. C. Corona; S. Eckert; H. Hartnett; S. P. Hollis; C. H. House; A. Ijiri; J. Ishibashi; Y. Masaki; S. McAllister; J. McManus; C. Moyer; M. Nishizawa; T. Noguchi; T. Nunoura; G. Southam; K. Yanagawa; S. Yang; C. Yeats
IODP expedition 331: Strong and expansive subseafloor hydrothermal activities in the Okinawa trough
Scientific Drilling, 2012年04月
13, 19, 27 - 益崎 庸介; 美野 さやか; 渡部 裕美; 宮崎 淳一; 布浦 拓郎; 小島 茂明; 澤辺 智雄; 中川 聡
PK-02 複数の深海底熱水活動域における固有巷貝とその共生細菌の群集遺伝学的解析(PK 相互作用・共生,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2012年
28, 170, 170 - 西澤 学; 布浦 拓郎; 平井 美穂; 真壁 明子; 柳川 勝紀; 野牧 秀隆; 北橋 倫; 木庭 啓介; 高井 研
超深海堆積物におけるアンモニア酸化と脱窒
日本地球化学会年会要旨集, 2012年
59, 0 - 藤本 理夏子; 徳原 将弘; 金井 保; 布浦 拓郎; 高木 善弘; 高見 英人; 高井 研; 跡見 晴幸
2Cp13 好熱性アーキアCaldiarchaeum subterraneumの有するユビキチン様遺伝子の機能解析(酵素学,酵素工学,一般講演)
日本生物工学会大会講演要旨集, 2012年
64, 41, 41 - 西澤 学; 布浦 拓郎; 平井 美穂; 真壁 明子; 柳川 勝紀; 野牧 秀隆; 北橋 倫; 木庭 啓介; 高井 研
S03-1 海溝堆積物における窒素動態と微生物生態(S03 窒素循環と微生物群集・機能:最先端研究の現場より,シンポジウムセッション)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2012年
28 - 布浦 拓郎; 砂村 倫成; 平井 美穂; 宮崎 淳一; 眞壁 明子; 井上 一大; 菊池 徹; 小出 修; 上野 雄一郎; 高井 研
PAa-23 海溝生命圏 : 海溝中の微生物生態系を明かす(PAa 水圏生態系(一般),ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2012年
28, 137, 137 - 平井 美穂; 西澤 学; 野牧 秀隆; 柳川 勝紀; 北橋 倫; 小出 修; 田角 栄二; 菊池 徹; 平山 仙子; 宮崎 淳一; 木庭 啓介; 布浦 拓郎; 高井 研
PF-06 小笠原海溝底及び深海平原堆積物中の窒素循環(PF 物質循環/地球微生物学,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2012年
28 - 田角 栄二; 布浦 拓郎; 川口 慎介; 今野 祐多; 藤倉 克則; 古島 靖夫; 渡部 裕美; 宮本 教生; 辻 健; 新井 和乃; 野口 拓郎; 長谷川 和範; 土岐 知弘; 野牧 秀隆; 谷川 亘; 笠谷 貴史; 砂村 倫成; 高井 研
PF-08 東北地方太平洋沖地震後に観察された深海底堆積物中メタンの多様性が示すものとは(PF 物質循環/地球微生物学,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2012年
28, 158, 158 - 吉田(高島)ゆかり; 高木善弘; 島村繁; 布浦拓郎; 高井研
深海底熱水活動域に生息する化学合成独立栄養細菌に感染するファージのゲノム解析
日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web), 2012年
14th - 布浦拓郎; 風間宏美; 角太淳吾; 島村繁; 高木善弘; 高井研
深海底熱水活動域に棲息する新奇硫黄酸化Gammaproteobacteriaのゲノム解析
日本ゲノム微生物学会年会要旨集, 2012年
6th, 63 - 牧田寛子; 山中寿朗; REIMER James Davis; 布浦拓郎; 渡部裕美; 宮崎征行; 望月芳和; 和辻智郎; 川口慎介; 中村謙太郎; 高井研; 長塩皓美; 福本七重; WHITE Kristine; 式場はるか; 河合恵理奈; 土岐知弘; 菊池早希子; 高橋嘉夫; 伊勢優史; 柳川勝紀; 砂村倫成; 野口拓郎; 岡村慶; 田中響子
南部沖縄トラフ多良間海丘に存在する酸化鉄被膜地帯での微生物調査:NT11‐18研究航海概要
ブルーアース要旨集, 2012年
2012, 190 - 美野さやか; 中川聡; 澤辺智雄; 宮崎淳一; 牧田寛子; 和辻智朗; 中村謙太郎; 加藤真悟; 小島茂明; 渡部裕美; 土岐知弘; 島伸和; 石橋純一郎; 布浦拓郎; 山本正浩; 高井研
深海底熱水活動域に生息する化学合成微生物の遺伝学的多様性と群集構造の解明
ブルーアース要旨集, 2012年
2012, 185 - 平井美穂; 布浦拓郎; 砂村倫成; 宮崎淳一; 小出修; 菊池徹; 井上一大; 眞壁明子; 上野雄一郎; 高井研
マリアナ海溝チャレンジャー海淵の微生物生態系
ブルーアース要旨集, 2012年
2012, 182 - 植松勝之; 多米晃裕; 布浦拓郎; 吉田ゆかり; 渡部裕美; 豊福高志; 藤原義弘; 丸山正; 北里洋; 山口正視
海洋生物の試料作製のノウハウ
日本顕微鏡学会関東支部講演会予稿集, 2011年03月05日
35th, 57 - 柳川 勝紀; 吉田 ゆかり; 諸野 祐樹; 砂村 倫成; 布浦 拓郎
102a-1 深海底堆積物中のウィルス分布(102a 極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 51, 51 - 西澤 学; 木場 啓介; 平井 美穂; 布浦 拓郎; 高井 研
102a-6 菱刈金山地下温泉小川に発達した微生物生態と窒素動態(102a 極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 52, 52 - 布浦 拓郎; 風間 宏美; 角太 淳吾; 島村 繁; 高木 善弘; 高井 研
102a-7 新奇硫黄酸化細菌の性状とゲノム解析(102a 極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 53, 53 - 高井 研; 川口 慎介; 吉田 ゆかり; 布浦 拓郎; 野口 拓郎; 岡村 慶; 石橋 秀規; 角皆 潤; 原 隆弘; 佐野 有司; 林 為人; 北里 洋; 中川 書子; 高畑 直人; 本多 牧生
103p-1 東北大地震が日本海溝深海域に及ぼした化学・微生物学的影響(103p 物質循環/界面/バイオフィルム/方法論,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 58, 58 - 吉田(高島) ゆかり; 布浦 拓郎; 島村 繁; 高井 研
PA-046 深海底熱水噴出域から単離した化学合成独立栄養細菌の溶原性ファージの性状解析(PA 極限環境,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 76, 76 - 柳川 勝紀; 布浦 拓郎; 川口 慎介; 平井 美穂; 砂村 倫成; 高井 研
102a-2 中部沖縄トラフ伊平屋北海域に存在する熱水孔下生命圏とその代謝活性(102a 極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 51, 51 - 平井 美穂; 柳川 勝紀; 布浦 拓郎; 高井 研
PA-042 海水浸透及び深部熱水溜まりの影響を受けた中部沖縄トラフ伊平屋北熱水活動域海底下微生物圏(PA 極限環境,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 75, 75 - 和泉 裕志; 布浦 拓郎; 宮崎 征行; 美野 さやか; 土岐 知弘; 高井 研; 左子 芳彦; 澤辺 智雄; 中川 聡
PA-043 深海底熱水活動域から分離・培養された新規好熱性Acidobacteriaの性状解析(PA 極限環境,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 76, 76 - 吉田 光宏; 布浦 拓郎; 高木 善弘; 高井 研
PA-045 深海堆積物表層環境におけるウイルスメタゲノムの解析(PA 極限環境,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2011年
27, 76, 76 - 牧田寛子; 菊池早希子; 高木善弘; 阿部真理子; 宮崎征行; 山本正浩; 布浦拓郎; 川口慎介; 土田真二; 中村謙太郎; 宮崎淳一; 稲垣史生; 高井研; 長塩皓美; 西尾竜; 山中寿朗; 多和田美紀; 土岐知弘; 野口拓郎; 岡村慶; 岡部宣章; 井尻暁; 砂村倫成; 加藤真悟; 中村光一; 中川聡; 中川太郎
各地の深海底に存在する褐色変色域での微生物調査
ブルーアース要旨集, 2011年
2011, 224 - 布浦 拓郎; 砂村 倫成; 平井 美穂; 宮崎 淳一; 眞壁 明子; 井上 一大; 菊池 徹; 小出 修; 上野 雄一郎; 高井 研
IC-11 海溝生命圈は存在するのか? : マリアナ海溝チャレンジャー海淵微生物生態系の解明(A.水圏生態系,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010年
26, 81, 81 - 平井 美穂; 布浦 拓郎; 菊池 徹; 坪内 泰志; 小出 修; 西澤 学; 宮崎 淳一; 高井 研
P-1 小笠原海溝底堆積物中の窒素循環に関わる徹生物相の解析(A.水圏生態系,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010年
26, 95, 95 - 高見 英人; 野口 英樹; 高木 善弘; 内山 郁夫; 西 真郎; 豊田 敦; 池 甲珠; 荒井 渉; 伊藤 武彦; 布浦 拓郎; 服部 正平; 高井 研
1B-10 Candidate division OP1は祖先的acetvl-CoA pathwayを有する好熱性acetogen(J.ゲノム,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010年
26, 73, 73 - 美野 さやか; 中川 聡; 牧田 寛子; 稲垣 史生; 山本 正浩; 布浦 拓郎; 中村 光一; GODFROY ANNE; 高井 研; 澤辺 智雄
P-50 深海底に生息する化学合成微生物の群集遺伝学的構造解明へのアプローチ(D.極限環境,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010年
26, 119, 119 - 宮崎 征行; 阿部 真理子; 小出 修; 森 梢; 島村 繁; 布浦 拓郎; 小林 徹; 井町 寛之; 能木 裕一; 高井 研
P-118 海底下堆積物から分離した好気性細菌の分類学的研究(H.分類/系統解析,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2010年
26, 153, 153 - 布浦拓郎; 高木善弘; 角田淳吾; 西真郎; 菅原潤一; 風間宏美; CHEE Gab‐Joo; 服部正平; 金井昭夫; 跡見晴幸; 高井研; 高見英人
未培養系統群アーキアのメタゲノム解析とその真核生物型タンパク質修飾系
生化学, 2010年
ROMBUNNO.3P-0555 - 長野由梨子; 秦田勇二; 布浦拓郎; 長濱統彦; 宮崎淳一; 高井研
伊豆・小笠原海溝最深部(9,760m)海底堆積物中における未知真菌群集の調査
Blue Earth要旨集, 2009年03月
2009, 242 - 布浦拓郎; 宮崎淳一; 小出修; 栄徳勝光; 高井研; 菊池徹; 諸野祐樹; 稲垣史生; 井上一大; 眞壁明子; 上野雄一郎; 砂村倫成
マリアナ海溝チャレンジャー海淵における地球化学・微生物学調査
Blue Earth要旨集, 2009年03月
2009, 239 - 石橋 純一郎; 野口 拓郎; 山中 寿朗; 中川 聡; 布浦 拓郎; 中村 光一; 稲垣 史生
沖縄トラフ伊是名海穴の熱水活動の地球化学的特徴
日本地球化学会年会要旨集, 2009年
56, 0, 123, 123 - 布浦 拓郎; 砂村 倫成; 眞壁 明子; 井上 一大; 菊池 徹; 小出 修; 上野 雄一郎; 宮崎 淳一; 高井 研
1B-6 マリアナ海溝チャレンジャー海淵水塊中の微生物分布(口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2009年
25, 12, 12 - 井町 寛之; 江原 真之; 青井 健; 山口 隆司; 平山 仙子; 布浦 拓郎; 高井 研
1C-9(P-53) 嫌気的メタン酸化アーキアの培養の試み(口頭発表+ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2009年
25, 21, 21 - 青井 健; 田角 栄二; 山口 隆司; 布浦 拓郎; 稲垣 史生; 高井 研; 井町 寛之
P-51 微生物学的廃水処理リアクターを利用した深海底メタン生成菌の培養の試み(ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2009年
25, 75, 75 - 平井 美穂; 布浦 拓郎; 宮崎 征行; 井町 寛之; 平山 仙子; 古島 靖夫; 山本 啓之; 高井 研
P-55 石西礁湖海底温泉からの新奇好熱菌の単離とその性状(ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2009年
25, 76, 76 - 布浦拓郎; 角太淳吾; 西真郎; 菅原潤一; 風間宏美; 松井里美; 金井昭夫; 高井研; 高木善弘; 高見英人
未培養好熱性Crenarchaeotaのメタゲノム解析より示されたアーキアゲノムの多様性と進化
日本Archaea研究会講演会要旨集, 2009年
22nd, 37, 38 - 芦寿一郎; 辻健; 藤内智士; 坂口有人; 布浦拓郎; 井町寛之; BROWN Kevin; 橋本善孝; 土岐知弘; 柴田伊廣; 森田澄人; 後藤秀作; 清川昌一
熊野沖付加プリズムの海底‐掘削孔総合水理観測
海洋研究開発機構航海概要報告(CD-ROM), 2008年03月
2006, ROMBUNNO.YOKOSUKAYK06-03 - 大澤弘敬; 吉田弘; 井上朝哉; 澤隆雄; 渡邊佳孝; 石橋正二郎; 田原淳一郎; 伊藤和彰; 高井研; 宮崎淳一; 布浦拓郎; 諸野祐樹; 稲垣史生; 菊池徹; 小出修; 眞壁明子; 井上一大; 砂村倫成
大深度小型無人機(ABISMO)の実海域実験
海洋研究開発機構航海概要報告書&運航実績一覧&航跡図&運航線表(CD-ROM), 2008年
2008 - 井町 寛之; 青井 健; 矢代 悠人; 山口 隆司; 布浦 拓郎; 稲垣 史生; 高井 研
03-054 微生物学的廃水処理リアクターを利用した深海底微生物の培養(極限環境,研究発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2008年
24, 85, 85 - 大野 さやか; 布浦 拓郎; 植松 勝之; 諸野 祐; 稲垣 史生; 中川 聡; 井町 寛之; Takai Ken
08-155 深海底熱水噴出孔周辺のバクテリオファージの生態調査(極限環境,研究発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2008年
24, 136, 136 - 布浦 拓郎; 角太 淳吾; 西 真郎; 風間 宏美; 松井 里美; 高井 研; 高木 善弘; 高見 英人
10-189 菱刈金山地下熱水環境に優占する未培養好熱性Crenarchaeotaのmetagenomicsによる全ゲノム解析(ゲノム,研究発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2008年
24, 153, 153 - 菊池 徹; 布浦 拓郎; 小出 修; 宮崎 淳一; 高井 研
11-204 小笠原海溝深海底堆積物中における微生物相の解析(極限環境,研究発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2008年
24, 160, 160 - 小出修; 森梢; 島村繁; 三浦健; 高木善弘; 諸野祐樹; 小林徹; 布浦拓郎; 井町寛之; 稲垣史生; 高井研; 掘越弘毅
下北半島沖海底下より掘削されたコア堆積層中に生存する好気性細菌の多様性
日本農芸化学会大会講演要旨集, 2008年
2008 - 小出修; 森梢; 島村繁; 三浦健; 高木善弘; 小林徹; 布浦拓郎; 井町寛之; 稲垣史生; 高井研; 掘越弘毅
“ちきゅう”による下北半島沖掘削試験から得られたコア堆積層中の好気性菌の多様性
極限環境微生物学会誌, 2007年12月
6, 1/2, 153, 154 - 西村 宏; 布浦 拓郎; 高井 研; 左子 芳彦
2-22 微好気性好熱水素細菌Hydrogenimonas thermophilaのヒドロゲナーゼに関する研究(極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2007年
23, 60, 60 - 稲垣 史生; 諸野 祐樹; 益井 宣明; 寺田 武志; 井町 寛之; 布浦 拓郎; 小林 徹; 高見 英人; 高井 研; 小川 奈々子; 大河内 直彦; 小谷 亮介; 武内 理香; 戸丸 仁; 荻原 成騎; 吉岡 秀佳; 松本 良; 堀越 弘毅; CK06-06航海関係者および陸上研究者一同
2-25 地球深部探査船「ちきゅう」による下北沖慣熟掘削航海CK06-06速報 : 海底下生命圏を支えるエネルギー源は何か?(極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2007年
23, 62, 62 - 宮崎 淳一; 土岐 知弘; 布浦 拓郎; 井町 寛之; 芦寿 一郎; 高井 研
PB-55 メタン冷湧水帯における窒素固定菌の分布(極限環境,ポスターセッションB,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2007年
23, 142, 142 - 中川聡; 高井研; 山本正浩; 布浦拓郎; 井町寛之; 土田真二; 吉田勝則; 眞壁明子; 川口慎介; 成田拓; 正木裕香; 柳川勝紀; 大野さやか; 和田幸子; 棚田詢; 岡田聡; 和辻智郎; 上野雄一郎; 川市智; 吉富泰助; SWANNER Elizabeth; 足立文
深海底熱水活動域の熱水‐海水混合域における化学合成独立栄養細菌のzonation 南奄西海丘熱水活動域地球微生物学調査
海洋研究開発機構航海概要報告書&運航実績一覧&航跡図&運航線表(CD-ROM), 2007年
2007, NATSUSHIMANT07-11,NATSUSHIMANT07-13 - 布浦 拓郎
3B-PM3 地下生命圈からの微生物ハンティング : 培養からメタゲノムまで(これからの微生物資源:秘められた可能性,シンポジウム)
日本生物工学会大会講演要旨集, 2006年
18, 37, 37 - 布浦 拓郎; 笈田 花子; 高井 研; 稲垣 史生; 平山 仙子; 中島 美和子; 石橋 純一郎; 小坂 紋子; 大久保 智; 角皆 潤; 中村 光一; 木下 正高; 掘越 弘毅
PA-48 深海底熱水活動域堆積物中における微生物分布(1)(極限環境,ポスターセッションA,(1)ポスター発表会,研究発表会)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2006年
22, 102, 102 - 笈田 花子; 布浦 拓郎; 高井 研; 稲垣 史生; 平山 仙子; 中島 美和子; 石橋 純一郎; 小坂 紋子; 大久保 智; 角皆 潤; 中村 光一; 木下 正高; 掘越 弘毅
PA-49 深海底熱水活動域堆積物中における微生物分布(2)(極限環境,ポスターセッションA,(1)ポスター発表会,研究発表会)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2006年
22, 103, 103 - 平山 仙子; 高井 研; 布浦 拓郎; 笈田 花子; 砂村 倫成; 山本 啓之; 堀越 弘毅
PB-44 竹富島沖浅海底温泉に棲息する新規の硫黄およびメタン酸化細菌 : 群集構造解析と優占種の分離・培養(群集構造解析,ポスターセッションB,(1)ポスター発表会,研究発表会)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2006年
22, 162, 162 - 高見 英人; 西 真郎; 松井 里美; 池 甲珠; 布浦 拓郎; 高井 研; 黒川 顕; 伊藤 武彦; 山下 敦; 服部 正平
C-20 菱刈金山地下熱水環境のメタゲノミクス(極限環境,(2)口頭発表会,研究発表会)(Symbiosis/Interaction,(2) Oral presentation)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2006年
22, 284, 284 - 稲垣 史生; 布浦 拓郎; 高井 研; Kuypers Marcel M. M.; Treude Tina; Boetius Antje
C-22 液体CO_2/CO_2-ハイドレートを含む深海底堆積物 : 微生物生態系とその地球科学的意義(極限環境,(2)口頭発表会,研究発表会)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2006年
22, 286, 286 - Jun Ichiro Ishibashi; John E. Lupton; Toshiyuki Yamaguchi; Joel Querellou; Takuro Nunoura; Ken Takai
Expedition reveals changes in Lau Basin hydrothermal system
Eos, 2006年
87, 2, 13, 17 - 本郷 やよい; 小畑 元; 蒲生 俊敬; 角皆 潤; 中島 美和子; 石橋 純一郎; 布浦 拓郎
埋積海嶺型沖縄トラフ熱水系における希土類元素の地球化学的挙動について
日本地球化学会年会要旨集, 2005年
52, 0, 100, 100 - 平山 仙子; 布浦 拓郎; 中川 聡; 笈田 花子; 高井 研; 山本 啓之; 掘越 弘毅
PA-29 浅海底および深海底熱水域から分離した新規好気的メタン酸化細菌の諸性質(極限環境,ポスターセッションA,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2005年
21, 75, 75 - 笈田 花子; 布浦 拓郎; 高井 研; 芦 寿一郎; 掘越 弘毅
PA-72 Methyl CoM reductase subunit A遺伝子(mcrA)による嫌気的メタン酸化Archaea定量法の確立(遺伝子解析,ポスターセッションA,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2005年
21, 118, 118 - 布浦 拓郎; 高見 英人; 笈田 花子; 平山 仙子; 西 真郎; 島村 繁; 鈴木 庸平; 稲垣 史生; 高井 研; 山下 敦士; 服部 正平; 掘越 弘毅
A-19 地殼内生物圏におけるメタゲノム解析(遺伝子解析,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2005年
21, 215, 215 - 高井 研; 中川 聡; 鈴木 庸平; 平山 仙子; 布浦 拓郎
S1-1 深海底熱水活動域における微生物生態系(シンポジウム1「極限微生物の生態と新機能」,第21回大会シンポジウム)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2005年
21, 277, 279 - 中島 美和子; 石橋 純一郎; 角皆 潤; 大久保 智; 今野 裕多; 三枝 俊介; 稲垣 史夫; 布浦 拓郎
沖縄トラフ、第四与那国海丘の海底熱水系における堆積層内の熱水循環と化学的特徴
日本地球化学会年会要旨集, 2004年
51, 0, 212, 212 - 大久保 智; 今野 祐多; 三枝 俊介; 角皆 潤; 中川 書子; 小坂 紋子; 中島 美和子; 石橋 純一郎; 布浦 拓郎
沖縄トラフ海底の熱水中に含まれるメタンの起源
日本地球化学会年会要旨集, 2004年
51, 0, 255, 255 - 笈田 花子; 布浦 拓郎; 平山 仙子; 鈴木 庸平; 稲垣 史生; 西 真郎; 島村 繁; 高見 英人; 高井 研; Nealson Kenneth H.; 堀越 弘毅
P-041 菱刈金山地下熱水環境に存在する未培養好熱性Archaeaのrrn遺伝子オペロンを含むFosmidクローンの解析(遺伝子解析,ポスター発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004年
20, 63, 63 - 高井 研; 布浦 拓郎; 鈴木 雅恵; 平山 仙子; 稲垣 史生; 鈴木 庸平; 掘越 弘毅
A-10 深海底熱水活動域における生物学的エネルギー・炭素フラックスの解明にむけて : (1)ε-プロテオバクテリアのエネルギー・炭素代謝の酵素・遺伝学的解析(極限環境,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004年
20, 132, 132 - 布浦 拓郎; 笈田 花子; 平山 仙子; 鈴木 庸平; 稲垣 史生; 西 真郎; 島村 繁; 高見 英人; 高井 研; Nealson Kenneth H.; 掘越 弘毅
B-13 菱刈金山地下熱水環境に優占する未知なる好熱性Archaeaゲノムの探索(遺伝子解析,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004年
20, 175, 175 - 稲垣 史生; 角皆 潤; 鈴木 雅恵; 小坂 紋子; 町山 英章; 布浦 拓郎; 高井 研; Nealson Kenneth H.; 掘越 弘毅
B-14 黒島海丘における好気的・嫌気的メタン酸化微生物群集に関する地球化学的・分子生物学的研究(群集構造解析,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2004年
20, 176, 176 - T Nunoura; K Takai; KH Nealson; K Horikoshi; M Delwiche; F Colwell
The microbial community structure of methane hydrate bearing deep subseafloor sediments in Cascadia Margin (ODP Leg204)
GEOCHIMICA ET COSMOCHIMICA ACTA, 2003年09月
67, 18, A343, A343 - T Nunoura; K Takai
The evolution of metabolisms in hydrothermal vents
GEOCHIMICA ET COSMOCHIMICA ACTA, 2003年09月
67, 18, A342, A342 - FS Colwell; ME Delwiche; D Reed; S Boyd; T Nunoura; K Takai
Microbiology of hydrates: Searching for the methane source term
GEOCHIMICA ET COSMOCHIMICA ACTA, 2003年09月
67, 18, A69, A69 - 布浦 拓郎; 笈田 花子; 益井 宣明; 稲垣 史生; 高井 研; 掘越 弘毅; 相良掘削計画研究者一同
O-15 堆積物中微生物相から見た相良油田の特性
日本地質学会学術大会講演要旨, 2003年
2003, 0, 9, 9 - 稲垣 史生; 鈴木 雅恵; 布浦 拓郎; 高井 研; Nealson Kenneth H.; 掘越 弘毅
29-B-09 ODP国際海洋掘削計画による海底下生命圏研究 : (1)Peru Margin付加体堆積物中の微生物群集構造(ODP Leg.201)(極限環境,一般講演)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2003年
19, 142, 142 - 布浦 拓郎; 稲垣 史生; 高井 研; Mark Delweche; Frederick Colwell; Nealson Kenneth H.; 掘越 弘毅
29-B-10 ODP国際海洋掘削計画による海底下生命圏研究 : (2)Cascadia Marginメタンハイドレート胚胎堆積物中の微生物群集構造(ODP Leg.204)(極限環境,一般講演)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2003年
19, 143, 143 - 中川 聡; 高井 研; 稲垣 史生; 平山 仙子; 布浦 拓郎; 掘越 弘毅; 内田 有恆; 左子 芳彦
29-B-12 深海底熱水孔環境に優占する水素/硫黄酸化細菌の分布とその性状(極限環境,一般講演)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2003年
19, 145, 145 - 布浦 拓郎; 笈田 花子; 益井 宣明; 稲垣 史生; 高井 研; 堀越 弘毅
A-13 相良油田堆積物中の微生物相解析(極限環境1,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2002年
18, 31, 31 - 笈田 花子; 高井 研; 稲垣 史生; 平山 仙子; 布浦 拓郎; 中川 聡; 堀越 弘毅
A-16 中部沖縄トラフ伊平屋熱水活動域の海底下微生物群集構造と熱水循環系との関わり(極限環境1,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2002年
18, 34, 34 - 中川 聡; 高井 研; 稲垣 史生; 平山 仙子; 布浦 拓郎; 堀越 弘毅; 内田 有恆; 左子 芳彦
A-20 網羅的培養による中部沖縄トラフ熱水孔環境微生物の分布・生息量・多様性(極限環境2,口頭発表)
日本微生物生態学会講演要旨集, 2002年
18, 38, 38 - K Takai; T Nunoura; Y Sako; A Uchida
Acquired thermotolerance and temperature-induced protein accumulation in the extremely thermophilic bacterium Rhodothermus obamensis
JOURNAL OF BACTERIOLOGY, 1998年05月
180, 10, 2770, 2774 - TAKAI Ken; NUNOURA Takuro; SAKO Yoshihiko; UCHIDA Aritsune
A Molecular View of Microbial Diversity in Marine and Rerrestrial Hot Water Environments.
Viva origino, 1998年03月01日
26, 1, 68, 68
