Methylomarinovum caldicuralii gen. nov., sp. nov., a moderately thermophilic methanotroph isolated from a shallow submarine hydrothermal system, and
proposal of the family Methylothermaceae fam. nov.
Hirayama H, Abe M, Miyazaki M, Nunoura T, Furushima Y, Yamamoto H, Takai K.
Int J Syst Evol Microbiol. 2014 Mar;64(Pt 3):989-99.
私達の研究グループでは以前、沖縄県・八重山諸島のひとつ、竹富島の沖合にある浅海熱水活動域(竹富海底温泉)で調査を行いました。ここは石垣島と西表島の間に広がる日本最大級の珊瑚礁海域、石西礁湖(せきせいしょうこ)の中の海底温泉という色々な意味で何とも魅力的なところです。
直径50-60 mのすり鉢状の地形の中心、水深23mの最深部から50℃以上の熱水が湧き出ています。実はここで昔、温泉を引こうと工事をしかけて頓挫したそうで、現在もその名残の土管が埋まっています。土管や母岩の亀裂から噴出する温泉は、ダイバーが冷えた体を温める癒しのダイビングスポットにもなっているようです。残念なことにうちのグループでは誰一人ダイビングライセンスを持っていないため、現場をこの目で見ていませんが(ボート上にてサンプル処理に備え待機してました)、共同研究者が潜った時、オジサマダイバーが温泉のお湯にあたりながらいつまでも寛いでおられ、サンプリングできず大変困ったとか。熱水は噴出した瞬間に約30℃の周辺海水と混ざるので、お湯加減がちょうど良くなり離れられなくなるそうです。
約50℃という熱過ぎず冷た過ぎずのヒトにも微生物にも絶妙な熱水には硫化水素が含まれ、また熱水とともに約70%がメタンから成るガスも噴出しています。太陽光が十分届き光合成も起きるため、暗黒の深海熱水域とはひと味違った微生物生態系が形成されているはず。土管にはバクテリアマットがモサモサ。期待が高まります。
そこで我がグループの精鋭達がそれぞれの得意技を駆使し微生物ハンティングに挑むこととなりました。期待通り、採取した熱水やバクテリアマットから多くの新規微生物の単離に成功し、これまでに3株を新属新種、1株を新種として正式に記載しています。そこへ更にもう一つ、
海洋の熱水活動域からは世界初となる、中等度好熱性の好気性メタン酸化菌を単離し、新属・新種 Methylomarinovum caldicuralii として正式に記載
したのがこの論文です。好気性メタン酸化菌とはメタンをエネルギー源および炭素源として生育する好気性細菌で、今のところあまり世間から注目されることもありませんが、地球環境の維持に不可欠な存在であることは間違いありません。( ̄^ ̄) ドヤッ!
、、、、、私、それまで深海の熱水活動域から好気性メタン酸化菌を単離しようと試みてきましたが、正直に申しますと全くもってウンともスンともでした(泣)。
ところが竹富海底温泉のサンプルは培養開始後すぐに、あれ?もうナンカ生えてる??
浅い海って、もしやオイシイ!?(・・以下省略)
こうして海からは初の好熱性メタン酸化菌の単離にあっさり成功しました!
名前は、属名 Methylomarinovum が「メチル化合物を使う海の卵形のもの」、種名 caldicuralii が「熱い珊瑚」という意味合いの言葉。つまり「珊瑚の海の熱水域でメチル化合物を使って生きる卵形の菌」という、まさに “ありのままの名前” となっております。
そして、“ありの〜ままの〜姿” は図1をご覧下さい
52℃の熱水から単離したこの菌は45-50℃で最も良く増殖し、また最高55℃までは生育できることを確認しています。ただ、保存に関しては要注意?! 私は通常定期的に植え継いで保存していますが、この菌、うっかりすると生えてこなくなり眠れぬ夜を過ごす羽目に陥ります。以前、陸上地下鉱山の熱水から好熱性メタン酸化菌 Methylothermus subterraneus を単離した時も、絶命しかけ辛くも命を繋いだことがありましたが(もちろん菌がね)、どうも好熱性メタン酸化菌は保存中の死滅率が高いようで、植え継ぐ場合はあまり間をあけてはいけないようです。
さて、この論文では、Methylomarinovum 属を含めた3つの属を新しい科に分類することも提唱し認められました。好気的メタン酸化菌は大きく4つのグループに分かれますが、海洋に生息するのは最大勢力 Gammaproteobacteria 綱のグループ。実質的にはすべて Gammaproteobacteria綱・Methylococcales 目・Methylococcaceae 科に分類されていました。
私も最初は Methylomarinovum 属を Methylococcaceae 科の新属として記載しようとしましたが、新属の Methylomarinovum 属、 Methylothermus 属、そして Methylohalobius 属の3属5種が Methylococcaceae 科の他の属とは様々な点で異なっていることは気づいていました。
高温や高塩濃度で生育できるといういわゆる極限環境微生物の特徴をもち、細胞膜の構成脂肪酸も、16S r RNA遺伝子の系統も、その他の種とは明らかに違っています。実は深海底熱水孔周辺のサンプルからもこの3属に近縁の遺伝子が数多く検出されており、高温の極限環境に適応した種を多く含む系統であることが予想されます。
そこで系統関係を精査すると、なんとこの3属がメタン酸化とは無関係の Chromatiales 目を挟んで他の属と明確に分断されてしまったのです。こうなるといずれ目レベルで新しい分類群にすべきかも知れませんが、今回はまず3属を新しい Methylothermaceae 科に分類することにしました(図2)。